Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12044
• Subject: XM_006506886.2
• Aligned Length: 3187
• Identities: 2154
• Gaps: 632

Alignment

Query    1  ---------------------------------------------------------ATGCGGACCTATTATTT  17
                                                                     |||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGACTGCATTTCTTGATGTTGAGTCTGCTCCTGTCGGCATGGCAGCCCACCCAAACATGCGGACCTATTATTT  74

Query   18  CTGCACTGATACAGGAAAGGAAATGGAGTTGTGGATGAAAGCCATGTTAGATGCTGCCCTAGTACAGACAGAAC  91
            ||||||.||||||||||||||.||||||.||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||||
Sbjct   75  CTGCACCGATACAGGAAAGGAGATGGAGCTGTGGATGAAGGCCATGTTAGATGCTGCTCTGGTGCAGACAGAAC  148

Query   92  CTGTGAAAAGAGTGGACAAGATTACATCTGAAAATGCACCAACTAAAGAAACCAATAACATTCCCAACCATAGA  165
            ||||||||||||||||||||||||||.||||.|.||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  149  CTGTGAAAAGAGTGGACAAGATTACAACTGACAGTGCATCAACCAAAGAAACCAATAACATTCCCAACCACAGA  222

Query  166  GTGCTAATTAAACCAGAGATCCAAAACAATCAAAAAAACAAGGAAATGAGCAAAATTGAAGAAAAAAAGGCATT  239
            ||.||.||||.|||.|||.||||||||.||||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||||.|||.||
Sbjct  223  GTTCTCATTAGACCCGAGGTCCAAAACCATCAGAAGAATAAGGAAATCAGCAAAATTGAAGAAAAAAGGGCCTT  296

Query  240  AGAAGCTGAAAAATATGGATTTCAGAAGGATGGTCAAGATAGACCCTTAACAAAAATTAATAGTGTAAAGCTGA  313
            |||||||||||.|||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||.|||
Sbjct  297  AGAAGCTGAAAGATACGGATTTCAGAAGGACGGGCAAGATAGACCATTAACAAAAATTAACAGTGTGAAGTTGA  370

Query  314  ATTCTCTGCCATCTGAATATGAGAGTGGGTCAGCATGCCCTGCTCAGACTGTGCACTACAGACCAATCAACTTG  387
            |.||.||||.|||.||||||||.||.|||.|||..|||||..||||||.|||.|||||||||||.|||||..||
Sbjct  371  ACTCCCTGCTATCAGAATATGAAAGCGGGCCAGACTGCCCACCTCAGAATGTACACTACAGACCCATCAATGTG  444

Query  388  AGCAGTTCAGAGAACAAAATAGTCAATGTTAGCCTGGCAGATCTTAGAGGTGGAAATCGCCCCAATACAGGGCC  461
            |..|||||.||...||||...||.|||||.|||.||||||||.|..|.|||||.|.||.|||.|||.|||||||
Sbjct  445  AATAGTTCTGACGGCAAAGCGGTGAATGTCAGCTTGGCAGATGTCCGGGGTGGGAGTCACCCAAATGCAGGGCC  518

Query  462  CTTATACACAGAGGCCGATCGAGTCATACAGAGAACAAATTCAATGCAGCAGTTGGAACAGTGGATTAAAATCC  535
            |.||..||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.|||.|.||.||||||||||||.|||
Sbjct  519  CCTAGCCACAGAGGCCGACCGAGTCATTCAGAGAACGAATTCAATGCAACAGCTAGAGCAGTGGATTAAAGTCC  592

Query  536  AGAAGGGGAGGGGTCATGAAGAAGAAACCAGGGGAGTAATTTCTTACCAAACATTACCAAGAAATATGCCAAGT  609
            ||||.||..||||||.|||||||||..||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct  593  AGAAAGGACGGGGTCTTGAAGAAGAGCCCAGAGGAGTAATTTCTTATCAAACATTGCCAAGAAATATGCCAAGC  666

Query  610  CACAGAGCCCAGATTATGGCCCGCTACCCTGAAGGTTATAGAACACTCCCAAGAAACAGCAAGACAAGGCCTGA  683
            ||||||||||||||..|||||||||.||||||||||||..|.||||||||.||||||||||||||.||.|||||
Sbjct  667  CACAGAGCCCAGATCCTGGCCCGCTGCCCTGAAGGTTACCGGACACTCCCGAGAAACAGCAAGACCAGACCTGA  740

Query  684  AAGTATCTGCAGTGTAACCCCTTCCACTCATGACAAGACATTAGGACCCGGAGCGGAGGAGAAACGGAGGTCCA  757
            .|||||||||||.||||||.||||...||||||.|||||   |||.||.|||||.||.|||||.|||.|.||||
Sbjct  741  GAGTATCTGCAGCGTAACCTCTTCTGGTCATGAGAAGAC---AGGGCCGGGAGCAGAAGAGAAGCGGCGATCCA  811

Query  758  TGAGAGATGACACAATGTGGCAGCTCTACGAATGGCAGCAGCGTCAGTTTTATAACAAACAGAGCACCCTCCCT  831
            |||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||..||||.|||||||||||||||
Sbjct  812  TGAGAGATGACACCATGTGGCAGCTGTACGAGTGGCAGCAGCGCCAGTTTTACCACAAGCAGAGCACCCTCCCT  885

Query  832  CGACACAGTACT--TTGAGTAGTCCCAAAACCATGGTAAATATTTCTGACCAGACAATGCACTCTATTCCCACA  903
            ||.|||.|  ||  .||||.|||||||||.|||||||..|..|.|||||||||||.||||||||.||.|||||.
Sbjct  886  CGGCACGG--CTGCCTGAGCAGTCCCAAAGCCATGGTGCAGGTGTCTGACCAGACGATGCACTCCATCCCCACG  957

Query  904  TCACCTTCCCACGGGTCAATAGCTGCTTATCAGGGATACTCCCCTCAACGAACTTACAGATCGGAAGTGTCTTC  977
            |||||||||||.||||||..|||||||||.|||||.|.|||||||||.||.||.|||||.||.||||||.|.||
Sbjct  958  TCACCTTCCCATGGGTCAGCAGCTGCTTACCAGGGCTTCTCCCCTCAGCGGACGTACAGGTCAGAAGTGACCTC  1031

Query  978  ACCAATTCAGAGAGGAGATGTGACAATAGACCGCAGACACAGGGCCCATCACCCTAAGCATGTCTATGTGCCTG  1051
            .||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||.|.|||||||||||||||||||||||..|||
Sbjct 1032  GCCCATCCAGAGAGGAGATGTGACGATAGACCGCAGGCACAGGCCTCATCACCCTAAGCATGTCTATGTAGCTG  1105

Query 1052  ACAGAAGGTCAGTGCCAGCTGGCCTGACTTTACAGTCTGTTAGTCCCCAGAGCCTCCAAGGGAAAACG------  1119
            |||||||||||.|||||||||||.|.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|.||||      
Sbjct 1106  ACAGAAGGTCAATGCCAGCTGGCTTAACTTTACAGGCTGTTAGTCCCCAGAGCCTCCAAGGCAGAACGCCAGAG  1179

Query 1120  --------------------------------------------------------------------------  1119
                                                                                      
Sbjct 1180  GAGCTCACACTGCTGCTAATAAAGCTGAGACGGCAGCAGGCAGAGCTGAGTAGTGTCCGGGAGCACACCTTAGC  1253

Query 1120  --------------------------------------------------------------------------  1119
                                                                                      
Sbjct 1254  ACAGCTCATGCAGCTGAAACTTGAGGCCCACAGCCCAAAGAATGAGATTCTTTCACATCATCTCCAAAGGAACA  1327

Query 1120  --------------------------------------------------------------------------  1119
                                                                                      
Sbjct 1328  CCATATATTTGGATCATCAGATGAAAGAAAATGAACCTATTATCACCATGGTTCACACAATGATTGAGAACTCG  1401

Query 1120  ---------------------------------------------------------------CTGTCACAAGA  1130
                                                                           |||||||||||
Sbjct 1402  GCGCTAAGACCACAACTGTACCAACAATTCTTAAGACAGAAGAACAAGATAAGTCTCTATTGTCTGTCACAAGA  1475

Query 1131  TGAAGGTAGAGGCACATTATACAAATACAGACCTGAAGAAGTAGATATTGATGCCAAGTTAAGCCGATTATGTG  1204
            ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||.||||||.||||.||||
Sbjct 1476  TGAATGTAGAGGCACATTATACAAATACAGACCTGAAGAAGCAGGTATTGATGCCAAATTAAGCAGATTGTGTG  1549

Query 1205  AACAAGATAAAGTGGTGCATGCTCTGGAAGAGAAACTTCAGCAACTCCACAAGGAGAAATACACGCTTGAGCAA  1278
            ||||.|||||||||||.|..||.|||||.|||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1550  AACAGGATAAAGTGGTCCGAGCGCTGGAGGAGAAGCTGCAGCAGCTGCACAAGGAGAAATACACGCTTGAGCAA  1623

Query 1279  GCTTTGCTATCAGCCAGCCAAGAGATAGAAATGCATGCAGATAACCCAGCAGCCATTCAGACAGTGGTGTTACA  1352
            ||.|||||.||||||||||||||||||||.|||.||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||.||
Sbjct 1624  GCCTTGCTGTCAGCCAGCCAAGAGATAGAGATGAATGCTGATAACCCAGCTGCCATTCAAACTGTGGTGTTGCA  1697

Query 1353  AAGGGATGATTTACAAAATGGACTGCTTAGTACGTGTCGAGAACTTTCTCGAGCCACTGCCGAATTGGAACGAG  1426
            .||||||||..|.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||.||.|||||||||||.||..|||||||||
Sbjct 1698  GAGGGATGACCTGCAAAACGGACTGCTGAGCACGTGTCGGGAACTCTCCCGAGCCACTGCTGAGCTGGAACGAG  1771

Query 1427  CATGGAGAGAATATGATAAGTTAGAATACGATGTAACTGTTACCAGGAACCAGATGCAAGAGCAGCTGGATCAC  1500
            |.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||.||||||||||.|..|||||.||.|.|
Sbjct 1772  CCTGGAGAGAATATGACAAGTTGGAATATGATGTGACTGTTACCAGGGACCAGATGCAGGGTCAGCTCGACCGC  1845

Query 1501  CTTGGTGAAGTTCAGACGGAATCAGCAGGAATTCAGCGTGCACAGATTCAGAAAGAACTTTGGCGAATTCAGGA  1574
            |||||.|||||.||||..||.||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.||.||.|||.|||||||.||
Sbjct 1846  CTTGGAGAAGTGCAGAGTGAGTCGGCAGGAATTCAACGGGCACAGATTCAAAAGGAGCTCTGGAGAATTCAAGA  1919

Query 1575  TGTCATGGAAGGGCTGAGTAAACATAAGCAGCAAAGAGGTACTACAGAAA---TAGGTATGATAGGATCAAAGC  1645
            |||||||||.|||.||||.|||||.||.|||||||||||..||.||||||   |||||.||..|||||||||||
Sbjct 1920  TGTCATGGAGGGGTTGAGCAAACACAAACAGCAAAGAGGCTCTTCAGAAACAGTAGGTCTGGCAGGATCAAAGC  1993

Query 1646  CTTTCTCAACAGTTAAGTACAA----------------------------------------------------  1667
            ||||||||.|||||||||||||                                                    
Sbjct 1994  CTTTCTCATCAGTTAAGTACAAGAGCGAGGAAGAGGAAGTAGTCCCACCTCGGCCTCCACTTCCTCGGTCTTAT  2067

Query 1668  --------------------------------------------------------------------------  1667
                                                                                      
Sbjct 2068  GACTTTACAGAGCAGCCTCCCATAATCCCCCCTCTGCCCAGTGATAGCAGCTCCTTGCTCTGTTATAGCAGGGG  2141

Query 1668  ------------------------------------------------------AAATGAG----------GGT  1677
                                                                  ||||| |          |||
Sbjct 2142  CCCCGTGCATCTGCCTGAAGACAAGAAGATTCATCAAGTTCAAGGATATCCAAGAAATG-GATCTCACTGTGGT  2214

Query 1678  CCAGATTATAGACTCTACAAGAGTGAACCAGAGTTAACAACAGTGGCAGAAGTTGATGAATCTAATGGAGAAGA  1751
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 2215  CCAGATTATAGACTCTACAAGAGTGAGCCAGAGTTAACCACAGTGGCAGAAGTCGATGAATCTAACGGAGAAGA  2288

Query 1752  AAAATCAGAACCTGTTTCAGAGATAGAAACTTCAGTTGTTAAAGGTTCCCACTTTCCTGTTGGAGTAGTCCCTC  1825
            |||.|||||.||.|||||.||||.||||.||.||||.||||||||||||||.|||||.||.||   |||.||||
Sbjct 2289  AAAGTCAGAGCCAGTTTCTGAGACAGAAGCTCCAGTCGTTAAAGGTTCCCATTTTCCAGTCGG---AGTTCCTC  2359

Query 1826  CAAGAGCAAAATCACCAACACCCGAATCTTCGACAATAGCTTCCTATGTAACCTTGAGGAAAACTAAGAAGATG  1899
            ..|||.||||.|||||.||||||||.||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct 2360  TGAGAACAAAGTCACCCACACCCGAGTCCTCCACGATAGCTTCCTATGTGACCTTGAGGAAGACTAAGAAGATG  2433

Query 1900  ATGGATCTAAGAACGGAAAGACCAAGAAGTGCAGTGGAACAGCTCTGTTTGGCTGAAAGTACTCGACCAAGGAT  1973
            .||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||.|||||||.|||.|||||||.||.||
Sbjct 2434  GTGGAGCTAAGAACGGAAAGACCAAGAAGTGCCGTGGAGCAGCTGTGTCTGGCTGAGAGTGCTCGACCTAGAAT  2507

Query 1974  GACTGTGGAAGAGCAAATGGAAAGAATAAGAAGACATCAACAAGCGTGCCTGAGGGAGAAGAAAAAAGGGTTAA  2047
            |||||||||||||||..|.||.||.||.||.|||||.||.||.||.|||||||||||||||||.||.|||.|.|
Sbjct 2508  GACTGTGGAAGAGCAGCTAGAGAGGATCAGGAGACACCAGCAGGCCTGCCTGAGGGAGAAGAAGAAGGGGCTGA  2581

Query 2048  ATGTTATCGGTGCTTCAGACCAGTCACCCTTACAAAGCCCTTCAAATTTAAGGGATAATCCATTTAGGACTACT  2121
            .|||..||||||||||.||                  |||.|||.|..|.|||||.|.||||.|.|||..||||
Sbjct 2582  GTGTCCTCGGTGCTTCCGA------------------CCCGTCAGACGTGAGGGACAGTCCACTCAGGCTTACT  2637

Query 2122  CAGACTCGAAGGAGGGATGA------TAAGGAACTGGACACTG-CCATTAGAGAAAATGATGTAAAGCCAGACC  2188
            |||||||.||||||||||||      ||||||.||.|||||.| ||| .||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 2638  CAGACTCTAAGGAGGGATGATAACGTTAAGGAGCTAGACACCGTCCA-CAGAGAAAATGATGTAAAGCCAGACT  2710

Query 2189  ATGAAACTCCTGCA--ACAGAAATTGT--TCAACTAAAAGAAACCGAACCCCAAAATGTGGACTTCAGCAAAGA  2258
            |.||.|||||.|||  ||||    |||  |||.|||.||||..|.||||||||.||||..|||.||.|||.|.|
Sbjct 2711  ACGAGACTCCAGCAGCACAG----TGTGCTCACCTAGAAGACGCTGAACCCCAGAATGCAGACATCGGCAGAAA  2780

Query 2259  GTTAAAAAAAACTGAAAACATTTCATATGAAATGCTTTTTGAACCTGAGCCAAATGGAGTAAATTCTGTGGAAA  2332
            |.||||||               .||.|||||||||||....||||||.|||||||||.|...|||||.||||.
Sbjct 2781  GCTAAAAA---------------GATCTGAAATGCTTTACACACCTGAACCAAATGGAATGGCTTCTGAGGAAG  2839

Query 2333  TGATGGATAAAGAAAGAAACAAAGACAAAATGCCTGAGGATGTTACATTCAGCCCTCAAGATGAAAC-------  2399
            |||.|||.||.||||||.|.|||||..|..|||.||..||||...|||.|||||||||.||.||.||       
Sbjct 2840  TGACGGAGAAGGAAAGACAGAAAGAGCAGGTGCATGCCGATGGGTCATGCAGCCCTCAGGAAGAGACGGCCATG  2913

Query 2400  ACAGACCGCAAATCATAAACCAGAAGAGCATCCTGAAGAAAATACAAAGAACAGTGTTGACGAACAGGAAGAAA  2473
            |||||.|    ||||.|   ..||||..|..|||||.|||   .||.||   |||.||.|.||..|||||||||
Sbjct 2914  ACAGAGC----ATCAGA---TGGAAGGCCCCCCTGAGGAA---GCAGAG---AGTCTTCATGAGGAGGAAGAAA  2974

Query 2474  CTGTTATTTCTTACGAATCAACTCCTGAGGTTTCTAGAGGA-AATCAAACAATGGCAGTGAAAAGTCTGTCCCC  2546
            ||.||..|||.|..||..||.||||||||.||.|||| ||| ||||||||.|   ||||||.||||||||||||
Sbjct 2975  CTCTTGCTTCCTGTGAGCCAGCTCCTGAGATTCCTAG-GGAGAATCAAACCA---CAGTGAGAAGTCTGTCCCC  3044

Query 2547  ATCTCCTGAGTCCT---CGGCATCGCCAGTTCCATCCACTCAGCCGCAGCTCACAGAAGGATCACATTTCATGT  2617
            .||||||||.||||   |||||   .|||.|||..||||||..||.|||||||..||||||||.||||||||||
Sbjct 3045  GTCTCCTGACTCCTCCACGGCA---GCAGATCCGCCCACTCCTCCACAGCTCAGGGAAGGATCGCATTTCATGT  3115

Query 2618  GTGTG  2622
            |||||
Sbjct 3116  GTGTG  3120