Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12044
• Subject: XM_006506888.2
• Aligned Length: 3148
• Identities: 2117
• Gaps: 632

Alignment

Query    1  ATGCGGACCTATTATTTCTGCACTGATACAGGAAAGGAAATGGAGTTGTGGATGAAAGCCATGTTAGATGCTGC  74
                                                   ||||||.||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct    1  ---------------------------------------ATGGAGCTGTGGATGAAGGCCATGTTAGATGCTGC  35

Query   75  CCTAGTACAGACAGAACCTGTGAAAA------------------GAGTGGACAAGATTACATCTGAAAATGCAC  130
            .||.||.|||||||||||||||||||                  |||||||||||||||||.||||.|.||||.
Sbjct   36  TCTGGTGCAGACAGAACCTGTGAAAAGAATTACCTTTAATTTCCGAGTGGACAAGATTACAACTGACAGTGCAT  109

Query  131  CAACTAAAGAAACCAATAACATTCCCAACCATAGAGTGCTAATTAAACCAGAGATCCAAAACAATCAAAAAAAC  204
            ||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||.|||.|||.||||||||.||||.||.||.
Sbjct  110  CAACCAAAGAAACCAATAACATTCCCAACCACAGAGTTCTCATTAGACCCGAGGTCCAAAACCATCAGAAGAAT  183

Query  205  AAGGAAATGAGCAAAATTGAAGAAAAAAAGGCATTAGAAGCTGAAAAATATGGATTTCAGAAGGATGGTCAAGA  278
            ||||||||.|||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||.|||.||||||||||||||.||.|||||
Sbjct  184  AAGGAAATCAGCAAAATTGAAGAAAAAAGGGCCTTAGAAGCTGAAAGATACGGATTTCAGAAGGACGGGCAAGA  257

Query  279  TAGACCCTTAACAAAAATTAATAGTGTAAAGCTGAATTCTCTGCCATCTGAATATGAGAGTGGGTCAGCATGCC  352
            ||||||.||||||||||||||.|||||.|||.||||.||.||||.|||.||||||||.||.|||.|||..||||
Sbjct  258  TAGACCATTAACAAAAATTAACAGTGTGAAGTTGAACTCCCTGCTATCAGAATATGAAAGCGGGCCAGACTGCC  331

Query  353  CTGCTCAGACTGTGCACTACAGACCAATCAACTTGAGCAGTTCAGAGAACAAAATAGTCAATGTTAGCCTGGCA  426
            |..||||||.|||.|||||||||||.|||||..|||..|||||.||...||||...||.|||||.|||.|||||
Sbjct  332  CACCTCAGAATGTACACTACAGACCCATCAATGTGAATAGTTCTGACGGCAAAGCGGTGAATGTCAGCTTGGCA  405

Query  427  GATCTTAGAGGTGGAAATCGCCCCAATACAGGGCCCTTATACACAGAGGCCGATCGAGTCATACAGAGAACAAA  500
            |||.|..|.|||||.|.||.|||.|||.||||||||.||..||||||||||||.||||||||.||||||||.||
Sbjct  406  GATGTCCGGGGTGGGAGTCACCCAAATGCAGGGCCCCTAGCCACAGAGGCCGACCGAGTCATTCAGAGAACGAA  479

Query  501  TTCAATGCAGCAGTTGGAACAGTGGATTAAAATCCAGAAGGGGAGGGGTCATGAAGAAGAAACCAGGGGAGTAA  574
            |||||||||.|||.|.||.||||||||||||.|||||||.||..||||||.|||||||||..||||.|||||||
Sbjct  480  TTCAATGCAACAGCTAGAGCAGTGGATTAAAGTCCAGAAAGGACGGGGTCTTGAAGAAGAGCCCAGAGGAGTAA  553

Query  575  TTTCTTACCAAACATTACCAAGAAATATGCCAAGTCACAGAGCCCAGATTATGGCCCGCTACCCTGAAGGTTAT  648
            |||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||..|||||||||.||||||||||||.
Sbjct  554  TTTCTTATCAAACATTGCCAAGAAATATGCCAAGCCACAGAGCCCAGATCCTGGCCCGCTGCCCTGAAGGTTAC  627

Query  649  AGAACACTCCCAAGAAACAGCAAGACAAGGCCTGAAAGTATCTGCAGTGTAACCCCTTCCACTCATGACAAGAC  722
            .|.||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||.||||...||||||.|||||
Sbjct  628  CGGACACTCCCGAGAAACAGCAAGACCAGACCTGAGAGTATCTGCAGCGTAACCTCTTCTGGTCATGAGAAGAC  701

Query  723  ATTAGGACCCGGAGCGGAGGAGAAACGGAGGTCCATGAGAGATGACACAATGTGGCAGCTCTACGAATGGCAGC  796
               |||.||.|||||.||.|||||.|||.|.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct  702  ---AGGGCCGGGAGCAGAAGAGAAGCGGCGATCCATGAGAGATGACACCATGTGGCAGCTGTACGAGTGGCAGC  772

Query  797  AGCGTCAGTTTTATAACAAACAGAGCACCCTCCCTCGACACAGTACT--TTGAGTAGTCCCAAAACCATGGTAA  868
            ||||.||||||||..||||.|||||||||||||||||.|||.|  ||  .||||.|||||||||.|||||||..
Sbjct  773  AGCGCCAGTTTTACCACAAGCAGAGCACCCTCCCTCGGCACGG--CTGCCTGAGCAGTCCCAAAGCCATGGTGC  844

Query  869  ATATTTCTGACCAGACAATGCACTCTATTCCCACATCACCTTCCCACGGGTCAATAGCTGCTTATCAGGGATAC  942
            |..|.|||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||..|||||||||.|||||.|.|
Sbjct  845  AGGTGTCTGACCAGACGATGCACTCCATCCCCACGTCACCTTCCCATGGGTCAGCAGCTGCTTACCAGGGCTTC  918

Query  943  TCCCCTCAACGAACTTACAGATCGGAAGTGTCTTCACCAATTCAGAGAGGAGATGTGACAATAGACCGCAGACA  1016
            ||||||||.||.||.|||||.||.||||||.|.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct  919  TCCCCTCAGCGGACGTACAGGTCAGAAGTGACCTCGCCCATCCAGAGAGGAGATGTGACGATAGACCGCAGGCA  992

Query 1017  CAGGGCCCATCACCCTAAGCATGTCTATGTGCCTGACAGAAGGTCAGTGCCAGCTGGCCTGACTTTACAGTCTG  1090
            ||||.|.|||||||||||||||||||||||..||||||||||||||.|||||||||||.|.|||||||||.|||
Sbjct  993  CAGGCCTCATCACCCTAAGCATGTCTATGTAGCTGACAGAAGGTCAATGCCAGCTGGCTTAACTTTACAGGCTG  1066

Query 1091  TTAGTCCCCAGAGCCTCCAAGGGAAAACG---------------------------------------------  1119
            ||||||||||||||||||||||.|.||||                                             
Sbjct 1067  TTAGTCCCCAGAGCCTCCAAGGCAGAACGCCAGAGGAGCTCACACTGCTGCTAATAAAGCTGAGACGGCAGCAG  1140

Query 1120  --------------------------------------------------------------------------  1119
                                                                                      
Sbjct 1141  GCAGAGCTGAGTAGTGTCCGGGAGCACACCTTAGCACAGCTCATGCAGCTGAAACTTGAGGCCCACAGCCCAAA  1214

Query 1120  --------------------------------------------------------------------------  1119
                                                                                      
Sbjct 1215  GAATGAGATTCTTTCACATCATCTCCAAAGGAACACCATATATTTGGATCATCAGATGAAAGAAAATGAACCTA  1288

Query 1120  --------------------------------------------------------------------------  1119
                                                                                      
Sbjct 1289  TTATCACCATGGTTCACACAATGATTGAGAACTCGGCGCTAAGACCACAACTGTACCAACAATTCTTAAGACAG  1362

Query 1120  ------------------------CTGTCACAAGATGAAGGTAGAGGCACATTATACAAATACAGACCTGAAGA  1169
                                    |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1363  AAGAACAAGATAAGTCTCTATTGTCTGTCACAAGATGAATGTAGAGGCACATTATACAAATACAGACCTGAAGA  1436

Query 1170  AGTAGATATTGATGCCAAGTTAAGCCGATTATGTGAACAAGATAAAGTGGTGCATGCTCTGGAAGAGAAACTTC  1243
            ||.||.||||||||||||.||||||.||||.||||||||.|||||||||||.|..||.|||||.|||||.||.|
Sbjct 1437  AGCAGGTATTGATGCCAAATTAAGCAGATTGTGTGAACAGGATAAAGTGGTCCGAGCGCTGGAGGAGAAGCTGC  1510

Query 1244  AGCAACTCCACAAGGAGAAATACACGCTTGAGCAAGCTTTGCTATCAGCCAGCCAAGAGATAGAAATGCATGCA  1317
            ||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||.||||.
Sbjct 1511  AGCAGCTGCACAAGGAGAAATACACGCTTGAGCAAGCCTTGCTGTCAGCCAGCCAAGAGATAGAGATGAATGCT  1584

Query 1318  GATAACCCAGCAGCCATTCAGACAGTGGTGTTACAAAGGGATGATTTACAAAATGGACTGCTTAGTACGTGTCG  1391
            |||||||||||.||||||||.||.||||||||.||.||||||||..|.|||||.||||||||.||.||||||||
Sbjct 1585  GATAACCCAGCTGCCATTCAAACTGTGGTGTTGCAGAGGGATGACCTGCAAAACGGACTGCTGAGCACGTGTCG  1658

Query 1392  AGAACTTTCTCGAGCCACTGCCGAATTGGAACGAGCATGGAGAGAATATGATAAGTTAGAATACGATGTAACTG  1465
            .|||||.||.|||||||||||.||..||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||
Sbjct 1659  GGAACTCTCCCGAGCCACTGCTGAGCTGGAACGAGCCTGGAGAGAATATGACAAGTTGGAATATGATGTGACTG  1732

Query 1466  TTACCAGGAACCAGATGCAAGAGCAGCTGGATCACCTTGGTGAAGTTCAGACGGAATCAGCAGGAATTCAGCGT  1539
            ||||||||.||||||||||.|..|||||.||.|.||||||.|||||.||||..||.||.|||||||||||.||.
Sbjct 1733  TTACCAGGGACCAGATGCAGGGTCAGCTCGACCGCCTTGGAGAAGTGCAGAGTGAGTCGGCAGGAATTCAACGG  1806

Query 1540  GCACAGATTCAGAAAGAACTTTGGCGAATTCAGGATGTCATGGAAGGGCTGAGTAAACATAAGCAGCAAAGAGG  1613
            |||||||||||.||.||.||.|||.|||||||.|||||||||||.|||.||||.|||||.||.|||||||||||
Sbjct 1807  GCACAGATTCAAAAGGAGCTCTGGAGAATTCAAGATGTCATGGAGGGGTTGAGCAAACACAAACAGCAAAGAGG  1880

Query 1614  TACTACAGAAA---TAGGTATGATAGGATCAAAGCCTTTCTCAACAGTTAAGTACAA-----------------  1667
            ..||.||||||   |||||.||..|||||||||||||||||||.|||||||||||||                 
Sbjct 1881  CTCTTCAGAAACAGTAGGTCTGGCAGGATCAAAGCCTTTCTCATCAGTTAAGTACAAGAGCGAGGAAGAGGAAG  1954

Query 1668  --------------------------------------------------------------------------  1667
                                                                                      
Sbjct 1955  TAGTCCCACCTCGGCCTCCACTTCCTCGGTCTTATGACTTTACAGAGCAGCCTCCCATAATCCCCCCTCTGCCC  2028

Query 1668  --------------------------------------------------------------------------  1667
                                                                                      
Sbjct 2029  AGTGATAGCAGCTCCTTGCTCTGTTATAGCAGGGGCCCCGTGCATCTGCCTGAAGACAAGAAGATTCATCAAGT  2102

Query 1668  ---------------AAATGAG----------GGTCCAGATTATAGACTCTACAAGAGTGAACCAGAGTTAACA  1716
                           ||||| |          |||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 2103  TCAAGGATATCCAAGAAATG-GATCTCACTGTGGTCCAGATTATAGACTCTACAAGAGTGAGCCAGAGTTAACC  2175

Query 1717  ACAGTGGCAGAAGTTGATGAATCTAATGGAGAAGAAAAATCAGAACCTGTTTCAGAGATAGAAACTTCAGTTGT  1790
            ||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||||.||||.||.||||.||
Sbjct 2176  ACAGTGGCAGAAGTCGATGAATCTAACGGAGAAGAAAAGTCAGAGCCAGTTTCTGAGACAGAAGCTCCAGTCGT  2249

Query 1791  TAAAGGTTCCCACTTTCCTGTTGGAGTAGTCCCTCCAAGAGCAAAATCACCAACACCCGAATCTTCGACAATAG  1864
            ||||||||||||.|||||.||.||   |||.||||..|||.||||.|||||.||||||||.||.||.||.||||
Sbjct 2250  TAAAGGTTCCCATTTTCCAGTCGG---AGTTCCTCTGAGAACAAAGTCACCCACACCCGAGTCCTCCACGATAG  2320

Query 1865  CTTCCTATGTAACCTTGAGGAAAACTAAGAAGATGATGGATCTAAGAACGGAAAGACCAAGAAGTGCAGTGGAA  1938
            ||||||||||.|||||||||||.||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 2321  CTTCCTATGTGACCTTGAGGAAGACTAAGAAGATGGTGGAGCTAAGAACGGAAAGACCAAGAAGTGCCGTGGAG  2394

Query 1939  CAGCTCTGTTTGGCTGAAAGTACTCGACCAAGGATGACTGTGGAAGAGCAAATGGAAAGAATAAGAAGACATCA  2012
            |||||.|||.|||||||.|||.|||||||.||.|||||||||||||||||..|.||.||.||.||.|||||.||
Sbjct 2395  CAGCTGTGTCTGGCTGAGAGTGCTCGACCTAGAATGACTGTGGAAGAGCAGCTAGAGAGGATCAGGAGACACCA  2468

Query 2013  ACAAGCGTGCCTGAGGGAGAAGAAAAAAGGGTTAAATGTTATCGGTGCTTCAGACCAGTCACCCTTACAAAGCC  2086
            .||.||.|||||||||||||||||.||.|||.|.|.|||..||||||||||.||                  ||
Sbjct 2469  GCAGGCCTGCCTGAGGGAGAAGAAGAAGGGGCTGAGTGTCCTCGGTGCTTCCGA------------------CC  2524

Query 2087  CTTCAAATTTAAGGGATAATCCATTTAGGACTACTCAGACTCGAAGGAGGGATGA------TAAGGAACTGGAC  2154
            |.|||.|..|.|||||.|.||||.|.|||..|||||||||||.||||||||||||      ||||||.||.|||
Sbjct 2525  CGTCAGACGTGAGGGACAGTCCACTCAGGCTTACTCAGACTCTAAGGAGGGATGATAACGTTAAGGAGCTAGAC  2598

Query 2155  ACTG-CCATTAGAGAAAATGATGTAAAGCCAGACCATGAAACTCCTGCA--ACAGAAATTGT--TCAACTAAAA  2223
            ||.| ||| .||||||||||||||||||||||||.|.||.|||||.|||  ||||    |||  |||.|||.||
Sbjct 2599  ACCGTCCA-CAGAGAAAATGATGTAAAGCCAGACTACGAGACTCCAGCAGCACAG----TGTGCTCACCTAGAA  2667

Query 2224  GAAACCGAACCCCAAAATGTGGACTTCAGCAAAGAGTTAAAAAAAACTGAAAACATTTCATATGAAATGCTTTT  2297
            ||..|.||||||||.||||..|||.||.|||.|.||.||||||               .||.|||||||||||.
Sbjct 2668  GACGCTGAACCCCAGAATGCAGACATCGGCAGAAAGCTAAAAA---------------GATCTGAAATGCTTTA  2726

Query 2298  TGAACCTGAGCCAAATGGAGTAAATTCTGTGGAAATGATGGATAAAGAAAGAAACAAAGACAAAATGCCTGAGG  2371
            ...||||||.|||||||||.|...|||||.||||.|||.|||.||.||||||.|.|||||..|..|||.||..|
Sbjct 2727  CACACCTGAACCAAATGGAATGGCTTCTGAGGAAGTGACGGAGAAGGAAAGACAGAAAGAGCAGGTGCATGCCG  2800

Query 2372  ATGTTACATTCAGCCCTCAAGATGAAAC-------ACAGACCGCAAATCATAAACCAGAAGAGCATCCTGAAGA  2438
            |||...|||.|||||||||.||.||.||       |||||.|    ||||.|   ..||||..|..|||||.||
Sbjct 2801  ATGGGTCATGCAGCCCTCAGGAAGAGACGGCCATGACAGAGC----ATCAGA---TGGAAGGCCCCCCTGAGGA  2867

Query 2439  AAATACAAAGAACAGTGTTGACGAACAGGAAGAAACTGTTATTTCTTACGAATCAACTCCTGAGGTTTCTAGAG  2512
            |   .||.||   |||.||.|.||..|||||||||||.||..|||.|..||..||.||||||||.||.|||| |
Sbjct 2868  A---GCAGAG---AGTCTTCATGAGGAGGAAGAAACTCTTGCTTCCTGTGAGCCAGCTCCTGAGATTCCTAG-G  2934

Query 2513  GA-AATCAAACAATGGCAGTGAAAAGTCTGTCCCCATCTCCTGAGTCCT---CGGCATCGCCAGTTCCATCCAC  2582
            || ||||||||.|   ||||||.||||||||||||.||||||||.||||   |||||   .|||.|||..||||
Sbjct 2935  GAGAATCAAACCA---CAGTGAGAAGTCTGTCCCCGTCTCCTGACTCCTCCACGGCA---GCAGATCCGCCCAC  3002

Query 2583  TCAGCCGCAGCTCACAGAAGGATCACATTTCATGTGTGTG  2622
            ||..||.|||||||..||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 3003  TCCTCCACAGCTCAGGGAAGGATCGCATTTCATGTGTGTG  3042