Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12044
• Subject: XM_006506889.2
• Aligned Length: 3130
• Identities: 2117
• Gaps: 614

Alignment

Query    1  ATGCGGACCTATTATTTCTGCACTGATACAGGAAAGGAAATGGAGTTGTGGATGAAAGCCATGTTAGATGCTGC  74
                                                   ||||||.||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct    1  ---------------------------------------ATGGAGCTGTGGATGAAGGCCATGTTAGATGCTGC  35

Query   75  CCTAGTACAGACAGAACCTGTGAAAAGAGTGGACAAGATTACATCTGAAAATGCACCAACTAAAGAAACCAATA  148
            .||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|.||||.||||.|||||||||||||
Sbjct   36  TCTGGTGCAGACAGAACCTGTGAAAAGAGTGGACAAGATTACAACTGACAGTGCATCAACCAAAGAAACCAATA  109

Query  149  ACATTCCCAACCATAGAGTGCTAATTAAACCAGAGATCCAAAACAATCAAAAAAACAAGGAAATGAGCAAAATT  222
            |||||||||||||.|||||.||.||||.|||.|||.||||||||.||||.||.||.||||||||.|||||||||
Sbjct  110  ACATTCCCAACCACAGAGTTCTCATTAGACCCGAGGTCCAAAACCATCAGAAGAATAAGGAAATCAGCAAAATT  183

Query  223  GAAGAAAAAAAGGCATTAGAAGCTGAAAAATATGGATTTCAGAAGGATGGTCAAGATAGACCCTTAACAAAAAT  296
            ||||||||||.|||.|||||||||||||.|||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct  184  GAAGAAAAAAGGGCCTTAGAAGCTGAAAGATACGGATTTCAGAAGGACGGGCAAGATAGACCATTAACAAAAAT  257

Query  297  TAATAGTGTAAAGCTGAATTCTCTGCCATCTGAATATGAGAGTGGGTCAGCATGCCCTGCTCAGACTGTGCACT  370
            |||.|||||.|||.||||.||.||||.|||.||||||||.||.|||.|||..|||||..||||||.|||.||||
Sbjct  258  TAACAGTGTGAAGTTGAACTCCCTGCTATCAGAATATGAAAGCGGGCCAGACTGCCCACCTCAGAATGTACACT  331

Query  371  ACAGACCAATCAACTTGAGCAGTTCAGAGAACAAAATAGTCAATGTTAGCCTGGCAGATCTTAGAGGTGGAAAT  444
            |||||||.|||||..|||..|||||.||...||||...||.|||||.|||.||||||||.|..|.|||||.|.|
Sbjct  332  ACAGACCCATCAATGTGAATAGTTCTGACGGCAAAGCGGTGAATGTCAGCTTGGCAGATGTCCGGGGTGGGAGT  405

Query  445  CGCCCCAATACAGGGCCCTTATACACAGAGGCCGATCGAGTCATACAGAGAACAAATTCAATGCAGCAGTTGGA  518
            |.|||.|||.||||||||.||..||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.|||.|.||
Sbjct  406  CACCCAAATGCAGGGCCCCTAGCCACAGAGGCCGACCGAGTCATTCAGAGAACGAATTCAATGCAACAGCTAGA  479

Query  519  ACAGTGGATTAAAATCCAGAAGGGGAGGGGTCATGAAGAAGAAACCAGGGGAGTAATTTCTTACCAAACATTAC  592
            .||||||||||||.|||||||.||..||||||.|||||||||..||||.||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct  480  GCAGTGGATTAAAGTCCAGAAAGGACGGGGTCTTGAAGAAGAGCCCAGAGGAGTAATTTCTTATCAAACATTGC  553

Query  593  CAAGAAATATGCCAAGTCACAGAGCCCAGATTATGGCCCGCTACCCTGAAGGTTATAGAACACTCCCAAGAAAC  666
            ||||||||||||||||.||||||||||||||..|||||||||.||||||||||||..|.||||||||.||||||
Sbjct  554  CAAGAAATATGCCAAGCCACAGAGCCCAGATCCTGGCCCGCTGCCCTGAAGGTTACCGGACACTCCCGAGAAAC  627

Query  667  AGCAAGACAAGGCCTGAAAGTATCTGCAGTGTAACCCCTTCCACTCATGACAAGACATTAGGACCCGGAGCGGA  740
            ||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||.||||...||||||.|||||   |||.||.|||||.||
Sbjct  628  AGCAAGACCAGACCTGAGAGTATCTGCAGCGTAACCTCTTCTGGTCATGAGAAGAC---AGGGCCGGGAGCAGA  698

Query  741  GGAGAAACGGAGGTCCATGAGAGATGACACAATGTGGCAGCTCTACGAATGGCAGCAGCGTCAGTTTTATAACA  814
            .|||||.|||.|.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||..|||
Sbjct  699  AGAGAAGCGGCGATCCATGAGAGATGACACCATGTGGCAGCTGTACGAGTGGCAGCAGCGCCAGTTTTACCACA  772

Query  815  AACAGAGCACCCTCCCTCGACACAGTACT--TTGAGTAGTCCCAAAACCATGGTAAATATTTCTGACCAGACAA  886
            |.|||||||||||||||||.|||.|  ||  .||||.|||||||||.|||||||..|..|.|||||||||||.|
Sbjct  773  AGCAGAGCACCCTCCCTCGGCACGG--CTGCCTGAGCAGTCCCAAAGCCATGGTGCAGGTGTCTGACCAGACGA  844

Query  887  TGCACTCTATTCCCACATCACCTTCCCACGGGTCAATAGCTGCTTATCAGGGATACTCCCCTCAACGAACTTAC  960
            |||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||..|||||||||.|||||.|.|||||||||.||.||.|||
Sbjct  845  TGCACTCCATCCCCACGTCACCTTCCCATGGGTCAGCAGCTGCTTACCAGGGCTTCTCCCCTCAGCGGACGTAC  918

Query  961  AGATCGGAAGTGTCTTCACCAATTCAGAGAGGAGATGTGACAATAGACCGCAGACACAGGGCCCATCACCCTAA  1034
            ||.||.||||||.|.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||.|.|||||||||||
Sbjct  919  AGGTCAGAAGTGACCTCGCCCATCCAGAGAGGAGATGTGACGATAGACCGCAGGCACAGGCCTCATCACCCTAA  992

Query 1035  GCATGTCTATGTGCCTGACAGAAGGTCAGTGCCAGCTGGCCTGACTTTACAGTCTGTTAGTCCCCAGAGCCTCC  1108
            ||||||||||||..||||||||||||||.|||||||||||.|.|||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  993  GCATGTCTATGTAGCTGACAGAAGGTCAATGCCAGCTGGCTTAACTTTACAGGCTGTTAGTCCCCAGAGCCTCC  1066

Query 1109  AAGGGAAAACG---------------------------------------------------------------  1119
            ||||.|.||||                                                               
Sbjct 1067  AAGGCAGAACGCCAGAGGAGCTCACACTGCTGCTAATAAAGCTGAGACGGCAGCAGGCAGAGCTGAGTAGTGTC  1140

Query 1120  --------------------------------------------------------------------------  1119
                                                                                      
Sbjct 1141  CGGGAGCACACCTTAGCACAGCTCATGCAGCTGAAACTTGAGGCCCACAGCCCAAAGAATGAGATTCTTTCACA  1214

Query 1120  --------------------------------------------------------------------------  1119
                                                                                      
Sbjct 1215  TCATCTCCAAAGGAACACCATATATTTGGATCATCAGATGAAAGAAAATGAACCTATTATCACCATGGTTCACA  1288

Query 1120  --------------------------------------------------------------------------  1119
                                                                                      
Sbjct 1289  CAATGATTGAGAACTCGGCGCTAAGACCACAACTGTACCAACAATTCTTAAGACAGAAGAACAAGATAAGTCTC  1362

Query 1120  ------CTGTCACAAGATGAAGGTAGAGGCACATTATACAAATACAGACCTGAAGAAGTAGATATTGATGCCAA  1187
                  |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 1363  TATTGTCTGTCACAAGATGAATGTAGAGGCACATTATACAAATACAGACCTGAAGAAGCAGGTATTGATGCCAA  1436

Query 1188  GTTAAGCCGATTATGTGAACAAGATAAAGTGGTGCATGCTCTGGAAGAGAAACTTCAGCAACTCCACAAGGAGA  1261
            .||||||.||||.||||||||.|||||||||||.|..||.|||||.|||||.||.|||||.||.||||||||||
Sbjct 1437  ATTAAGCAGATTGTGTGAACAGGATAAAGTGGTCCGAGCGCTGGAGGAGAAGCTGCAGCAGCTGCACAAGGAGA  1510

Query 1262  AATACACGCTTGAGCAAGCTTTGCTATCAGCCAGCCAAGAGATAGAAATGCATGCAGATAACCCAGCAGCCATT  1335
            |||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||.||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 1511  AATACACGCTTGAGCAAGCCTTGCTGTCAGCCAGCCAAGAGATAGAGATGAATGCTGATAACCCAGCTGCCATT  1584

Query 1336  CAGACAGTGGTGTTACAAAGGGATGATTTACAAAATGGACTGCTTAGTACGTGTCGAGAACTTTCTCGAGCCAC  1409
            ||.||.||||||||.||.||||||||..|.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||.||.||||||||
Sbjct 1585  CAAACTGTGGTGTTGCAGAGGGATGACCTGCAAAACGGACTGCTGAGCACGTGTCGGGAACTCTCCCGAGCCAC  1658

Query 1410  TGCCGAATTGGAACGAGCATGGAGAGAATATGATAAGTTAGAATACGATGTAACTGTTACCAGGAACCAGATGC  1483
            |||.||..||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1659  TGCTGAGCTGGAACGAGCCTGGAGAGAATATGACAAGTTGGAATATGATGTGACTGTTACCAGGGACCAGATGC  1732

Query 1484  AAGAGCAGCTGGATCACCTTGGTGAAGTTCAGACGGAATCAGCAGGAATTCAGCGTGCACAGATTCAGAAAGAA  1557
            |.|..|||||.||.|.||||||.|||||.||||..||.||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.||.
Sbjct 1733  AGGGTCAGCTCGACCGCCTTGGAGAAGTGCAGAGTGAGTCGGCAGGAATTCAACGGGCACAGATTCAAAAGGAG  1806

Query 1558  CTTTGGCGAATTCAGGATGTCATGGAAGGGCTGAGTAAACATAAGCAGCAAAGAGGTACTACAGAAA---TAGG  1628
            ||.|||.|||||||.|||||||||||.|||.||||.|||||.||.|||||||||||..||.||||||   ||||
Sbjct 1807  CTCTGGAGAATTCAAGATGTCATGGAGGGGTTGAGCAAACACAAACAGCAAAGAGGCTCTTCAGAAACAGTAGG  1880

Query 1629  TATGATAGGATCAAAGCCTTTCTCAACAGTTAAGTACAA-----------------------------------  1667
            |.||..|||||||||||||||||||.|||||||||||||                                   
Sbjct 1881  TCTGGCAGGATCAAAGCCTTTCTCATCAGTTAAGTACAAGAGCGAGGAAGAGGAAGTAGTCCCACCTCGGCCTC  1954

Query 1668  --------------------------------------------------------------------------  1667
                                                                                      
Sbjct 1955  CACTTCCTCGGTCTTATGACTTTACAGAGCAGCCTCCCATAATCCCCCCTCTGCCCAGTGATAGCAGCTCCTTG  2028

Query 1668  -----------------------------------------------------------------------AAA  1670
                                                                                   |||
Sbjct 2029  CTCTGTTATAGCAGGGGCCCCGTGCATCTGCCTGAAGACAAGAAGATTCATCAAGTTCAAGGATATCCAAGAAA  2102

Query 1671  TGAG----------GGTCCAGATTATAGACTCTACAAGAGTGAACCAGAGTTAACAACAGTGGCAGAAGTTGAT  1734
            || |          |||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct 2103  TG-GATCTCACTGTGGTCCAGATTATAGACTCTACAAGAGTGAGCCAGAGTTAACCACAGTGGCAGAAGTCGAT  2175

Query 1735  GAATCTAATGGAGAAGAAAAATCAGAACCTGTTTCAGAGATAGAAACTTCAGTTGTTAAAGGTTCCCACTTTCC  1808
            ||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||||.||||.||.||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 2176  GAATCTAACGGAGAAGAAAAGTCAGAGCCAGTTTCTGAGACAGAAGCTCCAGTCGTTAAAGGTTCCCATTTTCC  2249

Query 1809  TGTTGGAGTAGTCCCTCCAAGAGCAAAATCACCAACACCCGAATCTTCGACAATAGCTTCCTATGTAACCTTGA  1882
            .||.||   |||.||||..|||.||||.|||||.||||||||.||.||.||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct 2250  AGTCGG---AGTTCCTCTGAGAACAAAGTCACCCACACCCGAGTCCTCCACGATAGCTTCCTATGTGACCTTGA  2320

Query 1883  GGAAAACTAAGAAGATGATGGATCTAAGAACGGAAAGACCAAGAAGTGCAGTGGAACAGCTCTGTTTGGCTGAA  1956
            ||||.||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||.|||||||.
Sbjct 2321  GGAAGACTAAGAAGATGGTGGAGCTAAGAACGGAAAGACCAAGAAGTGCCGTGGAGCAGCTGTGTCTGGCTGAG  2394

Query 1957  AGTACTCGACCAAGGATGACTGTGGAAGAGCAAATGGAAAGAATAAGAAGACATCAACAAGCGTGCCTGAGGGA  2030
            |||.|||||||.||.|||||||||||||||||..|.||.||.||.||.|||||.||.||.||.|||||||||||
Sbjct 2395  AGTGCTCGACCTAGAATGACTGTGGAAGAGCAGCTAGAGAGGATCAGGAGACACCAGCAGGCCTGCCTGAGGGA  2468

Query 2031  GAAGAAAAAAGGGTTAAATGTTATCGGTGCTTCAGACCAGTCACCCTTACAAAGCCCTTCAAATTTAAGGGATA  2104
            ||||||.||.|||.|.|.|||..||||||||||.||                  |||.|||.|..|.|||||.|
Sbjct 2469  GAAGAAGAAGGGGCTGAGTGTCCTCGGTGCTTCCGA------------------CCCGTCAGACGTGAGGGACA  2524

Query 2105  ATCCATTTAGGACTACTCAGACTCGAAGGAGGGATGA------TAAGGAACTGGACACTG-CCATTAGAGAAAA  2171
            .||||.|.|||..|||||||||||.||||||||||||      ||||||.||.|||||.| ||| .||||||||
Sbjct 2525  GTCCACTCAGGCTTACTCAGACTCTAAGGAGGGATGATAACGTTAAGGAGCTAGACACCGTCCA-CAGAGAAAA  2597

Query 2172  TGATGTAAAGCCAGACCATGAAACTCCTGCA--ACAGAAATTGT--TCAACTAAAAGAAACCGAACCCCAAAAT  2241
            ||||||||||||||||.|.||.|||||.|||  ||||    |||  |||.|||.||||..|.||||||||.|||
Sbjct 2598  TGATGTAAAGCCAGACTACGAGACTCCAGCAGCACAG----TGTGCTCACCTAGAAGACGCTGAACCCCAGAAT  2667

Query 2242  GTGGACTTCAGCAAAGAGTTAAAAAAAACTGAAAACATTTCATATGAAATGCTTTTTGAACCTGAGCCAAATGG  2315
            |..|||.||.|||.|.||.||||||               .||.|||||||||||....||||||.||||||||
Sbjct 2668  GCAGACATCGGCAGAAAGCTAAAAA---------------GATCTGAAATGCTTTACACACCTGAACCAAATGG  2726

Query 2316  AGTAAATTCTGTGGAAATGATGGATAAAGAAAGAAACAAAGACAAAATGCCTGAGGATGTTACATTCAGCCCTC  2389
            |.|...|||||.||||.|||.|||.||.||||||.|.|||||..|..|||.||..||||...|||.||||||||
Sbjct 2727  AATGGCTTCTGAGGAAGTGACGGAGAAGGAAAGACAGAAAGAGCAGGTGCATGCCGATGGGTCATGCAGCCCTC  2800

Query 2390  AAGATGAAAC-------ACAGACCGCAAATCATAAACCAGAAGAGCATCCTGAAGAAAATACAAAGAACAGTGT  2456
            |.||.||.||       |||||.|    ||||.|   ..||||..|..|||||.|||   .||.||   |||.|
Sbjct 2801  AGGAAGAGACGGCCATGACAGAGC----ATCAGA---TGGAAGGCCCCCCTGAGGAA---GCAGAG---AGTCT  2861

Query 2457  TGACGAACAGGAAGAAACTGTTATTTCTTACGAATCAACTCCTGAGGTTTCTAGAGGA-AATCAAACAATGGCA  2529
            |.|.||..|||||||||||.||..|||.|..||..||.||||||||.||.|||| ||| ||||||||.|   ||
Sbjct 2862  TCATGAGGAGGAAGAAACTCTTGCTTCCTGTGAGCCAGCTCCTGAGATTCCTAG-GGAGAATCAAACCA---CA  2931

Query 2530  GTGAAAAGTCTGTCCCCATCTCCTGAGTCCT---CGGCATCGCCAGTTCCATCCACTCAGCCGCAGCTCACAGA  2600
            ||||.||||||||||||.||||||||.||||   |||||   .|||.|||..||||||..||.|||||||..||
Sbjct 2932  GTGAGAAGTCTGTCCCCGTCTCCTGACTCCTCCACGGCA---GCAGATCCGCCCACTCCTCCACAGCTCAGGGA  3002

Query 2601  AGGATCACATTTCATGTGTGTG  2622
            ||||||.|||||||||||||||
Sbjct 3003  AGGATCGCATTTCATGTGTGTG  3024