Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12044
• Subject: XM_006506891.2
• Aligned Length: 2706
• Identities: 2152
• Gaps: 150

Alignment

Query    1  ---------------------------------------------------------ATGCGGACCTATTATTT  17
                                                                     |||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGACTGCATTTCTTGATGTTGAGTCTGCTCCTGTCGGCATGGCAGCCCACCCAAACATGCGGACCTATTATTT  74

Query   18  CTGCACTGATACAGGAAAGGAAATGGAGTTGTGGATGAAAGCCATGTTAGATGCTGCCCTAGTACAGACAGAAC  91
            ||||||.||||||||||||||.||||||.||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||||
Sbjct   75  CTGCACCGATACAGGAAAGGAGATGGAGCTGTGGATGAAGGCCATGTTAGATGCTGCTCTGGTGCAGACAGAAC  148

Query   92  CTGTGAAAAGAGTGGACAAGATTACATCTGAAAATGCACCAACTAAAGAAACCAATAACATTCCCAACCATAGA  165
            ||||||||||||||||||||||||||.||||.|.||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  149  CTGTGAAAAGAGTGGACAAGATTACAACTGACAGTGCATCAACCAAAGAAACCAATAACATTCCCAACCACAGA  222

Query  166  GTGCTAATTAAACCAGAGATCCAAAACAATCAAAAAAACAAGGAAATGAGCAAAATTGAAGAAAAAAAGGCATT  239
            ||.||.||||.|||.|||.||||||||.||||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||||.|||.||
Sbjct  223  GTTCTCATTAGACCCGAGGTCCAAAACCATCAGAAGAATAAGGAAATCAGCAAAATTGAAGAAAAAAGGGCCTT  296

Query  240  AGAAGCTGAAAAATATGGATTTCAGAAGGATGGTCAAGATAGACCCTTAACAAAAATTAATAGTGTAAAGCTGA  313
            |||||||||||.|||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||.|||
Sbjct  297  AGAAGCTGAAAGATACGGATTTCAGAAGGACGGGCAAGATAGACCATTAACAAAAATTAACAGTGTGAAGTTGA  370

Query  314  ATTCTCTGCCATCTGAATATGAGAGTGGGTCAGCATGCCCTGCTCAGACTGTGCACTACAGACCAATCAACTTG  387
            |.||.||||.|||.||||||||.||.|||.|||..|||||..||||||.|||.|||||||||||.|||||..||
Sbjct  371  ACTCCCTGCTATCAGAATATGAAAGCGGGCCAGACTGCCCACCTCAGAATGTACACTACAGACCCATCAATGTG  444

Query  388  AGCAGTTCAGAGAACAAAATAGTCAATGTTAGCCTGGCAGATCTTAGAGGTGGAAATCGCCCCAATACAGGGCC  461
            |..|||||.||...||||...||.|||||.|||.||||||||.|..|.|||||.|.||.|||.|||.|||||||
Sbjct  445  AATAGTTCTGACGGCAAAGCGGTGAATGTCAGCTTGGCAGATGTCCGGGGTGGGAGTCACCCAAATGCAGGGCC  518

Query  462  CTTATACACAGAGGCCGATCGAGTCATACAGAGAACAAATTCAATGCAGCAGTTGGAACAGTGGATTAAAATCC  535
            |.||..||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.|||.|.||.||||||||||||.|||
Sbjct  519  CCTAGCCACAGAGGCCGACCGAGTCATTCAGAGAACGAATTCAATGCAACAGCTAGAGCAGTGGATTAAAGTCC  592

Query  536  AGAAGGGGAGGGGTCATGAAGAAGAAACCAGGGGAGTAATTTCTTACCAAACATTACCAAGAAATATGCCAAGT  609
            ||||.||..||||||.|||||||||..||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct  593  AGAAAGGACGGGGTCTTGAAGAAGAGCCCAGAGGAGTAATTTCTTATCAAACATTGCCAAGAAATATGCCAAGC  666

Query  610  CACAGAGCCCAGATTATGGCCCGCTACCCTGAAGGTTATAGAACACTCCCAAGAAACAGCAAGACAAGGCCTGA  683
            ||||||||||||||..|||||||||.||||||||||||..|.||||||||.||||||||||||||.||.|||||
Sbjct  667  CACAGAGCCCAGATCCTGGCCCGCTGCCCTGAAGGTTACCGGACACTCCCGAGAAACAGCAAGACCAGACCTGA  740

Query  684  AAGTATCTGCAGTGTAACCCCTTCCACTCATGACAAGACATTAGGACCCGGAGCGGAGGAGAAACGGAGGTCCA  757
            .|||||||||||.||||||.||||...||||||.|||||   |||.||.|||||.||.|||||.|||.|.||||
Sbjct  741  GAGTATCTGCAGCGTAACCTCTTCTGGTCATGAGAAGAC---AGGGCCGGGAGCAGAAGAGAAGCGGCGATCCA  811

Query  758  TGAGAGATGACACAATGTGGCAGCTCTACGAATGGCAGCAGCGTCAGTTTTATAACAAACAGAGCACCCTCCCT  831
            |||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||..||||.|||||||||||||||
Sbjct  812  TGAGAGATGACACCATGTGGCAGCTGTACGAGTGGCAGCAGCGCCAGTTTTACCACAAGCAGAGCACCCTCCCT  885

Query  832  CGACACAGTACT--TTGAGTAGTCCCAAAACCATGGTAAATATTTCTGACCAGACAATGCACTCTATTCCCACA  903
            ||.|||.|  ||  .||||.|||||||||.|||||||..|..|.|||||||||||.||||||||.||.|||||.
Sbjct  886  CGGCACGG--CTGCCTGAGCAGTCCCAAAGCCATGGTGCAGGTGTCTGACCAGACGATGCACTCCATCCCCACG  957

Query  904  TCACCTTCCCACGGGTCAATAGCTGCTTATCAGGGATACTCCCCTCAACGAACTTACAGATCGGAAGTGTCTTC  977
            |||||||||||.||||||..|||||||||.|||||.|.|||||||||.||.||.|||||.||.||||||.|.||
Sbjct  958  TCACCTTCCCATGGGTCAGCAGCTGCTTACCAGGGCTTCTCCCCTCAGCGGACGTACAGGTCAGAAGTGACCTC  1031

Query  978  ACCAATTCAGAGAGGAGATGTGACAATAGACCGCAGACACAGGGCCCATCACCCTAAGCATGTCTATGTGCCTG  1051
            .||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||.|.|||||||||||||||||||||||..|||
Sbjct 1032  GCCCATCCAGAGAGGAGATGTGACGATAGACCGCAGGCACAGGCCTCATCACCCTAAGCATGTCTATGTAGCTG  1105

Query 1052  ACAGAAGGTCAGTGCCAGCTGGCCTGACTTTACAGTCTGTTAGTCCCCAGAGCCTCCAAGGGAAAACGCTGTCA  1125
            |||||||||||.|||||||||||.|.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||
Sbjct 1106  ACAGAAGGTCAATGCCAGCTGGCTTAACTTTACAGGCTGTTAGTCCCCAGAGCCTCCAAGGCAGAACGCTGTCA  1179

Query 1126  CAAGATGAAGGTAGAGGCACATTATACAAATACAGACCTGAAGAAGTAGATATTGATGCCAAGTTAAGCCGATT  1199
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||.||||||.||||
Sbjct 1180  CAAGATGAATGTAGAGGCACATTATACAAATACAGACCTGAAGAAGCAGGTATTGATGCCAAATTAAGCAGATT  1253

Query 1200  ATGTGAACAAGATAAAGTGGTGCATGCTCTGGAAGAGAAACTTCAGCAACTCCACAAGGAGAAATACACGCTTG  1273
            .||||||||.|||||||||||.|..||.|||||.|||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1254  GTGTGAACAGGATAAAGTGGTCCGAGCGCTGGAGGAGAAGCTGCAGCAGCTGCACAAGGAGAAATACACGCTTG  1327

Query 1274  AGCAAGCTTTGCTATCAGCCAGCCAAGAGATAGAAATGCATGCAGATAACCCAGCAGCCATTCAGACAGTGGTG  1347
            |||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||.||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||
Sbjct 1328  AGCAAGCCTTGCTGTCAGCCAGCCAAGAGATAGAGATGAATGCTGATAACCCAGCTGCCATTCAAACTGTGGTG  1401

Query 1348  TTACAAAGGGATGATTTACAAAATGGACTGCTTAGTACGTGTCGAGAACTTTCTCGAGCCACTGCCGAATTGGA  1421
            ||.||.||||||||..|.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||.||.|||||||||||.||..||||
Sbjct 1402  TTGCAGAGGGATGACCTGCAAAACGGACTGCTGAGCACGTGTCGGGAACTCTCCCGAGCCACTGCTGAGCTGGA  1475

Query 1422  ACGAGCATGGAGAGAATATGATAAGTTAGAATACGATGTAACTGTTACCAGGAACCAGATGCAAGAGCAGCTGG  1495
            ||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||.||||||||||.|..|||||.|
Sbjct 1476  ACGAGCCTGGAGAGAATATGACAAGTTGGAATATGATGTGACTGTTACCAGGGACCAGATGCAGGGTCAGCTCG  1549

Query 1496  ATCACCTTGGTGAAGTTCAGACGGAATCAGCAGGAATTCAGCGTGCACAGATTCAGAAAGAACTTTGGCGAATT  1569
            |.|.||||||.|||||.||||..||.||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.||.||.|||.|||||
Sbjct 1550  ACCGCCTTGGAGAAGTGCAGAGTGAGTCGGCAGGAATTCAACGGGCACAGATTCAAAAGGAGCTCTGGAGAATT  1623

Query 1570  CAGGATGTCATGGAAGGGCTGAGTAAACATAAGCAGCAAAGAGGTACTACAGAAA---TAGGTATGATAGGATC  1640
            ||.|||||||||||.|||.||||.|||||.||.|||||||||||..||.||||||   |||||.||..||||||
Sbjct 1624  CAAGATGTCATGGAGGGGTTGAGCAAACACAAACAGCAAAGAGGCTCTTCAGAAACAGTAGGTCTGGCAGGATC  1697

Query 1641  AAAGCCTTTCTCAACAGTTAAGTACAAAAATGAGGGTCCAGATTATAGACTCTACAAGAGTGAACCAGAGTTAA  1714
            |||||||||||||.|||||||||||||.|..||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1698  AAAGCCTTTCTCATCAGTTAAGTACAAGAGCGAGGGTCCAGATTATAGACTCTACAAGAGTGAGCCAGAGTTAA  1771

Query 1715  CAACAGTGGCAGAAGTTGATGAATCTAATGGAGAAGAAAAATCAGAACCTGTTTCAGAGATAGAAACTTCAGTT  1788
            |.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||||.||||.||.||||.
Sbjct 1772  CCACAGTGGCAGAAGTCGATGAATCTAACGGAGAAGAAAAGTCAGAGCCAGTTTCTGAGACAGAAGCTCCAGTC  1845

Query 1789  GTTAAAGGTTCCCACTTTCCTGTTGGAGTAGTCCCTCCAAGAGCAAAATCACCAACACCCGAATCTTCGACAAT  1862
            ||||||||||||||.|||||.||.||   |||.||||..|||.||||.|||||.||||||||.||.||.||.||
Sbjct 1846  GTTAAAGGTTCCCATTTTCCAGTCGG---AGTTCCTCTGAGAACAAAGTCACCCACACCCGAGTCCTCCACGAT  1916

Query 1863  AGCTTCCTATGTAACCTTGAGGAAAACTAAGAAGATGATGGATCTAAGAACGGAAAGACCAAGAAGTGCAGTGG  1936
            ||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1917  AGCTTCCTATGTGACCTTGAGGAAGACTAAGAAGATGGTGGAGCTAAGAACGGAAAGACCAAGAAGTGCCGTGG  1990

Query 1937  AACAGCTCTGTTTGGCTGAAAGTACTCGACCAAGGATGACTGTGGAAGAGCAAATGGAAAGAATAAGAAGACAT  2010
            |.|||||.|||.|||||||.|||.|||||||.||.|||||||||||||||||..|.||.||.||.||.|||||.
Sbjct 1991  AGCAGCTGTGTCTGGCTGAGAGTGCTCGACCTAGAATGACTGTGGAAGAGCAGCTAGAGAGGATCAGGAGACAC  2064

Query 2011  CAACAAGCGTGCCTGAGGGAGAAGAAAAAAGGGTTAAATGTTATCGGTGCTTCAGACCAGTCACCCTTACAAAG  2084
            ||.||.||.|||||||||||||||||.||.|||.|.|.|||..||||||||||.||                  
Sbjct 2065  CAGCAGGCCTGCCTGAGGGAGAAGAAGAAGGGGCTGAGTGTCCTCGGTGCTTCCGA------------------  2120

Query 2085  CCCTTCAAATTTAAGGGATAATCCATTTAGGACTACTCAGACTCGAAGGAGGGATGA------TAAGGAACTGG  2152
            |||.|||.|..|.|||||.|.||||.|.|||..|||||||||||.||||||||||||      ||||||.||.|
Sbjct 2121  CCCGTCAGACGTGAGGGACAGTCCACTCAGGCTTACTCAGACTCTAAGGAGGGATGATAACGTTAAGGAGCTAG  2194

Query 2153  ACACTG-CCATTAGAGAAAATGATGTAAAGCCAGACCATGAAACTCCTGCA--ACAGAAATTGT--TCAACTAA  2221
            ||||.| ||| .||||||||||||||||||||||||.|.||.|||||.|||  ||||    |||  |||.|||.
Sbjct 2195  ACACCGTCCA-CAGAGAAAATGATGTAAAGCCAGACTACGAGACTCCAGCAGCACAG----TGTGCTCACCTAG  2263

Query 2222  AAGAAACCGAACCCCAAAATGTGGACTTCAGCAAAGAGTTAAAAAAAACTGAAAACATTTCATATGAAATGCTT  2295
            ||||..|.||||||||.||||..|||.||.|||.|.||.||||||               .||.||||||||||
Sbjct 2264  AAGACGCTGAACCCCAGAATGCAGACATCGGCAGAAAGCTAAAAA---------------GATCTGAAATGCTT  2322

Query 2296  TTTGAACCTGAGCCAAATGGAGTAAATTCTGTGGAAATGATGGATAAAGAAAGAAACAAAGACAAAATGCCTGA  2369
            |....||||||.|||||||||.|...|||||.||||.|||.|||.||.||||||.|.|||||..|..|||.||.
Sbjct 2323  TACACACCTGAACCAAATGGAATGGCTTCTGAGGAAGTGACGGAGAAGGAAAGACAGAAAGAGCAGGTGCATGC  2396

Query 2370  GGATGTTACATTCAGCCCTCAAGATGAAAC-------ACAGACCGCAAATCATAAACCAGAAGAGCATCCTGAA  2436
            .||||...|||.|||||||||.||.||.||       |||||.|    ||||.|   ..||||..|..|||||.
Sbjct 2397  CGATGGGTCATGCAGCCCTCAGGAAGAGACGGCCATGACAGAGC----ATCAGA---TGGAAGGCCCCCCTGAG  2463

Query 2437  GAAAATACAAAGAACAGTGTTGACGAACAGGAAGAAACTGTTATTTCTTACGAATCAACTCCTGAGGTTTCTAG  2510
            |||   .||.||   |||.||.|.||..|||||||||||.||..|||.|..||..||.||||||||.||.||||
Sbjct 2464  GAA---GCAGAG---AGTCTTCATGAGGAGGAAGAAACTCTTGCTTCCTGTGAGCCAGCTCCTGAGATTCCTAG  2531

Query 2511  AGGA-AATCAAACAATGGCAGTGAAAAGTCTGTCCCCATCTCCTGAGTCCT---CGGCATCGCCAGTTCCATCC  2580
             ||| ||||||||.|   ||||||.||||||||||||.||||||||.||||   |||||   .|||.|||..||
Sbjct 2532  -GGAGAATCAAACCA---CAGTGAGAAGTCTGTCCCCGTCTCCTGACTCCTCCACGGCA---GCAGATCCGCCC  2598

Query 2581  ACTCAGCCGCAGCTCACAGAAGGATCACATTTCATGTGTGTG  2622
            ||||..||.|||||||..||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 2599  ACTCCTCCACAGCTCAGGGAAGGATCGCATTTCATGTGTGTG  2640