Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_12044
- Subject:
- XM_011520716.1
- Aligned Length:
- 3639
- Identities:
- 2622
- Gaps:
- 1017
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCGGCGGATCTGAACCTGGAGTGGATCTCCCTGCCCCGGTCCTGGACTTACGGGATCACCAGGGGCGGCCG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 AGTCTTCTTCATCAACGAGGAGGCCAAGAGCACCACCTGGCTGCACCCCGTCACCGGCGAGGCGGTGGTCACCG 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 GACACCGGCGGCAGAGCACAGATTTGCCTACTGGCTGGGAAGAAGCATATACTTTTGAAGGTGCAAGATACTAT 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 ATAAACCATAATGAAAGGAAAGTGACCTGCAAACATCCAGTCACAGGACAACCATCACAGGACAATTGTATTTT 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 TGTAGTGAATGAACAGACTGTTGCAACCATGACATCTGAAGAAAAGAAGGAACGGCCAATAAGTATGATAAATG 370
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 371 AAGCTTCTAACTATAACGTGACTTCAGATTATGCAGTGCATCCAATGAGCCCTGTAGGCAGAACTTCACGAGCT 444
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 445 TCAAAAAAAGTTCATAATTTTGGAAAGAGGTCAAATTCAATTAAAAGGAATCCTAATGCACCGGTTGTCAGACG 518
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 519 AGGTTGGCTTTATAAACAGGACAGTACTGGCATGAAATTGTGGAAGAAACGCTGGTTTGTGCTTTCTGACCTTT 592
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 593 GCCTCTTTTATTATAGAGATGAGAAAGAAGAGGGTATCCTGGGAAGCATACTGTTACCTAGTTTTCAGATAGCT 666
Query 1 ------------------------------------------------------------ATGCGGACCTATTA 14
||||||||||||||
Sbjct 667 TTGCTTACCTCTGAAGATCACATTAATCGCAAATATGCTTTTAAGGCAGCCCATCCAAACATGCGGACCTATTA 740
Query 15 TTTCTGCACTGATACAGGAAAGGAAATGGAGTTGTGGATGAAAGCCATGTTAGATGCTGCCCTAGTACAGACAG 88
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TTTCTGCACTGATACAGGAAAGGAAATGGAGTTGTGGATGAAAGCCATGTTAGATGCTGCCCTAGTACAGACAG 814
Query 89 AACCTGTGAAAAGAGTGGACAAGATTACATCTGAAAATGCACCAACTAAAGAAACCAATAACATTCCCAACCAT 162
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AACCTGTGAAAAGAGTGGACAAGATTACATCTGAAAATGCACCAACTAAAGAAACCAATAACATTCCCAACCAT 888
Query 163 AGAGTGCTAATTAAACCAGAGATCCAAAACAATCAAAAAAACAAGGAAATGAGCAAAATTGAAGAAAAAAAGGC 236
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AGAGTGCTAATTAAACCAGAGATCCAAAACAATCAAAAAAACAAGGAAATGAGCAAAATTGAAGAAAAAAAGGC 962
Query 237 ATTAGAAGCTGAAAAATATGGATTTCAGAAGGATGGTCAAGATAGACCCTTAACAAAAATTAATAGTGTAAAGC 310
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 ATTAGAAGCTGAAAAATATGGATTTCAGAAGGATGGTCAAGATAGACCCTTAACAAAAATTAATAGTGTAAAGC 1036
Query 311 TGAATTCTCTGCCATCTGAATATGAGAGTGGGTCAGCATGCCCTGCTCAGACTGTGCACTACAGACCAATCAAC 384
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TGAATTCTCTGCCATCTGAATATGAGAGTGGGTCAGCATGCCCTGCTCAGACTGTGCACTACAGACCAATCAAC 1110
Query 385 TTGAGCAGTTCAGAGAACAAAATAGTCAATGTTAGCCTGGCAGATCTTAGAGGTGGAAATCGCCCCAATACAGG 458
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TTGAGCAGTTCAGAGAACAAAATAGTCAATGTTAGCCTGGCAGATCTTAGAGGTGGAAATCGCCCCAATACAGG 1184
Query 459 GCCCTTATACACAGAGGCCGATCGAGTCATACAGAGAACAAATTCAATGCAGCAGTTGGAACAGTGGATTAAAA 532
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GCCCTTATACACAGAGGCCGATCGAGTCATACAGAGAACAAATTCAATGCAGCAGTTGGAACAGTGGATTAAAA 1258
Query 533 TCCAGAAGGGGAGGGGTCATGAAGAAGAAACCAGGGGAGTAATTTCTTACCAAACATTACCAAGAAATATGCCA 606
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TCCAGAAGGGGAGGGGTCATGAAGAAGAAACCAGGGGAGTAATTTCTTACCAAACATTACCAAGAAATATGCCA 1332
Query 607 AGTCACAGAGCCCAGATTATGGCCCGCTACCCTGAAGGTTATAGAACACTCCCAAGAAACAGCAAGACAAGGCC 680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 AGTCACAGAGCCCAGATTATGGCCCGCTACCCTGAAGGTTATAGAACACTCCCAAGAAACAGCAAGACAAGGCC 1406
Query 681 TGAAAGTATCTGCAGTGTAACCCCTTCCACTCATGACAAGACATTAGGACCCGGAGCGGAGGAGAAACGGAGGT 754
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TGAAAGTATCTGCAGTGTAACCCCTTCCACTCATGACAAGACATTAGGACCCGGAGCGGAGGAGAAACGGAGGT 1480
Query 755 CCATGAGAGATGACACAATGTGGCAGCTCTACGAATGGCAGCAGCGTCAGTTTTATAACAAACAGAGCACCCTC 828
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CCATGAGAGATGACACAATGTGGCAGCTCTACGAATGGCAGCAGCGTCAGTTTTATAACAAACAGAGCACCCTC 1554
Query 829 CCTCGACACAGTACTTTGAGTAGTCCCAAAACCATGGTAAATATTTCTGACCAGACAATGCACTCTATTCCCAC 902
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CCTCGACACAGTACTTTGAGTAGTCCCAAAACCATGGTAAATATTTCTGACCAGACAATGCACTCTATTCCCAC 1628
Query 903 ATCACCTTCCCACGGGTCAATAGCTGCTTATCAGGGATACTCCCCTCAACGAACTTACAGATCGGAAGTGTCTT 976
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 ATCACCTTCCCACGGGTCAATAGCTGCTTATCAGGGATACTCCCCTCAACGAACTTACAGATCGGAAGTGTCTT 1702
Query 977 CACCAATTCAGAGAGGAGATGTGACAATAGACCGCAGACACAGGGCCCATCACCCTAAGCATGTCTATGTGCCT 1050
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CACCAATTCAGAGAGGAGATGTGACAATAGACCGCAGACACAGGGCCCATCACCCTAAGCATGTCTATGTGCCT 1776
Query 1051 GACAGAAGGTCAGTGCCAGCTGGCCTGACTTTACAGTCTGTTAGTCCCCAGAGCCTCCAAGGGAAAACG----- 1119
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GACAGAAGGTCAGTGCCAGCTGGCCTGACTTTACAGTCTGTTAGTCCCCAGAGCCTCCAAGGGAAAACGCCAGA 1850
Query 1120 -------------------------------------------------------------------------- 1119
Sbjct 1851 GGAGCTTACGCTGCTGCTAATAAAGCTGAGACGGCAGCAAGCCGAACTGAGTAGTATCCGGGAGCATACGTTAG 1924
Query 1120 -------------------------------------------------------------------------- 1119
Sbjct 1925 CACAGCTCATGCAGCTAAAGCTTGAGGCCCACAGCCCAAAGAATGAAATTCTTTCACATCATCTCCAAAGGAAC 1998
Query 1120 -------------------------------------------------------------------------- 1119
Sbjct 1999 ACCATATATTTGGATCATCAGATGAAAGAAAATGAACCTATTATCACCATGGTTCACACAATGATTGAGAACTC 2072
Query 1120 ----------------------------------------------------------------CTGTCACAAG 1129
||||||||||
Sbjct 2073 GGCGCTAAGACCCCAACTGTACCAGCAATTCTTAAGACAGAAGAGCAAGATAAGTCTATATTGTCTGTCACAAG 2146
Query 1130 ATGAAGGTAGAGGCACATTATACAAATACAGACCTGAAGAAGTAGATATTGATGCCAAGTTAAGCCGATTATGT 1203
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 ATGAAGGTAGAGGCACATTATACAAATACAGACCTGAAGAAGTAGATATTGATGCCAAGTTAAGCCGATTATGT 2220
Query 1204 GAACAAGATAAAGTGGTGCATGCTCTGGAAGAGAAACTTCAGCAACTCCACAAGGAGAAATACACGCTTGAGCA 1277
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 GAACAAGATAAAGTGGTGCATGCTCTGGAAGAGAAACTTCAGCAACTCCACAAGGAGAAATACACGCTTGAGCA 2294
Query 1278 AGCTTTGCTATCAGCCAGCCAAGAGATAGAAATGCATGCAGATAACCCAGCAGCCATTCAGACAGTGGTGTTAC 1351
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 AGCTTTGCTATCAGCCAGCCAAGAGATAGAAATGCATGCAGATAACCCAGCAGCCATTCAGACAGTGGTGTTAC 2368
Query 1352 AAAGGGATGATTTACAAAATGGACTGCTTAGTACGTGTCGAGAACTTTCTCGAGCCACTGCCGAATTGGAACGA 1425
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 AAAGGGATGATTTACAAAATGGACTGCTTAGTACGTGTCGAGAACTTTCTCGAGCCACTGCCGAATTGGAACGA 2442
Query 1426 GCATGGAGAGAATATGATAAGTTAGAATACGATGTAACTGTTACCAGGAACCAGATGCAAGAGCAGCTGGATCA 1499
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 GCATGGAGAGAATATGATAAGTTAGAATACGATGTAACTGTTACCAGGAACCAGATGCAAGAGCAGCTGGATCA 2516
Query 1500 CCTTGGTGAAGTTCAGACGGAATCAGCAGGAATTCAGCGTGCACAGATTCAGAAAGAACTTTGGCGAATTCAGG 1573
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 CCTTGGTGAAGTTCAGACGGAATCAGCAGGAATTCAGCGTGCACAGATTCAGAAAGAACTTTGGCGAATTCAGG 2590
Query 1574 ATGTCATGGAAGGGCTGAGTAAACATAAGCAGCAAAGAGGTACTACAGAAATAGGTATGATAGGATCAAAGCCT 1647
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 ATGTCATGGAAGGGCTGAGTAAACATAAGCAGCAAAGAGGTACTACAGAAATAGGTATGATAGGATCAAAGCCT 2664
Query 1648 TTCTCAACAGTTAAGTACAAAAATGAGGGTCCAGATTATAGACTCTACAAGAGTGAACCAGAGTTAACAACAGT 1721
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 TTCTCAACAGTTAAGTACAAAAATGAGGGTCCAGATTATAGACTCTACAAGAGTGAACCAGAGTTAACAACAGT 2738
Query 1722 GGCAGAAGTTGATGAATCTAATGGAGAAGAAAAATCAGAACCTGTTTCAGAGATAGAAACTTCAGTTGTTAAAG 1795
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 GGCAGAAGTTGATGAATCTAATGGAGAAGAAAAATCAGAACCTGTTTCAGAGATAGAAACTTCAGTTGTTAAAG 2812
Query 1796 GTTCCCACTTTCCTGTTGGAGTAGTCCCTCCAAGAGCAAAATCACCAACACCCGAATCTTCGACAATAGCTTCC 1869
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 GTTCCCACTTTCCTGTTGGAGTAGTCCCTCCAAGAGCAAAATCACCAACACCCGAATCTTCGACAATAGCTTCC 2886
Query 1870 TATGTAACCTTGAGGAAAACTAAGAAGATGATGGATCTAAGAACGGAAAGACCAAGAAGTGCAGTGGAACAGCT 1943
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 TATGTAACCTTGAGGAAAACTAAGAAGATGATGGATCTAAGAACGGAAAGACCAAGAAGTGCAGTGGAACAGCT 2960
Query 1944 CTGTTTGGCTGAAAGTACTCGACCAAGGATGACTGTGGAAGAGCAAATGGAAAGAATAAGAAGACATCAACAAG 2017
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 CTGTTTGGCTGAAAGTACTCGACCAAGGATGACTGTGGAAGAGCAAATGGAAAGAATAAGAAGACATCAACAAG 3034
Query 2018 CGTGCCTGAGGGAGAAGAAAAAAGGGTTAAATGTTATCGGTGCTTCAGACCAGTCACCCTTACAAAGCCCTTCA 2091
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035 CGTGCCTGAGGGAGAAGAAAAAAGGGTTAAATGTTATCGGTGCTTCAGACCAGTCACCCTTACAAAGCCCTTCA 3108
Query 2092 AATTTAAGGGATAATCCATTTAGGACTACTCAGACTCGAAGGAGGGATGATAAGGAACTGGACACTGCCATTAG 2165
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109 AATTTAAGGGATAATCCATTTAGGACTACTCAGACTCGAAGGAGGGATGATAAGGAACTGGACACTGCCATTAG 3182
Query 2166 AGAAAATGATGTAAAGCCAGACCATGAAACTCCTGCAACAGAAATTGTTCAACTAAAAGAAACCGAACCCCAAA 2239
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183 AGAAAATGATGTAAAGCCAGACCATGAAACTCCTGCAACAGAAATTGTTCAACTAAAAGAAACCGAACCCCAAA 3256
Query 2240 ATGTGGACTTCAGCAAAGAGTTAAAAAAAACTGAAAACATTTCATATGAAATGCTTTTTGAACCTGAGCCAAAT 2313
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257 ATGTGGACTTCAGCAAAGAGTTAAAAAAAACTGAAAACATTTCATATGAAATGCTTTTTGAACCTGAGCCAAAT 3330
Query 2314 GGAGTAAATTCTGTGGAAATGATGGATAAAGAAAGAAACAAAGACAAAATGCCTGAGGATGTTACATTCAGCCC 2387
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3331 GGAGTAAATTCTGTGGAAATGATGGATAAAGAAAGAAACAAAGACAAAATGCCTGAGGATGTTACATTCAGCCC 3404
Query 2388 TCAAGATGAAACACAGACCGCAAATCATAAACCAGAAGAGCATCCTGAAGAAAATACAAAGAACAGTGTTGACG 2461
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3405 TCAAGATGAAACACAGACCGCAAATCATAAACCAGAAGAGCATCCTGAAGAAAATACAAAGAACAGTGTTGACG 3478
Query 2462 AACAGGAAGAAACTGTTATTTCTTACGAATCAACTCCTGAGGTTTCTAGAGGAAATCAAACAATGGCAGTGAAA 2535
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3479 AACAGGAAGAAACTGTTATTTCTTACGAATCAACTCCTGAGGTTTCTAGAGGAAATCAAACAATGGCAGTGAAA 3552
Query 2536 AGTCTGTCCCCATCTCCTGAGTCCTCGGCATCGCCAGTTCCATCCACTCAGCCGCAGCTCACAGAAGGATCACA 2609
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3553 AGTCTGTCCCCATCTCCTGAGTCCTCGGCATCGCCAGTTCCATCCACTCAGCCGCAGCTCACAGAAGGATCACA 3626
Query 2610 TTTCATGTGTGTG 2622
|||||||||||||
Sbjct 3627 TTTCATGTGTGTG 3639
