Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_12044
- Subject:
- XM_017019495.1
- Aligned Length:
- 3828
- Identities:
- 2607
- Gaps:
- 1221
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCGGCGGATCTGAACCTGGAGTGGATCTCCCTGCCCCGGTCCTGGACTTACGGGATCACCAGGGGCGGCCG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 AGTCTTCTTCATCAACGAGGAGGCCAAGAGCACCACCTGGCTGCACCCCGTCACCGGCGAGGCGGTGGTCACCG 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 GACACCGGCGGCAGAGCACAGATTTGCCTACTGGCTGGGAAGAAGCATATACTTTTGAAGGTGCAAGATACTAT 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 ATAAACCATAATGAAAGGAAAGTGACCTGCAAACATCCAGTCACAGGACAACCATCACAGGACAATTGTATTTT 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 TGTAGTGAATGAACAGACTGTTGCAACCATGACATCTGAAGAAAAGAAGGAACGGCCAATAAGTATGATAAATG 370
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 371 AAGCTTCTAACTATAACGTGACTTCAGATTATGCAGTGCATCCAATGAGCCCTGTAGGCAGAACTTCACGAGCT 444
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 445 TCAAAAAAAGTTCATAATTTTGGAAAGAGGTCAAATTCAATTAAAAGGAATCCTAATGCACCGGTTGTCAGACG 518
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 519 AGGTTGGCTTTATAAACAGGACAGTACTGGCATGAAATTGTGGAAGAAACGCTGGTTTGTGCTTTCTGACCTTT 592
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 593 GCCTCTTTTATTATAGAGATGAGAAAGAAGAGGGTATCCTGGGAAGCATACTGTTACCTAGTTTTCAGATAGCT 666
Query 1 ------------------------------------------------------------ATGCGGACCTATTA 14
||||||||||||||
Sbjct 667 TTGCTTACCTCTGAAGATCACATTAATCGCAAATATGCTTTTAAGGCAGCCCATCCAAACATGCGGACCTATTA 740
Query 15 TTTCTGCACTGATACAGGAAAGGAAATGGAGTTGTGGATGAAAGCCATGTTAGATGCTGCCCTAGTACAGACAG 88
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TTTCTGCACTGATACAGGAAAGGAAATGGAGTTGTGGATGAAAGCCATGTTAGATGCTGCCCTAGTACAGACAG 814
Query 89 AACCTGTGAAAAGAGTGGACAAGATTACATCTGAAAATGCACCAACTAAAGAAACCAATAACATTCCCAACCAT 162
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AACCTGTGAAAAGAGTGGACAAGATTACATCTGAAAATGCACCAACTAAAGAAACCAATAACATTCCCAACCAT 888
Query 163 AGAGTGCTAATTAAACCAGAGATCCAAAACAATCAAAAAAACAAGGAAATGAGCAAAATTGAAGAAAAAAAGGC 236
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AGAGTGCTAATTAAACCAGAGATCCAAAACAATCAAAAAAACAAGGAAATGAGCAAAATTGAAGAAAAAAAGGC 962
Query 237 ATTAGAAGCTGAAAAATATGGATTTCAGAAGGATGGTCAAGATAGACCCTTAACAAAAATTAATAGTGTAAAGC 310
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 ATTAGAAGCTGAAAAATATGGATTTCAGAAGGATGGTCAAGATAGACCCTTAACAAAAATTAATAGTGTAAAGC 1036
Query 311 TGAATTCTCTGCCATCTGAATATGAGAGTGGGTCAGCATGCCCTGCTCAGACTGTGCACTACAGACCAATCAAC 384
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TGAATTCTCTGCCATCTGAATATGAGAGTGGGTCAGCATGCCCTGCTCAGACTGTGCACTACAGACCAATCAAC 1110
Query 385 TTGAGCAGTTCAGAGAACAAAATAGTCAATGTTAGCCTGGCAGATCTTAGAGGTGGAAATCGCCCCAATACAGG 458
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TTGAGCAGTTCAGAGAACAAAATAGTCAATGTTAGCCTGGCAGATCTTAGAGGTGGAAATCGCCCCAATACAGG 1184
Query 459 GCCCTTATACACAGAGGCCGATCGAGTCATACAGAGAACAAATTCAATGCAGCAGTTGGAACAGTGGATTAAAA 532
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GCCCTTATACACAGAGGCCGATCGAGTCATACAGAGAACAAATTCAATGCAGCAGTTGGAACAGTGGATTAAAA 1258
Query 533 TCCAGAAGGGGAGGGGTCATGAAGAAGAAACCAGGGGAGTAATTTCTTACCAAACATTACCAAGAAATATGCCA 606
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TCCAGAAGGGGAGGGGTCATGAAGAAGAAACCAGGGGAGTAATTTCTTACCAAACATTACCAAGAAATATGCCA 1332
Query 607 AGTCACAGAGCCCAGATTATGGCCCGCTACCCTGAAGGTTATAGAACACTCCCAAGAAACAGCAAGACAAGGCC 680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 AGTCACAGAGCCCAGATTATGGCCCGCTACCCTGAAGGTTATAGAACACTCCCAAGAAACAGCAAGACAAGGCC 1406
Query 681 TGAAAGTATCTGCAGTGTAACCCCTTCCACTCATGACAAGACATTAGGACCCGGAGCGGAGGAGAAACGGAGGT 754
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TGAAAGTATCTGCAGTGTAACCCCTTCCACTCATGACAAGACATTAGGACCCGGAGCGGAGGAGAAACGGAGGT 1480
Query 755 CCATGAGAGATGACACAATGTGGCAGCTCTACGAATGGCAGCAGCGTCAGTTTTATAACAAACAGAGCACCCTC 828
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CCATGAGAGATGACACAATGTGGCAGCTCTACGAATGGCAGCAGCGTCAGTTTTATAACAAACAGAGCACCCTC 1554
Query 829 CCTCGACACAGTACTTTGAGTAGTCCCAAAACCATGGTAAATATTTCTGACCAGACAATGCACTCTATTCCCAC 902
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CCTCGACACAGTACTTTGAGTAGTCCCAAAACCATGGTAAATATTTCTGACCAGACAATGCACTCTATTCCCAC 1628
Query 903 ATCACCTTCCCACGGGTCAATAGCTGCTTATCAGGGATACTCCCCTCAACGAACTTACAGATCGGAAGTGTCTT 976
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 ATCACCTTCCCACGGGTCAATAGCTGCTTATCAGGGATACTCCCCTCAACGAACTTACAGATCGGAAGTGTCTT 1702
Query 977 CACCAATTCAGAGAGGAGATGTGACAATAGACCGCAGACACAGGGCCCATCACCCTAAGCATGTCTATGTGCCT 1050
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CACCAATTCAGAGAGGAGATGTGACAATAGACCGCAGACACAGGGCCCATCACCCTAAGCATGTCTATGTGCCT 1776
Query 1051 GACAGAAGGTCAGTGCCAGCTGGCCTGACTTTACAGTCTGTTAGTCCCCAGAGCCTCCAAGGGAAAACG----- 1119
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GACAGAAGGTCAGTGCCAGCTGGCCTGACTTTACAGTCTGTTAGTCCCCAGAGCCTCCAAGGGAAAACGCCAGA 1850
Query 1120 -------------------------------------------------------------------------- 1119
Sbjct 1851 GGAGCTTACGCTGCTGCTAATAAAGCTGAGACGGCAGCAAGCCGAACTGAGTAGTATCCGGGAGCATACGTTAG 1924
Query 1120 -------------------------------------------------------------------------- 1119
Sbjct 1925 CACAGCTCATGCAGCTAAAGCTTGAGGCCCACAGCCCAAAGAATGAAATTCTTTCACATCATCTCCAAAGGAAC 1998
Query 1120 -------------------------------------------------------------------------- 1119
Sbjct 1999 ACCATATATTTGGATCATCAGATGAAAGAAAATGAACCTATTATCACCATGGTTCACACAATGATTGAGAACTC 2072
Query 1120 ----------------------------------------------------------------CTGTCACAAG 1129
||||||||||
Sbjct 2073 GGCGCTAAGACCCCAACTGTACCAGCAATTCTTAAGACAGAAGAGCAAGATAAGTCTATATTGTCTGTCACAAG 2146
Query 1130 ATGAAGGTAGAGGCACATTATACAAATACAGACCTGAAGAAGTAGATATTGATGCCAAGTTAAGCCGATTATGT 1203
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 ATGAAGGTAGAGGCACATTATACAAATACAGACCTGAAGAAGTAGATATTGATGCCAAGTTAAGCCGATTATGT 2220
Query 1204 GAACAAGATAAAGTGGTGCATGCTCTGGAAGAGAAACTTCAGCAACTCCACAAGGAGAAATACACGCTTGAGCA 1277
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 GAACAAGATAAAGTGGTGCATGCTCTGGAAGAGAAACTTCAGCAACTCCACAAGGAGAAATACACGCTTGAGCA 2294
Query 1278 AGCTTTGCTATCAGCCAGCCAAGAGATAGAAATGCATGCAGATAACCCAGCAGCCATTCAGACAGTGGTGTTAC 1351
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 AGCTTTGCTATCAGCCAGCCAAGAGATAGAAATGCATGCAGATAACCCAGCAGCCATTCAGACAGTGGTGTTAC 2368
Query 1352 AAAGGGATGATTTACAAAATGGACTGCTTAGTACGTGTCGAGAACTTTCTCGAGCCACTGCCGAATTGGAACGA 1425
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 AAAGGGATGATTTACAAAATGGACTGCTTAGTACGTGTCGAGAACTTTCTCGAGCCACTGCCGAATTGGAACGA 2442
Query 1426 GCATGGAGAGAATATGATAAGTTAGAATACGATGTAACTGTTACCAGGAACCAGATGCAAGAGCAGCTGGATCA 1499
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 GCATGGAGAGAATATGATAAGTTAGAATACGATGTAACTGTTACCAGGAACCAGATGCAAGAGCAGCTGGATCA 2516
Query 1500 CCTTGGTGAAGTTCAGACGGAATCAGCAGGAATTCAGCGTGCACAGATTCAGAAAGAACTTTGGCGAATTCAGG 1573
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 CCTTGGTGAAGTTCAGACGGAATCAGCAGGAATTCAGCGTGCACAGATTCAGAAAGAACTTTGGCGAATTCAGG 2590
Query 1574 ATGTCATGGAAGGGCTGAGTAAACATAAGCAGCAAAGAGGTACTACAGAAATAGGTATGATAGGATCAAAGCCT 1647
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 ATGTCATGGAAGGGCTGAGTAAACATAAGCAGCAAAG---------------AGGTATGATAGGATCAAAGCCT 2649
Query 1648 TTCTCAACAGTTAAGTACAAAAATGAG----------------------------------------------- 1674
|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2650 TTCTCAACAGTTAAGTACAAAAATGAGGAAGAGGAAGTAGTCCCACCTCGTCCTCCACTTCCTCGGTCCTATGA 2723
Query 1675 -------------------------------------------------------------------------- 1674
Sbjct 2724 CTTTACAGAGCAGCCTCCCATAATCCCCCCTCTGCCCAGTGATAGCAGCTCCTTGCTCTGTTATAGCAGGGGCC 2797
Query 1675 --------------------------------------------------------------------GGTCCA 1680
||||||
Sbjct 2798 CAGTTCATCTGCCTGAAGAAAAGAAGATGTATCAAGTTCAAGGATATCCAAGAAATGGATCTCACTGTGGTCCA 2871
Query 1681 GATTATAGACTCTACAAGAGTGAACCAGAGTTAACAACAGTGGCAGAAGTTGATGAATCTAATGGAGAAGAAAA 1754
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2872 GATTATAGACTCTACAAGAGTGAACCAGAGTTAACAACAGTGGCAGAAGTTGATGAATCTAATGGAGAAGAAAA 2945
Query 1755 ATCAGAACCTGTTTCAGAGATAGAAACTTCAGTTGTTAAAGGTTCCCACTTTCCTGTTGGAGTAGTCCCTCCAA 1828
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2946 ATCAGAACCTGTTTCAGAGATAGAAACTTCAGTTGTTAAAGGTTCCCACTTTCCTGTTGGAGTAGTCCCTCCAA 3019
Query 1829 GAGCAAAATCACCAACACCCGAATCTTCGACAATAGCTTCCTATGTAACCTTGAGGAAAACTAAGAAGATGATG 1902
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3020 GAGCAAAATCACCAACACCCGAATCTTCGACAATAGCTTCCTATGTAACCTTGAGGAAAACTAAGAAGATGATG 3093
Query 1903 GATCTAAGAACGGAAAGACCAAGAAGTGCAGTGGAACAGCTCTGTTTGGCTGAAAGTACTCGACCAAGGATGAC 1976
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3094 GATCTAAGAACGGAAAGACCAAGAAGTGCAGTGGAACAGCTCTGTTTGGCTGAAAGTACTCGACCAAGGATGAC 3167
Query 1977 TGTGGAAGAGCAAATGGAAAGAATAAGAAGACATCAACAAGCGTGCCTGAGGGAGAAGAAAAAAGGGTTAAATG 2050
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3168 TGTGGAAGAGCAAATGGAAAGAATAAGAAGACATCAACAAGCGTGCCTGAGGGAGAAGAAAAAAGGGTTAAATG 3241
Query 2051 TTATCGGTGCTTCAGACCAGTCACCCTTACAAAGCCCTTCAAATTTAAGGGATAATCCATTTAGGACTACTCAG 2124
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3242 TTATCGGTGCTTCAGACCAGTCACCCTTACAAAGCCCTTCAAATTTAAGGGATAATCCATTTAGGACTACTCAG 3315
Query 2125 ACTCGAAGGAGGGATGATAAGGAACTGGACACTGCCATTAGAGAAAATGATGTAAAGCCAGACCATGAAACTCC 2198
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3316 ACTCGAAGGAGGGATGATAAGGAACTGGACACTGCCATTAGAGAAAATGATGTAAAGCCAGACCATGAAACTCC 3389
Query 2199 TGCAACAGAAATTGTTCAACTAAAAGAAACCGAACCCCAAAATGTGGACTTCAGCAAAGAGTTAAAAAAAACTG 2272
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3390 TGCAACAGAAATTGTTCAACTAAAAGAAACCGAACCCCAAAATGTGGACTTCAGCAAAGAGTTAAAAAAAACTG 3463
Query 2273 AAAACATTTCATATGAAATGCTTTTTGAACCTGAGCCAAATGGAGTAAATTCTGTGGAAATGATGGATAAAGAA 2346
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3464 AAAACATTTCATATGAAATGCTTTTTGAACCTGAGCCAAATGGAGTAAATTCTGTGGAAATGATGGATAAAGAA 3537
Query 2347 AGAAACAAAGACAAAATGCCTGAGGATGTTACATTCAGCCCTCAAGATGAAACACAGACCGCAAATCATAAACC 2420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3538 AGAAACAAAGACAAAATGCCTGAGGATGTTACATTCAGCCCTCAAGATGAAACACAGACCGCAAATCATAAACC 3611
Query 2421 AGAAGAGCATCCTGAAGAAAATACAAAGAACAGTGTTGACGAACAGGAAGAAACTGTTATTTCTTACGAATCAA 2494
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3612 AGAAGAGCATCCTGAAGAAAATACAAAGAACAGTGTTGACGAACAGGAAGAAACTGTTATTTCTTACGAATCAA 3685
Query 2495 CTCCTGAGGTTTCTAGAGGAAATCAAACAATGGCAGTGAAAAGTCTGTCCCCATCTCCTGAGTCCTCGGCATCG 2568
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3686 CTCCTGAGGTTTCTAGAGGAAATCAAACAATGGCAGTGAAAAGTCTGTCCCCATCTCCTGAGTCCTCGGCATCG 3759
Query 2569 CCAGTTCCATCCACTCAGCCGCAGCTCACAGAAGGATCACATTTCATGTGTGTG 2622
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3760 CCAGTTCCATCCACTCAGCCGCAGCTCACAGAAGGATCACATTTCATGTGTGTG 3813
