Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12044
• Subject: XM_017019497.1
• Aligned Length: 3504
• Identities: 2622
• Gaps: 882

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGACATCTGAAGAAAAGAAGGAACGGCCAATAAGTATGATAAATGAAGCTTCTAACTATAACGTGACTTCAGA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  TTATGCAGTGCATCCAATGAGCCCTGTAGGCAGAACTTCACGAGCTTCAAAAAAAGTTCATAATTTTGGAAAGA  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  GGTCAAATTCAATTAAAAGGAATCCTAATGCACCGGTTGTCAGACGAGGTTGGCTTTATAAACAGGACAGTACT  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  GGCATGAAATTGTGGAAGAAACGCTGGTTTGTGCTTTCTGACCTTTGCCTCTTTTATTATAGAGATGAGAAAGA  296

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  297  AGAGGGTATCCTGGGAAGCATACTGTTACCTAGTTTTCAGATAGCTTTGCTTACCTCTGAAGATCACATTAATC  370

Query    1  --------------------------------ATGCGGACCTATTATTTCTGCACTGATACAGGAAAGGAAATG  42
                                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCAAATATGCTTTTAAGGCAGCCCATCCAAACATGCGGACCTATTATTTCTGCACTGATACAGGAAAGGAAATG  444

Query   43  GAGTTGTGGATGAAAGCCATGTTAGATGCTGCCCTAGTACAGACAGAACCTGTGAAAAGAGTGGACAAGATTAC  116
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAGTTGTGGATGAAAGCCATGTTAGATGCTGCCCTAGTACAGACAGAACCTGTGAAAAGAGTGGACAAGATTAC  518

Query  117  ATCTGAAAATGCACCAACTAAAGAAACCAATAACATTCCCAACCATAGAGTGCTAATTAAACCAGAGATCCAAA  190
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ATCTGAAAATGCACCAACTAAAGAAACCAATAACATTCCCAACCATAGAGTGCTAATTAAACCAGAGATCCAAA  592

Query  191  ACAATCAAAAAAACAAGGAAATGAGCAAAATTGAAGAAAAAAAGGCATTAGAAGCTGAAAAATATGGATTTCAG  264
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACAATCAAAAAAACAAGGAAATGAGCAAAATTGAAGAAAAAAAGGCATTAGAAGCTGAAAAATATGGATTTCAG  666

Query  265  AAGGATGGTCAAGATAGACCCTTAACAAAAATTAATAGTGTAAAGCTGAATTCTCTGCCATCTGAATATGAGAG  338
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAGGATGGTCAAGATAGACCCTTAACAAAAATTAATAGTGTAAAGCTGAATTCTCTGCCATCTGAATATGAGAG  740

Query  339  TGGGTCAGCATGCCCTGCTCAGACTGTGCACTACAGACCAATCAACTTGAGCAGTTCAGAGAACAAAATAGTCA  412
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGGGTCAGCATGCCCTGCTCAGACTGTGCACTACAGACCAATCAACTTGAGCAGTTCAGAGAACAAAATAGTCA  814

Query  413  ATGTTAGCCTGGCAGATCTTAGAGGTGGAAATCGCCCCAATACAGGGCCCTTATACACAGAGGCCGATCGAGTC  486
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATGTTAGCCTGGCAGATCTTAGAGGTGGAAATCGCCCCAATACAGGGCCCTTATACACAGAGGCCGATCGAGTC  888

Query  487  ATACAGAGAACAAATTCAATGCAGCAGTTGGAACAGTGGATTAAAATCCAGAAGGGGAGGGGTCATGAAGAAGA  560
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATACAGAGAACAAATTCAATGCAGCAGTTGGAACAGTGGATTAAAATCCAGAAGGGGAGGGGTCATGAAGAAGA  962

Query  561  AACCAGGGGAGTAATTTCTTACCAAACATTACCAAGAAATATGCCAAGTCACAGAGCCCAGATTATGGCCCGCT  634
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AACCAGGGGAGTAATTTCTTACCAAACATTACCAAGAAATATGCCAAGTCACAGAGCCCAGATTATGGCCCGCT  1036

Query  635  ACCCTGAAGGTTATAGAACACTCCCAAGAAACAGCAAGACAAGGCCTGAAAGTATCTGCAGTGTAACCCCTTCC  708
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACCCTGAAGGTTATAGAACACTCCCAAGAAACAGCAAGACAAGGCCTGAAAGTATCTGCAGTGTAACCCCTTCC  1110

Query  709  ACTCATGACAAGACATTAGGACCCGGAGCGGAGGAGAAACGGAGGTCCATGAGAGATGACACAATGTGGCAGCT  782
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ACTCATGACAAGACATTAGGACCCGGAGCGGAGGAGAAACGGAGGTCCATGAGAGATGACACAATGTGGCAGCT  1184

Query  783  CTACGAATGGCAGCAGCGTCAGTTTTATAACAAACAGAGCACCCTCCCTCGACACAGTACTTTGAGTAGTCCCA  856
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CTACGAATGGCAGCAGCGTCAGTTTTATAACAAACAGAGCACCCTCCCTCGACACAGTACTTTGAGTAGTCCCA  1258

Query  857  AAACCATGGTAAATATTTCTGACCAGACAATGCACTCTATTCCCACATCACCTTCCCACGGGTCAATAGCTGCT  930
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AAACCATGGTAAATATTTCTGACCAGACAATGCACTCTATTCCCACATCACCTTCCCACGGGTCAATAGCTGCT  1332

Query  931  TATCAGGGATACTCCCCTCAACGAACTTACAGATCGGAAGTGTCTTCACCAATTCAGAGAGGAGATGTGACAAT  1004
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TATCAGGGATACTCCCCTCAACGAACTTACAGATCGGAAGTGTCTTCACCAATTCAGAGAGGAGATGTGACAAT  1406

Query 1005  AGACCGCAGACACAGGGCCCATCACCCTAAGCATGTCTATGTGCCTGACAGAAGGTCAGTGCCAGCTGGCCTGA  1078
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AGACCGCAGACACAGGGCCCATCACCCTAAGCATGTCTATGTGCCTGACAGAAGGTCAGTGCCAGCTGGCCTGA  1480

Query 1079  CTTTACAGTCTGTTAGTCCCCAGAGCCTCCAAGGGAAAACG---------------------------------  1119
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                 
Sbjct 1481  CTTTACAGTCTGTTAGTCCCCAGAGCCTCCAAGGGAAAACGCCAGAGGAGCTTACGCTGCTGCTAATAAAGCTG  1554

Query 1120  --------------------------------------------------------------------------  1119
                                                                                      
Sbjct 1555  AGACGGCAGCAAGCCGAACTGAGTAGTATCCGGGAGCATACGTTAGCACAGCTCATGCAGCTAAAGCTTGAGGC  1628

Query 1120  --------------------------------------------------------------------------  1119
                                                                                      
Sbjct 1629  CCACAGCCCAAAGAATGAAATTCTTTCACATCATCTCCAAAGGAACACCATATATTTGGATCATCAGATGAAAG  1702

Query 1120  --------------------------------------------------------------------------  1119
                                                                                      
Sbjct 1703  AAAATGAACCTATTATCACCATGGTTCACACAATGATTGAGAACTCGGCGCTAAGACCCCAACTGTACCAGCAA  1776

Query 1120  ------------------------------------CTGTCACAAGATGAAGGTAGAGGCACATTATACAAATA  1157
                                                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TTCTTAAGACAGAAGAGCAAGATAAGTCTATATTGTCTGTCACAAGATGAAGGTAGAGGCACATTATACAAATA  1850

Query 1158  CAGACCTGAAGAAGTAGATATTGATGCCAAGTTAAGCCGATTATGTGAACAAGATAAAGTGGTGCATGCTCTGG  1231
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CAGACCTGAAGAAGTAGATATTGATGCCAAGTTAAGCCGATTATGTGAACAAGATAAAGTGGTGCATGCTCTGG  1924

Query 1232  AAGAGAAACTTCAGCAACTCCACAAGGAGAAATACACGCTTGAGCAAGCTTTGCTATCAGCCAGCCAAGAGATA  1305
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  AAGAGAAACTTCAGCAACTCCACAAGGAGAAATACACGCTTGAGCAAGCTTTGCTATCAGCCAGCCAAGAGATA  1998

Query 1306  GAAATGCATGCAGATAACCCAGCAGCCATTCAGACAGTGGTGTTACAAAGGGATGATTTACAAAATGGACTGCT  1379
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GAAATGCATGCAGATAACCCAGCAGCCATTCAGACAGTGGTGTTACAAAGGGATGATTTACAAAATGGACTGCT  2072

Query 1380  TAGTACGTGTCGAGAACTTTCTCGAGCCACTGCCGAATTGGAACGAGCATGGAGAGAATATGATAAGTTAGAAT  1453
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  TAGTACGTGTCGAGAACTTTCTCGAGCCACTGCCGAATTGGAACGAGCATGGAGAGAATATGATAAGTTAGAAT  2146

Query 1454  ACGATGTAACTGTTACCAGGAACCAGATGCAAGAGCAGCTGGATCACCTTGGTGAAGTTCAGACGGAATCAGCA  1527
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  ACGATGTAACTGTTACCAGGAACCAGATGCAAGAGCAGCTGGATCACCTTGGTGAAGTTCAGACGGAATCAGCA  2220

Query 1528  GGAATTCAGCGTGCACAGATTCAGAAAGAACTTTGGCGAATTCAGGATGTCATGGAAGGGCTGAGTAAACATAA  1601
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  GGAATTCAGCGTGCACAGATTCAGAAAGAACTTTGGCGAATTCAGGATGTCATGGAAGGGCTGAGTAAACATAA  2294

Query 1602  GCAGCAAAGAGGTACTACAGAAATAGGTATGATAGGATCAAAGCCTTTCTCAACAGTTAAGTACAAAAATGAG-  1674
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct 2295  GCAGCAAAGAGGTACTACAGAAATAGGTATGATAGGATCAAAGCCTTTCTCAACAGTTAAGTACAAAAATGAGG  2368

Query 1675  --------------------------------------------------------------------------  1674
                                                                                      
Sbjct 2369  AAGAGGAAGTAGTCCCACCTCGTCCTCCACTTCCTCGGTCCTATGACTTTACAGAGCAGCCTCCCATAATCCCC  2442

Query 1675  --------------------------------------------------------------------------  1674
                                                                                      
Sbjct 2443  CCTCTGCCCAGTGATAGCAGCTCCTTGCTCTGTTATAGCAGGGGCCCAGTTCATCTGCCTGAAGAAAAGAAGAT  2516

Query 1675  ----------------------------------------GGTCCAGATTATAGACTCTACAAGAGTGAACCAG  1708
                                                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  GTATCAAGTTCAAGGATATCCAAGAAATGGATCTCACTGTGGTCCAGATTATAGACTCTACAAGAGTGAACCAG  2590

Query 1709  AGTTAACAACAGTGGCAGAAGTTGATGAATCTAATGGAGAAGAAAAATCAGAACCTGTTTCAGAGATAGAAACT  1782
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  AGTTAACAACAGTGGCAGAAGTTGATGAATCTAATGGAGAAGAAAAATCAGAACCTGTTTCAGAGATAGAAACT  2664

Query 1783  TCAGTTGTTAAAGGTTCCCACTTTCCTGTTGGAGTAGTCCCTCCAAGAGCAAAATCACCAACACCCGAATCTTC  1856
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  TCAGTTGTTAAAGGTTCCCACTTTCCTGTTGGAGTAGTCCCTCCAAGAGCAAAATCACCAACACCCGAATCTTC  2738

Query 1857  GACAATAGCTTCCTATGTAACCTTGAGGAAAACTAAGAAGATGATGGATCTAAGAACGGAAAGACCAAGAAGTG  1930
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  GACAATAGCTTCCTATGTAACCTTGAGGAAAACTAAGAAGATGATGGATCTAAGAACGGAAAGACCAAGAAGTG  2812

Query 1931  CAGTGGAACAGCTCTGTTTGGCTGAAAGTACTCGACCAAGGATGACTGTGGAAGAGCAAATGGAAAGAATAAGA  2004
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  CAGTGGAACAGCTCTGTTTGGCTGAAAGTACTCGACCAAGGATGACTGTGGAAGAGCAAATGGAAAGAATAAGA  2886

Query 2005  AGACATCAACAAGCGTGCCTGAGGGAGAAGAAAAAAGGGTTAAATGTTATCGGTGCTTCAGACCAGTCACCCTT  2078
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  AGACATCAACAAGCGTGCCTGAGGGAGAAGAAAAAAGGGTTAAATGTTATCGGTGCTTCAGACCAGTCACCCTT  2960

Query 2079  ACAAAGCCCTTCAAATTTAAGGGATAATCCATTTAGGACTACTCAGACTCGAAGGAGGGATGATAAGGAACTGG  2152
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961  ACAAAGCCCTTCAAATTTAAGGGATAATCCATTTAGGACTACTCAGACTCGAAGGAGGGATGATAAGGAACTGG  3034

Query 2153  ACACTGCCATTAGAGAAAATGATGTAAAGCCAGACCATGAAACTCCTGCAACAGAAATTGTTCAACTAAAAGAA  2226
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035  ACACTGCCATTAGAGAAAATGATGTAAAGCCAGACCATGAAACTCCTGCAACAGAAATTGTTCAACTAAAAGAA  3108

Query 2227  ACCGAACCCCAAAATGTGGACTTCAGCAAAGAGTTAAAAAAAACTGAAAACATTTCATATGAAATGCTTTTTGA  2300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109  ACCGAACCCCAAAATGTGGACTTCAGCAAAGAGTTAAAAAAAACTGAAAACATTTCATATGAAATGCTTTTTGA  3182

Query 2301  ACCTGAGCCAAATGGAGTAAATTCTGTGGAAATGATGGATAAAGAAAGAAACAAAGACAAAATGCCTGAGGATG  2374
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183  ACCTGAGCCAAATGGAGTAAATTCTGTGGAAATGATGGATAAAGAAAGAAACAAAGACAAAATGCCTGAGGATG  3256

Query 2375  TTACATTCAGCCCTCAAGATGAAACACAGACCGCAAATCATAAACCAGAAGAGCATCCTGAAGAAAATACAAAG  2448
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257  TTACATTCAGCCCTCAAGATGAAACACAGACCGCAAATCATAAACCAGAAGAGCATCCTGAAGAAAATACAAAG  3330

Query 2449  AACAGTGTTGACGAACAGGAAGAAACTGTTATTTCTTACGAATCAACTCCTGAGGTTTCTAGAGGAAATCAAAC  2522
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3331  AACAGTGTTGACGAACAGGAAGAAACTGTTATTTCTTACGAATCAACTCCTGAGGTTTCTAGAGGAAATCAAAC  3404

Query 2523  AATGGCAGTGAAAAGTCTGTCCCCATCTCCTGAGTCCTCGGCATCGCCAGTTCCATCCACTCAGCCGCAGCTCA  2596
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3405  AATGGCAGTGAAAAGTCTGTCCCCATCTCCTGAGTCCTCGGCATCGCCAGTTCCATCCACTCAGCCGCAGCTCA  3478

Query 2597  CAGAAGGATCACATTTCATGTGTGTG  2622
            ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3479  CAGAAGGATCACATTTCATGTGTGTG  3504