Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_12052
- Subject:
- NM_019045.5
- Aligned Length:
- 2739
- Identities:
- 1866
- Gaps:
- 870
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCGTCGGAAAGCGACACCGAGGAATTCTATGATGCCCCTGAAGATGTGCACCTAGGGGGCGGCTACCCCGT 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GGGGTCTCCAGGAAAAGTTGGGCTTTCAACATTCAAGGAAACAGAGAACACTGCATACAAAGTTGGAAATGAGT 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 CCCCTGTACAAGAATTGAAACAAGATGTGTCTAAAAAGATTATTGAAAGTATTATTGAGGAGAGTCAGAAAGTA 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 CTACAGCTTGAAGATGACTCTTTGGATTCCAAAGGAAAAGAACTCTCTGATCAAGCTACTGCCAGTCCTATTGT 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 GGCTAGAACAGATCTGAGCAATATACCCGGACTGTTAGCCATAGATCAAGTACTACCGGAAGAATCCCAAAAGG 370
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 371 CAGAGAGTCAGAATACATTTGAAGAGACTGAATTAGAATTAAAAAAATGCTTTCCTTCTGATGAAACCTGTGAG 444
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 445 AAACCAGTAGATGAAACCACGAAGTTAACTCAAACAAGTTCAACTGAGCAGCTTAATGTGCTTGAAACTGAAAC 518
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 519 AGAAGTATTGAACAAGGAAGCAGTGGAAGTCAAAGGAGGTGGTGATGTTTTAGAGCCTGTGTCCTCAGACTCCT 592
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 593 TATCTACTAAAGATTTTGCCGCTGTGGAAGAAGTGGCCCCTGCCAAACCCCCAAGACACCTTACTCCAGAGCCT 666
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 667 GATATAGTGGCTAGTACAAAGAAGCCTGTTCCAGCACGCCCACCTCCTCCAACTAATTTCCCACCTCCTAGACC 740
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 741 CCCACCTCCTTCTCGACCTGCTCCACCACCAAGAAAAAGGAAAAGCGAATTGGAATTTGAGACTCTGAAAACTC 814
Query 1 --------------------------------------------------------ATGGCTTCAGAAAGTGCG 18
|||||||||||||||.||
Sbjct 815 CTGATATAGATGTTCCCAAAGAGAATATTACGTCTGATTCTCTCCTAACCGCAAGCATGGCTTCAGAAAGTACG 888
Query 19 GTTAAGGATTCTCAGCCTTCTCTTGATTTGGCAAGTGCTACCAGTGGAGATAAAATAGTTACCGCCCAGGAAAA 92
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GTTAAGGATTCTCAGCCTTCTCTTGATTTGGCAAGTGCTACCAGTGGAGATAAAATAGTTACCGCCCAGGAAAA 962
Query 93 TGGAAAAGCACCTGATGGGCAGACTGTAGCAGGTGAAGTGATGGGCCCTCAGAGACCTAGATCCAACTCTGGGA 166
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TGGAAAAGCACCTGATGGGCAGACTGTAGCAGGTGAAGTGATGGGCCCTCAGAGACCTAGATCCAACTCTGGGA 1036
Query 167 GAGAGCTTACTGATGAGGAAATTTTAGCCAGTGTAATGATTAAGAACCTGGATACTGGAGAAGAAATACCTTTG 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GAGAGCTTACTGATGAGGAAATTTTAGCCAGTGTAATGATTAAGAACCTGGATACTGGAGAAGAAATACCTTTG 1110
Query 241 AGTCTTGCAGAAGAGAAACTACCAACAGGCATTAATCCTCTCACTCTACACATCATGAGAAGGACAAAAGAATA 314
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AGTCTTGCAGAAGAGAAACTACCAACAGGCATTAATCCTCTCACTCTACACATCATGAGAAGGACAAAAGAATA 1184
Query 315 TGTAAGTAATGACGCGGCACAGTCAGATGATGAAGAGAAGTTACAGTCTCAGCCAACAGATACTGATGGTGGAA 388
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TGTAAGTAATGACGCGGCACAGTCAGATGATGAAGAGAAGTTACAGTCTCAGCCAACAGATACTGATGGTGGAA 1258
Query 389 GGTTAAAACAGAAAACGACTCAACTAAAGAAGTTTCTTGGAAAATCAGTAAAGAGAGCAAAGCACCTTGCTGAG 462
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GGTTAAAACAGAAAACGACTCAACTAAAGAAGTTTCTTGGAAAATCAGTAAAGAGAGCAAAGCACCTTGCTGAG 1332
Query 463 GAATATGGTGAACGTGCTATAAATAAAGTTAAAAGTGTTAGAGATGAAGTGTTTCATACTGATCAAGATGATCC 536
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GAATATGGTGAACGTGCTATAAATAAAGTTAAAAGTGTTAGAGATGAAGTGTTTCATACTGATCAAGATGATCC 1406
Query 537 TTCATCAAGTGATGATGAAGGAATGCCATACACAAGACCAGTTAAATTCAAAGCAGCACACGGTTTTAAAGGAC 610
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1407 TTCATCAAGTGATGATGAAGGAATGCCATACACAAGACCAGTTAAATTCAAAGCAGCACACGGTTTCAAAGGAC 1480
Query 611 CTTATGATTTTGATCAGATCAAAGTGGTGCAAGATCTTAGTGGTGAACATATGGGAGCTGTTTGGACCATGAAA 684
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CTTATGATTTTGATCAGATCAAAGTGGTGCAAGATCTTAGTGGTGAACATATGGGAGCTGTTTGGACCATGAAA 1554
Query 685 TTTTCTCACTGTGGCCGATTACTTGCCTCAGCTGGACAAGACAATGTAGTGAGAATATGGGCTTTAAAAAATGC 758
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 TTTTCTCACTGTGGCCGATTACTTGCCTCAGCTGGACAAGACAATGTAGTGAGAATATGGGCTTTAAAAAATGC 1628
Query 759 TTTTGACTATTTCAACAATATGCGAATGAAATACAATACTGAAGGACGTGTGTCCCCATCACCCTCTCAGGAAA 832
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TTTTGACTATTTCAACAATATGCGAATGAAATACAATACTGAAGGACGTGTGTCCCCATCACCCTCTCAGGAAA 1702
Query 833 GTCTAAGTTCATCAAAATCGGATACAGATACAGGGGTATGCAGTGGAACTGATGAAGACCCTGATGATAAAAAC 906
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 GTCTAAGTTCATCAAAATCGGATACAGATACAGGGGTATGCAGTGGAACTGATGAAGACCCTGATGATAAAAAC 1776
Query 907 GCACCCTTTCGGCAACGGCCATTTTGCAAATATAAAGGACATACTGCTGATCTCCTTGATCTTTCATGGTCTAA 980
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GCACCCTTTCGGCAACGGCCATTTTGCAAATATAAAGGACATACTGCTGATCTCCTTGATCTTTCATGGTCTAA 1850
Query 981 AAACTACTTTCTTCTTTCTTCTTCAATGGATAAAACAGTCAGATTATGGCACATTTCTCGAAGAGAATGCCTTT 1054
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 AAACTACTTTCTTCTTTCTTCTTCAATGGATAAAACAGTCAGATTATGGCACATTTCTCGAAGAGAATGCCTTT 1924
Query 1055 GCTGTTTTCAACATATAGATTTTGTCACTGCCATAGCTTTTCATCCAAGAGATGACAGGTATTTTCTAAGTGGG 1128
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 GCTGTTTTCAACATATAGATTTTGTCACTGCCATAGCTTTTCATCCAAGAGATGACAGGTATTTTCTAAGTGGG 1998
Query 1129 TCTTTGGATGGAAAGCTCCGCCTTTGGAACATACCTGACAAAAAAGTGGCTTTGTGGAATGAAGTAGATGGTCA 1202
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 TCTTTGGATGGAAAGCTCCGCCTTTGGAACATACCTGACAAAAAAGTGGCTTTGTGGAATGAAGTAGATGGTCA 2072
Query 1203 GACAAAATTGATCACAGCTGCAAATTTCTGTCAGAATGGCAAATATGCAGTGATTGGGACATATGATGGCAGAT 1276
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 GACAAAATTGATCACAGCTGCAAATTTCTGTCAGAATGGCAAATATGCAGTGATTGGGACATATGATGGCAGAT 2146
Query 1277 GTATTTTCTATGATACAGAGCATTTGAAATACCATACACAAATACATGTCCGATCTACTAGAGGGCGCAACAAG 1350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 GTATTTTCTATGATACAGAGCATTTGAAATACCATACACAAATACATGTCCGATCTACTAGAGGGCGCAACAAG 2220
Query 1351 GTTGGAAGAAAAATTACTGGCATTGAGCCTTTACCTGGAGAAAATAAGATATTGGTAACCTCAAATGACTCCAG 1424
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 GTTGGAAGAAAAATTACTGGCATTGAGCCTTTACCTGGAGAAAATAAGATATTGGTAACCTCAAATGACTCCAG 2294
Query 1425 AATCAGACTATATGATTTGAGAGATTTGTCACTATCCATGAAGTATAAGGGTTACGTCAATAGCAGCAGCCAGA 1498
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 AATCAGACTATATGATTTGAGAGATTTGTCACTATCCATGAAGTATAAGGGTTACGTCAATAGCAGCAGCCAGA 2368
Query 1499 TCAAAGCAAGTTTCAGCCATGATTTTACTTACCTCGTTAGTGGTTCAGAAGATAAGTATGTTTATATCTGGAGT 1572
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 TCAAAGCAAGTTTCAGCCATGATTTTACTTACCTCGTTAGTGGTTCAGAAGATAAGTATGTTTATATCTGGAGT 2442
Query 1573 ACCTACCATGACCTAAGCAAGTTTACTTCAGTCAGGAGAGATCGTAATGACTTCTGGGAAGGTATTAAAGCCCA 1646
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 ACCTACCATGACCTAAGCAAGTTTACTTCAGTCAGGAGAGATCGTAATGACTTCTGGGAAGGTATTAAAGCCCA 2516
Query 1647 CAATGCAGTTGTTACATCAGCCATCTTTGCACCAAACCCAAGTTTGATGTTATCTTTGGATGTGCAATCTGAAA 1720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 CAATGCAGTTGTTACATCAGCCATCTTTGCACCAAACCCAAGTTTGATGTTATCTTTGGATGTGCAATCTGAAA 2590
Query 1721 AATCAGAAGGGAACGAGAAAAGTGAAGATGCTGAAGTTTTGGATGCCACACCTTCTGGTATTATGAAGACAGAT 1794
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 AATCAGAAGGGAACGAGAAAAGTGAAGATGCTGAAGTTTTGGATGCCACACCTTCTGGTATTATGAAGACAGAT 2664
Query 1795 AACACAGAAGTTCTTCTCTCTGCTGACTTCACTGGAGCAATCAAAGTGTTTGTTAACAAAAGAAAAAATGTATC 1868
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 2665 AACACAGAAGTTCTTCTCTCTGCTGACTTCACTGGAGCAATCAAAGTGTTTGTTAATAAAAGAAAAAATGTATC 2738
Query 1869 T 1869
|
Sbjct 2739 T 2739