Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_12202
- Subject:
- NM_001352082.2
- Aligned Length:
- 1328
- Identities:
- 1198
- Gaps:
- 127
Alignment
Query 1 ----------------------------------------------ATGCCAATGTGGAA-------------- 14
||| ||||||
Sbjct 1 ATGGATGATGATGATTTTGGTGGTTTTGAGGCTGCGGAGACTTTTGATG-----GTGGAAGTGGTGAAACCCAA 69
Query 15 -----------------------------------TAAAGTATCTGGAGTCCATCTTTCACCATCTTCTCCTGA 53
|..||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 70 ACAACATCTCCTGCTATTCCTTGGGCTGCCTTTCCTGCAGTATCTGGAGTCCATCTTTCACCATCTTCTCCTGA 143
Query 54 GATTGTACTGGACCGTGACCACTCTTCTTCCATTGGCTGCCTCTCTTCTGATGCCATTATTTCATCACCAGAGA 127
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 144 GATTGTACTGGACCGTGACCACTCTTCTTCCATTGGCTGCCTCTCTTCTGATGCCATTATTTCATCACCAGAGA 217
Query 128 ATACACATGCAGCAAATAGCATTGTGAGTCAAACTATTCCAAAAGCACAGATTCAGCAATCAACACACACTCAT 201
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 218 ATACACATGCAGCAAATAGCATT---------------------------ATTCAGCAATCAACACACACTCAT 264
Query 202 CTGGATATCTCACTTTTTCCATTGGGTTTAACTGATGAAAAAAGTAATGGAACAATTGCCCTTGTGGATGATTC 275
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 265 CTGGATATCTCACTTTTTCCATTGGGTTTAACTGATGAAAAAAGTAATGGAACAATTGCCCTTGTGGATGATTC 338
Query 276 TGAGGATCCTGGAGCCAATGTATCTAACATACAGCTTCAGCAAAAAATTTCAAGTCTGGAGATTAAACTCAAAG 349
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 339 TGAGGATCCTGGAGCCAATGTATCTAACATACAGCTTCAGCAAAAAATTTCAAGTCTGGAGATTAAACTCAAAG 412
Query 350 TATCTGAAGAAGAAAAACAGAGAATTAAACAGGATGTGGAATCATTGATGGAAAAGCATAATGTCTTAGAAAAA 423
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 413 TATCTGAAGAAGAAAAACAGAGAATTAAACAGGATGTGGAATCATTGATGGAAAAGCATAATGTCTTAGAAAAA 486
Query 424 GGCTTTCTAAAAGAAAAAGAGCAAGAGGCCATTTCTTTTCAAGATAGATACAAAGAACTTCAGGAAAAACATAA 497
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 487 GGCTTTCTAAAAGAAAAAGAGCAAGAGGCCATTTCTTTTCAAGATAGATACAAAGAACTTCAGGAAAAACATAA 560
Query 498 ACAAGAATTGGAAGACATGAGGAAAGCTGGTCACGAAGCCCTCAGCATTATTGTGGATGAATATAAGGCACTAC 571
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 561 ACAAGAATTGGAAGACATGAGGAAAGCTGGTCACGAAGCCCTCAGCATTATTGTGGATGAATATAAGGCACTAC 634
Query 572 TGCAGTCTTCAGTTAAGCAACAAGTAGAAGCTATTGAAAAACAGTACATTTCTGCAATTGAGAAACAGGCACAC 645
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 635 TGCAGTCTTCAGTTAAGCAACAAGTAGAAGCTATTGAAAAACAGTACATTTCTGCAATTGAGAAACAGGCACAC 708
Query 646 AAGTGTGAGGAGTTGCTAAATGCTCAGCATCAGAGGCTCCTTGAAATGCTAGATACAGAGAAGGAACTGTTAAA 719
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 709 AAGTGTGAGGAGTTGCTAAATGCTCAGCATCAGAGGCTCCTTGAAATGCTAGATACAGAGAAGGAACTGTTAAA 782
Query 720 AGAAAAAATAAAGGAAGCTTTGATTCAGCAATCTCAAGAACAGAAGGAAATATTGGAAAAGTGTTTGGAGGAAG 793
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 783 AGAAAAAATAAAGGAAGCTTTGATTCAGCAATCTCAAGAACAGAAGGAAATATTGGAAAAGTGTTTGGAGGAAG 856
Query 794 AAAGGCAAAGAAATAAAGAGGCATTAGTATCCGCTGCAAAGCTTGAAAAAGAAGCAATGAAGGATGCAGTTTTA 867
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 857 AAAGGCAAAGAAATAAAGAGGCATTAGTATCCGCTGCAAAGCTTGAAAAAGAAGCAGTGAAGGATGCAGTTTTA 930
Query 868 AAAGTCGTAGAAGAAGAAAGAAAAAATTTAGAAAAAGCGCATGCTGAAGAAAGGGAATTATGGAAGACAGAACA 941
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 931 AAAGTCGTAGAAGAAGAAAGAAAAAATTTAGAAAAAGCGCATGCTGAAGAAAGGGAATTATGGAAGACAGAACA 1004
Query 942 TGCAAAAGATCAAGAAAAAGTATCTCAGGAAATTCAAAAAGCTATACAAGAACAAAGAAAAATAAGTCAGGAAA 1015
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1005 TGCAAAAGATCAAGAAAAAGTATCTCAGGAAATTCAAAAAGCTATACAAGAACAAAGAAAAATAAGTCAGGAAA 1078
Query 1016 CTGTTAAGGCAGCAATAATAGAAGAGCAGAAACGAAGTGAAAAGGCTGTGGAAGAGGCAGTGAAAAGAACAAGA 1089
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1079 CTGTTAAGGCAGCAATAATAGAAGAGCAGAAACGAAGTGAAAAGGCTGTGGAAGAGGCAGTGAAAAGAACAAGA 1152
Query 1090 GATGAATTGATAGAGTATATAAAAGAACAGAAAAGGCTCGATCAAGTCATCCGCCAAAGAAGCCTGTCCAGTTT 1163
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1153 GATGAATTGATAGAGTATATAAAAGAACAGAAAAGGCTCGATCAAGTCATCCGCCAAAGAAGCCTGTCCAGTTT 1226
Query 1164 GGAACTGTTCCTCTCCTGTGCACAGAAACAGTTAAGTGCTTTAATAGCTACGGAACCAGTTGACATTGAA 1233
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1227 GGAACTGTTCCTCTCCTGTGCACAGAAACAGTTAAGTGCTTTAATAGCTACGGAACCAGTTGACATTGAA 1296