Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12202
• Subject: XM_024449035.1
• Aligned Length: 1233
• Identities: 1205
• Gaps: 27

Alignment

Query    1  ATGCCAATGTGGAATAAAGTATCTGGAGTCCATCTTTCACCATCTTCTCCTGAGATTGTACTGGACCGTGACCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCAATGTGGAATAAAGTATCTGGAGTCCATCTTTCACCATCTTCTCCTGAGATTGTACTGGACCGTGACCA  74

Query   75  CTCTTCTTCCATTGGCTGCCTCTCTTCTGATGCCATTATTTCATCACCAGAGAATACACATGCAGCAAATAGCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTCTTCTTCCATTGGCTGCCTCTCTTCTGATGCCATTATTTCATCACCAGAGAATACACATGCAGCAAATAGCA  148

Query  149  TTGTGAGTCAAACTATTCCAAAAGCACAGATTCAGCAATCAACACACACTCATCTGGATATCTCACTTTTTCCA  222
            ||                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TT---------------------------ATTCAGCAATCAACACACACTCATCTGGATATCTCACTTTTTCCA  195

Query  223  TTGGGTTTAACTGATGAAAAAAGTAATGGAACAATTGCCCTTGTGGATGATTCTGAGGATCCTGGAGCCAATGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  196  TTGGGTTTAACTGATGAAAAAAGTAATGGAACAATTGCCCTTGTGGATGATTCTGAGGATCCTGGAGCCAATGT  269

Query  297  ATCTAACATACAGCTTCAGCAAAAAATTTCAAGTCTGGAGATTAAACTCAAAGTATCTGAAGAAGAAAAACAGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  270  ATCTAACATACAGCTTCAGCAAAAAATTTCAAGTCTGGAGATTAAACTCAAAGTATCTGAAGAAGAAAAACAGA  343

Query  371  GAATTAAACAGGATGTGGAATCATTGATGGAAAAGCATAATGTCTTAGAAAAAGGCTTTCTAAAAGAAAAAGAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  344  GAATTAAACAGGATGTGGAATCATTGATGGAAAAGCATAATGTCTTAGAAAAAGGCTTTCTAAAAGAAAAAGAG  417

Query  445  CAAGAGGCCATTTCTTTTCAAGATAGATACAAAGAACTTCAGGAAAAACATAAACAAGAATTGGAAGACATGAG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  418  CAAGAGGCCATTTCTTTTCAAGATAGATACAAAGAACTTCAGGAAAAACATAAACAAGAATTGGAAGACATGAG  491

Query  519  GAAAGCTGGTCACGAAGCCCTCAGCATTATTGTGGATGAATATAAGGCACTACTGCAGTCTTCAGTTAAGCAAC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  492  GAAAGCTGGTCACGAAGCCCTCAGCATTATTGTGGATGAATATAAGGCACTACTGCAGTCTTCAGTTAAGCAAC  565

Query  593  AAGTAGAAGCTATTGAAAAACAGTACATTTCTGCAATTGAGAAACAGGCACACAAGTGTGAGGAGTTGCTAAAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  566  AAGTAGAAGCTATTGAAAAACAGTACATTTCTGCAATTGAGAAACAGGCACACAAGTGTGAGGAGTTGCTAAAT  639

Query  667  GCTCAGCATCAGAGGCTCCTTGAAATGCTAGATACAGAGAAGGAACTGTTAAAAGAAAAAATAAAGGAAGCTTT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  640  GCTCAGCATCAGAGGCTCCTTGAAATGCTAGATACAGAGAAGGAACTGTTAAAAGAAAAAATAAAGGAAGCTTT  713

Query  741  GATTCAGCAATCTCAAGAACAGAAGGAAATATTGGAAAAGTGTTTGGAGGAAGAAAGGCAAAGAAATAAAGAGG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  714  GATTCAGCAATCTCAAGAACAGAAGGAAATATTGGAAAAGTGTTTGGAGGAAGAAAGGCAAAGAAATAAAGAGG  787

Query  815  CATTAGTATCCGCTGCAAAGCTTGAAAAAGAAGCAATGAAGGATGCAGTTTTAAAAGTCGTAGAAGAAGAAAGA  888
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  788  CATTAGTATCCGCTGCAAAGCTTGAAAAAGAAGCAGTGAAGGATGCAGTTTTAAAAGTCGTAGAAGAAGAAAGA  861

Query  889  AAAAATTTAGAAAAAGCGCATGCTGAAGAAAGGGAATTATGGAAGACAGAACATGCAAAAGATCAAGAAAAAGT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  862  AAAAATTTAGAAAAAGCGCATGCTGAAGAAAGGGAATTATGGAAGACAGAACATGCAAAAGATCAAGAAAAAGT  935

Query  963  ATCTCAGGAAATTCAAAAAGCTATACAAGAACAAAGAAAAATAAGTCAGGAAACTGTTAAGGCAGCAATAATAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  936  ATCTCAGGAAATTCAAAAAGCTATACAAGAACAAAGAAAAATAAGTCAGGAAACTGTTAAGGCAGCAATAATAG  1009

Query 1037  AAGAGCAGAAACGAAGTGAAAAGGCTGTGGAAGAGGCAGTGAAAAGAACAAGAGATGAATTGATAGAGTATATA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1010  AAGAGCAGAAACGAAGTGAAAAGGCTGTGGAAGAGGCAGTGAAAAGAACAAGAGATGAATTGATAGAGTATATA  1083

Query 1111  AAAGAACAGAAAAGGCTCGATCAAGTCATCCGCCAAAGAAGCCTGTCCAGTTTGGAACTGTTCCTCTCCTGTGC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1084  AAAGAACAGAAAAGGCTCGATCAAGTCATCCGCCAAAGAAGCCTGTCCAGTTTGGAACTGTTCCTCTCCTGTGC  1157

Query 1185  ACAGAAACAGTTAAGTGCTTTAATAGCTACGGAACCAGTTGACATTGAA  1233
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1158  ACAGAAACAGTTAAGTGCTTTAATAGCTACGGAACCAGTTGACATTGAA  1206