Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12202
• Subject: XM_024449036.1
• Aligned Length: 1328
• Identities: 1198
• Gaps: 127

Alignment

Query    1  ----------------------------------------------ATGCCAATGTGGAA--------------  14
                                                          |||     ||||||              
Sbjct    1  ATGGATGATGATGATTTTGGTGGTTTTGAGGCTGCGGAGACTTTTGATG-----GTGGAAGTGGTGAAACCCAA  69

Query   15  -----------------------------------TAAAGTATCTGGAGTCCATCTTTCACCATCTTCTCCTGA  53
                                               |..||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   70  ACAACATCTCCTGCTATTCCTTGGGCTGCCTTTCCTGCAGTATCTGGAGTCCATCTTTCACCATCTTCTCCTGA  143

Query   54  GATTGTACTGGACCGTGACCACTCTTCTTCCATTGGCTGCCTCTCTTCTGATGCCATTATTTCATCACCAGAGA  127
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  144  GATTGTACTGGACCGTGACCACTCTTCTTCCATTGGCTGCCTCTCTTCTGATGCCATTATTTCATCACCAGAGA  217

Query  128  ATACACATGCAGCAAATAGCATTGTGAGTCAAACTATTCCAAAAGCACAGATTCAGCAATCAACACACACTCAT  201
            |||||||||||||||||||||||                           ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  218  ATACACATGCAGCAAATAGCATT---------------------------ATTCAGCAATCAACACACACTCAT  264

Query  202  CTGGATATCTCACTTTTTCCATTGGGTTTAACTGATGAAAAAAGTAATGGAACAATTGCCCTTGTGGATGATTC  275
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  265  CTGGATATCTCACTTTTTCCATTGGGTTTAACTGATGAAAAAAGTAATGGAACAATTGCCCTTGTGGATGATTC  338

Query  276  TGAGGATCCTGGAGCCAATGTATCTAACATACAGCTTCAGCAAAAAATTTCAAGTCTGGAGATTAAACTCAAAG  349
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  339  TGAGGATCCTGGAGCCAATGTATCTAACATACAGCTTCAGCAAAAAATTTCAAGTCTGGAGATTAAACTCAAAG  412

Query  350  TATCTGAAGAAGAAAAACAGAGAATTAAACAGGATGTGGAATCATTGATGGAAAAGCATAATGTCTTAGAAAAA  423
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  413  TATCTGAAGAAGAAAAACAGAGAATTAAACAGGATGTGGAATCATTGATGGAAAAGCATAATGTCTTAGAAAAA  486

Query  424  GGCTTTCTAAAAGAAAAAGAGCAAGAGGCCATTTCTTTTCAAGATAGATACAAAGAACTTCAGGAAAAACATAA  497
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  487  GGCTTTCTAAAAGAAAAAGAGCAAGAGGCCATTTCTTTTCAAGATAGATACAAAGAACTTCAGGAAAAACATAA  560

Query  498  ACAAGAATTGGAAGACATGAGGAAAGCTGGTCACGAAGCCCTCAGCATTATTGTGGATGAATATAAGGCACTAC  571
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  561  ACAAGAATTGGAAGACATGAGGAAAGCTGGTCACGAAGCCCTCAGCATTATTGTGGATGAATATAAGGCACTAC  634

Query  572  TGCAGTCTTCAGTTAAGCAACAAGTAGAAGCTATTGAAAAACAGTACATTTCTGCAATTGAGAAACAGGCACAC  645
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  635  TGCAGTCTTCAGTTAAGCAACAAGTAGAAGCTATTGAAAAACAGTACATTTCTGCAATTGAGAAACAGGCACAC  708

Query  646  AAGTGTGAGGAGTTGCTAAATGCTCAGCATCAGAGGCTCCTTGAAATGCTAGATACAGAGAAGGAACTGTTAAA  719
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  709  AAGTGTGAGGAGTTGCTAAATGCTCAGCATCAGAGGCTCCTTGAAATGCTAGATACAGAGAAGGAACTGTTAAA  782

Query  720  AGAAAAAATAAAGGAAGCTTTGATTCAGCAATCTCAAGAACAGAAGGAAATATTGGAAAAGTGTTTGGAGGAAG  793
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  783  AGAAAAAATAAAGGAAGCTTTGATTCAGCAATCTCAAGAACAGAAGGAAATATTGGAAAAGTGTTTGGAGGAAG  856

Query  794  AAAGGCAAAGAAATAAAGAGGCATTAGTATCCGCTGCAAAGCTTGAAAAAGAAGCAATGAAGGATGCAGTTTTA  867
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  857  AAAGGCAAAGAAATAAAGAGGCATTAGTATCCGCTGCAAAGCTTGAAAAAGAAGCAGTGAAGGATGCAGTTTTA  930

Query  868  AAAGTCGTAGAAGAAGAAAGAAAAAATTTAGAAAAAGCGCATGCTGAAGAAAGGGAATTATGGAAGACAGAACA  941
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  931  AAAGTCGTAGAAGAAGAAAGAAAAAATTTAGAAAAAGCGCATGCTGAAGAAAGGGAATTATGGAAGACAGAACA  1004

Query  942  TGCAAAAGATCAAGAAAAAGTATCTCAGGAAATTCAAAAAGCTATACAAGAACAAAGAAAAATAAGTCAGGAAA  1015
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1005  TGCAAAAGATCAAGAAAAAGTATCTCAGGAAATTCAAAAAGCTATACAAGAACAAAGAAAAATAAGTCAGGAAA  1078

Query 1016  CTGTTAAGGCAGCAATAATAGAAGAGCAGAAACGAAGTGAAAAGGCTGTGGAAGAGGCAGTGAAAAGAACAAGA  1089
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1079  CTGTTAAGGCAGCAATAATAGAAGAGCAGAAACGAAGTGAAAAGGCTGTGGAAGAGGCAGTGAAAAGAACAAGA  1152

Query 1090  GATGAATTGATAGAGTATATAAAAGAACAGAAAAGGCTCGATCAAGTCATCCGCCAAAGAAGCCTGTCCAGTTT  1163
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1153  GATGAATTGATAGAGTATATAAAAGAACAGAAAAGGCTCGATCAAGTCATCCGCCAAAGAAGCCTGTCCAGTTT  1226

Query 1164  GGAACTGTTCCTCTCCTGTGCACAGAAACAGTTAAGTGCTTTAATAGCTACGGAACCAGTTGACATTGAA  1233
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1227  GGAACTGTTCCTCTCCTGTGCACAGAAACAGTTAAGTGCTTTAATAGCTACGGAACCAGTTGACATTGAA  1296