Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_12261
- Subject:
- NM_001286514.2
- Aligned Length:
- 3808
- Identities:
- 3304
- Gaps:
- 494
Alignment
Query 1 ATGGACAGTTTAGAAGAACCTCAGAAAAAAGTCTTTAAGGCTCGAAAAACGATGAGAGTGAGTGATCGTCAGCA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGACAGTTTAGAAGAACCTCAGAAAAAAGTCTTTAAGGCTCGAAAAACGATGAGAGTGAGTGATCGTCAGCA 74
Query 75 ACTTGAAGCAGTGTACAAGGTCAAAGAAGAACTGTTGAAAACTGATGTCAAGCTGTTAAATGGCAACCATGAAA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 ACTTGAAGCAGTGTACAAGGTCAAAGAAGAACTGTTGAAAACTGATGTCAAGCTGTTAAATGGCAACCATGAAA 148
Query 149 ATGGAGATTTGGACCCAACCTCACCTTTGGAAAACATGGATTACATTAAAGACAAGGAAGAGGTGAATGGCATT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ATGGAGATTTGGACCCAACCTCACCTTTGGAAAACATGGATTACATTAAAGACAAGGAAGAGGTGAATGGCATT 222
Query 223 GAAGAGATTTGTTTTGATCCTGAAGGAAGTAAAGCAGAATGGAAGGAAACACCCTGTATCCTAAGTGTTAATGT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GAAGAGATTTGTTTTGATCCTGAAGGAAGTAAAGCAGAATGGAAGGAAACACCCTGTATCCTAAGTGTTAATGT 296
Query 297 AAAAAACAAGCAGGATGATGATTTAAATTGTGAACCTTTGTCTCCCCATAATATAACTCCAGAACCAGTCTCTA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AAAAAACAAGCAGGATGATGATTTAAATTGTGAACCTTTGTCTCCCCATAATATAACTCCAGAACCAGTCTCTA 370
Query 371 AACTGCCTGCTGAACCAGTTTCTGGTGATCCAGCCCCTGGTGATCTGGATGCCGGAGATCCAGCCTCCGGAGTA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AACTGCCTGCTGAACCAGTTTCTGGTGATCCAGCCCCTGGTGATCTGGATGCCGGAGATCCAGCCTCCGGAGTA 444
Query 445 CTGGCCTCTGGTGATTCCACCTCTGGTGATCCCACCTCTAGCGAGCCCTCCTCTAGTGATGCTGCCTCTGGTGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CTGGCCTCTGGTGATTCCACCTCTGGTGATCCCACCTCTAGCGAGCCCTCCTCTAGTGATGCTGCCTCTGGTGA 518
Query 519 TGCAACCTCTGGTGATGCCCCTTCTGGTGATGTGTCCCCTGGTGATGCCACCTCTGGTGATGCCACTGCTGATG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGCAACCTCTGGTGATGCCCCTTCTGGTGATGTGTCCCCTGGTGATGCCACCTCTGGTGATGCCACTGCTGATG 592
Query 593 ATCTCTCCTCTGGTGATCCCACCTCTAGTGATCCCATCCCAGGTGAACCGGTCCCTGTTGAACCCATTTCTGGT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ATCTCTCCTCTGGTGATCCCACCTCTAGTGATCCCATCCCAGGTGAACCGGTCCCTGTTGAACCCATTTCTGGT 666
Query 667 GATTGTGCCGCTGATGATATAGCCTCTAGTGAAATAACTTCTGTTGATCTGGCTTCTGGAGCACCAGCTTCCAC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GATTGTGCCGCTGATGATATAGCCTCTAGTGAAATAACTTCTGTTGATCTGGCTTCTGGAGCACCAGCTTCCAC 740
Query 741 TGATCCAGCCTCTGATGATCTGGCCTCTGGTGATCTATCCTCTAGTGAACTGGCCTCTGATGATCTGGCCACTG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGATCCAGCCTCTGATGATCTGGCCTCTGGTGATCTATCCTCTAGTGAACTGGCCTCTGATGATCTGGCCACTG 814
Query 815 GTGAACTGGCCTCTGATGAGCTGACTTCTGAATCAACCTTTGATCGTACCTTTGAACCAAAGTCTGTACCAGTT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GTGAACTGGCCTCTGATGAGCTGACTTCTGAATCAACCTTTGATCGTACCTTTGAACCAAAGTCTGTACCAGTT 888
Query 889 TGTGAACCAGTTCCTGAAATTGACAATATAGAACCAAGTAGCAATAAAGATGATGATTTTCTTGAAAAAAATGG 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TGTGAACCAGTTCCTGAAATTGACAATATAGAACCAAGTAGCAATAAAGATGATGATTTTCTTGAAAAAAATGG 962
Query 963 AGCTGATGAAAAATTAGAGCAAATTCAGAGTAAAGACTCATTGGATGAGAAAAATAAAGCTGATAATAATATTG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AGCTGATGAAAAATTAGAGCAAATTCAGAGTAAAGACTCATTGGATGAGAAAAATAAAGCTGATAATAATATTG 1036
Query 1037 ATGCTAATGAAGAAACTCTAGAAACAGATGATACAACTATTTGTTCAGATCGACCTCCTGAAAATGAAAAGAAG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 ATGCTAATGAAGAAACTCTAGAAACAGATGATACAACTATTTGTTCAGATCGACCTCCTGAAAATGAAAAGAAG 1110
Query 1111 GTAGAGGAAGATATTATCACAGAGCTTGCTCTTGGAGAAGATGCTATATCTAGCAGTATGGAAATTGACCAAGG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GTAGAGGAAGATATTATCACAGAGCTTGCTCTTGGAGAAGATGCTATATCTAGCAGTATGGAAATTGACCAAGG 1184
Query 1185 TGAAAAGAATGAAGATGAAACTTCTGCAGATCTTGTAGAAACGATTAATGAAAATGTTATTGAAGATAACAAAA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TGAAAAGAATGAAGATGAAACTTCTGCAGATCTTGTAGAAACGATTAATGAAAATGTTATTGAAGATAACAAAA 1258
Query 1259 GTGAGAATATCTTAGAAAATACAGACTCTATGGAGACAGATGAAATCATTCCTATTTTGGAAAAGCTTGCACCT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GTGAGAATATCTTAGAAAATACAGACTCTATGGAGACAGATGAAATCATTCCTATTTTGGAAAAGCTTGCACCT 1332
Query 1333 TCTGAGGATGAACTTACTTGCTTTTCTAAAACATCTCTCCTTCCAATCGATGAGACAAATCCAGATTTGGAAGA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 TCTGAGGATGAACTTACTTGCTTTTCTAAAACATCTCTCCTTCCAATCGATGAGACAAATCCAGATTTGGAAGA 1406
Query 1407 GAAAATGGAAAGTTCTTTTGGTTCACCATCTAAACAAGAAAGTAGTGAGAGTTTGCCAAAAGAAGCCTTTCTGG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GAAAATGGAAAGTTCTTTTGGTTCACCATCTAAACAAGAAAGTAGTGAGAGTTTGCCAAAAGAAGCCTTTCTGG 1480
Query 1481 TCCTCTCTGATGAAGAGGATATTTCGGGTGAAAAAGATGAGTCTGAAGTTATATCGCAAAATGAAACGTGCTCT 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TCCTCTCTGATGAAGAGGATATTTCGGGTGAAAAAGATGAGTCTGAAGTTATATCGCAAAATGAAACGTGCTCT 1554
Query 1555 CCAGAAGTAGAAAGTAATGAAAAGGACAACAGACCTGAGGAAGAAGAGCAAGTAATACATGAAGATGATGAAAG 1628
|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CCAGAAGTAGAAAGTAATGAAAAGGACAACAAACCTGAGGAAGAAGAGCAAGTAATACATGAAGATGATGAAAG 1628
Query 1629 ACCTTCTGAGAAAAATGAATTTTCTAGACGAAAACGTTCTAAATCAGAAGACATGGACAATGTACAGTCTAAAC 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 ACCTTCTGAGAAAAATGAATTTTCTAGACGAAAACGTTCTAAATCAGAAGACATGGACAATGTACAGTCTAAAC 1702
Query 1703 GTCGTCGATATATGGAAGAAGAATATGAGGCAGAATTTCAAGTAAAGATTACAGCCAAAGGAGACATTAACCAG 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 GTCGTCGATATATGGAAGAAGAATATGAGGCAGAATTTCAAGTAAAGATTACAGCCAAAGGAGACATTAACCAG 1776
Query 1777 AAACTTCAAAAGGTTATACAGTGGTTGCTGGAAGAAAAATTGTGTGCGCTGCAGTGTGCTGTATTTGATAAGAC 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 AAACTTCAAAAGGTTATACAGTGGTTGCTGGAAGAAAAATTGTGTGCGCTGCAGTGTGCTGTATTTGATAAGAC 1850
Query 1851 TTTGGCAGAATTGAAAACACGAGTGGAAAAGATTGAATGTAACAAGAGGCATAAAACAGTTCTCACTGAACTAC 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 TTTGGCAGAATTGAAAACACGAGTGGAAAAGATTGAATGTAACAAGAGGCATAAAACAGTTCTCACTGAACTAC 1924
Query 1925 AGGCCAAGATAGCCAGGTTAACCAAACGCTTTGAAGCAGCCAAAGAAGATCTTAAGAAAAGACATGAACATCCA 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 AGGCCAAGATAGCCAGGTTAACCAAACGCTTTGAAGCAGCCAAAGAAGATCTTAAGAAAAGACATGAACATCCA 1998
Query 1999 CCCAACCCACCAGTATCACCAGGAAAAACTGTAAATGATGTCAACAGCAATAATAACATGTCTTACAGAAATGC 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 CCCAACCCACCAGTATCACCAGGAAAAACTGTAAATGATGTCAACAGCAATAATAACATGTCTTACAGAAATGC 2072
Query 2073 AGGCACAGTGAGACAGATGCTGGAGTCCAAAAGAAATGTAAGCGAGAGTGCACCACCATCCTTTCAAACTCCTG 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 AGGCACAGTGAGACAGATGCTGGAGTCCAAAAGAAATGTAAGCGAGAGTGCACCACCATCCTTTCAAACTCCTG 2146
Query 2147 TGAATACAGTATCTTCAACCAATCTTGTCACTCCTCCAGCAGTTGTCAGTAGTCAACCTAAATTGCAGACTCCA 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 TGAATACAGTATCTTCAACCAATCTTGTCACTCCTCCAGCAGTTGTCAGTAGTCAACCTAAATTGCAGACTCCA 2220
Query 2221 GTGACTTCGGGTTCCCTCACAGCAACGTCAGTTCTTCCTGCACCCAATACAGCTACTGTAGTTGCTACTACTCA 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 GTGACTTCGGGTTCCCTCACAGCAACGTCAGTTCTTCCTGCACCCAATACAGCTACTGTAGTTGCTACTACTCA 2294
Query 2295 GGTGCCTAGTGGAAATCCCCAGCCTACAATCTCTTTACAGCCTTTGCCAGTGATTTTGCATGTACCTGTTGCAG 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 GGTGCCTAGTGGAAATCCCCAGCCTACAATCTCTTTACAGCCTTTGCCAGTGATTTTGCATGTACCTGTTGCAG 2368
Query 2369 TATCCTCCCAGCCTCAGCTTCTACAGAGCCATCCAGGGACTTTGGTGACTAATCAACCATCTGGCAATGTTGAA 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 TATCCTCCCAGCCTCAGCTTCTACAGAGCCATCCAGGGACTTTGGTGACTAATCAACCATCTGGCAATGTTGAA 2442
Query 2443 TTCATTTCTGTGCAAAGCCCACCTACAGTGAGTGGTCTTACCAAAAATCCAGTATCCTTGCCATCCTTGCCAAA 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 TTCATTTCTGTGCAAAGCCCACCTACAGTGAGTGGTCTTACCAAAAATCCAGTATCCTTGCCATCCTTGCCAAA 2516
Query 2517 TCCCACTAAACCAAACAACGTTCCTTCTGTGCCCAGTCCTAGTATTCAAAGGAACCCTACTGCCAGTGCTGCAC 2590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 TCCCACTAAACCAAACAACGTTCCTTCTGTGCCCAGTCCTAGTATTCAAAGGAACCCTACTGCCAGTGCTGCAC 2590
Query 2591 CATTGGGAACAACACTTGCTGTGCAGGCTGTTCCAACAGCACACTCTATTGTACAAGCCACAAGGACTTCTTTA 2664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 CATTGGGAACAACACTTGCTGTGCAGGCTGTTCCAACAGCACACTCTATTGTACAAGCCACAAGGACTTCTTTA 2664
Query 2665 CCCACAGTGGGCCCATCAGGACTCTATAGTCCATCAACTAATCGAGGTCCTATACAGATGAAAATTCCAATTTC 2738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 CCCACAGTGGGCCCATCAGGACTCTATAGTCCATCAACTAATCGAGGTCCTATACAGATGAAAATTCCAATTTC 2738
Query 2739 TGCATTTAGTACTTCGTCTGCTGCAGAACAGAACAGCAATACCACCCCAAGAATTGAAAACCAGACAAACAAAA 2812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 TGCATTTAGTACTTCGTCTGCTGCAGAACAGAACAGCAATACCACCCCAAGAATTGAAAACCAGACAAACAAAA 2812
Query 2813 CAATAGATGCTTCTGTCAGTAAGAAAGCAGCTGATAGCACATCACAGTGTGGAAAAGCCACTGGCAGTGATTCA 2886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 CAATAGATGCTTCTGTCAGTAAGAAAGCAGCTGATAGCACATCACAGTGTGGAAAAGCCACTGGCAGTGATTCA 2886
Query 2887 AGTGGTGTCATTGATCTCACAATGGATGATGAAGAGAGTGGAGCTTCACAAGACCCCAAAAAACTAAATCACAC 2960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 AGTGGTGTCATTGATCTCACAATGGATGATGAAGAGAGTGGAGCTTCACAAGACCCCAAAAAACTAAATCACAC 2960
Query 2961 TCCTGTATCAACCATGAGTTCTTCTCAGCCTGTGTCACGACCATTGCAACCCATACAACCAGCACCGCCTCTTC 3034
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 TCCTGTATCAACCATGAGTTCTTCTCAGCCTGTGTCACGACCATTGCAACCCATACAACCAGCACCGCCTCTTC 3034
Query 3035 AACCATCTGGGGTGCCAACAAGTGGACCATCTCAGACCACCATACACTTACTACCTACAGCTCCAACTACCGTG 3108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035 AACCATCTGGGGTGCCAACAAGTGGACCATCTCAGACCACCATACACTTACTACCTACAGCTCCAACTACCGTG 3108
Query 3109 AATGTAACACATCGTCCAGTAACTCAGGTGACCACAAGACTCCCTGTACCAAGAGCTCCTGCAAACCACCAGGT 3182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109 AATGTAACACATCGTCCAGTAACTCAGGTGACCACAAGACTCCCTGTACCAAGAGCTCCTGCAAACCACCAGGT 3182
Query 3183 GGTTTATACAACTCTTCCTGCACCACCAGCTCAGGCTCCCTTGCGAGGAACTGTTATGCAGGCTCCTGCTGTTC 3256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183 GGTTTATACAACTCTTCCTGCACCACCAGCTCAGGCTCCCTTGCGAGGAACTGTTATGCAGGCTCCTGCTGTTC 3256
Query 3257 GGCAGGTCAATCCCCAAAATA--GTAAGAGATT---------------------TTTCTTGTA---TATGG--- 3301
||||||||||||||||||||| ||.|.|| || |.|.||||| .||||
Sbjct 3257 GGCAGGTCAATCCCCAAAATAGTGTTACAG-TTCGAGTGCCTCAAACAACCACATATGTTGTAAACAATGGACT 3329
Query 3302 --CCCCAAGAT--ACATG-------------------------------------------------------- 3315
|||...||| |||.|
Sbjct 3330 AACCCTGGGATCAACAGGACCTCAGCTCACAGTGCATCACCGACCACCACAAGTGCATACTGAGCCCCCACGCC 3403
Query 3316 -------------------------------------------------------------------------- 3315
Sbjct 3404 CCGTGCACCCAGCACCCTTACCAGAAGCTCCACAACCACAGCGTCTGCCCCCAGAAGCTGCCAGCACATCTCTG 3477
Query 3316 -------------------------------------------------------------------------- 3315
Sbjct 3478 CCTCAGAAGCCACACTTGAAGTTAGCACGCGTTCAGAGTCAAAATGGCATAGTACTGTCATGGAGTGTCCTGGA 3551
Query 3316 -------------------------------------------------------------------------- 3315
Sbjct 3552 GGTGGATCGAAGCTGTGCCACTGTTGATAGCTACCATCTCTATGCTTACCATGAGGAACCCAGTGCCACTGTGC 3625
Query 3316 -------------------------------------------------------------------------- 3315
Sbjct 3626 CCTCACAATGGAAAAAGATTGGGGAAGTCAAGGCACTTCCCTTGCCCATGGCATGTACTCTCACCCAGTTTGTA 3699
Query 3316 -------------------------------------------------------------------------- 3315
Sbjct 3700 TCTGGTAGCAAATACTACTTTGCAGTACGAGCCAAGGATATTTATGGACGTTTTGGGCCTTTCTGTGATCCTCA 3773
Query 3316 ---------------------------------- 3315
Sbjct 3774 GTCAACAGATGTGATCTCTTCTACCCAGAGCAGT 3807