Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_12261
- Subject:
- XM_005253424.4
- Aligned Length:
- 3832
- Identities:
- 3304
- Gaps:
- 518
Alignment
Query 1 ------------------------ATGGACAGTTTAGAAGAACCTCAGAAAAAAGTCTTTAAGGCTCGAAAAAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCATCAGGACCAGAGATTCAGAATGGACAGTTTAGAAGAACCTCAGAAAAAAGTCTTTAAGGCTCGAAAAAC 74
Query 51 GATGAGAGTGAGTGATCGTCAGCAACTTGAAGCAGTGTACAAGGTCAAAGAAGAACTGTTGAAAACTGATGTCA 124
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GATGAGAGTGAGTGATCGTCAGCAACTTGAAGCAGTGTACAAGGTCAAAGAAGAACTGTTGAAAACTGATGTCA 148
Query 125 AGCTGTTAAATGGCAACCATGAAAATGGAGATTTGGACCCAACCTCACCTTTGGAAAACATGGATTACATTAAA 198
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AGCTGTTAAATGGCAACCATGAAAATGGAGATTTGGACCCAACCTCACCTTTGGAAAACATGGATTACATTAAA 222
Query 199 GACAAGGAAGAGGTGAATGGCATTGAAGAGATTTGTTTTGATCCTGAAGGAAGTAAAGCAGAATGGAAGGAAAC 272
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GACAAGGAAGAGGTGAATGGCATTGAAGAGATTTGTTTTGATCCTGAAGGAAGTAAAGCAGAATGGAAGGAAAC 296
Query 273 ACCCTGTATCCTAAGTGTTAATGTAAAAAACAAGCAGGATGATGATTTAAATTGTGAACCTTTGTCTCCCCATA 346
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 ACCCTGTATCCTAAGTGTTAATGTAAAAAACAAGCAGGATGATGATTTAAATTGTGAACCTTTGTCTCCCCATA 370
Query 347 ATATAACTCCAGAACCAGTCTCTAAACTGCCTGCTGAACCAGTTTCTGGTGATCCAGCCCCTGGTGATCTGGAT 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ATATAACTCCAGAACCAGTCTCTAAACTGCCTGCTGAACCAGTTTCTGGTGATCCAGCCCCTGGTGATCTGGAT 444
Query 421 GCCGGAGATCCAGCCTCCGGAGTACTGGCCTCTGGTGATTCCACCTCTGGTGATCCCACCTCTAGCGAGCCCTC 494
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GCCGGAGATCCAGCCTCCGGAGTACTGGCCTCTGGTGATTCCACCTCTGGTGATCCCACCTCTAGCGAGCCCTC 518
Query 495 CTCTAGTGATGCTGCCTCTGGTGATGCAACCTCTGGTGATGCCCCTTCTGGTGATGTGTCCCCTGGTGATGCCA 568
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CTCTAGTGATGCTGCCTCTGGTGATGCAACCTCTGGTGATGCCCCTTCTGGTGATGTGTCCCCTGGTGATGCCA 592
Query 569 CCTCTGGTGATGCCACTGCTGATGATCTCTCCTCTGGTGATCCCACCTCTAGTGATCCCATCCCAGGTGAACCG 642
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CCTCTGGTGATGCCACTGCTGATGATCTCTCCTCTGGTGATCCCACCTCTAGTGATCCCATCCCAGGTGAACCG 666
Query 643 GTCCCTGTTGAACCCATTTCTGGTGATTGTGCCGCTGATGATATAGCCTCTAGTGAAATAACTTCTGTTGATCT 716
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GTCCCTGTTGAACCCATTTCTGGTGATTGTGCCGCTGATGATATAGCCTCTAGTGAAATAACTTCTGTTGATCT 740
Query 717 GGCTTCTGGAGCACCAGCTTCCACTGATCCAGCCTCTGATGATCTGGCCTCTGGTGATCTATCCTCTAGTGAAC 790
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GGCTTCTGGAGCACCAGCTTCCACTGATCCAGCCTCTGATGATCTGGCCTCTGGTGATCTATCCTCTAGTGAAC 814
Query 791 TGGCCTCTGATGATCTGGCCACTGGTGAACTGGCCTCTGATGAGCTGACTTCTGAATCAACCTTTGATCGTACC 864
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TGGCCTCTGATGATCTGGCCACTGGTGAACTGGCCTCTGATGAGCTGACTTCTGAATCAACCTTTGATCGTACC 888
Query 865 TTTGAACCAAAGTCTGTACCAGTTTGTGAACCAGTTCCTGAAATTGACAATATAGAACCAAGTAGCAATAAAGA 938
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TTTGAACCAAAGTCTGTACCAGTTTGTGAACCAGTTCCTGAAATTGACAATATAGAACCAAGTAGCAATAAAGA 962
Query 939 TGATGATTTTCTTGAAAAAAATGGAGCTGATGAAAAATTAGAGCAAATTCAGAGTAAAGACTCATTGGATGAGA 1012
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TGATGATTTTCTTGAAAAAAATGGAGCTGATGAAAAATTAGAGCAAATTCAGAGTAAAGACTCATTGGATGAGA 1036
Query 1013 AAAATAAAGCTGATAATAATATTGATGCTAATGAAGAAACTCTAGAAACAGATGATACAACTATTTGTTCAGAT 1086
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AAAATAAAGCTGATAATAATATTGATGCTAATGAAGAAACTCTAGAAACAGATGATACAACTATTTGTTCAGAT 1110
Query 1087 CGACCTCCTGAAAATGAAAAGAAGGTAGAGGAAGATATTATCACAGAGCTTGCTCTTGGAGAAGATGCTATATC 1160
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CGACCTCCTGAAAATGAAAAGAAGGTAGAGGAAGATATTATCACAGAGCTTGCTCTTGGAGAAGATGCTATATC 1184
Query 1161 TAGCAGTATGGAAATTGACCAAGGTGAAAAGAATGAAGATGAAACTTCTGCAGATCTTGTAGAAACGATTAATG 1234
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TAGCAGTATGGAAATTGACCAAGGTGAAAAGAATGAAGATGAAACTTCTGCAGATCTTGTAGAAACGATTAATG 1258
Query 1235 AAAATGTTATTGAAGATAACAAAAGTGAGAATATCTTAGAAAATACAGACTCTATGGAGACAGATGAAATCATT 1308
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AAAATGTTATTGAAGATAACAAAAGTGAGAATATCTTAGAAAATACAGACTCTATGGAGACAGATGAAATCATT 1332
Query 1309 CCTATTTTGGAAAAGCTTGCACCTTCTGAGGATGAACTTACTTGCTTTTCTAAAACATCTCTCCTTCCAATCGA 1382
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CCTATTTTGGAAAAGCTTGCACCTTCTGAGGATGAACTTACTTGCTTTTCTAAAACATCTCTCCTTCCAATCGA 1406
Query 1383 TGAGACAAATCCAGATTTGGAAGAGAAAATGGAAAGTTCTTTTGGTTCACCATCTAAACAAGAAAGTAGTGAGA 1456
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TGAGACAAATCCAGATTTGGAAGAGAAAATGGAAAGTTCTTTTGGTTCACCATCTAAACAAGAAAGTAGTGAGA 1480
Query 1457 GTTTGCCAAAAGAAGCCTTTCTGGTCCTCTCTGATGAAGAGGATATTTCGGGTGAAAAAGATGAGTCTGAAGTT 1530
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 GTTTGCCAAAAGAAGCCTTTCTGGTCCTCTCTGATGAAGAGGATATTTCGGGTGAAAAAGATGAGTCTGAAGTT 1554
Query 1531 ATATCGCAAAATGAAACGTGCTCTCCAGAAGTAGAAAGTAATGAAAAGGACAACAGACCTGAGGAAGAAGAGCA 1604
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1555 ATATCGCAAAATGAAACGTGCTCTCCAGAAGTAGAAAGTAATGAAAAGGACAACAAACCTGAGGAAGAAGAGCA 1628
Query 1605 AGTAATACATGAAGATGATGAAAGACCTTCTGAGAAAAATGAATTTTCTAGACGAAAACGTTCTAAATCAGAAG 1678
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 AGTAATACATGAAGATGATGAAAGACCTTCTGAGAAAAATGAATTTTCTAGACGAAAACGTTCTAAATCAGAAG 1702
Query 1679 ACATGGACAATGTACAGTCTAAACGTCGTCGATATATGGAAGAAGAATATGAGGCAGAATTTCAAGTAAAGATT 1752
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 ACATGGACAATGTACAGTCTAAACGTCGTCGATATATGGAAGAAGAATATGAGGCAGAATTTCAAGTAAAGATT 1776
Query 1753 ACAGCCAAAGGAGACATTAACCAGAAACTTCAAAAGGTTATACAGTGGTTGCTGGAAGAAAAATTGTGTGCGCT 1826
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 ACAGCCAAAGGAGACATTAACCAGAAACTTCAAAAGGTTATACAGTGGTTGCTGGAAGAAAAATTGTGTGCGCT 1850
Query 1827 GCAGTGTGCTGTATTTGATAAGACTTTGGCAGAATTGAAAACACGAGTGGAAAAGATTGAATGTAACAAGAGGC 1900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 GCAGTGTGCTGTATTTGATAAGACTTTGGCAGAATTGAAAACACGAGTGGAAAAGATTGAATGTAACAAGAGGC 1924
Query 1901 ATAAAACAGTTCTCACTGAACTACAGGCCAAGATAGCCAGGTTAACCAAACGCTTTGAAGCAGCCAAAGAAGAT 1974
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 ATAAAACAGTTCTCACTGAACTACAGGCCAAGATAGCCAGGTTAACCAAACGCTTTGAAGCAGCCAAAGAAGAT 1998
Query 1975 CTTAAGAAAAGACATGAACATCCACCCAACCCACCAGTATCACCAGGAAAAACTGTAAATGATGTCAACAGCAA 2048
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 CTTAAGAAAAGACATGAACATCCACCCAACCCACCAGTATCACCAGGAAAAACTGTAAATGATGTCAACAGCAA 2072
Query 2049 TAATAACATGTCTTACAGAAATGCAGGCACAGTGAGACAGATGCTGGAGTCCAAAAGAAATGTAAGCGAGAGTG 2122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 TAATAACATGTCTTACAGAAATGCAGGCACAGTGAGACAGATGCTGGAGTCCAAAAGAAATGTAAGCGAGAGTG 2146
Query 2123 CACCACCATCCTTTCAAACTCCTGTGAATACAGTATCTTCAACCAATCTTGTCACTCCTCCAGCAGTTGTCAGT 2196
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 CACCACCATCCTTTCAAACTCCTGTGAATACAGTATCTTCAACCAATCTTGTCACTCCTCCAGCAGTTGTCAGT 2220
Query 2197 AGTCAACCTAAATTGCAGACTCCAGTGACTTCGGGTTCCCTCACAGCAACGTCAGTTCTTCCTGCACCCAATAC 2270
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 AGTCAACCTAAATTGCAGACTCCAGTGACTTCGGGTTCCCTCACAGCAACGTCAGTTCTTCCTGCACCCAATAC 2294
Query 2271 AGCTACTGTAGTTGCTACTACTCAGGTGCCTAGTGGAAATCCCCAGCCTACAATCTCTTTACAGCCTTTGCCAG 2344
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 AGCTACTGTAGTTGCTACTACTCAGGTGCCTAGTGGAAATCCCCAGCCTACAATCTCTTTACAGCCTTTGCCAG 2368
Query 2345 TGATTTTGCATGTACCTGTTGCAGTATCCTCCCAGCCTCAGCTTCTACAGAGCCATCCAGGGACTTTGGTGACT 2418
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 TGATTTTGCATGTACCTGTTGCAGTATCCTCCCAGCCTCAGCTTCTACAGAGCCATCCAGGGACTTTGGTGACT 2442
Query 2419 AATCAACCATCTGGCAATGTTGAATTCATTTCTGTGCAAAGCCCACCTACAGTGAGTGGTCTTACCAAAAATCC 2492
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 AATCAACCATCTGGCAATGTTGAATTCATTTCTGTGCAAAGCCCACCTACAGTGAGTGGTCTTACCAAAAATCC 2516
Query 2493 AGTATCCTTGCCATCCTTGCCAAATCCCACTAAACCAAACAACGTTCCTTCTGTGCCCAGTCCTAGTATTCAAA 2566
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 AGTATCCTTGCCATCCTTGCCAAATCCCACTAAACCAAACAACGTTCCTTCTGTGCCCAGTCCTAGTATTCAAA 2590
Query 2567 GGAACCCTACTGCCAGTGCTGCACCATTGGGAACAACACTTGCTGTGCAGGCTGTTCCAACAGCACACTCTATT 2640
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 GGAACCCTACTGCCAGTGCTGCACCATTGGGAACAACACTTGCTGTGCAGGCTGTTCCAACAGCACACTCTATT 2664
Query 2641 GTACAAGCCACAAGGACTTCTTTACCCACAGTGGGCCCATCAGGACTCTATAGTCCATCAACTAATCGAGGTCC 2714
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 GTACAAGCCACAAGGACTTCTTTACCCACAGTGGGCCCATCAGGACTCTATAGTCCATCAACTAATCGAGGTCC 2738
Query 2715 TATACAGATGAAAATTCCAATTTCTGCATTTAGTACTTCGTCTGCTGCAGAACAGAACAGCAATACCACCCCAA 2788
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 TATACAGATGAAAATTCCAATTTCTGCATTTAGTACTTCGTCTGCTGCAGAACAGAACAGCAATACCACCCCAA 2812
Query 2789 GAATTGAAAACCAGACAAACAAAACAATAGATGCTTCTGTCAGTAAGAAAGCAGCTGATAGCACATCACAGTGT 2862
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 GAATTGAAAACCAGACAAACAAAACAATAGATGCTTCTGTCAGTAAGAAAGCAGCTGATAGCACATCACAGTGT 2886
Query 2863 GGAAAAGCCACTGGCAGTGATTCAAGTGGTGTCATTGATCTCACAATGGATGATGAAGAGAGTGGAGCTTCACA 2936
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 GGAAAAGCCACTGGCAGTGATTCAAGTGGTGTCATTGATCTCACAATGGATGATGAAGAGAGTGGAGCTTCACA 2960
Query 2937 AGACCCCAAAAAACTAAATCACACTCCTGTATCAACCATGAGTTCTTCTCAGCCTGTGTCACGACCATTGCAAC 3010
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 AGACCCCAAAAAACTAAATCACACTCCTGTATCAACCATGAGTTCTTCTCAGCCTGTGTCACGACCATTGCAAC 3034
Query 3011 CCATACAACCAGCACCGCCTCTTCAACCATCTGGGGTGCCAACAAGTGGACCATCTCAGACCACCATACACTTA 3084
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035 CCATACAACCAGCACCGCCTCTTCAACCATCTGGGGTGCCAACAAGTGGACCATCTCAGACCACCATACACTTA 3108
Query 3085 CTACCTACAGCTCCAACTACCGTGAATGTAACACATCGTCCAGTAACTCAGGTGACCACAAGACTCCCTGTACC 3158
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109 CTACCTACAGCTCCAACTACCGTGAATGTAACACATCGTCCAGTAACTCAGGTGACCACAAGACTCCCTGTACC 3182
Query 3159 AAGAGCTCCTGCAAACCACCAGGTGGTTTATACAACTCTTCCTGCACCACCAGCTCAGGCTCCCTTGCGAGGAA 3232
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183 AAGAGCTCCTGCAAACCACCAGGTGGTTTATACAACTCTTCCTGCACCACCAGCTCAGGCTCCCTTGCGAGGAA 3256
Query 3233 CTGTTATGCAGGCTCCTGCTGTTCGGCAGGTCAATCCCCAAAATA--GTAAGAGATT----------------- 3287
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||.|.|| ||
Sbjct 3257 CTGTTATGCAGGCTCCTGCTGTTCGGCAGGTCAATCCCCAAAATAGTGTTACAG-TTCGAGTGCCTCAAACAAC 3329
Query 3288 ----TTTCTTGTA---TATGG-----CCCCAAGAT--ACATG-------------------------------- 3315
|.|.||||| .|||| |||...||| |||.|
Sbjct 3330 CACATATGTTGTAAACAATGGACTAACCCTGGGATCAACAGGACCTCAGCTCACAGTGCATCACCGACCACCAC 3403
Query 3316 -------------------------------------------------------------------------- 3315
Sbjct 3404 AAGTGCATACTGAGCCCCCACGCCCCGTGCACCCAGCACCCTTACCAGAAGCTCCACAACCACAGCGTCTGCCC 3477
Query 3316 -------------------------------------------------------------------------- 3315
Sbjct 3478 CCAGAAGCTGCCAGCACATCTCTGCCTCAGAAGCCACACTTGAAGTTAGCACGCGTTCAGAGTCAAAATGGCAT 3551
Query 3316 -------------------------------------------------------------------------- 3315
Sbjct 3552 AGTACTGTCATGGAGTGTCCTGGAGGTGGATCGAAGCTGTGCCACTGTTGATAGCTACCATCTCTATGCTTACC 3625
Query 3316 -------------------------------------------------------------------------- 3315
Sbjct 3626 ATGAGGAACCCAGTGCCACTGTGCCCTCACAATGGAAAAAGATTGGGGAAGTCAAGGCACTTCCCTTGCCCATG 3699
Query 3316 -------------------------------------------------------------------------- 3315
Sbjct 3700 GCATGTACTCTCACCCAGTTTGTATCTGGTAGCAAATACTACTTTGCAGTACGAGCCAAGGATATTTATGGACG 3773
Query 3316 ---------------------------------------------------------- 3315
Sbjct 3774 TTTTGGGCCTTTCTGTGATCCTCAGTCAACAGATGTGATCTCTTCTACCCAGAGCAGT 3831