Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_12261
- Subject:
- XM_011520754.3
- Aligned Length:
- 3811
- Identities:
- 3304
- Gaps:
- 497
Alignment
Query 1 ATGGACAGTTTAGAAGAACCTCAGAAAAAAGTCTTTAAGGCTCGAAAAACGATGAGAGTGAGTGATCGTCAGCA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGACAGTTTAGAAGAACCTCAGAAAAAAGTCTTTAAGGCTCGAAAAACGATGAGAGTGAGTGATCGTCAGCA 74
Query 75 ACTTGAAGCAGTGTACAAGGTCAAAGAAGAACTGTTGAAAACTGATGTCAAGCTGTTAAATGGCAACCATGAAA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 ACTTGAAGCAGTGTACAAGGTCAAAGAAGAACTGTTGAAAACTGATGTCAAGCTGTTAAATGGCAACCATGAAA 148
Query 149 ATGGAGATTTGGACCCAACCTCACCTTTGGAAAACATGGATTACATTAAAGACAAGGAAGAGGTGAATGGCATT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ATGGAGATTTGGACCCAACCTCACCTTTGGAAAACATGGATTACATTAAAGACAAGGAAGAGGTGAATGGCATT 222
Query 223 GAAGAGATTTGTTTTGATCCTGAAGGAAGTAAAGCAGAATGGAAGGAAACACCCTGTATCCTAAGTGTTAATGT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GAAGAGATTTGTTTTGATCCTGAAGGAAGTAAAGCAGAATGGAAGGAAACACCCTGTATCCTAAGTGTTAATGT 296
Query 297 AAAAAACAAGCAGGATGATGATTTAAATTGTGAACCTTTGTCTCCCCATAATATAACTCCAGAACCAGTCTCTA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AAAAAACAAGCAGGATGATGATTTAAATTGTGAACCTTTGTCTCCCCATAATATAACTCCAGAACCAGTCTCTA 370
Query 371 AACTGCCTGCTGAACCAGTTTCTGGTGATCCAGCCCCTGGTGATCTGGATGCCGGAGATCCAGCCTCCGGAGTA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AACTGCCTGCTGAACCAGTTTCTGGTGATCCAGCCCCTGGTGATCTGGATGCCGGAGATCCAGCCTCCGGAGTA 444
Query 445 CTGGCCTCTGGTGATTCCACCTCTGGTGATCCCACCTCTAGCGAGCCCTCCTCTAGTGATGCTGCCTCTGGTGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CTGGCCTCTGGTGATTCCACCTCTGGTGATCCCACCTCTAGCGAGCCCTCCTCTAGTGATGCTGCCTCTGGTGA 518
Query 519 TGCAACCTCTGGTGATGCCCCTTCTGGTGATGTGTCCCCTGGTGATGCCACCTCTGGTGATGCCACTGCTGATG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGCAACCTCTGGTGATGCCCCTTCTGGTGATGTGTCCCCTGGTGATGCCACCTCTGGTGATGCCACTGCTGATG 592
Query 593 ATCTCTCCTCTGGTGATCCCACCTCTAGTGATCCCATCCCAGGTGAACCGGTCCCTGTTGAACCCATTTCTGGT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ATCTCTCCTCTGGTGATCCCACCTCTAGTGATCCCATCCCAGGTGAACCGGTCCCTGTTGAACCCATTTCTGGT 666
Query 667 GATTGTGCCGCTGATGATATAGCCTCTAGTGAAATAACTTCTGTTGATCTGGCTTCTGGAGCACCAGCTTCCAC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GATTGTGCCGCTGATGATATAGCCTCTAGTGAAATAACTTCTGTTGATCTGGCTTCTGGAGCACCAGCTTCCAC 740
Query 741 TGATCCAGCCTCTGATGATCTGGCCTCTGGTGATCTATCCTCTAGTGAACTGGCCTCTGATGATCTGGCCACTG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGATCCAGCCTCTGATGATCTGGCCTCTGGTGATCTATCCTCTAGTGAACTGGCCTCTGATGATCTGGCCACTG 814
Query 815 GTGAACTGGCCTCTGATGAGCTGACTTCTGAATCAACCTTTGATCGTACCTTTGAACCAAAGTCTGTACCAGTT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GTGAACTGGCCTCTGATGAGCTGACTTCTGAATCAACCTTTGATCGTACCTTTGAACCAAAGTCTGTACCAGTT 888
Query 889 TGTGAACCAGTTCCTGAAATTGACAATATAGAACCAAGTAGCAATAAAGATGATGATTTTCTTGAAAAAAATGG 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TGTGAACCAGTTCCTGAAATTGACAATATAGAACCAAGTAGCAATAAAGATGATGATTTTCTTGAAAAAAATGG 962
Query 963 AGCTGATGAAAAATTAGAGCAAATTCAGAGTAAAGACTCATTGGATGAGAAAAATAAAGCTGATAATAATATTG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AGCTGATGAAAAATTAGAGCAAATTCAGAGTAAAGACTCATTGGATGAGAAAAATAAAGCTGATAATAATATTG 1036
Query 1037 ATGCTAATGAAGAAACTCTAGAAACAGATGATACAACTATTTGTTCAGATCGACCTCCTGAAAATGAAAAGAAG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 ATGCTAATGAAGAAACTCTAGAAACAGATGATACAACTATTTGTTCAGATCGACCTCCTGAAAATGAAAAGAAG 1110
Query 1111 GTAGAGGAAGATATTATCACAGAGCTTGCTCTTGGAGAAGATGCTATATCTAGCAGTATGGAAATTGACCAAGG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GTAGAGGAAGATATTATCACAGAGCTTGCTCTTGGAGAAGATGCTATATCTAGCAGTATGGAAATTGACCAAGG 1184
Query 1185 TGAAAAGAATGAAGATGAAACTTCTGCAGATCTTGTAGAAACGATTAATGAAAATGTTATTGAAGATAACAAAA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TGAAAAGAATGAAGATGAAACTTCTGCAGATCTTGTAGAAACGATTAATGAAAATGTTATTGAAGATAACAAAA 1258
Query 1259 GTGAGAATATCTTAGAAAATACAGACTCTATGGAGACAGATGAAATCATTCCTATTTTGGAAAAGCTTGCACCT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GTGAGAATATCTTAGAAAATACAGACTCTATGGAGACAGATGAAATCATTCCTATTTTGGAAAAGCTTGCACCT 1332
Query 1333 TCTGAGGATGAACTTACTTGCTTTTCTAAAACATCTCTCCTTCCAATCGATGAGACAAATCCAGATTTGGAAGA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 TCTGAGGATGAACTTACTTGCTTTTCTAAAACATCTCTCCTTCCAATCGATGAGACAAATCCAGATTTGGAAGA 1406
Query 1407 GAAAATGGAAAGTTCTTTTGGTTCACCATCTAAACAAGAAAGTAGTGAGAGTTTGCCAAAAGAAGCCTTTCTGG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GAAAATGGAAAGTTCTTTTGGTTCACCATCTAAACAAGAAAGTAGTGAGAGTTTGCCAAAAGAAGCCTTTCTGG 1480
Query 1481 TCCTCTCTGATGAAGAGGATATTTCGGGTGAAAAAGATGAGTCTGAAGTTATATCGCAAAATGAAACGTGCTCT 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TCCTCTCTGATGAAGAGGATATTTCGGGTGAAAAAGATGAGTCTGAAGTTATATCGCAAAATGAAACGTGCTCT 1554
Query 1555 C---CAGAAGTAGAAAGTAATGAAAAGGACAACAGACCTGAGGAAGAAGAGCAAGTAATACATGAAGATGATGA 1625
| ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CCAGCAGAAGTAGAAAGTAATGAAAAGGACAACAAACCTGAGGAAGAAGAGCAAGTAATACATGAAGATGATGA 1628
Query 1626 AAGACCTTCTGAGAAAAATGAATTTTCTAGACGAAAACGTTCTAAATCAGAAGACATGGACAATGTACAGTCTA 1699
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 AAGACCTTCTGAGAAAAATGAATTTTCTAGACGAAAACGTTCTAAATCAGAAGACATGGACAATGTACAGTCTA 1702
Query 1700 AACGTCGTCGATATATGGAAGAAGAATATGAGGCAGAATTTCAAGTAAAGATTACAGCCAAAGGAGACATTAAC 1773
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 AACGTCGTCGATATATGGAAGAAGAATATGAGGCAGAATTTCAAGTAAAGATTACAGCCAAAGGAGACATTAAC 1776
Query 1774 CAGAAACTTCAAAAGGTTATACAGTGGTTGCTGGAAGAAAAATTGTGTGCGCTGCAGTGTGCTGTATTTGATAA 1847
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 CAGAAACTTCAAAAGGTTATACAGTGGTTGCTGGAAGAAAAATTGTGTGCGCTGCAGTGTGCTGTATTTGATAA 1850
Query 1848 GACTTTGGCAGAATTGAAAACACGAGTGGAAAAGATTGAATGTAACAAGAGGCATAAAACAGTTCTCACTGAAC 1921
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 GACTTTGGCAGAATTGAAAACACGAGTGGAAAAGATTGAATGTAACAAGAGGCATAAAACAGTTCTCACTGAAC 1924
Query 1922 TACAGGCCAAGATAGCCAGGTTAACCAAACGCTTTGAAGCAGCCAAAGAAGATCTTAAGAAAAGACATGAACAT 1995
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 TACAGGCCAAGATAGCCAGGTTAACCAAACGCTTTGAAGCAGCCAAAGAAGATCTTAAGAAAAGACATGAACAT 1998
Query 1996 CCACCCAACCCACCAGTATCACCAGGAAAAACTGTAAATGATGTCAACAGCAATAATAACATGTCTTACAGAAA 2069
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 CCACCCAACCCACCAGTATCACCAGGAAAAACTGTAAATGATGTCAACAGCAATAATAACATGTCTTACAGAAA 2072
Query 2070 TGCAGGCACAGTGAGACAGATGCTGGAGTCCAAAAGAAATGTAAGCGAGAGTGCACCACCATCCTTTCAAACTC 2143
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 TGCAGGCACAGTGAGACAGATGCTGGAGTCCAAAAGAAATGTAAGCGAGAGTGCACCACCATCCTTTCAAACTC 2146
Query 2144 CTGTGAATACAGTATCTTCAACCAATCTTGTCACTCCTCCAGCAGTTGTCAGTAGTCAACCTAAATTGCAGACT 2217
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 CTGTGAATACAGTATCTTCAACCAATCTTGTCACTCCTCCAGCAGTTGTCAGTAGTCAACCTAAATTGCAGACT 2220
Query 2218 CCAGTGACTTCGGGTTCCCTCACAGCAACGTCAGTTCTTCCTGCACCCAATACAGCTACTGTAGTTGCTACTAC 2291
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 CCAGTGACTTCGGGTTCCCTCACAGCAACGTCAGTTCTTCCTGCACCCAATACAGCTACTGTAGTTGCTACTAC 2294
Query 2292 TCAGGTGCCTAGTGGAAATCCCCAGCCTACAATCTCTTTACAGCCTTTGCCAGTGATTTTGCATGTACCTGTTG 2365
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 TCAGGTGCCTAGTGGAAATCCCCAGCCTACAATCTCTTTACAGCCTTTGCCAGTGATTTTGCATGTACCTGTTG 2368
Query 2366 CAGTATCCTCCCAGCCTCAGCTTCTACAGAGCCATCCAGGGACTTTGGTGACTAATCAACCATCTGGCAATGTT 2439
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 CAGTATCCTCCCAGCCTCAGCTTCTACAGAGCCATCCAGGGACTTTGGTGACTAATCAACCATCTGGCAATGTT 2442
Query 2440 GAATTCATTTCTGTGCAAAGCCCACCTACAGTGAGTGGTCTTACCAAAAATCCAGTATCCTTGCCATCCTTGCC 2513
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 GAATTCATTTCTGTGCAAAGCCCACCTACAGTGAGTGGTCTTACCAAAAATCCAGTATCCTTGCCATCCTTGCC 2516
Query 2514 AAATCCCACTAAACCAAACAACGTTCCTTCTGTGCCCAGTCCTAGTATTCAAAGGAACCCTACTGCCAGTGCTG 2587
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 AAATCCCACTAAACCAAACAACGTTCCTTCTGTGCCCAGTCCTAGTATTCAAAGGAACCCTACTGCCAGTGCTG 2590
Query 2588 CACCATTGGGAACAACACTTGCTGTGCAGGCTGTTCCAACAGCACACTCTATTGTACAAGCCACAAGGACTTCT 2661
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 CACCATTGGGAACAACACTTGCTGTGCAGGCTGTTCCAACAGCACACTCTATTGTACAAGCCACAAGGACTTCT 2664
Query 2662 TTACCCACAGTGGGCCCATCAGGACTCTATAGTCCATCAACTAATCGAGGTCCTATACAGATGAAAATTCCAAT 2735
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 TTACCCACAGTGGGCCCATCAGGACTCTATAGTCCATCAACTAATCGAGGTCCTATACAGATGAAAATTCCAAT 2738
Query 2736 TTCTGCATTTAGTACTTCGTCTGCTGCAGAACAGAACAGCAATACCACCCCAAGAATTGAAAACCAGACAAACA 2809
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 TTCTGCATTTAGTACTTCGTCTGCTGCAGAACAGAACAGCAATACCACCCCAAGAATTGAAAACCAGACAAACA 2812
Query 2810 AAACAATAGATGCTTCTGTCAGTAAGAAAGCAGCTGATAGCACATCACAGTGTGGAAAAGCCACTGGCAGTGAT 2883
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 AAACAATAGATGCTTCTGTCAGTAAGAAAGCAGCTGATAGCACATCACAGTGTGGAAAAGCCACTGGCAGTGAT 2886
Query 2884 TCAAGTGGTGTCATTGATCTCACAATGGATGATGAAGAGAGTGGAGCTTCACAAGACCCCAAAAAACTAAATCA 2957
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 TCAAGTGGTGTCATTGATCTCACAATGGATGATGAAGAGAGTGGAGCTTCACAAGACCCCAAAAAACTAAATCA 2960
Query 2958 CACTCCTGTATCAACCATGAGTTCTTCTCAGCCTGTGTCACGACCATTGCAACCCATACAACCAGCACCGCCTC 3031
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 CACTCCTGTATCAACCATGAGTTCTTCTCAGCCTGTGTCACGACCATTGCAACCCATACAACCAGCACCGCCTC 3034
Query 3032 TTCAACCATCTGGGGTGCCAACAAGTGGACCATCTCAGACCACCATACACTTACTACCTACAGCTCCAACTACC 3105
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035 TTCAACCATCTGGGGTGCCAACAAGTGGACCATCTCAGACCACCATACACTTACTACCTACAGCTCCAACTACC 3108
Query 3106 GTGAATGTAACACATCGTCCAGTAACTCAGGTGACCACAAGACTCCCTGTACCAAGAGCTCCTGCAAACCACCA 3179
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109 GTGAATGTAACACATCGTCCAGTAACTCAGGTGACCACAAGACTCCCTGTACCAAGAGCTCCTGCAAACCACCA 3182
Query 3180 GGTGGTTTATACAACTCTTCCTGCACCACCAGCTCAGGCTCCCTTGCGAGGAACTGTTATGCAGGCTCCTGCTG 3253
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183 GGTGGTTTATACAACTCTTCCTGCACCACCAGCTCAGGCTCCCTTGCGAGGAACTGTTATGCAGGCTCCTGCTG 3256
Query 3254 TTCGGCAGGTCAATCCCCAAAATA--GTAAGAGATT---------------------TTTCTTGTA---TATGG 3301
|||||||||||||||||||||||| ||.|.|| || |.|.||||| .||||
Sbjct 3257 TTCGGCAGGTCAATCCCCAAAATAGTGTTACAG-TTCGAGTGCCTCAAACAACCACATATGTTGTAAACAATGG 3329
Query 3302 -----CCCCAAGAT--ACATG----------------------------------------------------- 3315
|||...||| |||.|
Sbjct 3330 ACTAACCCTGGGATCAACAGGACCTCAGCTCACAGTGCATCACCGACCACCACAAGTGCATACTGAGCCCCCAC 3403
Query 3316 -------------------------------------------------------------------------- 3315
Sbjct 3404 GCCCCGTGCACCCAGCACCCTTACCAGAAGCTCCACAACCACAGCGTCTGCCCCCAGAAGCTGCCAGCACATCT 3477
Query 3316 -------------------------------------------------------------------------- 3315
Sbjct 3478 CTGCCTCAGAAGCCACACTTGAAGTTAGCACGCGTTCAGAGTCAAAATGGCATAGTACTGTCATGGAGTGTCCT 3551
Query 3316 -------------------------------------------------------------------------- 3315
Sbjct 3552 GGAGGTGGATCGAAGCTGTGCCACTGTTGATAGCTACCATCTCTATGCTTACCATGAGGAACCCAGTGCCACTG 3625
Query 3316 -------------------------------------------------------------------------- 3315
Sbjct 3626 TGCCCTCACAATGGAAAAAGATTGGGGAAGTCAAGGCACTTCCCTTGCCCATGGCATGTACTCTCACCCAGTTT 3699
Query 3316 -------------------------------------------------------------------------- 3315
Sbjct 3700 GTATCTGGTAGCAAATACTACTTTGCAGTACGAGCCAAGGATATTTATGGACGTTTTGGGCCTTTCTGTGATCC 3773
Query 3316 ------------------------------------- 3315
Sbjct 3774 TCAGTCAACAGATGTGATCTCTTCTACCCAGAGCAGT 3810