Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_12261
- Subject:
- XR_001748807.2
- Aligned Length:
- 3383
- Identities:
- 2848
- Gaps:
- 534
Alignment
Query 1 --------------------------------------------------------------------ATGGAC 6
||||||
Sbjct 1 GTAGCTGCTTAGGCAGCAAGTATGTCAGTGAGGAGACTTGTCACATGCATCAGGACCAGAGATTCAGAATGGAC 74
Query 7 AGTTTAGAAGAACCTCAGAAAAAAGTCTTTAAGGCTCGAAAAACGATGAGAGTGAGTGATCGTCAGCAACTTGA 80
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AGTTTAGAAGAACCTCAGAAAAAAGTCTTTAAGGCTCGAAAAACGATGAGAGTGAGTGATCGTCAGCAACTTGA 148
Query 81 AGCAGTGTACAAGGTCAAAGAAGAACTGTTGAAAACTGATGTCAAGCTGTTAAATGGCAACCATGAAAATGGAG 154
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AGCAGTGTACAAGGTCAAAGAAGAACTGTTGAAAACTGATGTCAAGCTGTTAAATGGCAACCATGAAAATGGAG 222
Query 155 ATTTGGACCCAACCTCACCTTTGGAAAACATGGATTACATTAAAGACAAGGAAGAGGTGAATGGCATTGAAGAG 228
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ATTTGGACCCAACCTCACCTTTGGAAAACATGGATTACATTAAAGACAAGGAAGAGGTGAATGGCATTGAAGAG 296
Query 229 ATTTGTTTTGATCCTGAAGGAAGTAAAGCAGAATGGAAGGAAACACCCTGTATCCTAAGTGTTAATGTAAAAAA 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 ATTTGTTTTGATCCTGAAGGAAGTAAAGCAGAATGGAAGGAAACACCCTGTATCCTAAGTGTTAATGTAAAAAA 370
Query 303 CAAGCAGGATGATGATTTAAATTGTGAACCTTTGTCTCCCCATAATATAACTCCAGAACCAGTCTCTAAACTGC 376
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CAAGCAGGATGATGATTTAAATTGTGAACCTTTGTCTCCCCATAATATAACTCCAGAACCAGTCTCTAAACTGC 444
Query 377 CTGCTGAACCAGTTTCTGGTGATCCAGCCCCTGGTGATCTGGATGCCGGAGATCCAGCCTCCGGAGTACTGGCC 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CTGCTGAACCAGTTTCTGGTGATCCAGCCCCTGGTGATCTGGATGCCGGAGATCCAGCCTCCGGAGTACTGGCC 518
Query 451 TCTGGTGATTCCACCTCTGGTGATCCCACCTCTAGCGAGCCCTCCTCTAGTGATGCTGCCTCTGGTGATGCAAC 524
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TCTGGTGATTCCACCTCTGGTGATCCCACCTCTAGCGAGCCCTCCTCTAGTGATGCTGCCTCTGGTGATGCAAC 592
Query 525 CTCTGGTGATGCCCCTTCTGGTGATGTGTCCCCTGGTGATGCCACCTCTGGTGATGCCACTGCTGATGATCTCT 598
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CTCTGGTGATGCCCCTTCTGGTGATGTGTCCCCTGGTGATGCCACCTCTGGTGATGCCACTGCTGATGATCTCT 666
Query 599 CCTCTGGTGATCCCACCTCTAGTGATCCCATCCCAGGTGAACCGGTCCCTGTTGAACCCATTTCTGGTGATTGT 672
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CCTCTGGTGATCCCACCTCTAGTGATCCCATCCCAGGTGAACCGGTCCCTGTTGAACCCATTTCTGGTGATTGT 740
Query 673 GCCGCTGATGATATAGCCTCTAGTGAAATAACTTCTGTTGATCTGGCTTCTGGAGCACCAGCTTCCACTGATCC 746
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GCCGCTGATGATATAGCCTCTAGTGAAATAACTTCTGTTGATCTGGCTTCTGGAGCACCAGCTTCCACTGATCC 814
Query 747 AGCCTCTGATGATCTGGCCTCTGGTGATCTATCCTCTAGTGAACTGGCCTCTGATGATCTGGCCACTGGTGAAC 820
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AGCCTCTGATGATCTGGCCTCTGGTGATCTATCCTCTAGTGAACTGGCCTCTGATGATCTGGCCACTGGTGAAC 888
Query 821 TGGCCTCTGATGAGCTGACTTCTGAATCAACCTTTGATCGTACCTTTGAACCAAAGTCTGTACCAGTTTGTGAA 894
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TGGCCTCTGATGAGCTGACTTCTGAATCAACCTTTGATCGTACCTTTGAACCAAAGTCTGTACCAGTTTGTGAA 962
Query 895 CCAGTTCCTGAAATTGACAATATAGAACCAAGTAGCAATAAAGATGATGATTTTCTTGAAAAAAATGGAGCTGA 968
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CCAGTTCCTGAAATTGACAATATAGAACCAAGTAGCAATAAAGATGATGATTTTCTTGAAAAAAATGGAGCTGA 1036
Query 969 TGAAAAATTAGAGCAAATTCAGAGTAAAGACTCATTGGATGAGAAAAATAAAGCTGATAATAATATTGATGCTA 1042
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TGAAAAATTAGAGCAAATTCAGAGTAAAGACTCATTGGATGAGAAAAATAAAGCTGATAATAATATTGATGCTA 1110
Query 1043 ATGAAGAAACTCTAGAAACAGATGATACAACTATTTGTTCAGATCGACCTCCTGAAAATGAAAAGAAGGTAGAG 1116
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 ATGAAGAAACTCTAGAAACAGATGATACAACTATTTGTTCAGATCGACCTCCTGAAAATGAAAAGAAGGTAGAG 1184
Query 1117 GAAGATATTATCACAGAGCTTGCTCTTGGAGAAGATGCTATATCTAGCAGTATGGAAATTGACCAAGGTGAAAA 1190
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GAAGATATTATCACAGAGCTTGCTCTTGGAGAAGATGCTATATCTAGCAGTATGGAAATTGACCAAGGTGAAAA 1258
Query 1191 GAATGAAGATGAAACTTCTGCAGATCTTGTAGAAACGATTAATGAAAATGTTATTGAAGATAACAAAAGTGAGA 1264
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GAATGAAGATGAAACTTCTGCAGATCTTGTAGAAACGATTAATGAAAATGTTATTGAAGATAACAAAAGTGAGA 1332
Query 1265 ATATCTTAGAAAATACAGACTCTATGGAGACAGATGAAATCATTCCTATTTTGGAAAAGCTTGCACCTTCTGAG 1338
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 ATATCTTAGAAAATACAGACTCTATGGAGACAGATGAAATCATTCCTATTTTGGAAAAGCTTGCACCTTCTGAG 1406
Query 1339 GATGAACTTACTTGCTTTTCTAAAACATCTCTCCTTCCAATCGATGAGACAAATCCAGATTTGGAAGAGAAAAT 1412
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GATGAACTTACTTGCTTTTCTAAAACATCTCTCCTTCCAATCGATGAGACAAATCCAGATTTGGAAGAGAAAAT 1480
Query 1413 GGAAAGTTCTTTTGGTTCACCATCTAAACAAGAAAGTAGTGAGAGTTTGCCAAAAGAAGCCTTTCTGGTCCTCT 1486
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 GGAAAGTTCTTTTGGTTCACCATCTAAACAAGAAAGTAGTGAGAGTTTGCCAAAAGAAGCCTTTCTGGTCCTCT 1554
Query 1487 CTGATGAAGAGGATATTTCGGGTGAAAAAGATGAGTCTGAAGTTATATCGCAAAATGAAACGTGCTCTCCAGAA 1560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CTGATGAAGAGGATATTTCGGGTGAAAAAGATGAGTCTGAAGTTATATCGCAAAATGAAACGTGCTCTCCAGAA 1628
Query 1561 GTAGAAAGTAATGAAAAGGACAACAGACCTGAGGAAGAAGAGCAAGTAATACATGAAGATGATGAAAGACCTTC 1634
|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GTAGAAAGTAATGAAAAGGACAACAAACCTGAGGAAGAAGAGCAAGTAATACATGAAGATGATGAAAGACCTTC 1702
Query 1635 TGAGAAAAATGAATTTTCTAGACGAAAACGTTCTAAATCAGAAGACATGGACAATGTACAGTCTAAACGTCGTC 1708
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 TGAGAAAAATGAATTTTCTAGACGAAAACGTTCTAAATCAGAAGACATGGACAATGTACAGTCTAAACGTCGTC 1776
Query 1709 GATATATGGAAGAAGAATATGAGGCAGAATTTCAAGTAAAGATTACAGCCAAAGGAGACATTAACCAGAAACTT 1782
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GATATATGGAAGAAGAATATGAGGCAGAATTTCAAGTAAAGATTACAGCCAAAGGAGACATTAACCAGAAACTT 1850
Query 1783 CAAAAGGTTATACAGTGGTTGCTGGAAGAAAAATTGTGTGCGCTGCAGTGTGCTGTATTTGATAAGACTTTGGC 1856
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 CAAAAGGTTATACAGTGGTTGCTGGAAGAAAAATTGTGTGCGCTGCAGTGTGCTGTATTTGATAAGACTTTGGC 1924
Query 1857 AGAATTGAAAACACGAGTGGAAAAGATTGAATGTAACAAGAGGCATAAAACAGTTCTCACTGAACTACAGGCCA 1930
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 AGAATTGAAAACACGAGTGGAAAAGATTGAATGTAACAAGAGGCATAAAACAGTTCTCACTGAACTACAGGCCA 1998
Query 1931 AGATAGCCAGGTTAACCAAACGCTTTGAAGCAGCCAAAGAAGATCTTAAGAAAAGACATGAACATCCACCCAAC 2004
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 AGATAGCCAGGTTAACCAAACGCTTTGAAGCAGCCAAAGAAGATCTTAAGAAAAGACATGAACATCCACCCAAC 2072
Query 2005 CCACCAGTATCACCAGGAAAAACTGTAAATGATGTCAACAGCAATAATAACATGTCTTACAGAAATGCAGGCAC 2078
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 CCACCAGTATCACCAGGAAAAACTGTAAATGATGTCAACAGCAATAATAACATGTCT----------------- 2129
Query 2079 AGTGAGACAGATGCTGGAGTCCAAAAGAAATGTAAGCGAGAGTGCACCACCATCCTTTCAAACTCCTGTGAATA 2152
||
Sbjct 2130 ------------------------------------------------------------------------TA 2131
Query 2153 CAGTATCTTCAACCAATCTTGTCACTCCTCCAGCAGTTGTCAGTAGTCAACCTAAATTGCAGACTCCAGTGACT 2226
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2132 CAGTATCTTCAACCAATCTTGTCACTCCTCCAGCAGTTGTCAGTAGTCAACCTAAATTGCAGACTCCAGTGACT 2205
Query 2227 TCGGGTTCCCTCACAGCAACGTCAGTTCTTCCTGCACCCAATACAGCTACTGTAGTTGCTACTACTCAGGTGCC 2300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2206 TCGGGTTCCCTCACAGCAACGTCAGTTCTTCCTGCACCCAATACAGCTACTGTAGTTGCTACTACTCAGGTGCC 2279
Query 2301 TAGTGGAAATCCCCAGCCTACAATCTCTTTACAGCCTTTGCCAGTGATTTTGCATGTACCTGTTGCAGTATCCT 2374
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2280 TAGTGGAAATCCCCAGCCTACAATCTCTTTACAGCCTTTGCCAGTGATTTTGCATGTACCTGTTGCAGTATCCT 2353
Query 2375 CCCAGCCTCAGCTTCTACAGAGCCATCCAGGGACTTTGGTGACTAATCAACCATCTGGCAATGTTGAATTCATT 2448
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2354 CCCAGCCTCAGCTTCTACAGAGCCATCCAGGGACTTTGGTGACTAATCAACCATCTGGCAATGTTGAATTCATT 2427
Query 2449 TCTGTGCAAAGCCCACCTACAGTGAGTGGTCTTACCAAAAATCCAGTATCCTTGCCATCCTTGCCAAATCCCAC 2522
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2428 TCTGTGCAAAGCCCACCTACAGTGAGTGGTCTTACCAAAAATCCAGTATCCTTGCCATCCTTGCCAAATCCCAC 2501
Query 2523 TAAACCAAACAACGTTCCTTCTGTGCCCAGTCCTAGTATTCAAAGGAACCCTACTGCCAGTGCTGCACCATTGG 2596
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2502 TAAACCAAACAACGTTCCTTCTGTGCCCAGTCCTAGTATTCAAAGGAACCCTACTGCCAGTGCTGCACCATTGG 2575
Query 2597 GAACAACACTTGCTGTGCAGGCTGTTCCAACAGCACACTCTATTGTACAAGCCACAAGGACTTCTTTACCCACA 2670
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2576 GAACAACACTTGCTGTGCAGGCTGTTCCAACAGCACACTCTATTGTACAAGCCACAAGGACTTCTTTACCCACA 2649
Query 2671 GTGGGCCCATCAGGACTCTATAGTCCATCAACTAATCGAGGTCCTATACAGATGAAAATTCCAATTTCTGCATT 2744
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2650 GTGGGCCCATCAGGACTCTATAGTCCATCAACTAATCGAGGTCCTATACAGATGAAAATTCCAATTTCTGCATT 2723
Query 2745 TAGTACTTCGTCTGCTGCAGAACAGAACAGCAATACCACCCCAAGAATTGAAAACCAGACAAACAAAACAATAG 2818
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2724 TAGTACTTCGTCTGCTGCAGAACAGAACAGCAATACCACCCCAAGAATTGAAAACCAGACAAACAAAACAATAG 2797
Query 2819 ATGCTTCTGTCAGTAAGAAAGCAGCTGATAGCACATCACAGTGTGGAAAAGCCACTGGCAGTGATTCAAGTGGT 2892
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2798 ATGCTTCTGTCAGTAAGAAAGCAGCTGATAGCACATCACAGTGTGGAAAAGCCACTGGCAGTGATTCAAGTGGT 2871
Query 2893 GTCATTGATCTCACAATGGATGATGAAGAGAGTGGAGCTTCACAAGACCCCAAAAAACTAAATCACACTCCTGT 2966
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2872 GTCATTGATCTCACAATGGATGATGAAGAGAGTGGAGCTTCACAAG---------------------------- 2917
Query 2967 ATCAACCATGAGTTCTTCTCAGCCTGTGTCACGACCATTGCAACCCATACAACCAGCACCGCCTCTTCAACCAT 3040
Sbjct 2918 -------------------------------------------------------------------------- 2917
Query 3041 CTGGGGTGCCAACAAGTGGACCATCTCAGACCACCATACACTTACTACCTACAGCTCCAACTACCGTGAATGTA 3114
Sbjct 2918 -------------------------------------------------------------------------- 2917
Query 3115 ACACATCGTCCAGTAACTCAGGTGACCACAAGACTCCCTGTACCAAGAGCTCCTGCAAACCACCAGGTGGTTTA 3188
Sbjct 2918 -------------------------------------------------------------------------- 2917
Query 3189 TACAACTCTTCCTGCACCACCAGCTCAGGCTCCCTTGCGAGGAACTGTTATGCAGGCTCCTGCTGTTCGGCAGG 3262
Sbjct 2918 -------------------------------------------------------------------------- 2917
Query 3263 TCAATCCCCAAAATAGTAAGAGATTTTTCTTGTATATGGCCCCAAGATACATG 3315
Sbjct 2918 ----------------------------------------------------- 2917