Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_12261
- Subject:
- XR_001748809.2
- Aligned Length:
- 3510
- Identities:
- 2848
- Gaps:
- 661
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 TAACGGCCCCGGCGCGTGCAAGGGAGAAGCGGGTTTGTTTTTGAATCTGCGGAGGCGGCGGCGGTGGCAGCGGC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GGCGCGGCGACTGAAGCGCGCGAAAAGCTGAGGCGGCAACGTCGGGGACGGCTGCGCGGGACGGCTCTGTAGGA 148
Query 1 -----------------------------------------------ATGGACAGTTTAGAAGAACCTCAGAAA 27
|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AGGAACTTGGTTCCCCCTCCCTCAGCTTCCGCCCCAAAAGATTCAGAATGGACAGTTTAGAAGAACCTCAGAAA 222
Query 28 AAAGTCTTTAAGGCTCGAAAAACGATGAGAGTGAGTGATCGTCAGCAACTTGAAGCAGTGTACAAGGTCAAAGA 101
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AAAGTCTTTAAGGCTCGAAAAACGATGAGAGTGAGTGATCGTCAGCAACTTGAAGCAGTGTACAAGGTCAAAGA 296
Query 102 AGAACTGTTGAAAACTGATGTCAAGCTGTTAAATGGCAACCATGAAAATGGAGATTTGGACCCAACCTCACCTT 175
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AGAACTGTTGAAAACTGATGTCAAGCTGTTAAATGGCAACCATGAAAATGGAGATTTGGACCCAACCTCACCTT 370
Query 176 TGGAAAACATGGATTACATTAAAGACAAGGAAGAGGTGAATGGCATTGAAGAGATTTGTTTTGATCCTGAAGGA 249
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TGGAAAACATGGATTACATTAAAGACAAGGAAGAGGTGAATGGCATTGAAGAGATTTGTTTTGATCCTGAAGGA 444
Query 250 AGTAAAGCAGAATGGAAGGAAACACCCTGTATCCTAAGTGTTAATGTAAAAAACAAGCAGGATGATGATTTAAA 323
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AGTAAAGCAGAATGGAAGGAAACACCCTGTATCCTAAGTGTTAATGTAAAAAACAAGCAGGATGATGATTTAAA 518
Query 324 TTGTGAACCTTTGTCTCCCCATAATATAACTCCAGAACCAGTCTCTAAACTGCCTGCTGAACCAGTTTCTGGTG 397
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TTGTGAACCTTTGTCTCCCCATAATATAACTCCAGAACCAGTCTCTAAACTGCCTGCTGAACCAGTTTCTGGTG 592
Query 398 ATCCAGCCCCTGGTGATCTGGATGCCGGAGATCCAGCCTCCGGAGTACTGGCCTCTGGTGATTCCACCTCTGGT 471
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ATCCAGCCCCTGGTGATCTGGATGCCGGAGATCCAGCCTCCGGAGTACTGGCCTCTGGTGATTCCACCTCTGGT 666
Query 472 GATCCCACCTCTAGCGAGCCCTCCTCTAGTGATGCTGCCTCTGGTGATGCAACCTCTGGTGATGCCCCTTCTGG 545
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GATCCCACCTCTAGCGAGCCCTCCTCTAGTGATGCTGCCTCTGGTGATGCAACCTCTGGTGATGCCCCTTCTGG 740
Query 546 TGATGTGTCCCCTGGTGATGCCACCTCTGGTGATGCCACTGCTGATGATCTCTCCTCTGGTGATCCCACCTCTA 619
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGATGTGTCCCCTGGTGATGCCACCTCTGGTGATGCCACTGCTGATGATCTCTCCTCTGGTGATCCCACCTCTA 814
Query 620 GTGATCCCATCCCAGGTGAACCGGTCCCTGTTGAACCCATTTCTGGTGATTGTGCCGCTGATGATATAGCCTCT 693
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GTGATCCCATCCCAGGTGAACCGGTCCCTGTTGAACCCATTTCTGGTGATTGTGCCGCTGATGATATAGCCTCT 888
Query 694 AGTGAAATAACTTCTGTTGATCTGGCTTCTGGAGCACCAGCTTCCACTGATCCAGCCTCTGATGATCTGGCCTC 767
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AGTGAAATAACTTCTGTTGATCTGGCTTCTGGAGCACCAGCTTCCACTGATCCAGCCTCTGATGATCTGGCCTC 962
Query 768 TGGTGATCTATCCTCTAGTGAACTGGCCTCTGATGATCTGGCCACTGGTGAACTGGCCTCTGATGAGCTGACTT 841
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TGGTGATCTATCCTCTAGTGAACTGGCCTCTGATGATCTGGCCACTGGTGAACTGGCCTCTGATGAGCTGACTT 1036
Query 842 CTGAATCAACCTTTGATCGTACCTTTGAACCAAAGTCTGTACCAGTTTGTGAACCAGTTCCTGAAATTGACAAT 915
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CTGAATCAACCTTTGATCGTACCTTTGAACCAAAGTCTGTACCAGTTTGTGAACCAGTTCCTGAAATTGACAAT 1110
Query 916 ATAGAACCAAGTAGCAATAAAGATGATGATTTTCTTGAAAAAAATGGAGCTGATGAAAAATTAGAGCAAATTCA 989
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 ATAGAACCAAGTAGCAATAAAGATGATGATTTTCTTGAAAAAAATGGAGCTGATGAAAAATTAGAGCAAATTCA 1184
Query 990 GAGTAAAGACTCATTGGATGAGAAAAATAAAGCTGATAATAATATTGATGCTAATGAAGAAACTCTAGAAACAG 1063
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GAGTAAAGACTCATTGGATGAGAAAAATAAAGCTGATAATAATATTGATGCTAATGAAGAAACTCTAGAAACAG 1258
Query 1064 ATGATACAACTATTTGTTCAGATCGACCTCCTGAAAATGAAAAGAAGGTAGAGGAAGATATTATCACAGAGCTT 1137
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 ATGATACAACTATTTGTTCAGATCGACCTCCTGAAAATGAAAAGAAGGTAGAGGAAGATATTATCACAGAGCTT 1332
Query 1138 GCTCTTGGAGAAGATGCTATATCTAGCAGTATGGAAATTGACCAAGGTGAAAAGAATGAAGATGAAACTTCTGC 1211
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GCTCTTGGAGAAGATGCTATATCTAGCAGTATGGAAATTGACCAAGGTGAAAAGAATGAAGATGAAACTTCTGC 1406
Query 1212 AGATCTTGTAGAAACGATTAATGAAAATGTTATTGAAGATAACAAAAGTGAGAATATCTTAGAAAATACAGACT 1285
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 AGATCTTGTAGAAACGATTAATGAAAATGTTATTGAAGATAACAAAAGTGAGAATATCTTAGAAAATACAGACT 1480
Query 1286 CTATGGAGACAGATGAAATCATTCCTATTTTGGAAAAGCTTGCACCTTCTGAGGATGAACTTACTTGCTTTTCT 1359
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CTATGGAGACAGATGAAATCATTCCTATTTTGGAAAAGCTTGCACCTTCTGAGGATGAACTTACTTGCTTTTCT 1554
Query 1360 AAAACATCTCTCCTTCCAATCGATGAGACAAATCCAGATTTGGAAGAGAAAATGGAAAGTTCTTTTGGTTCACC 1433
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 AAAACATCTCTCCTTCCAATCGATGAGACAAATCCAGATTTGGAAGAGAAAATGGAAAGTTCTTTTGGTTCACC 1628
Query 1434 ATCTAAACAAGAAAGTAGTGAGAGTTTGCCAAAAGAAGCCTTTCTGGTCCTCTCTGATGAAGAGGATATTTCGG 1507
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 ATCTAAACAAGAAAGTAGTGAGAGTTTGCCAAAAGAAGCCTTTCTGGTCCTCTCTGATGAAGAGGATATTTCGG 1702
Query 1508 GTGAAAAAGATGAGTCTGAAGTTATATCGCAAAATGAAACGTGCTCTCCAGAAGTAGAAAGTAATGAAAAGGAC 1581
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 GTGAAAAAGATGAGTCTGAAGTTATATCGCAAAATGAAACGTGCTCTCCAGAAGTAGAAAGTAATGAAAAGGAC 1776
Query 1582 AACAGACCTGAGGAAGAAGAGCAAGTAATACATGAAGATGATGAAAGACCTTCTGAGAAAAATGAATTTTCTAG 1655
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 AACAAACCTGAGGAAGAAGAGCAAGTAATACATGAAGATGATGAAAGACCTTCTGAGAAAAATGAATTTTCTAG 1850
Query 1656 ACGAAAACGTTCTAAATCAGAAGACATGGACAATGTACAGTCTAAACGTCGTCGATATATGGAAGAAGAATATG 1729
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 ACGAAAACGTTCTAAATCAGAAGACATGGACAATGTACAGTCTAAACGTCGTCGATATATGGAAGAAGAATATG 1924
Query 1730 AGGCAGAATTTCAAGTAAAGATTACAGCCAAAGGAGACATTAACCAGAAACTTCAAAAGGTTATACAGTGGTTG 1803
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 AGGCAGAATTTCAAGTAAAGATTACAGCCAAAGGAGACATTAACCAGAAACTTCAAAAGGTTATACAGTGGTTG 1998
Query 1804 CTGGAAGAAAAATTGTGTGCGCTGCAGTGTGCTGTATTTGATAAGACTTTGGCAGAATTGAAAACACGAGTGGA 1877
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 CTGGAAGAAAAATTGTGTGCGCTGCAGTGTGCTGTATTTGATAAGACTTTGGCAGAATTGAAAACACGAGTGGA 2072
Query 1878 AAAGATTGAATGTAACAAGAGGCATAAAACAGTTCTCACTGAACTACAGGCCAAGATAGCCAGGTTAACCAAAC 1951
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 AAAGATTGAATGTAACAAGAGGCATAAAACAGTTCTCACTGAACTACAGGCCAAGATAGCCAGGTTAACCAAAC 2146
Query 1952 GCTTTGAAGCAGCCAAAGAAGATCTTAAGAAAAGACATGAACATCCACCCAACCCACCAGTATCACCAGGAAAA 2025
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 GCTTTGAAGCAGCCAAAGAAGATCTTAAGAAAAGACATGAACATCCACCCAACCCACCAGTATCACCAGGAAAA 2220
Query 2026 ACTGTAAATGATGTCAACAGCAATAATAACATGTCTTACAGAAATGCAGGCACAGTGAGACAGATGCTGGAGTC 2099
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 ACTGTAAATGATGTCAACAGCAATAATAACATGTCT-------------------------------------- 2256
Query 2100 CAAAAGAAATGTAAGCGAGAGTGCACCACCATCCTTTCAAACTCCTGTGAATACAGTATCTTCAACCAATCTTG 2173
|||||||||||||||||||||||
Sbjct 2257 ---------------------------------------------------TACAGTATCTTCAACCAATCTTG 2279
Query 2174 TCACTCCTCCAGCAGTTGTCAGTAGTCAACCTAAATTGCAGACTCCAGTGACTTCGGGTTCCCTCACAGCAACG 2247
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2280 TCACTCCTCCAGCAGTTGTCAGTAGTCAACCTAAATTGCAGACTCCAGTGACTTCGGGTTCCCTCACAGCAACG 2353
Query 2248 TCAGTTCTTCCTGCACCCAATACAGCTACTGTAGTTGCTACTACTCAGGTGCCTAGTGGAAATCCCCAGCCTAC 2321
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2354 TCAGTTCTTCCTGCACCCAATACAGCTACTGTAGTTGCTACTACTCAGGTGCCTAGTGGAAATCCCCAGCCTAC 2427
Query 2322 AATCTCTTTACAGCCTTTGCCAGTGATTTTGCATGTACCTGTTGCAGTATCCTCCCAGCCTCAGCTTCTACAGA 2395
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2428 AATCTCTTTACAGCCTTTGCCAGTGATTTTGCATGTACCTGTTGCAGTATCCTCCCAGCCTCAGCTTCTACAGA 2501
Query 2396 GCCATCCAGGGACTTTGGTGACTAATCAACCATCTGGCAATGTTGAATTCATTTCTGTGCAAAGCCCACCTACA 2469
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2502 GCCATCCAGGGACTTTGGTGACTAATCAACCATCTGGCAATGTTGAATTCATTTCTGTGCAAAGCCCACCTACA 2575
Query 2470 GTGAGTGGTCTTACCAAAAATCCAGTATCCTTGCCATCCTTGCCAAATCCCACTAAACCAAACAACGTTCCTTC 2543
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2576 GTGAGTGGTCTTACCAAAAATCCAGTATCCTTGCCATCCTTGCCAAATCCCACTAAACCAAACAACGTTCCTTC 2649
Query 2544 TGTGCCCAGTCCTAGTATTCAAAGGAACCCTACTGCCAGTGCTGCACCATTGGGAACAACACTTGCTGTGCAGG 2617
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2650 TGTGCCCAGTCCTAGTATTCAAAGGAACCCTACTGCCAGTGCTGCACCATTGGGAACAACACTTGCTGTGCAGG 2723
Query 2618 CTGTTCCAACAGCACACTCTATTGTACAAGCCACAAGGACTTCTTTACCCACAGTGGGCCCATCAGGACTCTAT 2691
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2724 CTGTTCCAACAGCACACTCTATTGTACAAGCCACAAGGACTTCTTTACCCACAGTGGGCCCATCAGGACTCTAT 2797
Query 2692 AGTCCATCAACTAATCGAGGTCCTATACAGATGAAAATTCCAATTTCTGCATTTAGTACTTCGTCTGCTGCAGA 2765
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2798 AGTCCATCAACTAATCGAGGTCCTATACAGATGAAAATTCCAATTTCTGCATTTAGTACTTCGTCTGCTGCAGA 2871
Query 2766 ACAGAACAGCAATACCACCCCAAGAATTGAAAACCAGACAAACAAAACAATAGATGCTTCTGTCAGTAAGAAAG 2839
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2872 ACAGAACAGCAATACCACCCCAAGAATTGAAAACCAGACAAACAAAACAATAGATGCTTCTGTCAGTAAGAAAG 2945
Query 2840 CAGCTGATAGCACATCACAGTGTGGAAAAGCCACTGGCAGTGATTCAAGTGGTGTCATTGATCTCACAATGGAT 2913
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2946 CAGCTGATAGCACATCACAGTGTGGAAAAGCCACTGGCAGTGATTCAAGTGGTGTCATTGATCTCACAATGGAT 3019
Query 2914 GATGAAGAGAGTGGAGCTTCACAAGACCCCAAAAAACTAAATCACACTCCTGTATCAACCATGAGTTCTTCTCA 2987
|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3020 GATGAAGAGAGTGGAGCTTCACAAG------------------------------------------------- 3044
Query 2988 GCCTGTGTCACGACCATTGCAACCCATACAACCAGCACCGCCTCTTCAACCATCTGGGGTGCCAACAAGTGGAC 3061
Sbjct 3045 -------------------------------------------------------------------------- 3044
Query 3062 CATCTCAGACCACCATACACTTACTACCTACAGCTCCAACTACCGTGAATGTAACACATCGTCCAGTAACTCAG 3135
Sbjct 3045 -------------------------------------------------------------------------- 3044
Query 3136 GTGACCACAAGACTCCCTGTACCAAGAGCTCCTGCAAACCACCAGGTGGTTTATACAACTCTTCCTGCACCACC 3209
Sbjct 3045 -------------------------------------------------------------------------- 3044
Query 3210 AGCTCAGGCTCCCTTGCGAGGAACTGTTATGCAGGCTCCTGCTGTTCGGCAGGTCAATCCCCAAAATAGTAAGA 3283
Sbjct 3045 -------------------------------------------------------------------------- 3044
Query 3284 GATTTTTCTTGTATATGGCCCCAAGATACATG 3315
Sbjct 3045 -------------------------------- 3044