Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_12277
- Subject:
- XM_017024843.1
- Aligned Length:
- 1413
- Identities:
- 1321
- Gaps:
- 90
Alignment
Query 1 ATGAGGTCCTGCCTGTGGAGATGCAGGCACCTGAGCCAAGGCGTCCAGTGGTCCTTGCTTCTGGCTGTCCTGGT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAGGTCCTGCCTGTGGAGATGCAGGCACCTGAGCCAAGGCGTCCAGTGGTCCTTGCTTCTGGCTGTCCTGGT 74
Query 75 CTTCTTTCTCTTCGCCTTGCCCTCTTTTATTAAGGAGCCTCAAACAAAGCCTTCCAGGCATCAACGCACAGAGA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CTTCTTTCTCTTCGCCTTGCCCTCTTTTATTAAGGAGCCTCAAACAAAGCCTTCCAGGCATCAACGCACAGAGA 148
Query 149 ACATTAAAGAAAGGTCTCTACAGTCCCTGGCAAAGCCTAAGTCCCAGGCACCCACAAGGGCAAGGAGGACAACC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ACATTAAAGAAAGGTCTCTACAGTCCCTGGCAAAGCCTAAGTCCCAGGCACCCACAAGGGCAAGGAGGACAACC 222
Query 223 ATCTATGCAGAGCCAGTGCCAGAGAACAATGCCCTCAACACACAAACCCAGCCCAAGGCCCACACCACCGGAGA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ATCTATGCAGAGCCAGTGCCAGAGAACAATGCCCTCAACACACAAACCCAGCCCAAGGCCCACACCACCGGAGA 296
Query 297 CAGAGGAAAGGAGGCCAACCAGGCACCGCCGGAGGAGCAGGACAAGGTGCCCCACACAGCACAGAGGGCAGCAT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CAGAGGAAAGGAGGCCAACCAGGCACCGCCGGAGGAGCAGGACAAGGTGCCCCACACAGCACAGAGGGCAGCAT 370
Query 371 GGAAGAGCCCAGAAAAAGAGAAAACCATGGTGAACACACTGTCACCCAGAGGGCAAGATGCAGGGATGGCCTCT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GGAAGAGCCCAGAAAAAGAGAAAACCATGGTGAACACACTGTCACCCAGAGGGCAAGATGCAGGGATGGCCTCT 444
Query 445 GGCAGGACAGAGGCACAATCATGGAAGAGCCAGGACACAAAGACGACCAAAGGAAATGGGGGCCAGACCAGGAA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GGCAGGACAGAGGCACAATCATGGAAGAGCCAGGACACAAAGACGACCCAAGGAAATGGGGGCCAGACCAGGAA 518
Query 519 GCTGACGGCCTCCAGGACGGTGTCAGAGAAGCACCAGGGCAAAGCGGCAACCACAGCCAAGACGCTCATTCCCA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GCTGACGGCCTCCAGGACGGTGTCAGAGAAGCACCAGGGCAAAGCGGCAACCACAGCCAAGACGCTCATTCCCA 592
Query 593 AAAGTCAGCACAGAATGCTGGCTCCCACAGGAGCAGTGTCAACAAGGACGAGACAGAAAGGAGTGACCACAGCA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AAAGTCAGCACAGAATGCTGGCTCCCACAGGAGCAGTGTCAACAAGGACGAGACAGAAAGGAGTGACCACAGCA 666
Query 667 GTCATCCCACCTAAGGAGAAGAAACCTCAGGCCACCCCACCCCCTGCCCCTTTCCAGAGCCCCACGACGCAGAG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GTCATCCCACCTAAGGAGAAGAAACCTCAGGCCACCCCACCCCCTGCCCCTTTCCAGAGCCCCACGACGCAGAG 740
Query 741 AAACCAAAGACTGAAGGCCGCCAACTTCAAATCTGAGCCTCGGTGGGATTTTGAGGAAAAATACAGCTTCGAAA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AAACCAAAGACTGAAGGCCGCCAACTTCAAATCTGAGCCTCGGTGGGATTTTGAGGAAAAATACAGCTTCGAAA 814
Query 815 TAGGAGGCCTTCAGACGACTTGCCCTGACTCTGTGAAGATCAAAGCCTCCAAGTCGCTGTGGCTCCAGAAACTC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TAGGAGGCCTTCAGACGACTTGCCCTGACTCTGTGAAGATCAAAGCCTCCAAGTCGCTGTGGCTCCAGAAACTC 888
Query 889 TTTCTGCCCAACCTCACTCTCTTCCTGGACTCCAGACACTTCAACCAGAGTGAGTGGGACCGCCTGGAACACTT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TTTCTGCCCAACCTCACTCTCTTCCTGGACTCCAGACACTTCAACCAGAGTGAGTGGGACCGCCTGGAACACTT 962
Query 963 TGCACCACCCTTTGGCTTCATGGAGCTCAACTACTCCTTGGTGCAGAAGGTCGTGACACGCTTCCCTCCAGTGC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TGCACCACCCTTTGGCTTCATGGAGCTCAACTACTCCTTGGTGCAGAAGGTCGTGACACGCTTCCCTCCAGTGC 1036
Query 1037 CCCAGCAGCAGCTGCTCCTGGCCAGCCTCCCCGCTGGGAGCCTCCGGTGCATCACCTGTGCCGTGGTGGGCAAC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CCCAGCAGCAGCTGCTCCTGGCCAGCCTCCCCGCTGGGAGCCTCCGGTGCATCACCTGTGCCGTGGTGGGCAAC 1110
Query 1111 GGGGGCATCCTGAACAACTCCCACATAGGCCAGGAGATAGACAGTCACGACTACGTGTTCCGATTGAGCGGAGC 1184
||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GGGGGCATCCTGAACAACTCCCACATGGGCCAGGAGATAGACAGTCACGACTACGTGTTCCGATTGAGCGGAGC 1184
Query 1185 TCTCATTAAAGGCTACGAACAGGATGTGGGGACTCGGACATCCTTCTACGGCTTTACCGCCTTCTCCCTGACCC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TCTCATTAAAGGCTACGAACAGGATGTGGGGACTCGGACATCCTTCTACGGCTTTACCGCCTTCTCCCTGACCC 1258
Query 1259 AGTCACTCCTTATATTGGGCAATCGGGGTTTCAAGAACGTGCCTCTTGGGAAGGCACAGACCCCAGGAAGCTTT 1332
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AGTCACTCCTTATATTGGGCAATCGGGGTTTCAAGAACGTGCCTCTTGGGA----------------------- 1309
Query 1333 TCGGGAAGCCCTGCACATGGACAGGTACCTGTTGCTGCACCCAGACTTTCTCCGATACATGAAGAACAGGTTTC 1406
|||||||
Sbjct 1310 -------------------------------------------------------------------AGGTTTC 1316
Query 1407 TGAGGTC 1413
|||||||
Sbjct 1317 TGAGGTC 1323