Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12306
• Subject: NM_001146294.1
• Aligned Length: 1515
• Identities: 1360
• Gaps: 93

Alignment

Query    1  ATGTATATAAAGATGGCCACGTTAGCAAACGGACAGGCTGACAACGCAAGCCTCAGTACCAACGGGCTCGGCAG  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct    1  ATGTATATAAAGATGGCCACGTTAGCAAACGGACAGGCTGACAACGCGAGCCTCAGTACCAACGGGCTAGGCAG  74

Query   75  CAGCCCGGGCAGTGCCGGGCACATGAACGGATTAAGCCACAGCCCGGGGAACCCGTCGACCATTCCCATGAAGG  148
            ||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAGCCCGGGCAGCGCCGGGCATATGAACGGATTAAGCCACAGCCCGGGGAACCCGTCGACCATTCCCATGAAGG  148

Query  149  ACCATGATGCCATCAAGCTGTTCATTGGGCAGATCCCCCGCAACCTGGATGAGAAGGACCTCAAGCCCCTCTTC  222
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACCACGATGCCATCAAGCTGTTCATTGGGCAGATCCCCCGAAACCTGGATGAGAAGGACCTCAAGCCCCTCTTC  222

Query  223  GAGGAGTTTGGCAAAATCTACGAGCTTACGGTTCTGAAGGACAGGTTCACAGGCATGCACAAAGGCTGCGCCTT  296
            ||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  223  GAGGAGTTCGGCAAGATCTACGAGCTTACGGTTCTGAAGGACAGGTTCACAGGCATGCACAAAGGCTGCGCTTT  296

Query  297  CCTCACCTACTGCGAGCGTGAGTCAGCGCTGAAGGCCCAGAGCGCGCTGCACGAGCAGAAGACTCTGCCCGGGA  370
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  297  CCTCACCTACTGCGAGCGTGAGTCAGCGCTGAAGGCCCAGAGCGCGCTGCACGAGCAGAAGACCCTGCCCGGGA  370

Query  371  TGAACCGGCCGATCCAGGTGAAGCCTGCGGACAGCGAGAGCCGAGGAGGTAGTAGCTGCCTGCGCCAGCCCCCT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                          
Sbjct  371  TGAACCGGCCGATCCAGGTGAAGCCTGCGGACAGCGAGAGCCGAGGAG--------------------------  418

Query  445  TCACATAGAAAACTCTTCGTGGGCATGCTCAACAAGCAACAGTCCGAGGACGACGTGCGCCGCCTTTTCGAGGC  518
                |||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  419  ----ATAGAAAACTCTTCGTGGGTATGCTCAACAAGCAACAATCTGAGGACGACGTGCGCCGCCTCTTCGAGGC  488

Query  519  CTTTGGGAACATCGAGGAGTGCACCATCCTGCGCGGGCCCGACGGCAACAGCAAGGGGTGCGCCTTTGTGAAGT  592
            |||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  489  CTTCGGGAACATCGAGGAGTGCACTATCCTGCGCGGGCCGGACGGCAACAGCAAGGGGTGCGCCTTTGTGAAGT  562

Query  593  ACTCCTCCCACGCCGAGGCGCAGGCCGCCATCAACGCGCTACACGGCAGCCAGACCATGCCGGGAGCCTCGTCC  666
            ||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct  563  ACTCCTCCCATGCCGAGGCACAAGCCGCCATCAACGCTCTACATGGCAGCCAGACCATGCCTGGAGCCTCCTCC  636

Query  667  AGTCTGGTGGTCAAGTTCGCCGACACCGACAAGGAGCGCACGATGCGGCGAATGCAGCAGATGGCTGGCCAGAT  740
            ||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  637  AGCCTGGTGGTCAAGTTTGCAGACACTGACAAGGAGCGCACAATGCGACGGATGCAGCAGATGGCTGGCCAGAT  710

Query  741  GGGCATGTTCAACCCCATGGCCATCCCTTTCGGGGCCTACGGCGCCTACGCTCAGGCACTGATGCAGCAGCAAG  814
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  711  GGGCATGTTCAACCCCATGGCCATCCCCTTCGGAGCCTATGGCGCCTATGCTCAGGCACTGATGCAGCAGCAAG  784

Query  815  CGGCCCTGATGGCATCAGTCGCGCAGGGCGGCTACCTGAACCCCATGGCTGCCTTCGCTGCCGCCCAGATGCAG  888
            |.|||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  785  CAGCCCTCATGGCATCGGTCGCGCAAGGAGGCTACCTGAATCCCATGGCTGCCTTCGCTGCCGCCCAAATGCAG  858

Query  889  CAGATGGCGGCCCTCAACATGAATGGCCTGGCGGCCGCACCTATGACCCCAACCTCAGGTGGCAGCACCCCTCC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  859  CAGATGGCGGCCCTCAACATGAATGGCCTGGCAGCCGCACCTATGACCCCAACCTCAGGTGGCAGCACCCCTCC  932

Query  963  GGGCATCACTGCACCAGCCGTGCCTAGCATCCCATCCCCCATTGGGGTGAATGGCTTCACCGGCCTCCCCCCAC  1036
            .|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|
Sbjct  933  AGGCATCACTGCACCAGCTGTGCCTAGCATCCCATCCCCCATTGGGGTGAACGGCTTCACGGGCCTCCCCCCTC  1006

Query 1037  AGGCCAATGGGCAACCTGCTGCGGAAGCTGTGTTCGCCAATGGCATCCACCCCTACCCAGCACAGAGCCCCACC  1110
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1007  AGGCCAATGGGCAGCCTGCTGCGGAAGCTGTGTTTGCCAATGGCATTCACCCCTACCCAGCACAGAGCCCCACC  1080

Query 1111  GCCGCGGACCCCCTGCAGCAGGCCTACGCCGGAGTGCAGCAGTATGCAG---CAGCTGCCTACCCTGCTGCCTA  1181
            ||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081  GCAGCCGACCCCCTGCAGCAGGCCTACGCTGGAGTGCAGCAGTATGCAGGACCAGCTGCCTACCCTGCTGCCTA  1154

Query 1182  TGGTCAGATAAGCCAGGCCTTTCCTCAGCCGCCTCCAATGATCCCCCAGCAGCAGAGAGAAGGGCCCGAGGGCT  1255
            |||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1155  TGGTCAGATTAGCCAGGCCTTTCCTCAGCCACCGCCAATGATTCCCCAGCAACAGAGAGAAGGGCCCGAGGGCT  1228

Query 1256  GTAACCTGTTCATCTACCATCTGCCCCAGGAGTTTGGGGACGCTGAGCTGATGCAGATGTTCCTCCCTTTC---  1326
            ||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   
Sbjct 1229  GTAACCTGCTCATCTACCATCTGCCCCAGGAGTTTGGGGACGCTGAGCTGATGCAGATGTTCCTCCCTTTCGGT  1302

Query 1327  ---------------------------------------------------------GGCTTCGTGAGCTTCGA  1343
                                                                     |||||||||||||||||
Sbjct 1303  AATGTCATCTCCTCGAAAGTGTTTGTGGATCGGGCGACTAACCAAAGTAAATGCTTTGGCTTCGTGAGCTTCGA  1376

Query 1344  CAACCCGGCCAGCGCGCAGACCGCCATCCAGGCCATGAACGGCTTCCAGATCGGCATGAAGAGGCTCAAGGTGC  1417
            |||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1377  CAACCCGGCCAGCGCACAGACCGCCATCCAGGCCATGAACGGCTTCCAGATAGGCATGAAGAGGCTCAAGGTGC  1450

Query 1418  AGCTGAAGCGGCCCAAAGACGCCAATCGCCCGTAC  1452
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1451  AGCTGAAGCGGCCCAAAGACGCCAATCGCCCGTAC  1485