Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_12306
- Subject:
- XM_006525508.2
- Aligned Length:
- 1692
- Identities:
- 1361
- Gaps:
- 267
Alignment
Query 1 ATGTATATAAAGATGGCCACGTTAGCAAACGGACAGGCTGACAACGCAAGCCTCAGTACCAACGGGCTCGGCAG 74
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1 ATGTATATAAAGATGGCCACGTTAGCAAACGGACAGGCTGACAACGCGAGCCTCAGTACCAACGGGCTAGGCAG 74
Query 75 CAGCCCGGGCAGTGCCGGGCACATGAACGGATTAAGCCACAGCCCGGGGAACCCGTCGACCATTCCCATGAAGG 148
||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CAGCCCGGGCAGCGCCGGGCATATGAACGGATTAAGCCACAGCCCGGGGAACCCGTCGACCATTCCCATGAAGG 148
Query 149 ACCATGATGCCATCAAGCTGTTCATTGGGCAGATCCCCCGCAACCTGGATGAGAAGGACCTCAAGCCCCTCTTC 222
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ACCACGATGCCATCAAGCTGTTCATTGGGCAGATCCCCCGAAACCTGGATGAGAAGGACCTCAAGCCCCTCTTC 222
Query 223 GAGGAGTTTGGCAAAATCTACGAGCTTACGGTTCTGAAGGACAGGTTCACAGGCATGCACAAAGGCTGCGCCTT 296
||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 223 GAGGAGTTCGGCAAGATCTACGAGCTTACGGTTCTGAAGGACAGGTTCACAGGCATGCACAAAGGCTGCGCTTT 296
Query 297 CCTCACCTACTGCGAGCGTGAGTCAGCGCTGAAGGCCCAGAGCGCGCTGCACGAGCAGAAGACTCTGCCCGGGA 370
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 297 CCTCACCTACTGCGAGCGTGAGTCAGCGCTGAAGGCCCAGAGCGCGCTGCACGAGCAGAAGACCCTGCCCGGGA 370
Query 371 TGAACCGGCCGATCCAGGTGAAGCCTGCGGACAGCGAGAGCCGAGGAGGTAGTAGCTGCCTGCGCCAGCCCCCT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TGAACCGGCCGATCCAGGTGAAGCCTGCGGACAGCGAGAGCCGAGGAG-------------------------- 418
Query 445 TCACATAGAAAACTCTTCGTGGGCATGCTCAACAAGCAACAGTCCGAGGACGACGTGCGCCGCCTTTTCGAGGC 518
.|.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 419 -AAGATAGAAAACTCTTCGTGGGTATGCTCAACAAGCAACAATCTGAGGACGACGTGCGCCGCCTCTTCGAGGC 491
Query 519 CTTTGGGAACATCGAGGAGTGCACCATCCTGCGCGGGCCCGACGGCAACAGCAAGGGGTGCGCCTTTGTGAAGT 592
|||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 492 CTTCGGGAACATCGAGGAGTGCACTATCCTGCGCGGGCCGGACGGCAACAGCAAGGGGTGCGCCTTTGTGAAGT 565
Query 593 ACTCCTCCCACGCCGAGGCGCAGGCCGCCATCAACGCGCTACACGGCAGCCAGACCATGCCGGGAGCCTCGTCC 666
||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 566 ACTCCTCCCATGCCGAGGCACAAGCCGCCATCAACGCTCTACATGGCAGCCAGACCATGCCTGGAGCCTCCTCC 639
Query 667 AGTCTGGTGGTCAAGTTCGCCGACACCGACAAGGAGCGCACGATGCGGCGAATGCAGCAGATGGCTGGCCAGAT 740
||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 640 AGCCTGGTGGTCAAGTTTGCAGACACTGACAAGGAGCGCACAATGCGACGGATGCAGCAGATGGCTGGCCAGAT 713
Query 741 GGGCATGTTCAACCCCATGGCCATCCCTTTCGGGGCCTACGGCGCCTACGCTCAGGCACTGATGCAGCAGCAAG 814
|||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 714 GGGCATGTTCAACCCCATGGCCATCCCCTTCGGAGCCTATGGCGCCTATGCTCAGGCACTGATGCAGCAGCAAG 787
Query 815 CGGCCCTGATGGCATCAGTCGCGCAGGGCGGCTACCTGAACCCCATGGCTGCCTTCGCTGCCGCCCAGATGCAG 888
|.|||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 788 CAGCCCTCATGGCATCGGTCGCGCAAGGAGGCTACCTGAATCCCATGGCTGCCTTCGCTGCCGCCCAAATGCAG 861
Query 889 CAGATGGCGGCCCTCAACATGAATGGCCTGGCGGCCGCACCTATGACCCCAACCTCAGGTGGCAGCACCCCTCC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 862 CAGATGGCGGCCCTCAACATGAATGGCCTGGCAGCCGCACCTATGACCCCAACCTCAGGTGGCAGCACCCCTCC 935
Query 963 GGGCATCACTGCACCAGCCGTGCCTAGCATCCCATCCCCCATTGGGGTGAATGGCTTCACCGGCCTCCCCCCAC 1036
.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 936 AGGCATCACTGCACCAGCTGTGCCTAGCATCCCATCCCCCATTGGGGTGAACGGCTTCACGGGCCTCCCCCCTC 1009
Query 1037 AGGCCAATGGGCAACCTGCTGCGGAAGCTGTGTTCGCCAATGGCATCCACCCCTACCCAGCACAGAGCCCCACC 1110
|||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1010 AGGCCAATGGGCAGCCTGCTGCGGAAGCTGTGTTTGCCAATGGCATTCACCCCTACCCAGCACAGAGCCCCACC 1083
Query 1111 GCCGCGGACCCCCTGCAGCAGGCCTACGCCGGAGTGCAGCAGTATGCAG---CAGCTGCCTACCCTGCTGCCTA 1181
||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1084 GCAGCCGACCCCCTGCAGCAGGCCTACGCTGGAGTGCAGCAGTATGCAGGACCAGCTGCCTACCCTGCTGCCTA 1157
Query 1182 TGGTCAGATAAGCCAGGCCTTTCCTCAGCCGCCTCCAATGATCCCCCAGCAGCAGAGAGAAGGGCCCGAGGGCT 1255
|||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1158 TGGTCAGATTAGCCAGGCCTTTCCTCAGCCACCGCCAATGATTCCCCAGCAACAGAGAGAAGGGCCCGAGGGCT 1231
Query 1256 GTAACCTGTTCATCTACCATCTGCCCCAGGAGTTTGGGGACGCTGAGCTGATGCAGATGTTCCTCCCTTTC--- 1326
||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1232 GTAACCTGCTCATCTACCATCTGCCCCAGGAGTTTGGGGACGCTGAGCTGATGCAGATGTTCCTCCCTTTCGGT 1305
Query 1327 -------------------------------------------------------------------------- 1326
Sbjct 1306 AATGTCATCTCCTCGAAAGTGTTTGTGGATCGGGCGACTAACCAAAGTAAATGCTTTGGCCGGCACCCCGTGCC 1379
Query 1327 --------------------------------------------------------------GGCTTCGTGAGC 1338
||||||||||||
Sbjct 1380 CTCCCGCTGCCAGGCCCCCTCCTGTCAGGGAGGACAGTGTGCAATAAGCTCCTCCGCCCGCAGGCTTCGTGAGC 1453
Query 1339 TTCGACAACCCGGCCAGCGCGCAGACCGCCATCCAGGCCATGAACGGCTTCCAGATCGGCATGAAGAGGCTCAA 1412
||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1454 TTCGACAACCCGGCCAGCGCACAGACCGCCATCCAGGCCATGAACGGCTTCCAGATAGGCATGAAGAGGCTCAA 1527
Query 1413 GGTGCAGCTGAAGCGGCCCAAAGACGCCAATCGCCCGTAC---------------------------------- 1452
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1528 GGTGCAGCTGAAGCGGCCCAAAGACGCCAATCGCCCGTACTGAGCGCCGGCGGGAGCGTCCCCCGGGGGAGACC 1601
Query 1453 ---------------------------------------------------------------- 1452
Sbjct 1602 AGGACTCGCACAGGGCCAGTCAAATCCACCACAGTCTCGCGCTGAGCTAGGAATAAAGTTCACG 1665