Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12306
• Subject: XM_011246805.1
• Aligned Length: 1692
• Identities: 1388
• Gaps: 240

Alignment

Query    1  ATGTATATAAAGATGGCCACGTTAGCAAACGGACAGGCTGACAACGCAAGCCTCAGTACCAACGGGCTCGGCAG  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct    1  ATGTATATAAAGATGGCCACGTTAGCAAACGGACAGGCTGACAACGCGAGCCTCAGTACCAACGGGCTAGGCAG  74

Query   75  CAGCCCGGGCAGTGCCGGGCACATGAACGGATTAAGCCACAGCCCGGGGAACCCGTCGACCATTCCCATGAAGG  148
            ||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAGCCCGGGCAGCGCCGGGCATATGAACGGATTAAGCCACAGCCCGGGGAACCCGTCGACCATTCCCATGAAGG  148

Query  149  ACCATGATGCCATCAAGCTGTTCATTGGGCAGATCCCCCGCAACCTGGATGAGAAGGACCTCAAGCCCCTCTTC  222
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACCACGATGCCATCAAGCTGTTCATTGGGCAGATCCCCCGAAACCTGGATGAGAAGGACCTCAAGCCCCTCTTC  222

Query  223  GAGGAGTTTGGCAAAATCTACGAGCTTACGGTTCTGAAGGACAGGTTCACAGGCATGCACAAAGGCTGCGCCTT  296
            ||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  223  GAGGAGTTCGGCAAGATCTACGAGCTTACGGTTCTGAAGGACAGGTTCACAGGCATGCACAAAGGCTGCGCTTT  296

Query  297  CCTCACCTACTGCGAGCGTGAGTCAGCGCTGAAGGCCCAGAGCGCGCTGCACGAGCAGAAGACTCTGCCCGGGA  370
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  297  CCTCACCTACTGCGAGCGTGAGTCAGCGCTGAAGGCCCAGAGCGCGCTGCACGAGCAGAAGACCCTGCCCGGGA  370

Query  371  TGAACCGGCCGATCCAGGTGAAGCCTGCGGACAGCGAGAGCCGAGGAGGTAGTAGCTGCCTGCGCCAGCCCCCT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGAACCGGCCGATCCAGGTGAAGCCTGCGGACAGCGAGAGCCGAGGAGGTAGTAGCTGCCTGCGCCAGCCCCCT  444

Query  445  TCAC---ATAGAAAACTCTTCGTGGGCATGCTCAACAAGCAACAGTCCGAGGACGACGTGCGCCGCCTTTTCGA  515
            ||||   |||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  445  TCACAAGATAGAAAACTCTTCGTGGGTATGCTCAACAAGCAACAATCTGAGGACGACGTGCGCCGCCTCTTCGA  518

Query  516  GGCCTTTGGGAACATCGAGGAGTGCACCATCCTGCGCGGGCCCGACGGCAACAGCAAGGGGTGCGCCTTTGTGA  589
            ||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGCCTTCGGGAACATCGAGGAGTGCACTATCCTGCGCGGGCCGGACGGCAACAGCAAGGGGTGCGCCTTTGTGA  592

Query  590  AGTACTCCTCCCACGCCGAGGCGCAGGCCGCCATCAACGCGCTACACGGCAGCCAGACCATGCCGGGAGCCTCG  663
            |||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct  593  AGTACTCCTCCCATGCCGAGGCACAAGCCGCCATCAACGCTCTACATGGCAGCCAGACCATGCCTGGAGCCTCC  666

Query  664  TCCAGTCTGGTGGTCAAGTTCGCCGACACCGACAAGGAGCGCACGATGCGGCGAATGCAGCAGATGGCTGGCCA  737
            |||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCCAGCCTGGTGGTCAAGTTTGCAGACACTGACAAGGAGCGCACAATGCGACGGATGCAGCAGATGGCTGGCCA  740

Query  738  GATGGGCATGTTCAACCCCATGGCCATCCCTTTCGGGGCCTACGGCGCCTACGCTCAGGCACTGATGCAGCAGC  811
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GATGGGCATGTTCAACCCCATGGCCATCCCCTTCGGAGCCTATGGCGCCTATGCTCAGGCACTGATGCAGCAGC  814

Query  812  AAGCGGCCCTGATGGCATCAGTCGCGCAGGGCGGCTACCTGAACCCCATGGCTGCCTTCGCTGCCGCCCAGATG  885
            ||||.|||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  815  AAGCAGCCCTCATGGCATCGGTCGCGCAAGGAGGCTACCTGAATCCCATGGCTGCCTTCGCTGCCGCCCAAATG  888

Query  886  CAGCAGATGGCGGCCCTCAACATGAATGGCCTGGCGGCCGCACCTATGACCCCAACCTCAGGTGGCAGCACCCC  959
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CAGCAGATGGCGGCCCTCAACATGAATGGCCTGGCAGCCGCACCTATGACCCCAACCTCAGGTGGCAGCACCCC  962

Query  960  TCCGGGCATCACTGCACCAGCCGTGCCTAGCATCCCATCCCCCATTGGGGTGAATGGCTTCACCGGCCTCCCCC  1033
            |||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct  963  TCCAGGCATCACTGCACCAGCTGTGCCTAGCATCCCATCCCCCATTGGGGTGAACGGCTTCACGGGCCTCCCCC  1036

Query 1034  CACAGGCCAATGGGCAACCTGCTGCGGAAGCTGTGTTCGCCAATGGCATCCACCCCTACCCAGCACAGAGCCCC  1107
            |.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTCAGGCCAATGGGCAGCCTGCTGCGGAAGCTGTGTTTGCCAATGGCATTCACCCCTACCCAGCACAGAGCCCC  1110

Query 1108  ACCGCCGCGGACCCCCTGCAGCAGGCCTACGCCGGAGTGCAGCAGTATGCAGCAGCTGCCTACCCTGCTGCCTA  1181
            |||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ACCGCAGCCGACCCCCTGCAGCAGGCCTACGCTGGAGTGCAGCAGTATGCAGGACCTGCCTACCCTGCTGCCTA  1184

Query 1182  TGGTCAGATAAGCCAGGCCTTTCCTCAGCCGCCTCCAATGATCCCCCAGCAGCAGAGAGAAGGGCCCGAGGGCT  1255
            |||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGGTCAGATTAGCCAGGCCTTTCCTCAGCCACCGCCAATGATTCCCCAGCAACAGAGAGAAGGGCCCGAGGGCT  1258

Query 1256  GTAACCTGTTCATCTACCATCTGCCCCAGGAGTTTGGGGACGCTGAGCTGATGCAGATGTTCCTCCCTTTC---  1326
            ||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   
Sbjct 1259  GTAACCTGCTCATCTACCATCTGCCCCAGGAGTTTGGGGACGCTGAGCTGATGCAGATGTTCCTCCCTTTCGGT  1332

Query 1327  --------------------------------------------------------------------------  1326
                                                                                      
Sbjct 1333  AATGTCATCTCCTCGAAAGTGTTTGTGGATCGGGCGACTAACCAAAGTAAATGCTTTGGCCGGCACCCCGTGCC  1406

Query 1327  --------------------------------------------------------------GGCTTCGTGAGC  1338
                                                                          ||||||||||||
Sbjct 1407  CTCCCGCTGCCAGGCCCCCTCCTGTCAGGGAGGACAGTGTGCAATAAGCTCCTCCGCCCGCAGGCTTCGTGAGC  1480

Query 1339  TTCGACAACCCGGCCAGCGCGCAGACCGCCATCCAGGCCATGAACGGCTTCCAGATCGGCATGAAGAGGCTCAA  1412
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1481  TTCGACAACCCGGCCAGCGCACAGACCGCCATCCAGGCCATGAACGGCTTCCAGATAGGCATGAAGAGGCTCAA  1554

Query 1413  GGTGCAGCTGAAGCGGCCCAAAGACGCCAATCGCCCGTAC----------------------------------  1452
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                  
Sbjct 1555  GGTGCAGCTGAAGCGGCCCAAAGACGCCAATCGCCCGTACTGAGCGCCGGCGGGAGCGTCCCCCGGGGGAGACC  1628

Query 1453  ----------------------------------------------------------------  1452
                                                                            
Sbjct 1629  AGGACTCGCACAGGGCCAGTCAAATCCACCACAGTCTCGCGCTGAGCTAGGAATAAAGTTCACG  1692