Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12306
• Subject: XM_017317788.1
• Aligned Length: 1602
• Identities: 1388
• Gaps: 150

Alignment

Query    1  ATGTATATAAAGATGGCCACGTTAGCAAACGGACAGGCTGACAACGCAAGCCTCAGTACCAACGGGCTCGGCAG  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct    1  ATGTATATAAAGATGGCCACGTTAGCAAACGGACAGGCTGACAACGCGAGCCTCAGTACCAACGGGCTAGGCAG  74

Query   75  CAGCCCGGGCAGTGCCGGGCACATGAACGGATTAAGCCACAGCCCGGGGAACCCGTCGACCATTCCCATGAAGG  148
            ||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAGCCCGGGCAGCGCCGGGCATATGAACGGATTAAGCCACAGCCCGGGGAACCCGTCGACCATTCCCATGAAGG  148

Query  149  ACCATGATGCCATCAAGCTGTTCATTGGGCAGATCCCCCGCAACCTGGATGAGAAGGACCTCAAGCCCCTCTTC  222
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACCACGATGCCATCAAGCTGTTCATTGGGCAGATCCCCCGAAACCTGGATGAGAAGGACCTCAAGCCCCTCTTC  222

Query  223  GAGGAGTTTGGCAAAATCTACGAGCTTACGGTTCTGAAGGACAGGTTCACAGGCATGCACAAAGGCTGCGCCTT  296
            ||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  223  GAGGAGTTCGGCAAGATCTACGAGCTTACGGTTCTGAAGGACAGGTTCACAGGCATGCACAAAGGCTGCGCTTT  296

Query  297  CCTCACCTACTGCGAGCGTGAGTCAGCGCTGAAGGCCCAGAGCGCGCTGCACGAGCAGAAGACTCTGCCCGGGA  370
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  297  CCTCACCTACTGCGAGCGTGAGTCAGCGCTGAAGGCCCAGAGCGCGCTGCACGAGCAGAAGACCCTGCCCGGGA  370

Query  371  TGAACCGGCCGATCCAGGTGAAGCCTGCGGACAGCGAGAGCCGAGGAGGTAGTAGCTGCCTGCGCCAGCCCCCT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGAACCGGCCGATCCAGGTGAAGCCTGCGGACAGCGAGAGCCGAGGAGGTAGTAGCTGCCTGCGCCAGCCCCCT  444

Query  445  TCACATAGAAAACTCTTCGTGGGCATGCTCAACAAGCAACAGTCCGAGGACGACGTGCGCCGCCTTTTCGAGGC  518
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  445  TCACATAGAAAACTCTTCGTGGGTATGCTCAACAAGCAACAATCTGAGGACGACGTGCGCCGCCTCTTCGAGGC  518

Query  519  CTTTGGGAACATCGAGGAGTGCACCATCCTGCGCGGGCCCGACGGCAACAGCAAGGGGTGCGCCTTTGTGAAGT  592
            |||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTTCGGGAACATCGAGGAGTGCACTATCCTGCGCGGGCCGGACGGCAACAGCAAGGGGTGCGCCTTTGTGAAGT  592

Query  593  ACTCCTCCCACGCCGAGGCGCAGGCCGCCATCAACGCGCTACACGGCAGCCAGACCATGCCGGGAGCCTCGTCC  666
            ||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct  593  ACTCCTCCCATGCCGAGGCACAAGCCGCCATCAACGCTCTACATGGCAGCCAGACCATGCCTGGAGCCTCCTCC  666

Query  667  AGTCTGGTGGTCAAGTTCGCCGACACCGACAAGGAGCGCACGATGCGGCGAATGCAGCAGATGGCTGGCCAGAT  740
            ||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGCCTGGTGGTCAAGTTTGCAGACACTGACAAGGAGCGCACAATGCGACGGATGCAGCAGATGGCTGGCCAGAT  740

Query  741  GGGCATGTTCAACCCCATGGCCATCCCTTTCGGGGCCTACGGCGCCTACGCTCAGGCACTGATGCAGCAGCAAG  814
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGGCATGTTCAACCCCATGGCCATCCCCTTCGGAGCCTATGGCGCCTATGCTCAGGCACTGATGCAGCAGCAAG  814

Query  815  CGGCCCTGATGGCATCAGTCGCGCAGGGCGGCTACCTGAACCCCATGGCTGCCTTCGCTGCCGCCCAGATGCAG  888
            |.|||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  815  CAGCCCTCATGGCATCGGTCGCGCAAGGAGGCTACCTGAATCCCATGGCTGCCTTCGCTGCCGCCCAAATGCAG  888

Query  889  CAGATGGCGGCCCTCAACATGAATGGCCTGGCGGCCGCACCTATGACCCCAACCTCAGGTGGCAGCACCCCTCC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CAGATGGCGGCCCTCAACATGAATGGCCTGGCAGCCGCACCTATGACCCCAACCTCAGGTGGCAGCACCCCTCC  962

Query  963  GGGCATCACTGCACCAGCCGTGCCTAGCATCCCATCCCCCATTGGGGTGAATGGCTTCACCGGCCTCCCCCCAC  1036
            .|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|
Sbjct  963  AGGCATCACTGCACCAGCTGTGCCTAGCATCCCATCCCCCATTGGGGTGAACGGCTTCACGGGCCTCCCCCCTC  1036

Query 1037  AGGCCAATGGGCAACCTGCTGCGGAAGCTGTGTTCGCCAATGGCATCCACCCCTACCCAGCACAGAGCCCCACC  1110
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGGCCAATGGGCAGCCTGCTGCGGAAGCTGTGTTTGCCAATGGCATTCACCCCTACCCAGCACAGAGCCCCACC  1110

Query 1111  GCCGCGGACCCCCTGCAGCAGGCCTACGCCGGAGTGCAGCAGTATGCAGCAGCTGCCTACCCTGCTGCCTATGG  1184
            ||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCAGCCGACCCCCTGCAGCAGGCCTACGCTGGAGTGCAGCAGTATGCAGGACCTGCCTACCCTGCTGCCTATGG  1184

Query 1185  TCAGATAAGCCAGGCCTTTCCTCAGCCGCCTCCAATGATCCCCCAGCAGCAGAGAGAAGGGCCCGAGGGCTGTA  1258
            ||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TCAGATTAGCCAGGCCTTTCCTCAGCCACCGCCAATGATTCCCCAGCAACAGAGAGAAGGGCCCGAGGGCTGTA  1258

Query 1259  ACCTGTTCATCTACCATCTGCCCCAGGAGTTTGGGGACGCTGAGCTGATGCAGATGTTCCTCCCTTTC------  1326
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
Sbjct 1259  ACCTGCTCATCTACCATCTGCCCCAGGAGTTTGGGGACGCTGAGCTGATGCAGATGTTCCTCCCTTTCGGCCGG  1332

Query 1327  -------------------------------------------------------------------------G  1327
                                                                                     |
Sbjct 1333  CACCCCGTGCCCTCCCGCTGCCAGGCCCCCTCCTGTCAGGGAGGACAGTGTGCAATAAGCTCCTCCGCCCGCAG  1406

Query 1328  GCTTCGTGAGCTTCGACAACCCGGCCAGCGCGCAGACCGCCATCCAGGCCATGAACGGCTTCCAGATCGGCATG  1401
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1407  GCTTCGTGAGCTTCGACAACCCGGCCAGCGCACAGACCGCCATCCAGGCCATGAACGGCTTCCAGATAGGCATG  1480

Query 1402  AAGAGGCTCAAGGTGCAGCTGAAGCGGCCCAAAGACGCCAATCGCCCGTAC-----------------------  1452
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                       
Sbjct 1481  AAGAGGCTCAAGGTGCAGCTGAAGCGGCCCAAAGACGCCAATCGCCCGTACTGAGCGCCGGCGGGAGCGTCCCC  1554

Query 1453  ------------------------------------------------  1452
                                                            
Sbjct 1555  CGGGGGAGACCAGGACTCGCACAGGGCAGGATGCTGAACGGGCTACAT  1602