Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_12306
- Subject:
- XM_017317790.1
- Aligned Length:
- 1602
- Identities:
- 1358
- Gaps:
- 180
Alignment
Query 1 ATGTATATAAAGATGGCCACGTTAGCAAACGGACAGGCTGACAACGCAAGCCTCAGTACCAACGGGCTCGGCAG 74
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1 ATGTATATAAAGATGGCCACGTTAGCAAACGGACAGGCTGACAACGCGAGCCTCAGTACCAACGGGCTAGGCAG 74
Query 75 CAGCCCGGGCAGTGCCGGGCACATGAACGGATTAAGCCACAGCCCGGGGAACCCGTCGACCATTCCCATGAAGG 148
||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CAGCCCGGGCAGCGCCGGGCATATGAACGGATTAAGCCACAGCCCGGGGAACCCGTCGACCATTCCCATGAAGG 148
Query 149 ACCATGATGCCATCAAGCTGTTCATTGGGCAGATCCCCCGCAACCTGGATGAGAAGGACCTCAAGCCCCTCTTC 222
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ACCACGATGCCATCAAGCTGTTCATTGGGCAGATCCCCCGAAACCTGGATGAGAAGGACCTCAAGCCCCTCTTC 222
Query 223 GAGGAGTTTGGCAAAATCTACGAGCTTACGGTTCTGAAGGACAGGTTCACAGGCATGCACAAAGGCTGCGCCTT 296
||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 223 GAGGAGTTCGGCAAGATCTACGAGCTTACGGTTCTGAAGGACAGGTTCACAGGCATGCACAAAGGCTGCGCTTT 296
Query 297 CCTCACCTACTGCGAGCGTGAGTCAGCGCTGAAGGCCCAGAGCGCGCTGCACGAGCAGAAGACTCTGCCCGGGA 370
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 297 CCTCACCTACTGCGAGCGTGAGTCAGCGCTGAAGGCCCAGAGCGCGCTGCACGAGCAGAAGACCCTGCCCGGGA 370
Query 371 TGAACCGGCCGATCCAGGTGAAGCCTGCGGACAGCGAGAGCCGAGGAGGTAGTAGCTGCCTGCGCCAGCCCCCT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TGAACCGGCCGATCCAGGTGAAGCCTGCGGACAGCGAGAGCCGAGGAG-------------------------- 418
Query 445 TCACATAGAAAACTCTTCGTGGGCATGCTCAACAAGCAACAGTCCGAGGACGACGTGCGCCGCCTTTTCGAGGC 518
|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 419 ----ATAGAAAACTCTTCGTGGGTATGCTCAACAAGCAACAATCTGAGGACGACGTGCGCCGCCTCTTCGAGGC 488
Query 519 CTTTGGGAACATCGAGGAGTGCACCATCCTGCGCGGGCCCGACGGCAACAGCAAGGGGTGCGCCTTTGTGAAGT 592
|||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 489 CTTCGGGAACATCGAGGAGTGCACTATCCTGCGCGGGCCGGACGGCAACAGCAAGGGGTGCGCCTTTGTGAAGT 562
Query 593 ACTCCTCCCACGCCGAGGCGCAGGCCGCCATCAACGCGCTACACGGCAGCCAGACCATGCCGGGAGCCTCGTCC 666
||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 563 ACTCCTCCCATGCCGAGGCACAAGCCGCCATCAACGCTCTACATGGCAGCCAGACCATGCCTGGAGCCTCCTCC 636
Query 667 AGTCTGGTGGTCAAGTTCGCCGACACCGACAAGGAGCGCACGATGCGGCGAATGCAGCAGATGGCTGGCCAGAT 740
||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 637 AGCCTGGTGGTCAAGTTTGCAGACACTGACAAGGAGCGCACAATGCGACGGATGCAGCAGATGGCTGGCCAGAT 710
Query 741 GGGCATGTTCAACCCCATGGCCATCCCTTTCGGGGCCTACGGCGCCTACGCTCAGGCACTGATGCAGCAGCAAG 814
|||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 711 GGGCATGTTCAACCCCATGGCCATCCCCTTCGGAGCCTATGGCGCCTATGCTCAGGCACTGATGCAGCAGCAAG 784
Query 815 CGGCCCTGATGGCATCAGTCGCGCAGGGCGGCTACCTGAACCCCATGGCTGCCTTCGCTGCCGCCCAGATGCAG 888
|.|||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 785 CAGCCCTCATGGCATCGGTCGCGCAAGGAGGCTACCTGAATCCCATGGCTGCCTTCGCTGCCGCCCAAATGCAG 858
Query 889 CAGATGGCGGCCCTCAACATGAATGGCCTGGCGGCCGCACCTATGACCCCAACCTCAGGTGGCAGCACCCCTCC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 859 CAGATGGCGGCCCTCAACATGAATGGCCTGGCAGCCGCACCTATGACCCCAACCTCAGGTGGCAGCACCCCTCC 932
Query 963 GGGCATCACTGCACCAGCCGTGCCTAGCATCCCATCCCCCATTGGGGTGAATGGCTTCACCGGCCTCCCCCCAC 1036
.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 933 AGGCATCACTGCACCAGCTGTGCCTAGCATCCCATCCCCCATTGGGGTGAACGGCTTCACGGGCCTCCCCCCTC 1006
Query 1037 AGGCCAATGGGCAACCTGCTGCGGAAGCTGTGTTCGCCAATGGCATCCACCCCTACCCAGCACAGAGCCCCACC 1110
|||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1007 AGGCCAATGGGCAGCCTGCTGCGGAAGCTGTGTTTGCCAATGGCATTCACCCCTACCCAGCACAGAGCCCCACC 1080
Query 1111 GCCGCGGACCCCCTGCAGCAGGCCTACGCCGGAGTGCAGCAGTATGCAGCAGCTGCCTACCCTGCTGCCTATGG 1184
||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081 GCAGCCGACCCCCTGCAGCAGGCCTACGCTGGAGTGCAGCAGTATGCAGGACCTGCCTACCCTGCTGCCTATGG 1154
Query 1185 TCAGATAAGCCAGGCCTTTCCTCAGCCGCCTCCAATGATCCCCCAGCAGCAGAGAGAAGGGCCCGAGGGCTGTA 1258
||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1155 TCAGATTAGCCAGGCCTTTCCTCAGCCACCGCCAATGATTCCCCAGCAACAGAGAGAAGGGCCCGAGGGCTGTA 1228
Query 1259 ACCTGTTCATCTACCATCTGCCCCAGGAGTTTGGGGACGCTGAGCTGATGCAGATGTTCCTCCCTTTC------ 1326
|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1229 ACCTGCTCATCTACCATCTGCCCCAGGAGTTTGGGGACGCTGAGCTGATGCAGATGTTCCTCCCTTTCGGCCGG 1302
Query 1327 -------------------------------------------------------------------------G 1327
|
Sbjct 1303 CACCCCGTGCCCTCCCGCTGCCAGGCCCCCTCCTGTCAGGGAGGACAGTGTGCAATAAGCTCCTCCGCCCGCAG 1376
Query 1328 GCTTCGTGAGCTTCGACAACCCGGCCAGCGCGCAGACCGCCATCCAGGCCATGAACGGCTTCCAGATCGGCATG 1401
|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1377 GCTTCGTGAGCTTCGACAACCCGGCCAGCGCACAGACCGCCATCCAGGCCATGAACGGCTTCCAGATAGGCATG 1450
Query 1402 AAGAGGCTCAAGGTGCAGCTGAAGCGGCCCAAAGACGCCAATCGCCCGTAC----------------------- 1452
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1451 AAGAGGCTCAAGGTGCAGCTGAAGCGGCCCAAAGACGCCAATCGCCCGTACTGAGCGCCGGCGGGAGCGTCCCC 1524
Query 1453 ------------------------------------------------ 1452
Sbjct 1525 CGGGGGAGACCAGGACTCGCACAGGGCAGGATGCTGAACGGGCTACAT 1572