Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_12321
- Subject:
- XM_024453665.1
- Aligned Length:
- 1920
- Identities:
- 1794
- Gaps:
- 126
Alignment
Query 1 ------------------------------------ATGAAAGGCAGTAATAGAAATAAGGATCATTCAGCAGA 38
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGGGCTACATCCTGATACACTCACTGTCACAGTAATGAAAGGCAGTAATAGAAATAAGGATCATTCAGCAGA 74
Query 39 AGGAGAAGGGGTTGGAAAACGACCAAAACGAAAGTGTCTTCAGTGGCATCCATTGCTAGCAAAGAAACTTCTTG 112
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AGGAGAAGGGGTTGGAAAACGACCAAAACGAAAGTGTCTTCAGTGGCATCCATTGCTAGCAAAGAAACTTCTTG 148
Query 113 ATTTTTCAGAAGAGGAAGAAGAGGAAGACGAAGAGGAGGATATTGATAAGGTTCAACTTCTTGGGGCCGATGGC 186
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ATTTTTCAGAAGAGGAAGAAGAGGAAGACGAAGAGGAGGATATTGATAAGGTTCAACTTCTTGGGGCCGATGGC 222
Query 187 CTAGAGCAAGATGTTGGTGAAACTGAAGATGATGAATCACCAGAGCAGCGAGCCCGGAGACCAATGAATGCATT 260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CTAGAGCAAGATGTTGGTGAAACTGAAGATGATGAATCACCAGAGCAGCGAGCCCGGAGACCAATGAATGCATT 296
Query 261 TCTTTTATTTTGCAAACGCCATCGCTCTCTTGTACGTCAGGAACACCCCAGGCTTGATAACCGAGGTGCTACCA 334
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TCTTTTATTTTGCAAACGCCATCGCTCTCTTGTACGTCAGGAACACCCCAGGCTTGATAACCGAGGTGCTACCA 370
Query 335 AGATACTAGCTGATTGGTGGGCTGTTCTTGATCCAAAGGAAAAGCAGAAATACACAGACATGGCCAAGGAGTAT 408
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AGATACTAGCTGATTGGTGGGCTGTTCTTGATCCAAAGGAAAAGCAGAAATACACAGACATGGCCAAGGAGTAT 444
Query 409 AAGGATGCATTTATGAAAGCAAATCCTGGCTACAAATGGTGTCCTACCACAAACAAGCCTGTGAAATCCCCAAC 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AAGGATGCATTTATGAAAGCAAATCCTGGCTACAAATGGTGTCCTACCACAAACAAGCCTGTGAAATCCCCAAC 518
Query 483 ACCCACTGTCAATCCACGAAAGAAACTTTGGGCCTTCCCATCTGACTCTTCAAGAGACTTGCCAAGCCCCAAGA 556
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 ACCCACTGTCAATCCACGAAAGAAACTTTGGGCCTTCCCATCTGACTCTTCAAGAGACTTGCCAAGCCCCAAGA 592
Query 557 AAGCAAAGACTGAAGAAATGCCTCAGCTTAACTTTGGAATGGCTGATCCTACTCAAATGGGAGGCCTGAGTATG 630
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AAGCAAAGACTGAAGAAATGCCTCAGCTTAACTTTGGAATGGCTGATCCTACTCAAATGGGAGGCCTGAGTATG 666
Query 631 CTGCTGTTAGCTGGAGAACATGCTCTTGGCACACCAGAGGTATCCTCTGGCACATGCAGGCCTGATGTTTCAGA 704
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CTGCTGTTAGCTGGAGAACATGCTCTTGGCACACCAGAGGTATCCTCTGGCACATGCAGGCCTGATGTTTCAGA 740
Query 705 ATCTCCTGAATTACGTCAGAAGTCACCATTGTTTCAGTTTGCCGAGATATCTTCAAGTACGTCCCACTCTGATG 778
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 ATCTCCTGAATTACGTCAGAAGTCACCATTGTTTCAGTTTGCCGAGATATCTTCAAGTACGTCCCACTCTGATG 814
Query 779 CTTCTACAAAGCAGTGTCAAACATCTGCCTTGTTTCAGTTTGCAGAGATTTCTTCAAACACTTCGCAGTTGGGT 852
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CTTCTACAAAGCAGTGTCAAACATCTGCCTTGTTTCAGTTTGCAGAGATTTCTTCAAACACTTCGCAGTTGGGT 888
Query 853 GGTGCTGAGCCTGTAAAACGCTGTGGAAAGTCTGCACTCTTTCAACTGGCAGAGGAAAACGAAGCTCAGGAAAA 926
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GGTGCTGAGCCTGTAAAACGCTGTGGAAAGTCTGCACTCTTTCAACTGGCAGAGGAAAACGAAGCTCAGGAAAA 962
Query 927 GGAAACTCCTCTGATCATGAAGGGTGTTGGAATGAAGAAAGCTGGACATTTAGTCAGAGTGGGACCAGTGGGAG 1000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GGAAACTCCTCTGATCATGAAGGGTGTTGGAATGAAGAAAGCTGGACATTTAGTCAGAGTGGGACCAGTGGGAG 1036
Query 1001 CAAGAAGTTCAAGAAGACAAAGCCAAAAGAAGACTGTCTCCTTGGCTCCGCAAAGCTGGATGAAGAATTTGAAA 1074
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CAAGAAGTTCAAGAAGACAAAGCCAAAAGAAGACTGTCTCCTTGGCTCCGCAAAGCTGGATGAAGAATTTGAAA 1110
Query 1075 AAAAATTCAACAGCCTCCCTCAATATAGTCCTGTTACATTTGACCGGAAATGTGTACCTGTCCCAAGAAAAAAG 1148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AAAAATTCAACAGCCTCCCTCAATATAGTCCTGTTACATTTGACCGGAAATGTGTACCTGTCCCAAGAAAAAAG 1184
Query 1149 AAGAAGACTGGAAATGTGTCCTCAGAACCGACTAAAACCAGCAAAGGTCCTTTCCAGTCTCAGAAAAAGAACTT 1222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 AAGAAGACTGGAAATGTGTCCTCAGAACCGACTAAAACCAGC-------------------------------- 1226
Query 1223 ATTCCACAAAATTGTCAGCAAATATAAGCACAAAAAGGAGAAGCCCAATGTTCCGGAAAAAGGAAGTGGGGATA 1296
||||||||||||||||
Sbjct 1227 ----------------------------------------------------------AAAGGAAGTGGGGATA 1242
Query 1297 AATGGTCAAACAAGCAACTCTTCTTGGATGCCATTCACCCTACAGAAGCCATATTTTCAGAAGACAGAAACACC 1370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1243 AATGGTCAAACAAGCAACTCTTCTTGGATGCCATTCACCCTACAGAAGCCATATTTTCAGAAGACAGAAACACC 1316
Query 1371 ATGGAGCCTGTTCATAAGGTTAAAAATATCCCATCCATTTTCAACACTCCAGAGCCAACAACAACGCAAGAACC 1444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1317 ATGGAGCCTGTTCATAAGGTTAAAAATATCCCATCCATTTTCAACACTCCAGAGCCAACAACAACGCAAGAACC 1390
Query 1445 TTTGGTGGGCAGCCAAAAGAGAAAAGCAAGGAAAACCAAGATTACACACCTTGTCAGGACAGCAGATGGCCGGG 1518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1391 TTTGGTGGGCAGCCAAAAGAGAAAAGCAAGGAAAACCAAGATTACACACCTTGTCAGGACAGCAGATGGCCGGG 1464
Query 1519 TATCACCAGCAGGAGGTACTTTGGATGACAAACCAAAGGAACAACTGCAGAGGAGTCTCCCTAAAGCAACTGAG 1592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1465 TATCACCAGCAGGAGGTACTTTGGATGACAAACCAAAGGAACAACTGCAGAGGAGTCTCCCTAAAGCAACTGAG 1538
Query 1593 ACAGACTGCAATGACAAATGCTCACACAACACCGAGGTCGGGGAGACGCGGAGCAGTACTCCAGAAATGCCTGC 1666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1539 ACAGACTGCAATGACAAATGCTCACACAACACCGAGGTCGGGGAGACGCGGAGCAGTACTCCAGAAATGCCTGC 1612
Query 1667 CGTGTCTGCGTTCTTTAGCCTCGCTGCGCTGGCTGAAGTGGCAGCCATGGAAAATGTGCACAGAGGTCAGAGGT 1740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1613 CGTGTCTGCGTTCTTTAGCCTCGCTGCGCTGGCTGAAGTGGCAGCCATGGAAAATGTGCACAGAGGTCAGAGGT 1686
Query 1741 CAACTCCGCTCACCCATGATGGACAGCCAAAAGAAATGCCGCAGGCTCCTGTACTTATTTCCTGCGCTGACCAG 1814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1687 CAACTCCGCTCACCCATGATGGACAGCCAAAAGAAATGCCGCAGGCTCCTGTACTTATTTCCTGCGCTGACCAG 1760
Query 1815 TGAAGCGCCCTTTCATTGTAAAACATTGTGCTTTACCTACTACCCTAGCCTTGTCTTTACCGAGGGATGC 1884
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1761 TGAAGCGCCCTTTCATTGTAAAACATTGTGCTTTACCTACTACCCTAGCCTTGTCTTTACCGAGGGATGC 1830