Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_12338
- Subject:
- XM_005264439.4
- Aligned Length:
- 2217
- Identities:
- 1511
- Gaps:
- 705
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGCCATCAGCATGTACGCACGGGCCGGGATTGATGACATGTCCATGGAGAACAAGCCCCTGTATCAGATGCGG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CTGCTGTCGGAGGCTTTTGTCATCAAAGCATGCCTCCGGCTTCTTGGGGGAACACAGTCCCGGTGGTCAGAGGT 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 CCTGCAGGGGAGGCCTCTCTCTGGAACGCCTACCCAACTCCATCGCCTCCCGCTTCCGCCTGACAGAGAGGGAG 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 GAGGAAGTGATCACCTGTTTTGAGAGGGCCTCCTGGATCGCTCAGGTGTTCCTGCAGGAATTGGAGAAGACCAC 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 AAATAACAGCACGTCGAGGCATCTGAAAGGCTGTCACCCGCTTGACTATGAGCTCACCTACTTCCTGGAAGCTG 370
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 371 CCCTCCAGAGCGCCTATGTGAAAAACCTGAAGAAGGGGAACATCGTGAAGGGCATGAGAGAGCTCCGGGAGGTG 444
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 445 CTGCGGACTGTGGAGACCAAAGCAACTCAGAACTTCAAAGTGATGGCGGCCAAGCACCTGGCGGGGGTCCTGCT 518
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 519 GCACTCCCTGAGTGAGGAGTGCTACTGGAGCCCCCTGTCCCACCCTCTGCCTGAGTTCATGGGCAAGGAGGAGA 592
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 593 GTTCTTTCGCCACTCAGGCCCTGCGGAAACCTCACCTCTATGAAGGAGACAACCTCTACTGCCCCAAGGACAAC 666
Query 1 ---------------------------------------ATGGCAACTCGAGATGTGGTGCTGAGCCGGGTGCC 35
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ATCGAGGAAGCCCTCCTGCTCCTCCTCATCAGCGAATCCATGGCAACTCGAGATGTGGTGCTGAGCCGGGTGCC 740
Query 36 GGAGCAGGAGGAGGACCGGACAGTGAGCTTGCAGAATGCCGCAGCCATCTATGACCTCCTGAGCATCACGTTGG 109
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GGAGCAGGAGGAGGACCGGACAGTGAGCTTGCAGAATGCCGCAGCCATCTATGACCTCCTGAGCATCACGTTGG 814
Query 110 GCAGAAGGGGACAGTACGTCATGCTCTCGGAGTGCCTGGAGCGAGCCATGAAGTTTGCGTTTGGAGAATTTCAC 183
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GCAGAAGGGGACAGTACGTCATGCTCTCGGAGTGCCTGGAGCGAGCCATGAAGTTTGCGTTTGGAGAATTTCAC 888
Query 184 CTTTGGTACCAGGTGGCCCTCTCCATGGTGGCTTGTGGGAAGTCAGCCTACGCTGTGTCCCTGCTGCGGGAGTG 257
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CTTTGGTACCAGGTGGCCCTCTCCATGGTGGCTTGTGGGAAGTCAGCCTACGCTGTGTCCCTGCTGCGGGAGTG 962
Query 258 TGTGAAGTTGCGGCCCTCGGACCCCACCGTGCCCCTGATGGCCGCGAAGGTCTGCATCGGGTCCCTTCGCTGGC 331
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TGTGAAGTTGCGGCCCTCGGACCCCACCGTGCCCCTGATGGCCGCGAAGGTCTGCATCGGGTCCCTTCGCTGGC 1036
Query 332 TAGAGGAAGCAGAGCACTTTGCCATGATGGTGATCAGCCTCGGAGAGGAAGCCGGGGAGTTCCTCCCCAAGGGC 405
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TAGAGGAAGCAGAGCACTTTGCCATGATGGTGATCAGCCTCGGAGAGGAAGCCGGGGAGTTCCTCCCCAAGGGC 1110
Query 406 TACCTGGCTCTGGGTCTCACCTATAGCCTGCAGGCCACCGACGCCACCCTGAAGTCCAAGCAAGATGAATTGCA 479
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TACCTGGCTCTGGGTCTCACCTATAGCCTGCAGGCCACCGACGCCACCCTGAAGTCCAAGCAAGATGAATTGCA 1184
Query 480 CCGGAAGGCACTGCAGACGCTGGAGAGGGCTCAGCAGCTGGCGCCCAGTGACCCCCAGGTCATCCTCTATGTCT 553
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CCGGAAGGCACTGCAGACGCTGGAGAGGGCTCAGCAGCTGGCGCCCAGTGACCCCCAGGTCATCCTCTATGTCT 1258
Query 554 CGCTGCAGCTGGCCCTCGTCCGACAGATCTCCAGTGCCATGGAGCAGCTGCAGGAGGCCCTGAAGGTACGCAAG 627
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CGCTGCAGCTGGCCCTCGTCCGACAGATCTCCAGTGCCATGGAGCAGCTGCAGGAGGCCCTGAAGGTACGCAAG 1332
Query 628 GATGATGCCCACGCCCTCCACCTGCTGGCACTGCTCTTCTCTGCCCAGAAGCACCACCAGCATGCCCTGGATGT 701
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GATGATGCCCACGCCCTCCACCTGCTGGCACTGCTCTTCTCTGCCCAGAAGCACCACCAGCATGCCCTGGATGT 1406
Query 702 TGTCAACATGGCCATCACCGAGCACCCTGGGAACTTCAACCTGATGTTCACCAAGGTGAAGCTGGAGCAGGTGC 775
|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TGTCAACATGGCCATCACCGAGCACCCTGAGAACTTCAACCTGATGTTCACCAAGGTGAAGCTGGAGCAGGTGC 1480
Query 776 TGAAAGGCCCAGAGGAAGCCCTCGTGACCTGCAGACAAGTGCTGAGGCTGTGGCAGACCCTGTACAGCTTCTCC 849
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TGAAAGGCCCAGAGGAAGCCCTCGTGACCTGCAGACAAGTGCTGAGGCTGTGGCAGACCCTGTACAGCTTCTCC 1554
Query 850 CAGCTGGGAGGCCTAGAAAAGGATGGCAGCTTCGGTGAGGGCCTCACCATGAAGAAGCAGAGTGGCATGCACCT 923
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CAGCTGGGAGGCCTAGAAAAGGATGGCAGCTTCGGTGAGGGCCTCACCATGAAGAAGCAGAGTGGCATGCACCT 1628
Query 924 GACTTTGCCTGATGCCCATGATGCAGACTCTGGCTCCCGGCGGGCTTCGTCCATCGCCGCCTCCCGGCTGGAGG 997
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GACTTTGCCTGATGCCCATGATGCAGACTCTGGCTCCCGGCGGGCTTCGTCCATCGCCGCCTCCCGGCTGGAGG 1702
Query 998 AGGCCATGTCAGAGCTGACTATGCCCTCTTCGGTCCTGAAGCAGGGCCCCATGCAGCTGTGGACCACGCTGGAA 1071
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 AGGCCATGTCAGAGCTGACTATGCCCTCTTCGGTCCTGAAGCAGGGCCCCATGCAGCTGTGGACCACGCTGGAA 1776
Query 1072 CAGATCTGGCTGCAGGCTGCTGAGCTGTTCATGGAGCAGCAGCACCTCAAGGAAGCAGGTTTCTGCATCCAGGA 1145
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 CAGATCTGGCTGCAGGCTGCTGAGCTGTTCATGGAGCAGCAGCACCTCAAGGAAGCAGGTTTCTGCATCCAGGA 1850
Query 1146 GGCGGCGGGCCTCTTCCCCACTTCTCACTCAGTACTCTATATGCGGGGCCGGCTGGCTGAGGTGAAGGGCAACC 1219
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 GGCGGCGGGCCTCTTCCCCACTTCTCACTCAGTACTCTATATGCGGGGCCGGCTGGCTGAGGTGAAGGGCAACC 1924
Query 1220 TGGAGGAGGCCAAGCAGCTGTACAAGGAGGCGCTCACGGTGAACCCAGATGGCGTGCGCATCATGCATAGCCTG 1293
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 TGGAGGAGGCCAAGCAGCTGTACAAGGAGGCGCTCACGGTGAACCCAGATGGCGTGCGCATCATGCATAGCCTG 1998
Query 1294 GGTCTGATGCTGAGTCGGCTGGGCCACAAGAGCTTGGCCCAGAAGGTGCTTCGTGATGCCGTGGAGAGGCAGAG 1367
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 GGTCTGATGCTGAGTCGGCTGGGCCACAAGAGCTTGGCCCAGAAGGTGCTTCGTGATGCCGTGGAGAGGCAGAG 2072
Query 1368 TACGTGCCACGAGGCGTGGCAGGGCCTGGGCGAGGTGCTGCAGGCCCAGGGCCAGAACGAGGCTGCCGTTGACT 1441
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 TACGTGCCACGAGGCGTGGCAGGGCCTGGGCGAGGTGCTGCAGGCCCAGGGCCAGAACGAGGCTGCCGTTGACT 2146
Query 1442 GCTTCCTCACCGCCCTTGAGCTGGAGGCCAGCAGCCCTGTACTGCCCTTCTCCATCATCCCCAGAGAGCTC 1512
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 GCTTCCTCACCGCCCTTGAGCTGGAGGCCAGCAGCCCTGTACTGCCCTTCTCCATCATCCCCAGAGAGCTC 2217