Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12375
• Subject: XM_011544600.3
• Aligned Length: 1422
• Identities: 1093
• Gaps: 321

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGAGAAGCAACTGTCACTCTCTGGAGGTGGAGACTGCCGTGATTCACAAAGACAAGAGGATGGATCATGAAGC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CGCCCAGCTGGAGAAGCAGCATGTGCACAATGTGTACGAGAGCACAGCCCCTTACTTCAGCGACCTGCAGAGCA  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  AAGCCTGGCCTCGTGTCCGCCAGTTCCTGCAAGAGCAGAAGCCAGGCAGCCTCATCGCTGACATAGGTTGTGGG  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  ACTGGAAAATATCTTAAAGTGAACAGCCAGGTACATACCGTGGGCTGTGACTACTGTGGGCCACTGGTAGAGAT  296

Query    1  -------------------------ATGGTATGTGACAACCTTAATCTCCCCTTTAGGGATGAGGGCTTCGATG  49
                                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGCCCGGAATAGAGGATGTGAAGCCATGGTATGTGACAACCTTAATCTCCCCTTTAGGGATGAGGGCTTCGATG  370

Query   50  CCATCATCTCCATAGGAGTCATACATCATTTTTCTACAAAACAAAGAAGAATCAGAGCAATAAAAGAAATGGCC  123
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCATCATCTCCATAGGAGTCATACATCATTTTTCTACAAAACAAAGAAGAATCAGAGCAATAAAAGAAATGGCC  444

Query  124  AGGGTCTTAGTTCCCGGAGGCCAACTGATGATTTACGTTTGGGCAATGGAACAAAAGAACCGTCGCTTTGAGAA  197
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  445  AGGGTCTTAGTTCCCGGAGGCCAACTGATGATTTACGTTTGGGCAATGGAACAAAAGAACCGTCACTTTGAGAA  518

Query  198  GCAAGACGTGCTTGTTCCATGGAACAGGGCCCTGTGTTCCCAGCTCTTCTCAGAGTCCAGCCAGTCTGGGAGGA  271
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCAAGACGTGCTTGTTCCATGGAACAGGGCTCTGTGTTCCCAGCTCTTCTCAGAGTCCAGCCAGTCTGGGAGGA  592

Query  272  AGAGGCAGTGTGGATACCCAGAAAGAGGCCATCCCTACCATCCTCCTTGCTCTGAGTGTAGCTGTTCTGTTTGT  345
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGAGGCAGTGTGGATACCCAGAAAGAGGCCATCCCTACCATCCTCCTTGCTCTGAGTGTAGCTGTTCTGTTTGT  666

Query  346  TTTAAAGAGCAGGGTGGTTCAAAACGGTCCCACAGTGTGGGCTATGAACCTGCTATGGCAAGAACCTGTTTTGC  419
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TTTAAAGAGCAGTGTGGTTCAAAACGGTCCCACAGCGTGGGCTATGAACCTGCTATGGCAAGAACCTGTTTTGC  740

Query  420  AAATATTTCTAAGGAAGGCGAGGAAGAATATGGATTTTACAGCACATTAGGAAAATCGTTTCGTTCCTGGTTTT  493
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AAATATTTCTAAGGAAGGCGAGGAAGAATATGGATTTTACAGCACATTAGGAAAATCGTTTCGTTCCTGGTTTT  814

Query  494  TCTCCAGATCTTTGGATGAATCGACTCTGAGGAAGCAAATTGAAAGAGTAAGACCCTTGAAAAACACAGAAGTT  567
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCTCCAGATCTTTGGATGAATCGACTCTGAGGAAGCAAATTGAAAGAGTAAGACCCTTGAAAAACACAGAAGTT  888

Query  568  TGGGCCAGTAGCACTGTAACAGTCCAGCCTTCCAGACACTCTAGTCTAGACTTTGATCACCAAGAGCCATTTTC  641
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TGGGCCAGTAGCACTGTAACAGTCCAGCCTTCCAGACACTCTAGTTTAGACTTTGATCACCAAGAGCCATTTTC  962

Query  642  AACAAAAGAGCAAAGTTTAGATGAGGAAGTGTTTGTGGAATCTTCTTCTGGAAAACACTTGGAGTGGCTGAGAG  715
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AACAAAAGGGCAAAGTTTAGATGAGGAAGTGTTTGTGGAATCTTCTTCTGGAAAACACTTGGAGTGGCTGAGAG  1036

Query  716  CACCAGGCACTCTGAAACATTTAAATGGAGACCATCAAGGGGAAATGAGGAGAAATGGAGGGGGAAATTTTCTG  789
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CACCAGGCACTCTGAAACATTTAAATGGAGACCATCAAGGGGAAATGAGGAGAAATGGAGGGGGAAATTTTCTG  1110

Query  790  GATAGCACTAATACTGGTGTGAATTGTGTGGATGCAGGCAACATAGAAGATGATAATCCTTCTGCTAGTAAAAT  863
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GATAGCACTAATACTGGTGTGAATTGTGTGGATGCAGGCAACATAGAAGATGATAATCCTTCTGCTAGTAAAAT  1184

Query  864  ATTGAGAAGGATTTCTGCAGTCGATTCCACAGATTTCAACCCAGATGATACAATGTCTGTCGAAGATCCACAGA  937
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  ATTGAGAAGGATTTCTGCAGTTGATTCCACAGATTTCAACCCAGATGATACAATGTCTGTCGAAGATCCACAGA  1258

Query  938  CTGATGTTTTGGACTCCACAGCCTTTATGCGCTACTACCATGTGTTTCGAGAAGGGGAGCTCTGCAGTCTGCTC  1011
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CTGATGTTTTGGACTCCACAGCCTTTATGCGCTACTACCATGTGTTTCGAGAAGGGGAGCTCTGCAGTCTGCTC  1332

Query 1012  AAGGAGAATGTGTCAGAGCTCCGTATCCTGAGTTCTGGGAATGATCATGGTAACTGGTGTATCATTGCAGAGAA  1085
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AAGGAGAATGTGTCAGAGCTCCGTATCCTGAGTTCTGGGAATGATCATGGTAACTGGTGTATCATTGCAGAGAA  1406

Query 1086  AAAGGGAGGTTGTGAT  1101
            ||||.|||||||||||
Sbjct 1407  AAAGAGAGGTTGTGAT  1422