Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12410
• Subject: XM_006516086.3
• Aligned Length: 1434
• Identities: 1177
• Gaps: 141

Alignment

Query    1  ATGTTATCAGATGAGTTAGAATCCAAACCAGAGCTCCTGGTACAGTTTGTTCAGAATACGTCCATCCCATTGGG  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||..||||
Sbjct    1  ATGTTATCAGATGAGTTAGAATCCAAACCAGAGCTCCTGGTTCAGTTTGTTCAGAATACCTCCATCCCCCTGGG  74

Query   75  ACAGGGGCTTGTAGAATCAGAAGCTAAAGATATTACTTGCTTGTCCCTCCTTCCCGTGACTGAAGCCTCAGAAT  148
            |||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||||
Sbjct   75  ACAAGGGCTAGTAGAATCAGAAGCTAAAGACATTACTTGCTTATCCCTCCTTCCAGTGACCGAGGCCTCAGAAT  148

Query  149  GCAGTCGGCTAATGTTACCAGATGATACTACAAATCATTCTAACTCCTCCAAGGAGGTCCCTTCCTCAGCTGTT  222
            ||||.||.|||||||||||||||||.|||.||||||||.||||.||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  149  GCAGCCGACTAATGTTACCAGATGAAACTCCAAATCATGCTAATTCCTCCAAGGAGGTCCCTTCTTCAGCTGTT  222

Query  223  TTGAGAAGCCTTCGGGTGAATGTGGGTCCAGACGGAGAGGAGACGAGAGCTCAGACTGTACAGAAATCCCCGGA  296
            |||||.|||||||.||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct  223  TTGAGGAGCCTTCAGGTGAATGTGGGCCCAGACGGAGAAGAGACAAGGGCTCAGACTGTACAGAAGTCCCCAGA  296

Query  297  GTTTTTGTCCACTTCAGAGTCTTCTAGCTTGTTGCAAGATCTACAGCCAAGTGATAGCACTTCTTTTATTCTTC  370
            |||..||.||||..|||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct  297  GTTCCTGACCACACCAGAGTCGCCTAGCTTGTTGCAAGATCTACAGCCAAGTGATAGCACTTCCTTCATTCTTC  370

Query  371  TTAACCTAACAAGAGCAGGTCTGGGCTCTTCAGCTGAGCACTTAGTGTTTGTACAGGATGAGGCAGAAGATTCA  444
            |.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||.||||.||.|||
Sbjct  371  TGAACCTAACGAGAGCAGGGCTGGGCTCTTCAGCTGAGCACTTTGTGTTTGTTCAGGATGAGACAGAGGACTCA  444

Query  445  GGGAATGATTTCCTCTCCAGTGAGAGCACAGACAGTAGCATTCCATGGTTCCTCCGGGTTCAGGAGTTGGCCCA  518
            |||..|||.||||||||...|||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||..|||||||
Sbjct  445  GGGGCTGACTTCCTCTCTGCTGAGAGCACAGACAGCAGTATCCCATGGTTCCTCCGGGTTCAGGAACTGGCCCA  518

Query  519  TGACAGTTTGATTGCTGCTACTCGTGCACAACTGGCAAAGAATGCAAAAACCAGCAGCAATGGAGAAAATGTCC  592
            |||||||.|||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||..|||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGACAGTCTGATTGCGGCTACTCGTGCACAGCTGGCCAAGAATGCAAAAACTGGCAGCAATGGAGAAAATGTCC  592

Query  593  ACCTTGGTTCTGGTGATGGGCAGTCAAAAGATTCTGGGCCCCTTCCTCAAGTGGAAAAGAAGCTCAAGTGTACA  666
            |||||||.||||||||||||||..|||||||.|||||.|||||||||||||.|||.||||||||||||||.|||
Sbjct  593  ACCTTGGCTCTGGTGATGGGCAACCAAAAGACTCTGGTCCCCTTCCTCAAGCGGAGAAGAAGCTCAAGTGCACA  666

Query  667  GTTGAAGGTTGTGACCGGACATTTGTATGGCCAGCTCACTTTAAATACCACCTCAAGACTCATCGAAATGACCG  740
            ||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||.||||||||.||
Sbjct  667  GTTGAAGGCTGTGACCGGACATTTGTGTGGCCAGCTCACTTCAAGTACCACCTTAAAACTCACCGAAATGAGCG  740

Query  741  CTCCTTCATCTGTCCTGCAGAAGGTTGTGGGAAAAGCTTCTATGTGCTGCAGAGGCTGAAGGTGCACATGAGGA  814
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTCCTTCATCTGCCCTGCAGAAGGTTGTGGGAAAAGCTTTTATGTGCTGCAGAGGCTGAAGGTGCACATGAGGA  814

Query  815  CCCACAATGGAGAGAAGCCCTTTATGTGCCATGAGTCTGGCTGTGGTAAGCAGTTTACTACAGCTGGAAACCTG  888
            |.||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct  815  CACACAATGGGGAGAAACCCTTTATGTGCCACGAGTCTGGGTGTGGTAAGCAGTTCACTACAGCTGGGAACCTG  888

Query  889  AAGAACCACCGGCGCATCCACACAGGAGAGAAACCTTTCCTTTGTGAAGCCCAAGGATGTGGCCGTTCCTTTGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAGAACCACCGGCGCATCCACACAGGAGAGAAGCCTTTTCTCTGTGAAGCCCAGGGATGTGGCCGTTCCTTTGC  962

Query  963  TGAGTATTCTAGCCTCCGAAAACATCTGGTGGTTCACTCAGGAGAGAAGCCTCATCAGTGCCAAGTCTGTGGGA  1036
            |||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  963  TGAGTATTCAAGCCTCCGGAAACATCTGGTAGTTCACTCAGGTGAGAAGCCTCATCAGTGCCAGGTCTGTGGGA  1036

Query 1037  AGACCTTCTCTCAGAGTGGAAGCAGGAATGTGCATATGAGAAAGCATCACCTGCAGCTGGGAGCAGCTGGGAGT  1110
            |||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||..||.||||||||
Sbjct 1037  AGACCTTCTCTCAGAGTGGGAGTAGGAATGTGCATATGAGAAAGCATCACTTGCAGCTGGGGACAACTGGGAGT  1110

Query 1111  CAAGAGCAGGAGCAAAC---------------------------------------------------------  1127
            |||||.|||||.|||||                                                         
Sbjct 1111  CAAGAACAGGATCAAACCGCCGAGCCACTAATGGGCAGTAGTTTGCTTGAAGACGCTTCAGTTCCCAATAAAAA  1184

Query 1128  --------------------------------------------------------------------------  1127
                                                                                      
Sbjct 1185  CCTGGTGTCTATGAATTCCCAGTCCAGCCTTGGTGGAGAGTCCTTGAATCTATCAAATACCAATTCTATCCTTG  1258

Query 1128  ----------TGAGGTGCTTGCTGAAGGATCCCCACGTTCCCTGTCTTCAGTGCCTGATGTGACACATCACCTG  1191
                      ||||||||||.|||||.||.||.||||..||||||||||.|||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1259  GAGTTGATGATGAGGTGCTTACTGAAAGAGCCTCACGGCCCCTGTCTTCTGTGCCTGATGTGACACATCACTTG  1332

Query 1192  GTGACCATGCAGTCAGGGAGGCAATCATATGAAGTTTCTGTCTTAACTGCAGTAAATCCACAAGAGTTACTAAA  1265
            |||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 1333  GTGACCATGCAGTCAGGGAGGCAGTCCTATGAAGTTTCTGTCTTAACTGCGGTAAATCCGCAGGAGTTACTAAA  1406

Query 1266  CCAAGGAGATTTAACTGAAAGACGGACA  1293
            |||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1407  CCAAGGAGATTTAACTGAAAGACAGACA  1434