Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12422
• Subject: NM_058187.5
• Aligned Length: 1323
• Identities: 1313
• Gaps: 9

Alignment

Query    1  ATGCTTCTGCCGGGACGCGCACGCCAACCGCCGACGCCCCAGCCCGTGCAGCATCACGGCCTCCGCCGGCAGGT  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCTTCTGCCGGGACGCGCACGCCAACCGCCGACGCCCCAGCCCGTGCAGCATCCCGGCCTCCGCCGGCAGGT  74

Query   75  AGAGCCGCCGGGGCAGCTCCTGCGCCTCTTCTACTGCACTGTCCTGGTCTGCTCCAAAGAGATCTCAGCGCTCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGAGCCGCCGGGGCAGCTCCTGCGCCTCTTCTACTGCACTGTCCTGGTCTGCTCCAAAGAGATCTCAGCGCTCA  148

Query  149  CCGACTTCTCTGGTTACCTAACCAAACTCCTGCAAAACCACACCACCTATGCCTGTGATGGGGACTATTTGAAT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCGACTTCTCTGGTTACCTAACCAAACTCCTGCAAAACCACACCACCTATGCCTGTGATGGGGACTATTTGAAT  222

Query  223  CTACAGTGCCCTCGGCATTCTACGATAAGTGTCCAATCGGCATTTTATGGGCAAGATTACCAAATGTGTAGTTC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTACAGTGCCCTCGGCATTCTACGATAAGTGTCCAATCGGCATTTTATGGGCAAGATTACCAAATGTGTAGTTC  296

Query  297  CCAGAAGCCTGCCTCCCAGAGGGAAGACAGCTTAACCTGTGTGGCAGCCACCACCTTCCAGAAGGTGCTGGACG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCAGAAGCCTGCCTCCCAGAGGGAAGACAGCTTAACCTGTGTGGCAGCCACCACCTTCCAGAAGGTGCTGGACG  370

Query  371  AATGCCAGAACCAGCGGGCCTGCCACCTCCTGGTCAATAGCCGTGTTTTTGGACCTGACCTTTGTCCAGGAAGC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AATGCCAGAACCAGCGGGCCTGCCACCTCCTGGTCAATAGCCGTGTTTTTGGACCTGACCTTTGTCCAGGAAGC  444

Query  445  AGTAAATACCTCCTGGTCTCCTTTAAATGCCAACCTAATGAATTAAAAAACAAAACCGTGTGTGAAGACCAGGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGTAAATACCTCCTGGTCTCCTTTAAATGCCAACCTAATGAATTAAAAAACAAAACCGTGTGTGAAGACCAGGA  518

Query  519  GCTGAAACTGCACTGCCATGAATCCAAGTTCCTCAACATCTACTCTGCGACCTACGGCAGGAGGACCCAGGAAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCTGAAACTGCACTGCCATGAATCCAAGTTCCTCAACATCTACTCTGCGACCTACGGCAGGAGGACCCAGGAAA  592

Query  593  GGGACATCTGCTCCTCCAAGGCAGAGCGGCTCCCCCCTTTCGATTGCTTGTCTTACTCAGCTTTGCAAGTCCTA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GGGACATCTGCTCCTCCAAGGCAGAGCGGCTCCCCCCTTTCGATTGCTTGTCTTACTCAGCTTTGCAAGTCCTA  666

Query  667  TCCCGAAGGTGCTATGGGAAGCAGAGATGCAAAATCATCGTCAACAATCACCATTTTGGAAGCCCCTGTTTGCC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCCCGAAGGTGCTATGGGAAGCAGAGATGCAAAATCATCGTCAACAATCACCATTTTGGAAGCCCCTGTTTGCC  740

Query  741  AGGCGTGAAAAAATACCTCACTGTGACCTACGCATGTGTTCCCAAGAACATACTCACAGCGATTGATCCAGCCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGGCGTGAAAAAATACCTCACTGTGACCTACGCATGTGTTCCCAAGAACATACTCACAGCGATTGATCCAGCCA  814

Query  815  TTGCTAATCTAAAACCTTCTTTGAAGCAGAAAG---------ATGGTATAAACTTCGACCCAAGCGGATCGAAG  879
            |||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTGCTAATCTAAAACCTTCTTTGAAGCAGAAAGATGGTGAATATGGTATAAACTTCGACCCAAGCGGATCGAAG  888

Query  880  GTTCTGAGGAAAGATGGAATTCTTGTTAGCAACTCTCTGGCAGCCTTTGCTTACATTAGAGCCCACCCGGAGAG  953
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GTTCTGAGGAAAGATGGAATTCTTGTTAGCAACTCTCTGGCAGCCTTTGCTTACATTAGAGCCCACCCGGAGAG  962

Query  954  AGCTGCCCTGCTGTTCGTGTCCAGTGTCTGCATCGGCCTGGCCCTCACACTGTGCGCCCTGGTCATCAGAGAGT  1027
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGCTGCCCTGCTGTTCGTGTCCAGTGTCTGCATCGGCCTGGCCCTCACACTGTGCGCCCTGGTCATCAGAGAGT  1036

Query 1028  CCTGTGCCAAGGACTTCCGCGACTTGCAGCTGGGGAGGGAGCAGCTGGTGCCAGGAAGTGACAAGGTCGAGGAG  1101
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCTGTGCCAAGGACTTCCGCGACTTGCAGCTGGGGAGGGAGCAGCTGGTGCCAGGAAGTGACAAGGTCGAGGAG  1110

Query 1102  GACAGCGAGGATGAAGAAGAGGAGGAGGACCCCTCTGAGTCTGATTTCCCAGGGGAACTGTCGGGGTTCTGTAG  1175
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GACAGCGAGGATGAAGAAGAGGAGGAGGACCCCTCTGAGTCTGATTTCCCAGGGGAACTGTCGGGGTTCTGTAG  1184

Query 1176  GACTTCATATCCTATATACAGTTCCATAGAAGCTGCAGAGCTCGCAGAAAGGATTGAGCGCAGGGAGCAAATCA  1249
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GACTTCATATCCTATATACAGTTCCATAGAAGCTGCAGAGCTCGCAGAAAGGATTGAGCGCAGGGAGCAAATCA  1258

Query 1250  TTCAGGAAATATGGATGAACAGTGGTTTGGACACCTCGCTCCCAAGAAACATGGGCCAGTTCTAC  1314
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TTCAGGAAATATGGATGAACAGTGGTTTGGACACCTCGCTCCCAAGAAACATGGGCCAGTTCTAC  1323