Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12422
• Subject: XM_005261019.4
• Aligned Length: 1314
• Identities: 1151
• Gaps: 162

Alignment

Query    1  ATGCTTCTGCCGGGACGCGCACGCCAACCGCCGACGCCCCAGCCCGTGCAGCATCACGGCCTCCGCCGGCAGGT  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCTTCTGCCGGGACGCGCACGCCAACCGCCGACGCCCCAGCCCGTGCAGCATCCCGGCCTCCGCCGGCAGGT  74

Query   75  AGAGCCGCCGGGGCAGCTCCTGCGCCTCTTCTACTGCACTGTCCTGGTCTGCTCCAAAGAGATCTCAGCGCTCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGAGCCGCCGGGGCAGCTCCTGCGCCTCTTCTACTGCACTGTCCTGGTCTGCTCCAAAGAGATCTCAGCGCTCA  148

Query  149  CCGACTTCTCTGGTTACCTAACCAAACTCCTGCAAAACCACACCACCTATGCCTGTGATGGGGACTATTTGAAT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCGACTTCTCTGGTTACCTAACCAAACTCCTGCAAAACCACACCACCTATGCCTGTGATGGGGACTATTTGAAT  222

Query  223  CTACAGTGCCCTCGGCATTCTACGATAAGTGTCCAATCGGCATTTTATGGGCAAGATTACCAAATGTGTAGTTC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTACAGTGCCCTCGGCATTCTACGATAAGTGTCCAATCGGCATTTTATGGGCAAGATTACCAAATGTGTAGTTC  296

Query  297  CCAGAAGCCTGCCTCCCAGAGGGAAGACAGCTTAACCTGTGTGGCAGCCACCACCTTCCAGAAGGTGCTGGACG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCAGAAGCCTGCCTCCCAGAGGGAAGACAGCTTAACCTGTGTGGCAGCCACCACCTTCCAGAAGGTGCTGGACG  370

Query  371  AATGCCAGAACCAGCGGGCCTGCCACCTCCTGGTCAATAGCCGTGTTTTTGGACCTGACCTTTGTCCAGGAAGC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AATGCCAGAACCAGCGGGCCTGCCACCTCCTGGTCAATAGCCGTGTTTTTGGACCTGACCTTTGTCCAGGAAGC  444

Query  445  AGTAAATACCTCCTGGTCTCCTTTAAATGCCAACCTAATGAATTAAAAAACAAAACCGTGTGTGAAGACCAGGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGTAAATACCTCCTGGTCTCCTTTAAATGCCAACCTAATGAATTAAAAAACAAAACCGTGTGTGAAGACCAGGA  518

Query  519  GCTGAAACTGCACTGCCATGAATCCAAGTTCCTCAACATCTACTCTGCGACCTACGGCAGGAGGACCCAGGAAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCTGAAACTGCACTGCCATGAATCCAAGTTCCTCAACATCTACTCTGCGACCTACGGCAGGAGGACCCAGGAAA  592

Query  593  GGGACATCTGCTCCTCCAAGGCAGAGCGGCTCCCCCCTTTCGATTGCTTGTCTTACTCAGCTTTGCAAGTCCTA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GGGACATCTGCTCCTCCAAGGCAGAGCGGCTCCCCCCTTTCGATTGCTTGTCTTACTCAGCTTTGCAAGTCCTA  666

Query  667  TCCCGAAGGTGCTATGGGAAGCAGAGATGCAAAATCATCGTCAACAATCACCATTTTGGAAGCCCCTGTTTGCC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCCCGAAGGTGCTATGGGAAGCAGAGATGCAAAATCATCGTCAACAATCACCATTTTGGAAGCCCCTGTTTGCC  740

Query  741  AGGCGTGAAAAAATACCTCACTGTGACCTACGCATGTGTTCCCAAGAACATACTCACAGCGATTGATCCAGCCA  814
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                     
Sbjct  741  AGGCGTGAAAAAATACCTCACTGTGACCTACGCATGT-------------------------------------  777

Query  815  TTGCTAATCTAAAACCTTCTTTGAAGCAGAAAGATGGTATAAACTTCGACCCAAGCGGATCGAAGGTTCTGAGG  888
                                                                                      
Sbjct  778  --------------------------------------------------------------------------  777

Query  889  AAAGATGGAATTCTTGTTAGCAACTCTCTGGCAGCCTTTGCTTACATTAGAGCCCACCCGGAGAGAGCTGCCCT  962
                                                               |||||||||||||||||||||||
Sbjct  778  ---------------------------------------------------GCCCACCCGGAGAGAGCTGCCCT  800

Query  963  GCTGTTCGTGTCCAGTGTCTGCATCGGCCTGGCCCTCACACTGTGCGCCCTGGTCATCAGAGAGTCCTGTGCCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  801  GCTGTTCGTGTCCAGTGTCTGCATCGGCCTGGCCCTCACACTGTGCGCCCTGGTCATCAGAGAGTCCTGTGCCA  874

Query 1037  AGGACTTCCGCGACTTGCAGCTGGGGAGGGAGCAGCTGGTGCCAGGAAGTGACAAGGTCGAGGAGGACAGCGAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  875  AGGACTTCCGCGACTTGCAGCTGGGGAGGGAGCAGCTGGTGCCAGGAAGTGACAAGGTCGAGGAGGACAGCGAG  948

Query 1111  GATGAAGAAGAGGAGGAGGACCCCTCTGAGTCTGATTTCCCAGGGGAACTGTCGGGGTTCTGTAGGACTTCATA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  949  GATGAAGAAGAGGAGGAGGACCCCTCTGAGTCTGATTTCCCAGGGGAACTGTCGGGGTTCTGTAGGACTTCATA  1022

Query 1185  TCCTATATACAGTTCCATAGAAGCTGCAGAGCTCGCAGAAAGGATTGAGCGCAGGGAGCAAATCATTCAGGAAA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1023  TCCTATATACAGTTCCATAGAAGCTGCAGAGCTCGCAGAAAGGATTGAGCGCAGGGAGCAAATCATTCAGGAAA  1096

Query 1259  TATGGATGAACAGTGGTTTGGACACCTCGCTCCCAAGAAACATGGGCCAGTTCTAC  1314
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1097  TATGGATGAACAGTGGTTTGGACACCTCGCTCCCAAGAAACATGGGCCAGTTCTAC  1152