Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12422
• Subject: XM_017028421.1
• Aligned Length: 1314
• Identities: 1029
• Gaps: 285

Alignment

Query    1  ATGCTTCTGCCGGGACGCGCACGCCAACCGCCGACGCCCCAGCCCGTGCAGCATCACGGCCTCCGCCGGCAGGT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  AGAGCCGCCGGGGCAGCTCCTGCGCCTCTTCTACTGCACTGTCCTGGTCTGCTCCAAAGAGATCTCAGCGCTCA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CCGACTTCTCTGGTTACCTAACCAAACTCCTGCAAAACCACACCACCTATGCCTGTGATGGGGACTATTTGAAT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  CTACAGTGCCCTCGGCATTCTACGATAAGTGTCCAATCGGCATTTTATGGGCAAGATTACCAAATGTGTAGTTC  296
                                                                           |||||||||||
Sbjct    1  ---------------------------------------------------------------ATGTGTAGTTC  11

Query  297  CCAGAAGCCTGCCTCCCAGAGGGAAGACAGCTTAACCTGTGTGGCAGCCACCACCTTCCAGAAGGTGCTGGACG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   12  CCAGAAGCCTGCCTCCCAGAGGGAAGACAGCTTAACCTGTGTGGCAGCCACCACCTTCCAGAAGGTGCTGGACG  85

Query  371  AATGCCAGAACCAGCGGGCCTGCCACCTCCTGGTCAATAGCCGTGTTTTTGGACCTGACCTTTGTCCAGGAAGC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   86  AATGCCAGAACCAGCGGGCCTGCCACCTCCTGGTCAATAGCCGTGTTTTTGGACCTGACCTTTGTCCAGGAAGC  159

Query  445  AGTAAATACCTCCTGGTCTCCTTTAAATGCCAACCTAATGAATTAAAAAACAAAACCGTGTGTGAAGACCAGGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  160  AGTAAATACCTCCTGGTCTCCTTTAAATGCCAACCTAATGAATTAAAAAACAAAACCGTGTGTGAAGACCAGGA  233

Query  519  GCTGAAACTGCACTGCCATGAATCCAAGTTCCTCAACATCTACTCTGCGACCTACGGCAGGAGGACCCAGGAAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  234  GCTGAAACTGCACTGCCATGAATCCAAGTTCCTCAACATCTACTCTGCGACCTACGGCAGGAGGACCCAGGAAA  307

Query  593  GGGACATCTGCTCCTCCAAGGCAGAGCGGCTCCCCCCTTTCGATTGCTTGTCTTACTCAGCTTTGCAAGTCCTA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  308  GGGACATCTGCTCCTCCAAGGCAGAGCGGCTCCCCCCTTTCGATTGCTTGTCTTACTCAGCTTTGCAAGTCCTA  381

Query  667  TCCCGAAGGTGCTATGGGAAGCAGAGATGCAAAATCATCGTCAACAATCACCATTTTGGAAGCCCCTGTTTGCC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  382  TCCCGAAGGTGCTATGGGAAGCAGAGATGCAAAATCATCGTCAACAATCACCATTTTGGAAGCCCCTGTTTGCC  455

Query  741  AGGCGTGAAAAAATACCTCACTGTGACCTACGCATGTGTTCCCAAGAACATACTCACAGCGATTGATCCAGCCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  456  AGGCGTGAAAAAATACCTCACTGTGACCTACGCATGTGTTCCCAAGAACATACTCACAGCGATTGATCCAGCCA  529

Query  815  TTGCTAATCTAAAACCTTCTTTGAAGCAGAAAGATGGTATAAACTTCGACCCAAGCGGATCGAAGGTTCTGAGG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  530  TTGCTAATCTAAAACCTTCTTTGAAGCAGAAAGATGGTATAAACTTCGACCCAAGCGGATCGAAGGTTCTGAGG  603

Query  889  AAAGATGGAATTCTTGTTAGCAACTCTCTGGCAGCCTTTGCTTACATTAGAGCCCACCCGGAGAGAGCTGCCCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  604  AAAGATGGAATTCTTGTTAGCAACTCTCTGGCAGCCTTTGCTTACATTAGAGCCCACCCGGAGAGAGCTGCCCT  677

Query  963  GCTGTTCGTGTCCAGTGTCTGCATCGGCCTGGCCCTCACACTGTGCGCCCTGGTCATCAGAGAGTCCTGTGCCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  678  GCTGTTCGTGTCCAGTGTCTGCATCGGCCTGGCCCTCACACTGTGCGCCCTGGTCATCAGAGAGTCCTGTGCCA  751

Query 1037  AGGACTTCCGCGACTTGCAGCTGGGGAGGGAGCAGCTGGTGCCAGGAAGTGACAAGGTCGAGGAGGACAGCGAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  752  AGGACTTCCGCGACTTGCAGCTGGGGAGGGAGCAGCTGGTGCCAGGAAGTGACAAGGTCGAGGAGGACAGCGAG  825

Query 1111  GATGAAGAAGAGGAGGAGGACCCCTCTGAGTCTGATTTCCCAGGGGAACTGTCGGGGTTCTGTAGGACTTCATA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  826  GATGAAGAAGAGGAGGAGGACCCCTCTGAGTCTGATTTCCCAGGGGAACTGTCGGGGTTCTGTAGGACTTCATA  899

Query 1185  TCCTATATACAGTTCCATAGAAGCTGCAGAGCTCGCAGAAAGGATTGAGCGCAGGGAGCAAATCATTCAGGAAA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  900  TCCTATATACAGTTCCATAGAAGCTGCAGAGCTCGCAGAAAGGATTGAGCGCAGGGAGCAAATCATTCAGGAAA  973

Query 1259  TATGGATGAACAGTGGTTTGGACACCTCGCTCCCAAGAAACATGGGCCAGTTCTAC  1314
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  974  TATGGATGAACAGTGGTTTGGACACCTCGCTCCCAAGAAACATGGGCCAGTTCTAC  1029