Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_12439
Subject:
NM_001040424.2
Aligned Length:
1178
Identities:
1139
Gaps:
37

Alignment

Query    1  -------------------------------------MAEDGSEEIMFIWCEDCSQYHDSECPELGPVVMVKDS  37
                                                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  MPRRRPPASGAAQFPERIATRSPDPIPLCTFQRQVSEMAEDGSEEIMFIWCEDCSQYHDSECPELGPVVMVKDS  74

Query   38  FVLSRARSSLPPNLEIRRLEDGAEGVFAITQLVKRTQFGPFESRRVAKWEKESAFPLKVFQKDGHPVCFDTSNE  111
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  FVLSRARSSLPPNLEIRRLEDGAEGVFAITQLVKRTQFGPFESRRVAKWEKESAFPLKVFQKDGHPVCFDTSNE  148

Query  112  DDCNWMMLVRPAAEAEHQNLTAYQHGSDVYFTTSRDIPPGTELRVWYAAFYAKKMDKPMLKQAGSGVHAAGTPE  185
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  DDCNWMMLVRPAAEAEHQNLTAYQHGSDVYFTTSRDIPPGTELRVWYAAFYAKKMDKPMLKQAGSGVHAAGTPE  222

Query  186  NSAPVESEPSQWACKVCSATFLELQLLNEHLLGHLEQAKSLPPGSQSEAAAPEKEQDTPRGEPPAVPESENVAT  259
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  NSAPVESEPSQWACKVCSATFLELQLLNEHLLGHLEQAKSLPPGSQSEAAAPEKEQDTPRGEPPAVPESENVAT  296

Query  260  KEQKKKPRRGRKPKVSKAEQPLVIVEDKEPTEQVAEIITEVPPDEPVSATPDERIMELVLGKLATTTTDTSSVP  333
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  KEQKKKPRRGRKPKVSKAEQPLVIVEDKEPTEQVAEIITEVPPDEPVSATPDERIMELVLGKLATTTTDTSSVP  370

Query  334  KFTHHQNNTITLKRSLILSSRHGIRRKVIKQLGEHKRVYQCNICSKIFQNSSNLSRHVRSHGDKLFKCEECAKL  407
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  KFTHHQNNTITLKRSLILSSRHGIRRKLIKQLGEHKRVYQCNICSKIFQNSSNLSRHVRSHGDKLFKCEECAKL  444

Query  408  FSRKESLKQHVSYKHSRNEVDGEYRYRCGTCEKTFRIESALEFHNCRTDDKTFQCEMCFRFFSTNSNLSKHKKK  481
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  FSRKESLKQHVSYKHSRNEVDGEYRYRCGTCEKTFRIESALEFHNCRTDDKTFQCEMCFRFFSTNSNLSKHKKK  518

Query  482  HGDKKFACEVCSKMFYRKDVMLDHQRRHLEGVRRVKREDLEAGGENLVRYKKEPSGCPVCGKVFSCRSNMNKHL  555
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  HGDKKFACEVCSKMFYRKDVMLDHQRRHLEGVRRVKREDLEAGGENLVRYKKEPSGCPVCGKVFSCRSNMNKHL  592

Query  556  LTHGDKKYTCEICGRKFFRVDVLRDHIHVHFKDIALMDDHQREEFIGKIGISSEENDDNSDESADSEPHKYSCK  629
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  LTHGDKKYTCEICGRKFFRVDVLRDHIHVHFKDIALMDDHQREEFIGKIGISSEENDDNSDESADSEPHKYSCK  666

Query  630  RCQLTFGRGKEYLKHIMEVHKEKGYGCSICNRRFALKATYHAHMVIHRENLPDPNVQKYIHPCEICGRIFNSIG  703
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  RCQLTFGRGKEYLKHIMEVHKEKGYGCSICNRRFALKATYHAHMVIHRENLPDPNVQKYIHPCEICGRIFNSIG  740

Query  704  NLERHKLIHTGVKSHACEQCGKSFARKDMLKEHMRVHDNVREYLCAECGKGMKTKHALRHHMKLHKGIKEYECK  777
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  NLERHKLIHTGVKSHACEQCGKSFARKDMLKEHMRVHDNVREYLCAECGKGMKTKHALRHHMKLHKGIKEYECK  814

Query  778  ECHRRFAQKVNMLKHCKRHTGIKDFMCELCGKTFSERNTMETHKLIHTVGKQWTCSVCDKKYVTEYMLQKHVQL  851
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ECHRRFAQKVNMLKHCKRHTGIKDFMCELCGKTFSERNTMETHKLIHTVGKQWTCSVCDKKYVTEYMLQKHVQL  888

Query  852  THDKVEAQSCQLCGTKVSTRASMSRHMRRKHPEVLAVRIDDLDHLPETTTIDASSIGIVQPELTLEQEDLAEGK  925
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  THDKVEAQSCQLCGTKVSTRASMSRHMRRKHPEVLAVRIDDLDHLPETTTIDASSIGIVQPELTLEQEDLAEGK  962

Query  926  HGKAAKRSHKRKQKPEEEAGAPVPEDATFSEYSEKETEFTGSVGDETNSAVQSIQQVVVTLGDPNVTTPSSSVG  999
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  HGKAAKRSHKRKQKPEEEAGAPVPEDATFSEYSEKETEFTGSVGDETNSAVQSIQQVVVTLGDPNVTTPSSSVG  1036

Query 1000  LTNITVTPITTAAATQFTNLQPVAVGHLTTPERQLQLDNSILTVTFDTVSGSAMLHNRQNDVQIHPQPEASNPQ  1073
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  LTNITVTPITTAAATQFTNLQPVAVGHLTTPERQLQLDNSILTVTFDTVSGSAMLHNRQNDVQIHPQPEASNPQ  1110

Query 1074  SVAHFINLTTLVNSITPLGSQLSDQHPLTWRAVPQTDVLPPPQPQAPPQQAAQPQVQAEQQQQQMYSY  1141
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  SVAHFINLTTLVNSITPLGSQLSDQHPLTWRAVPQTDVLPPSQPQAPPQQAAQPQVQAEQQQQQMYSY  1178