Nucleotide Global Alignment
Description
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- ccsbBroadEn_12439
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- NM_022115.4
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Alignment
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Sbjct 1 ATGCCCCGCCGCCGCCCCCCGGCTTCCGGTGCTGCGCAGTTTCCGGAGCGGATCGCAACCCGGAGTCCGGATCC 74
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Sbjct 75 GATCCCGCTCTGCACATTCCAAAGGCAGCCGCGCGCCGCCCCGGTCCAGCCGCCATGCCGACTGTTCTTTGTTA 148
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Sbjct 149 CATTCGCCGGCTGCGGGCACCGTTGGCGATCGGAGTCAAAACCCGGCTGGATTTCCCGGAGCCGCTCCGGGATC 222
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Sbjct 223 GCCCTGCGCGCCGCCCGCCCGCCGGGGTCTTCGCCGCCCCGGCCCGCGGCCCCGCGGCCCCCGCCGCCGGGCGG 296
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Sbjct 297 CGTCGTCGCCGAGGCCCCAGGGGATGTCGTTATCCCCCGCCCTCGGGTACAGCCCATGCGGGTCGCACGGGGGG 370
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Sbjct 371 GTCCCTGGACCCCCAACCCCGCGTTTAGAGAAGCTGAGTCCTGGTCCCAGATTGGGAACCAGAGGGTCAGTGAG 444
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Sbjct 445 CAGCTCTTGGAAACATCTCTAGGGAATGAGGTGTCCGACACTGAGCCACTGAGCCCTGCGAGTGCAGGCCTGCG 518
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Sbjct 519 ACGCAATCCTGCCCTACCTCCTGGACCCTTTGCACAAAACTTTTCCTGGGGGAACCAGGAAAATCTGCCCCCAG 592
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Sbjct 593 CCCTGGGGAAGATTGCGAACGGAGGAGGAACTGGGGCAGGCAAGGCCGAATGCGGCTATGAAACTGAGTCACAC 666
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Sbjct 741 TTGCACGGTCTGCTTTTCACCCTTCAAGCTGCTGGGGATGAGCGGGGTGGAGGGCGTGTGGAATCAGCATTCAA 814
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Sbjct 815 GAAGTGCCAGCATGCACACTTTCCTAAACCACTCAGCAACGGGCATCAGAGAAGCAGGTTGCAGGAAGGACATG 888
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Sbjct 889 CCGGTGTCAGAGATGGCTGAAGATGGGAGCGAAGAGATCATGTTCATCTGGTGTGAAGACTGCAGCCAGTACCA 962
Query 63 CGACTCCGAATGTCCCGAGCTGGGCCCAGTGGTCATGGTCAAAGACTCCTTTGTGTTAAGCAGGGCA------- 129
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Sbjct 963 CGACTCCGAATGTCCCGAGCTGGGCCCAGTGGTCATGGTCAAAGACTCCTTTGTGTTAAGCAGGGCAAGGTCTT 1036
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Sbjct 1037 GGCCTGCCAGCGGACACGTGCACACCCAGGCGGGGCAGGGGATGCGGGGTTATGAGGACAGGGACAGGGCTGAC 1110
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Sbjct 1111 CCACAGCAGCTTCCAGAAGCAGTCCCTGCAGGCCTGGTGAGGCGGCTCAGTGGGCAGCAGCTGCCCTGCCGTTC 1184
Query 130 -------------------------------------------AGGTCATCCCTTCCTCCCAACTTGGAGATCA 160
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Sbjct 1185 CACCCTCACCTGGGGGAGGCTGTGCCACCTGGTGGCCCAGGGCAGGTCATCCCTTCCTCCCAACTTGGAGATCA 1258
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Sbjct 1259 GACGACTGGAAGATGGAGCCGAGGGGGTGTTCGCCATCACTCAGCTCGTCAAGCGGACACAGTTCGGTCCCTTT 1332
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Sbjct 1333 GAGTCCAGGAGGGTCGCCAAATGGGAAAAGGAGTCTGCATTTCCCCTGAAGGTGTTCCAGAAGGACGGGCACCC 1406
Query 309 CGTGTGCTTCGACACCTCCAACGAGGATGACTGCAACTGGATGATGCTGGTGCGGCCAGCGGCGGAGGCCGAGC 382
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Sbjct 1407 CGTGTGCTTCGACACCTCCAACGAGGATGACTGCAACTGGATGATGCTGGTGCGGCCAGCGGCGGAGGCCGAGC 1480
Query 383 ACCAGAACCTGACGGCCTACCAGCACGGCAGCGACGTGTACTTCACCACCTCCAGAGACATCCCCCCGGGTACC 456
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Sbjct 1481 ACCAGAACCTGACGGCCTACCAGCACGGCAGCGACGTGTACTTCACCACCTCCAGAGACATCCCCCCGGGTACC 1554
Query 457 GAGCTGCGCGTGTGGTATGCGGCCTTCTATGCCAAGAAGATGGACAAGCCCATGCTGAAGCAGGCCGGCTCTGG 530
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Sbjct 1555 GAGCTGCGCGTGTGGTATGCGGCCTTCTATGCCAAGAAGATGGACAAGCCCATGCTGAAGCAGGCCGGCTCTGG 1628
Query 531 CGTCCACGCTGCAGGCACCCCAGAAAACAGCGCCCCCGTGGAGTCGGAACCCAGCCAGTGGGCGTGTAAAGTGT 604
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Sbjct 1629 CGTCCACGCTGCAGGCACCCCAGAAAACAGCGCCCCCGTGGAGTCGGAGCCCAGCCAGTGGGCGTGTAAAGTGT 1702
Query 605 GTTCTGCCACCTTCCTGGAGCTGCAGCTCCTCAATGAACATCTGTTGGGCCACTTAGAACAAGCCAAAAGCCTT 678
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Sbjct 1703 GTTCTGCCACCTTCCTGGAGCTGCAGCTCCTCAATGAACATCTGTTGGGCCACTTAGAACAAGCCAAAAGCCTT 1776
Query 679 CCTCCAGGCAGCCAAAGCGAGGCAGCAGCTCCCGAGAAGGAGCAGGACACACCCCGGGGGGAACCCCCTGCAGT 752
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Sbjct 1777 CCTCCAGGCAGCCAAAGCGAGGCAGCAGCTCCCGAGAAGGAGCAGGACACACCCCGGGGGGAACCCCCTGCAGT 1850
Query 753 GCCCGAGAGCGAGAATGTTGCCACCAAAGAACAGAAGAAAAAGCCTCGAAGGGGGAGAAAACCCAAAGTGTCCA 826
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Sbjct 1851 GCCCGAGAGCGAGAATGTTGCCACCAAAGAACAGAAGAAAAAGCCTCGAAGGGGGAGAAAACCCAAAGTGTCCA 1924
Query 827 AAGCTGAGCAGCCTCTAGTCATCGTGGAAGACAAGGAACCCACAGAGCAAGTGGCAGAGATCATTACCGAGGTC 900
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Sbjct 1925 AAGCTGAGCAGCCTCTAGTCATCGTGGAAGACAAGGAACCCACAGAGCAAGTGGCAGAGATCATTACCGAGGTC 1998
Query 901 CCTCCGGATGAGCCTGTGAGTGCAACGCCAGATGAGCGGATCATGGAGCTGGTTCTGGGGAAGCTGGCCACCAC 974
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Sbjct 1999 CCTCCGGATGAGCCTGTGAGTGCAACGCCAGATGAGCGGATCATGGAGCTGGTTCTGGGGAAGCTGGCCACCAC 2072
Query 975 CACCACTGACACCAGCTCGGTTCCAAAGTTCACCCATCATCAGAATAACACCATCACGCTCAAGAGGAGCTTAA 1048
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Sbjct 2073 CACCACTGACACCAGCTCGGTTCCAAAGTTCACCCATCATCAGAATAACACCATCACGCTCAAGAGGAGCTTAA 2146
Query 1049 TTCTCTCAAGCAGACACGGCATCCGGCGCAAGGTCATCAAACAGCTCGGGGAGCACAAGCGGGTTTACCAGTGC 1122
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Sbjct 2147 TTCTCTCAAGCAGACACGGCATCCGGCGCAAGCTCATCAAACAGCTCGGGGAGCACAAGCGGGTTTACCAGTGC 2220
Query 1123 AATATCTGCAGCAAGATCTTCCAGAACAGCAGCAACCTGAGCAGGCACGTGCGCTCGCATGGTGACAAGCTGTT 1196
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Sbjct 2221 AATATCTGCAGCAAGATCTTCCAGAACAGCAGCAACCTGAGCAGGCACGTGCGCTCGCATGGTGACAAGCTGTT 2294
Query 1197 TAAGTGCGAAGAGTGTGCAAAATTGTTCAGCCGCAAAGAGAGCCTAAAGCAGCACGTTTCCTACAAGCACAGCA 1270
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Sbjct 2295 TAAGTGCGAAGAGTGTGCAAAATTGTTCAGCCGCAAAGAGAGCCTAAAGCAGCACGTTTCCTACAAGCACAGCA 2368
Query 1271 GGAACGAGGTGGACGGCGAGTACAGGTACCGCTGCGGCACTTGTGAGAAGACCTTCCGCATCGAGAGCGCGCTG 1344
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Sbjct 2369 GGAACGAGGTGGACGGCGAGTACAGGTACCGCTGCGGCACTTGTGAGAAGACCTTCCGCATCGAGAGCGCGCTG 2442
Query 1345 GAGTTCCACAACTGCAGGACAGATGACAAGACGTTCCAATGTGAGATGTGTTTCAGATTCTTCTCCACCAACAG 1418
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Sbjct 2443 GAGTTCCACAACTGCAGGACAGATGACAAGACGTTCCAATGTGAGATGTGTTTCAGATTCTTCTCCACCAACAG 2516
Query 1419 CAACCTCTCCAAGCACAAGAAGAAGCACGGCGACAAGAAGTTTGCCTGTGAGGTCTGCAGCAAGATGTTCTACC 1492
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Sbjct 2517 CAACCTCTCCAAGCACAAGAAGAAGCACGGCGACAAGAAGTTTGCCTGTGAGGTCTGCAGCAAGATGTTCTACC 2590
Query 1493 GCAAGGACGTCATGCTGGACCACCAGCGCCGGCACCTGGAAGGAGTGCGGCGAGTGAAGCGAGAGGACCTGGAG 1566
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Sbjct 2591 GCAAGGACGTCATGCTGGACCACCAGCGCCGGCACCTGGAAGGAGTGCGGCGAGTGAAGCGAGAGGACCTGGAG 2664
Query 1567 GCCGGTGGGGAGAACCTGGTCCGTTACAAGAAGGAGCCTTCCGGGTGCCCGGTGTGTGGCAAGGTGTTCTCCTG 1640
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Sbjct 2665 GCCGGTGGGGAGAACCTGGTCCGTTACAAGAAGGAGCCTTCCGGGTGCCCGGTGTGTGGCAAGGTGTTCTCCTG 2738
Query 1641 CCGGAGCAATATGAACAAGCACCTGCTCACCCACGGCGACAAGAAGTACACCTGCGAGATCTGCGGGCGCAAGT 1714
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Sbjct 2739 CCGGAGCAATATGAACAAGCACCTGCTCACCCACGGCGACAAGAAGTACACCTGCGAGATCTGCGGGCGCAAGT 2812
Query 1715 TCTTCCGCGTGGATGTGCTCAGGGACCACATCCATGTCCACTTCAAGGACATCGCGTTGATGGATGACCACCAG 1788
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Sbjct 2813 TCTTCCGCGTGGATGTGCTCAGGGACCACATCCATGTCCACTTCAAGGACATCGCGTTGATGGATGACCACCAG 2886
Query 1789 AGGGAAGAGTTTATCGGCAAGATCGGGATCTCCTCGGAAGAAAACGATGACAATTCTGACGAGAGCGCAGACTC 1862
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Sbjct 2887 AGGGAAGAGTTTATCGGCAAGATCGGGATCTCCTCGGAAGAAAACGATGACAATTCTGACGAGAGCGCAGACTC 2960
Query 1863 GGAGCCTCACAAGTACAGCTGCAAGCGGTGCCAGCTCACCTTCGGCCGGGGGAAGGAGTACCTGAAGCACATCA 1936
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Sbjct 2961 GGAGCCTCACAAGTACAGCTGCAAGCGGTGCCAGCTCACCTTCGGCCGGGGGAAGGAGTACCTGAAGCACATCA 3034
Query 1937 TGGAGGTGCACAAGGAGAAGGGCTATGGCTGCAGCATCTGCAACCGGCGCTTTGCACTGAAGGCCACCTACCAC 2010
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Sbjct 3035 TGGAGGTGCACAAGGAGAAGGGCTATGGCTGCAGCATCTGCAACCGGCGCTTTGCACTGAAGGCCACCTACCAC 3108
Query 2011 GCCCACATGGTCATCCACCGTGAAAACCTGCCGGACCCCAACGTGCAGAAGTACATCCACCCCTGCGAGATCTG 2084
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Sbjct 3109 GCCCACATGGTCATCCACCGTGAAAACCTGCCGGACCCCAACGTGCAGAAGTACATCCACCCCTGCGAGATCTG 3182
Query 2085 CGGGCGGATCTTCAACAGCATCGGGAACCTGGAGCGCCACAAGCTCATCCACACAGGTGTGAAGAGCCACGCCT 2158
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Sbjct 3183 CGGGCGGATCTTCAACAGCATCGGGAACCTGGAGCGCCACAAGCTCATCCACACAGGTGTGAAGAGCCACGCCT 3256
Query 2159 GCGAGCAGTGTGGGAAGTCCTTTGCCAGGAAGGACATGCTGAAGGAGCACATGCGTGTGCACGACAACGTCCGC 2232
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Sbjct 3257 GCGAGCAGTGTGGGAAGTCCTTTGCCAGGAAGGACATGCTGAAGGAGCACATGCGTGTGCACGACAATGTCCGC 3330
Query 2233 GAGTACCTGTGTGCCGAGTGTGGGAAAGGCATGAAGACCAAGCACGCGCTGCGCCACCACATGAAGCTGCACAA 2306
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Sbjct 3331 GAGTACCTGTGTGCCGAGTGTGGGAAAGGCATGAAGACCAAGCACGCGCTGCGCCACCACATGAAGCTGCACAA 3404
Query 2307 GGGCATCAAGGAGTACGAGTGCAAGGAGTGCCACCGCAGGTTCGCGCAGAAGGTCAACATGCTCAAGCACTGCA 2380
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Sbjct 3405 GGGCATCAAGGAGTACGAGTGCAAGGAGTGCCACCGCAGGTTCGCGCAGAAGGTCAACATGCTCAAGCACTGCA 3478
Query 2381 AGCGGCACACGGGGATTAAAGATTTCATGTGTGAATTGTGTGGGAAGACATTCAGCGAGAGGAACACCATGGAG 2454
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Sbjct 3479 AGCGGCACACGGGGATTAAAGATTTCATGTGTGAATTGTGTGGGAAGACATTCAGCGAGAGGAACACCATGGAG 3552
Query 2455 ACCCACAAGCTCATCCACACAGTGGGCAAGCAGTGGACGTGCTCCGTGTGCGACAAGAAGTACGTGACCGAGTA 2528
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Sbjct 3553 ACCCACAAGCTCATCCACACAGTGGGCAAGCAGTGGACGTGCTCCGTGTGCGACAAGAAGTACGTGACCGAGTA 3626
Query 2529 CATGCTGCAGAAGCACGTTCAGCTCACACACGACAAGGTGGAGGCGCAGAGCTGCCAGCTGTGCGGGACCAAGG 2602
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Sbjct 3627 CATGCTGCAGAAGCACGTTCAGCTCACACACGACAAGGTGGAGGCGCAGAGCTGCCAGCTGTGCGGGACCAAGG 3700
Query 2603 TGTCCACCAGGGCCTCCATGAGCCGACACATGCGGCGCAAGCACCCCGAGGTGCTCGCGGTGAGGATCGATGAC 2676
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Sbjct 3701 TGTCCACCAGGGCCTCCATGAGCCGACACATGCGGCGCAAGCACCCCGAGGTGCTCGCGGTGAGGATCGATGAC 3774
Query 2677 CTGGACCACCTCCCGGAGACCACCACCATCGACGCCTCCTCCATTGGCATCGTCCAGCCTGAGCTGACTCTGGA 2750
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Sbjct 3775 CTGGACCACCTCCCGGAGACCACCACCATCGACGCCTCCTCCATTGGCATCGTCCAGCCTGAGCTGACTCTGGA 3848
Query 2751 GCAGGAGGATTTGGCCGAAGGGAAGCACGGGAAAGCTGCCAAGCGAAGTCACAAGAGAAAGCAGAAGCCAGAAG 2824
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Sbjct 3849 GCAGGAGGATTTGGCCGAAGGGAAGCACGGGAAAGCTGCCAAGCGAAGTCACAAGAGAAAGCAGAAGCCAGAAG 3922
Query 2825 AGGAGGCGGGTGCTCCGGTGCCCGAGGACGCCACCTTCAGCGAATACTCAGAGAAAGAGACGGAGTTCACAGGC 2898
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Sbjct 3923 AGGAGGCGGGTGCTCCGGTGCCCGAGGACGCCACCTTCAGCGAATACTCAGAGAAAGAGACGGAGTTCACAGGC 3996
Query 2899 AGTGTAGGCGACGAGACCAATTCCGCAGTACAGAGCATTCAGCAGGTAGTGGTGACCCTGGGTGACCCAAATGT 2972
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Sbjct 3997 AGTGTAGGCGACGAGACCAATTCCGCAGTACAGAGCATTCAGCAGGTAGTGGTGACCCTGGGTGACCCAAATGT 4070
Query 2973 GACCACACCATCGAGCTCAGTCGGCTTGACCAACATCACCGTGACCCCCATCACCACTGCGGCCGCGACTCAGT 3046
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Sbjct 4071 GACCACACCATCGAGCTCAGTCGGCTTAACCAACATCACCGTGACCCCCATCACCACTGCGGCCGCGACTCAGT 4144
Query 3047 TTACCAATCTCCAGCCGGTGGCCGTGGGGCACCTTACCACCCCTGAACGCCAGTTACAGCTGGACAACTCAATC 3120
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Sbjct 4145 TTACCAATCTCCAGCCGGTGGCCGTGGGGCACCTTACCACCCCTGAACGCCAGTTACAGCTGGACAACTCAATC 4218
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Sbjct 4219 CTGACCGTGACCTTTGATACCGTCAGCGGCTCTGCCATGTTGCACAACCGCCAAAATGACGTCCAGATCCACCC 4292
Query 3195 CCAGCCGGAAGCCTCGAACCCACAGTCTGTGGCCCATTTCATCAACCTGACGACCCTGGTCAACTCCATCACGC 3268
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Sbjct 4293 CCAGCCGGAAGCCTCGAACCCACAGTCTGTGGCCCATTTCATCAACCTGACGACCCTGGTCAACTCCATCACGC 4366
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Sbjct 4367 CCCTGGGGAGCCAGCTTAGTGACCAGCACCCGCTCACGTGGCGGGCAGTGCCCCAGACTGACGTCTTGCCACCC 4440
Query 3343 CCGCAGCCGCAGGCACCCCCACAGCAGGCGGCCCAGCCCCAGGTGCAGGCGGAGCAGCAGCAGCAGCAGATGTA 3416
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Sbjct 4441 TCGCAGCCGCAGGCACCCCCACAGCAGGCGGCCCAGCCCCAGGTGCAGGCGGAGCAGCAGCAGCAGCAGATGTA 4514
Query 3417 CAGCTAC 3423
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Sbjct 4515 CAGCTAC 4521