Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_12439
- Subject:
- NM_144789.2
- Aligned Length:
- 3533
- Identities:
- 2922
- Gaps:
- 121
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGTGCCCACCTACTATCTGGGAAAAGGGTGGACAGGTGGGGGCCAGGTGGAGCCTGCGTGCTCCTGAGGTATC 74
Query 1 ----ATGGCTGAAGATGGGAGCGAAGAGATCATGTTCATCTGGTGTGAAGACTGCAGCCAGTACCACGACTCCG 70
||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 75 AGCAATGGCTGAAGATGGTAGTGAGGAGATCATGTTTATCTGGTGTGAAGACTGCAGCCAGTACCATGACTCGG 148
Query 71 AATGTCCCGAGCTGGGCCCAGTGGTCATGGTCAAAGACTCCTTTGTGTTAAGCAGGGCAAGGTCATCCCTTCCT 144
|.|||||.||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||.|.||||||||||||||.|||||.||.
Sbjct 149 AGTGTCCTGAACTGGGACCTGTGGTCATGGTCAAGGACTCCTTTGTGCTGAGCAGGGCAAGGTCCTCCCTCCCC 222
Query 145 CCCAACTTGGAGATCAGACGACTGGAAGATGGAGCCGAGGGGGTGTTCGCCATCACTCAGCTCGTCAAGCGGAC 218
.|.|||.||||||||||.||.|||||.||.||.||.||.||.|||||.||..|.||.|||||.||||||||.||
Sbjct 223 TCTAACCTGGAGATCAGGCGCCTGGATGACGGGGCTGAAGGCGTGTTTGCAGTGACCCAGCTAGTCAAGCGCAC 296
Query 219 ACAGTTCGGTCCCTTTGAGTCCAGGAGGGTCGCCAAATGGGAAAAGGAGTCTGCATTTCCCCTGAAGGTGTTCC 292
|||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.||||||||.||.|
Sbjct 297 ACAATTTGGTCCGTTTGAGTCCAGGAGAGTCGCCAAGTGGGAGAAAGAGTCGGCATTTCCTCTGAAGGTATTTC 370
Query 293 AGAAGGACGGGCACCCCGTGTGCTTCGACACCTCCAACGAGGATGACTGCAACTGGATGATGCTGGTGCGGCCA 366
|||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 371 AGAAGGACGGGCATCCTGTGTGCTTCGACACTTCCAATGAGGATGACTGCAACTGGATGATGCTAGTGCGACCA 444
Query 367 GCGGCGGAGGCCGAGCACCAGAACCTGACGGCCTACCAGCACGGCAGCGACGTGTACTTCACCACCTCCAGAGA 440
||...||||.|.|.|||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.|..||
Sbjct 445 GCACTGGAGCCTGGGCACCAGAACCTGACAGCCTACCAACATGGCAGTGACGTGTATTTCACCACCTCAAAGGA 518
Query 441 CATCCCCCCGGGTACCGAGCTGCGCGTGTGGTATGCGGCCTTCTATGCCAAGAAGATGGACAAGCCCATGCTGA 514
|||.||..|.||.||.||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 519 CATTCCTGCAGGCACTGAACTGCGTGTGTGGTATGCTGCCTTTTATGCCAAGAAGATGGACAAGCCCATGCTAA 592
Query 515 AGCAGGCCGGCTCTGGCGTCCACGCTGCAGGCACCCCAGAAAACAGCGCCCCCGTGGAGTCGGAACCCAGCCAG 588
||||||||.||||..|.||.||.||||||||||||||.||...|||.|.|.|.|||||..|.||.|...||||.
Sbjct 593 AGCAGGCCTGCTCCAGTGTTCAGGCTGCAGGCACCCCTGAGCCCAGTGTCTCTGTGGAACCTGAGCGTGGCCAA 666
Query 589 TGGGCGTGTAAAGTGTGTTCTGCCACCTTCCTGGAGCTGCAGCTCCTCAATGAACATCTGTTGGGCCACTTAGA 662
||||.||||||.|||||.||...|||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.||||||||..|.||
Sbjct 667 TGGGTGTGTAAGGTGTGCTCCAACACCTTCCTGGAGCTTCAGCTCCTGAACGAGCATCTCTTGGGCCATCTGGA 740
Query 663 ACAAGCCAAAAGCCTTCCTCCAGGCAGCCA-AAGC--GAGGCAGCAGCTCCCGAGAAGGAGCAGGACACACCCC 733
.||||||||||||||.|||.||||..|||| .||| ||| ||||||.|.||||||||||..||..|||||.
Sbjct 741 GCAAGCCAAAAGCCTCCCTGCAGGTGGCCAGCAGCATGAG---GCAGCTTCTGAGAAGGAGCCTGATGCACCCA 811
Query 734 GGGGGGAACCCCCTGCAGTGCCCGAGAGCGAGA--------------ATGTTGCCACCAAAGAACAGAAGAAAA 793
||..|||.||.||..|||...||||||||.||| ||| |.|||||||||.|..|||||||
Sbjct 812 GGATGGAGCCTCCCACAGCAGCCGAGAGCAAGAGCATCCAGAGTGTCATG--GTCACCAAAGAGCCAAAGAAAA 883
Query 794 AGCCTCGAAGGGGGAGAAAACCCAAAGTGTCCAAAGCTGAGCAGCCTCTAGTCATCGTGGAAGACAAGGAACCC 867
||||||||||.|||||.||||||||||..|||||.|.||||||||||||.|||||..|..||||||||||.||.
Sbjct 884 AGCCTCGAAGAGGGAGGAAACCCAAAGCATCCAAGGTTGAGCAGCCTCTGGTCATTATCAAAGACAAGGAGCCT 957
Query 868 ACAGAGCAAGTGGCAGAGATCATTACCGAGGTCCCTCCGGATGAGCCTGTGAGTGCAACGCCAGATGAGCGGAT 941
.|||||||.||||||||||||||.||.|||.||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 958 TCAGAGCATGTGGCAGAGATCATAACTGAGATCCCCCCAGATGAGCCTGTGAGTGCAACACCAGATGAACGGAT 1031
Query 942 CATGGAGCTGGTTCTGGGGAAGCTGGCCACCACCACCACTGACACCAGCTCGGTTCCAAAGTTCACCCATCATC 1015
|||||||.|.||..||||||||||||||.||.||||.|.|||..|||||||.||.|||||||||.|.|||||||
Sbjct 1032 CATGGAGTTAGTCTTGGGGAAGCTGGCCGCCCCCACAAATGAAGCCAGCTCAGTGCCAAAGTTCCCACATCATC 1105
Query 1016 AGAATAACACCATCACGCTCAAGAGGAGCTTAATTCTCTCAAGCAGACACGGCATCCGGCGCAAGGTCATCAAA 1089
..|..|.||||||..|.|||||||||.||||..||||.||.||||||||.|||.|||||||.|||.||.||...
Sbjct 1106 CAAGCAGCACCATTGCCCTCAAGAGGGGCTTGGTTCTGTCCAGCAGACATGGCGTCCGGCGGAAGCTCGTCCGT 1179
Query 1090 CAGCTCGGGGAGCACAAGCGGGTTTACCAGTGCAATATCTGCAGCAAGATCTTCCAGAACAGCAGCAACCTGAG 1163
|||||.||.|||||.||.||..|..|.|||||....|.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1180 CAGCTGGGTGAGCATAAACGCATCCATCAGTGTGGCACCTGCAGCAAGGTCTTCCAGAACAGCAGCAACCTGAG 1253
Query 1164 CAGGCACGTGCGCTCGCATGGT---------------GACAAGCTGTTTAAGTGCGAAGAGTGTGCAAAATTGT 1222
|.||||||||||||||||.||| ||||||||||||||.||.||.||.|||.|.|||.|||
Sbjct 1254 CCGGCACGTGCGCTCGCACGGTGAGTGCGCGCACGGGGACAAGCTGTTTAAATGTGAGGAATGTTCGAAACTGT 1327
Query 1223 TCAGCCGCAAAGAGAGCCTAAAGCAGCACGTTTCCTACAAGCACAGCAGGAACGAGGTGGACGGCGAGTACAGG 1296
|||||||.||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||.||||.|||||||||||.||||||.|.
Sbjct 1328 TCAGCCGTAAGGAAAGTCTAAAGCAGCATGTTTCCTACAAGCACAGCCGGAATGAGGTGGACGGTGAGTACCGC 1401
Query 1297 TACCGCTGCGGCACTTGTGAGAAGACCTTCCGCATCGAGAGCGCGCTGGAGTTCCACAACTGCAGGACAGATGA 1370
||||||||.||||..||||.||||||.|||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1402 TACCGCTGTGGCAGCTGTGGGAAGACATTCCGAATGGAGAGTGCACTGGAGTTCCACAACTGTAGGACAGATGA 1475
Query 1371 CAAGACGTTCCAATGTGAGATGTGTTTCAGATTCTTCTCCACCAACAGCAACCTCTCCAAGCACAAGAAGAAGC 1444
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 1476 CAAGACGTTCCAATGTGAGATGTGTTTCAGATTCTTCTCCACCAACAGCAACCTCTCTAAGCACAAGAAGAAAC 1549
Query 1445 ACGGCGACAAGAAGTTTGCCTGTGAGGTCTGCAGCAAGATGTTCTACCGCAAGGACGTCATGCTGGACCACCAG 1518
|.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 1550 ATGGGGACAAGAAGTTTGCCTGTGAGGTCTGCAGTAAGATGTTCTACCGCAAGGATGTTATGCTGGACCACCAG 1623
Query 1519 CGCCGGCACCTGGAAGGAGTGCGGCGAGTGAAGCGAGAGGACCTGGAGGCCGGTGGGGAGAACCTGGTCCGTTA 1592
.|.||.|||.||||.||.||||||||.||||||.||||.|||.||||||||.|.|||||.|.||||||.|||||
Sbjct 1624 AGGCGACACTTGGATGGTGTGCGGCGGGTGAAGAGAGAAGACTTGGAGGCCAGCGGGGAAAGCCTGGTTCGTTA 1697
Query 1593 CAAGAAGGAGCCTTCCGGGTGCCCGGTGTGTGGCAAGGTGTTCTCCTGCCGGAGCAATATGAACAAGCACCTGC 1666
|||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1698 CAAGAAGGAACCTTCTGGATGCCCAGTGTGTGGCAAGGTGTTCTCCTGTCGGAGCAACATGAACAAGCACCTGC 1771
Query 1667 TCACCCACGGCGACAAGAAGTACACCTGCGAGATCTGCGGGCGCAAGTTCTTCCGCGTGGATGTGCTCAGGGAC 1740
|.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||
Sbjct 1772 TGACCCACGGTGACAAGAAGTACACCTGCGAGATCTGTGGGCGCAAGTTCTTCCGAGTGGACGTACTCAGGGAC 1845
Query 1741 CACATCCATGTCCACTTCAAGGACATCGCGTTGATGGATGACCACCAGAGGGAAGAGTTTATCGGCAAGATCGG 1814
||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||.||||.|||||.||.|||||.||.||
Sbjct 1846 CACATCCATGTCCACTTCAAGGACATCGCGCTAATGGATGACCACCAGCGGGAGGAGTTCATTGGCAAAATTGG 1919
Query 1815 GATCTCCTCGGAAGAAAACGATGACAATTCTGACGAGAGCGCAGACTCGGAGCCTCACAAGTACAGCTGCAAGC 1888
|||||||||.||.||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||.
Sbjct 1920 GATCTCCTCAGAGGAGAATGATGACAACTCTGATGAGAGCGCAGACTCTGAGCCACACAAGTACAGCTGCAAGA 1993
Query 1889 GGTGCCAGCTCACCTTCGGCCGGGGGAAGGAGTACCTGAAGCACATCATGGAGGTGCACAAGGAGAAGGGCTAT 1962
|||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.
Sbjct 1994 GGTGCCAGCTCACTTTCGGCCGTGGGAAGGAATACCTGAAGCACATCATGGAGGTGCACAAGGAGAAGGGCCAC 2067
Query 1963 GGCTGCAGCATCTGCAACCGGCGCTTTGCACTGAAGGCCACCTACCACGCCCACATGGTCATCCACCGTGAAAA 2036
|||||||||||||||.||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 2068 GGCTGCAGCATCTGCCACCGACGCTTCGCACTCAAGGCCACCTACCATGCCCACATGGTCATCCACCGGGAGAA 2141
Query 2037 CCTGCCGGACCCCAACGTGCAGAAGTACATCCACCCCTGCGAGATCTGCGGGCGGATCTTCAACAGCATCGGGA 2110
||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||.||||.|||||||||||.||||
Sbjct 2142 CCTGCCTGACCCCAACGTGCAGAAGTACATTCACCCCTGTGAGATCTGTGGGAGGATATTCAACAGCATTGGGA 2215
Query 2111 ACCTGGAGCGCCACAAGCTCATCCACACAGGTGTGAAGAGCCACGCCTGCGAGCAGTGTGGGAAGTCCTTTGCC 2184
||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2216 ACTTGGAGCGCCACAAACTCATCCACACAGGTGTGAAAAGCCACGCCTGTGAGCAGTGTGGGAAGTCCTTTGCC 2289
Query 2185 AGGAAGGACATGCTGAAGGAGCACATGCGTGTGCACGACAACGTCCGCGAGTACCTGTGTGCCGAGTGTGGGAA 2258
|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.||||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 2290 AGGAAGGACATGCTGAAAGAGCACATGCGTGTGCATGACAACATCCGGGAGTACCTGTGCGCCGAGTGTGGGAA 2363
Query 2259 AGGCATGAAGACCAAGCACGCGCTGCGCCACCACATGAAGCTGCACAAGGGCATCAAGGAGTACGAGTGCAAGG 2332
|||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 2364 AGGTATGAAGACCAAGCATGCACTGCGCCACCATATGAAGCTGCACAAAGGCATCAAGGAGTATGAGTGCAAGG 2437
Query 2333 AGTGCCACCGCAGGTTCGCGCAGAAGGTCAACATGCTCAAGCACTGCAAGCGGCACACGGGGATTAAAGATTTC 2406
|.||.|||||||.|||.||.|||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||.||.||||||||.|||
Sbjct 2438 AATGTCACCGCAAGTTTGCACAGAAGGTCAACATGCTCAAGCACTACAAACGGCACACAGGAATTAAAGACTTC 2511
Query 2407 ATGTGTGAATTGTGTGGGAAGACATTCAGCGAGAGGAACACCATGGAGACCCACAAGCTCATCCACACAGTGGG 2480
|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 2512 ATGTGTGAATTGTGTGGGAAGACATTCAGTGAGAGGAACACAATGGAGACACACAAGCTCATCCACACAGTAGG 2585
Query 2481 CAAGCAGTGGACGTGCTCCGTGTGCGACAAGAAGTACGTGACCGAGTACATGCTGCAGAAGCACGTTCAGCTCA 2554
||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||
Sbjct 2586 CAAGCAGTGGACTTGTTCCGTGTGTGACAAGAAGTACGTCACAGAGTACATGCTTCAGAAACACGTCCAGCTCA 2659
Query 2555 CACACGACAAGGTGGAGGCGCAGAGCTGCCAGCTGTGCGGGACCAAGGTGTCCACCAGGGCCTCCATGAGCCGA 2628
|.||.|||||||||||.||.|||||.|||||.||.||.||.|||||.|||||.|||.||||||||||||||.||
Sbjct 2660 CTCATGACAAGGTGGAAGCACAGAGTTGCCAACTATGTGGCACCAAAGTGTCAACCCGGGCCTCCATGAGCAGA 2733
Query 2629 CACATGCGGCGCAAGCACCCCGAGGTGCTCGCGGTGAGGATCGATGACCTGGACCACCTCCCGGAGACCACCAC 2702
||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||..||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 2734 CATATGCGACGCAAGCACCCCGAGGTCCTCGCTGTTCGGATTGACGATCTGGACCACCTCCCCGAGACCACCAC 2807
Query 2703 CATCGACGCCTCCTCCATTGGCATCGTCCAGCCTGAGCTGACTCTGGAGCAGGAGGATTTGGCCGAAGGGAAGC 2776
||||||.||.||.|||||.|||||.||||||||||.||||...|||||||||||.||..||||.|||||.||||
Sbjct 2808 CATCGATGCATCTTCCATCGGCATTGTCCAGCCTGCGCTGGGCCTGGAGCAGGAAGAACTGGCAGAAGGTAAGC 2881
Query 2777 ACGGGAAAGCTGCCAAGCGAAGTCACAAGAGAAAGCAGAAGCCAGAAGAGGAGGCGGGTGCTCCGGTGCCCGAG 2850
|.||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||.|||
Sbjct 2882 ATGGAAAGGCTGCCAAGCGCAGCCACAAGAGAAAGCAGAAGCCAGAGGAAGAGGCAGGGGCTCCAGTGCCTGAG 2955
Query 2851 GACGCCACCTTCAGCGAATACTCAGAGAAAGAGACGGAGTTCACAGGCAGTGTAGGCGACGAGACCAATTCCGC 2924
||..||||||||||.||||||.|.||.||.|||.|.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||
Sbjct 2956 GATACCACCTTCAGTGAATACCCCGAAAAGGAGCCAGAGTTCACAGGCAGTGTGGGTGACGAGACAAATTCTGC 3029
Query 2925 AGTACAGAGCATTCAGCAGGTAGTGGTGACCCTGGGTGACCCAAATGTGACCACACCATCGAGCTCAGTCGGCT 2998
.||||||||.||.||.|||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||..|.|||||.||||||||.||..
Sbjct 3030 TGTACAGAGTATCCAACAGGTGGTGGTGACCCTAGGGGACCCCAATGTGACTGCTCCATCAAGCTCAGTTGGTC 3103
Query 2999 TGACCAACATCACCGTGACCCCCATCACCACTGCGGCCGCGACTCAGTTTACCAATCTCCAGCCGGTGGCCGTG 3072
|.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|..|||||||||||||||.|.|||||.|||||.||.
Sbjct 3104 TAACCAACATCACCGTGACCCCCATCACCACTGCAGCTGGAACTCAGTTTACCAATTTACAGCCAGTGGCTGTT 3177
Query 3073 GGGCACCTTACCACCCCTGAACGCCAGTTACAGCTGGACAACTCAATCCTGACCGTGACCTTTGATACCGTCAG 3146
||.||.|||||||.||||||.||||||.|||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 3178 GGACATCTTACCAACCCTGATCGCCAGCTACAGCTAGATAACTCCATCCTGACTGTGACCTTTGATACTGTCAG 3251
Query 3147 CGGCTCTGCCATGTTGCACAACCGCCAAAATGACGTCCAGATCCACCCCCAGCCGGAAGCCTCGAACCCACAGT 3220
.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||.|.|||||.||||
Sbjct 3252 TGGCTCCGCCATGTTGCACAACCGGCAAAATGATGTCCAGATCCACCCACAGCCAGAAGCCACAAACCCTCAGT 3325
Query 3221 CTGTGGCCCATTTCATCAACCTGACGACCCTGGTCAACTCCATCACGCCCCTGGGGAGCCAGCTTAGTGACCAG 3294
|.||||||||.||.||||||||.||.||.|||||.|||||||||||.|||.||||||.|||.||.|||||.|||
Sbjct 3326 CAGTGGCCCACTTTATCAACCTTACCACACTGGTAAACTCCATCACACCCTTGGGGAACCAACTCAGTGAGCAG 3399
Query 3295 CACCCGCTCACGTGGCGGGCAGTGCCCCAGACTGACGTCTTGCCACCCCCGCAGCCGCAGGCACCCCCACAGCA 3368
|||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||.||..|||..||.||.|||.|.|..|||.||||.|||||
Sbjct 3400 CACCCACTCACCTGGCGAGCAGTGCCCCAGACAGATGTGCTGCAGCCGCCACAGGCCCCTGCAGCCCCGCAGCA 3473
Query 3369 GGCGGCCCAGCCCCAGGTGCAGGCGGAGCAGCAGCAGCAGCAGATGTACAGCTAC 3423
|||||..||.||||||||.| ||.|..|||||||||||||||||||||||
Sbjct 3474 GGCGGTGCAACCCCAGGTAC------AGAATGAGCAGCAGCAGATGTACAGCTAC 3522