Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_12439
Subject:
NM_144789.2
Aligned Length:
3533
Identities:
2922
Gaps:
121

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGTGCCCACCTACTATCTGGGAAAAGGGTGGACAGGTGGGGGCCAGGTGGAGCCTGCGTGCTCCTGAGGTATC  74

Query    1  ----ATGGCTGAAGATGGGAGCGAAGAGATCATGTTCATCTGGTGTGAAGACTGCAGCCAGTACCACGACTCCG  70
                ||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct   75  AGCAATGGCTGAAGATGGTAGTGAGGAGATCATGTTTATCTGGTGTGAAGACTGCAGCCAGTACCATGACTCGG  148

Query   71  AATGTCCCGAGCTGGGCCCAGTGGTCATGGTCAAAGACTCCTTTGTGTTAAGCAGGGCAAGGTCATCCCTTCCT  144
            |.|||||.||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||.|.||||||||||||||.|||||.||.
Sbjct  149  AGTGTCCTGAACTGGGACCTGTGGTCATGGTCAAGGACTCCTTTGTGCTGAGCAGGGCAAGGTCCTCCCTCCCC  222

Query  145  CCCAACTTGGAGATCAGACGACTGGAAGATGGAGCCGAGGGGGTGTTCGCCATCACTCAGCTCGTCAAGCGGAC  218
            .|.|||.||||||||||.||.|||||.||.||.||.||.||.|||||.||..|.||.|||||.||||||||.||
Sbjct  223  TCTAACCTGGAGATCAGGCGCCTGGATGACGGGGCTGAAGGCGTGTTTGCAGTGACCCAGCTAGTCAAGCGCAC  296

Query  219  ACAGTTCGGTCCCTTTGAGTCCAGGAGGGTCGCCAAATGGGAAAAGGAGTCTGCATTTCCCCTGAAGGTGTTCC  292
            |||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.||||||||.||.|
Sbjct  297  ACAATTTGGTCCGTTTGAGTCCAGGAGAGTCGCCAAGTGGGAGAAAGAGTCGGCATTTCCTCTGAAGGTATTTC  370

Query  293  AGAAGGACGGGCACCCCGTGTGCTTCGACACCTCCAACGAGGATGACTGCAACTGGATGATGCTGGTGCGGCCA  366
            |||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct  371  AGAAGGACGGGCATCCTGTGTGCTTCGACACTTCCAATGAGGATGACTGCAACTGGATGATGCTAGTGCGACCA  444

Query  367  GCGGCGGAGGCCGAGCACCAGAACCTGACGGCCTACCAGCACGGCAGCGACGTGTACTTCACCACCTCCAGAGA  440
            ||...||||.|.|.|||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.|..||
Sbjct  445  GCACTGGAGCCTGGGCACCAGAACCTGACAGCCTACCAACATGGCAGTGACGTGTATTTCACCACCTCAAAGGA  518

Query  441  CATCCCCCCGGGTACCGAGCTGCGCGTGTGGTATGCGGCCTTCTATGCCAAGAAGATGGACAAGCCCATGCTGA  514
            |||.||..|.||.||.||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  519  CATTCCTGCAGGCACTGAACTGCGTGTGTGGTATGCTGCCTTTTATGCCAAGAAGATGGACAAGCCCATGCTAA  592

Query  515  AGCAGGCCGGCTCTGGCGTCCACGCTGCAGGCACCCCAGAAAACAGCGCCCCCGTGGAGTCGGAACCCAGCCAG  588
            ||||||||.||||..|.||.||.||||||||||||||.||...|||.|.|.|.|||||..|.||.|...||||.
Sbjct  593  AGCAGGCCTGCTCCAGTGTTCAGGCTGCAGGCACCCCTGAGCCCAGTGTCTCTGTGGAACCTGAGCGTGGCCAA  666

Query  589  TGGGCGTGTAAAGTGTGTTCTGCCACCTTCCTGGAGCTGCAGCTCCTCAATGAACATCTGTTGGGCCACTTAGA  662
            ||||.||||||.|||||.||...|||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.||||||||..|.||
Sbjct  667  TGGGTGTGTAAGGTGTGCTCCAACACCTTCCTGGAGCTTCAGCTCCTGAACGAGCATCTCTTGGGCCATCTGGA  740

Query  663  ACAAGCCAAAAGCCTTCCTCCAGGCAGCCA-AAGC--GAGGCAGCAGCTCCCGAGAAGGAGCAGGACACACCCC  733
            .||||||||||||||.|||.||||..|||| .|||  |||   ||||||.|.||||||||||..||..|||||.
Sbjct  741  GCAAGCCAAAAGCCTCCCTGCAGGTGGCCAGCAGCATGAG---GCAGCTTCTGAGAAGGAGCCTGATGCACCCA  811

Query  734  GGGGGGAACCCCCTGCAGTGCCCGAGAGCGAGA--------------ATGTTGCCACCAAAGAACAGAAGAAAA  793
            ||..|||.||.||..|||...||||||||.|||              |||  |.|||||||||.|..|||||||
Sbjct  812  GGATGGAGCCTCCCACAGCAGCCGAGAGCAAGAGCATCCAGAGTGTCATG--GTCACCAAAGAGCCAAAGAAAA  883

Query  794  AGCCTCGAAGGGGGAGAAAACCCAAAGTGTCCAAAGCTGAGCAGCCTCTAGTCATCGTGGAAGACAAGGAACCC  867
            ||||||||||.|||||.||||||||||..|||||.|.||||||||||||.|||||..|..||||||||||.||.
Sbjct  884  AGCCTCGAAGAGGGAGGAAACCCAAAGCATCCAAGGTTGAGCAGCCTCTGGTCATTATCAAAGACAAGGAGCCT  957

Query  868  ACAGAGCAAGTGGCAGAGATCATTACCGAGGTCCCTCCGGATGAGCCTGTGAGTGCAACGCCAGATGAGCGGAT  941
            .|||||||.||||||||||||||.||.|||.||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct  958  TCAGAGCATGTGGCAGAGATCATAACTGAGATCCCCCCAGATGAGCCTGTGAGTGCAACACCAGATGAACGGAT  1031

Query  942  CATGGAGCTGGTTCTGGGGAAGCTGGCCACCACCACCACTGACACCAGCTCGGTTCCAAAGTTCACCCATCATC  1015
            |||||||.|.||..||||||||||||||.||.||||.|.|||..|||||||.||.|||||||||.|.|||||||
Sbjct 1032  CATGGAGTTAGTCTTGGGGAAGCTGGCCGCCCCCACAAATGAAGCCAGCTCAGTGCCAAAGTTCCCACATCATC  1105

Query 1016  AGAATAACACCATCACGCTCAAGAGGAGCTTAATTCTCTCAAGCAGACACGGCATCCGGCGCAAGGTCATCAAA  1089
            ..|..|.||||||..|.|||||||||.||||..||||.||.||||||||.|||.|||||||.|||.||.||...
Sbjct 1106  CAAGCAGCACCATTGCCCTCAAGAGGGGCTTGGTTCTGTCCAGCAGACATGGCGTCCGGCGGAAGCTCGTCCGT  1179

Query 1090  CAGCTCGGGGAGCACAAGCGGGTTTACCAGTGCAATATCTGCAGCAAGATCTTCCAGAACAGCAGCAACCTGAG  1163
            |||||.||.|||||.||.||..|..|.|||||....|.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1180  CAGCTGGGTGAGCATAAACGCATCCATCAGTGTGGCACCTGCAGCAAGGTCTTCCAGAACAGCAGCAACCTGAG  1253

Query 1164  CAGGCACGTGCGCTCGCATGGT---------------GACAAGCTGTTTAAGTGCGAAGAGTGTGCAAAATTGT  1222
            |.||||||||||||||||.|||               ||||||||||||||.||.||.||.|||.|.|||.|||
Sbjct 1254  CCGGCACGTGCGCTCGCACGGTGAGTGCGCGCACGGGGACAAGCTGTTTAAATGTGAGGAATGTTCGAAACTGT  1327

Query 1223  TCAGCCGCAAAGAGAGCCTAAAGCAGCACGTTTCCTACAAGCACAGCAGGAACGAGGTGGACGGCGAGTACAGG  1296
            |||||||.||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||.||||.|||||||||||.||||||.|.
Sbjct 1328  TCAGCCGTAAGGAAAGTCTAAAGCAGCATGTTTCCTACAAGCACAGCCGGAATGAGGTGGACGGTGAGTACCGC  1401

Query 1297  TACCGCTGCGGCACTTGTGAGAAGACCTTCCGCATCGAGAGCGCGCTGGAGTTCCACAACTGCAGGACAGATGA  1370
            ||||||||.||||..||||.||||||.|||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1402  TACCGCTGTGGCAGCTGTGGGAAGACATTCCGAATGGAGAGTGCACTGGAGTTCCACAACTGTAGGACAGATGA  1475

Query 1371  CAAGACGTTCCAATGTGAGATGTGTTTCAGATTCTTCTCCACCAACAGCAACCTCTCCAAGCACAAGAAGAAGC  1444
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 1476  CAAGACGTTCCAATGTGAGATGTGTTTCAGATTCTTCTCCACCAACAGCAACCTCTCTAAGCACAAGAAGAAAC  1549

Query 1445  ACGGCGACAAGAAGTTTGCCTGTGAGGTCTGCAGCAAGATGTTCTACCGCAAGGACGTCATGCTGGACCACCAG  1518
            |.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 1550  ATGGGGACAAGAAGTTTGCCTGTGAGGTCTGCAGTAAGATGTTCTACCGCAAGGATGTTATGCTGGACCACCAG  1623

Query 1519  CGCCGGCACCTGGAAGGAGTGCGGCGAGTGAAGCGAGAGGACCTGGAGGCCGGTGGGGAGAACCTGGTCCGTTA  1592
            .|.||.|||.||||.||.||||||||.||||||.||||.|||.||||||||.|.|||||.|.||||||.|||||
Sbjct 1624  AGGCGACACTTGGATGGTGTGCGGCGGGTGAAGAGAGAAGACTTGGAGGCCAGCGGGGAAAGCCTGGTTCGTTA  1697

Query 1593  CAAGAAGGAGCCTTCCGGGTGCCCGGTGTGTGGCAAGGTGTTCTCCTGCCGGAGCAATATGAACAAGCACCTGC  1666
            |||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1698  CAAGAAGGAACCTTCTGGATGCCCAGTGTGTGGCAAGGTGTTCTCCTGTCGGAGCAACATGAACAAGCACCTGC  1771

Query 1667  TCACCCACGGCGACAAGAAGTACACCTGCGAGATCTGCGGGCGCAAGTTCTTCCGCGTGGATGTGCTCAGGGAC  1740
            |.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||
Sbjct 1772  TGACCCACGGTGACAAGAAGTACACCTGCGAGATCTGTGGGCGCAAGTTCTTCCGAGTGGACGTACTCAGGGAC  1845

Query 1741  CACATCCATGTCCACTTCAAGGACATCGCGTTGATGGATGACCACCAGAGGGAAGAGTTTATCGGCAAGATCGG  1814
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||.||||.|||||.||.|||||.||.||
Sbjct 1846  CACATCCATGTCCACTTCAAGGACATCGCGCTAATGGATGACCACCAGCGGGAGGAGTTCATTGGCAAAATTGG  1919

Query 1815  GATCTCCTCGGAAGAAAACGATGACAATTCTGACGAGAGCGCAGACTCGGAGCCTCACAAGTACAGCTGCAAGC  1888
            |||||||||.||.||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||.
Sbjct 1920  GATCTCCTCAGAGGAGAATGATGACAACTCTGATGAGAGCGCAGACTCTGAGCCACACAAGTACAGCTGCAAGA  1993

Query 1889  GGTGCCAGCTCACCTTCGGCCGGGGGAAGGAGTACCTGAAGCACATCATGGAGGTGCACAAGGAGAAGGGCTAT  1962
            |||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.
Sbjct 1994  GGTGCCAGCTCACTTTCGGCCGTGGGAAGGAATACCTGAAGCACATCATGGAGGTGCACAAGGAGAAGGGCCAC  2067

Query 1963  GGCTGCAGCATCTGCAACCGGCGCTTTGCACTGAAGGCCACCTACCACGCCCACATGGTCATCCACCGTGAAAA  2036
            |||||||||||||||.||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 2068  GGCTGCAGCATCTGCCACCGACGCTTCGCACTCAAGGCCACCTACCATGCCCACATGGTCATCCACCGGGAGAA  2141

Query 2037  CCTGCCGGACCCCAACGTGCAGAAGTACATCCACCCCTGCGAGATCTGCGGGCGGATCTTCAACAGCATCGGGA  2110
            ||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||.||||.|||||||||||.||||
Sbjct 2142  CCTGCCTGACCCCAACGTGCAGAAGTACATTCACCCCTGTGAGATCTGTGGGAGGATATTCAACAGCATTGGGA  2215

Query 2111  ACCTGGAGCGCCACAAGCTCATCCACACAGGTGTGAAGAGCCACGCCTGCGAGCAGTGTGGGAAGTCCTTTGCC  2184
            ||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2216  ACTTGGAGCGCCACAAACTCATCCACACAGGTGTGAAAAGCCACGCCTGTGAGCAGTGTGGGAAGTCCTTTGCC  2289

Query 2185  AGGAAGGACATGCTGAAGGAGCACATGCGTGTGCACGACAACGTCCGCGAGTACCTGTGTGCCGAGTGTGGGAA  2258
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.||||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 2290  AGGAAGGACATGCTGAAAGAGCACATGCGTGTGCATGACAACATCCGGGAGTACCTGTGCGCCGAGTGTGGGAA  2363

Query 2259  AGGCATGAAGACCAAGCACGCGCTGCGCCACCACATGAAGCTGCACAAGGGCATCAAGGAGTACGAGTGCAAGG  2332
            |||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 2364  AGGTATGAAGACCAAGCATGCACTGCGCCACCATATGAAGCTGCACAAAGGCATCAAGGAGTATGAGTGCAAGG  2437

Query 2333  AGTGCCACCGCAGGTTCGCGCAGAAGGTCAACATGCTCAAGCACTGCAAGCGGCACACGGGGATTAAAGATTTC  2406
            |.||.|||||||.|||.||.|||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||.||.||||||||.|||
Sbjct 2438  AATGTCACCGCAAGTTTGCACAGAAGGTCAACATGCTCAAGCACTACAAACGGCACACAGGAATTAAAGACTTC  2511

Query 2407  ATGTGTGAATTGTGTGGGAAGACATTCAGCGAGAGGAACACCATGGAGACCCACAAGCTCATCCACACAGTGGG  2480
            |||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 2512  ATGTGTGAATTGTGTGGGAAGACATTCAGTGAGAGGAACACAATGGAGACACACAAGCTCATCCACACAGTAGG  2585

Query 2481  CAAGCAGTGGACGTGCTCCGTGTGCGACAAGAAGTACGTGACCGAGTACATGCTGCAGAAGCACGTTCAGCTCA  2554
            ||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||
Sbjct 2586  CAAGCAGTGGACTTGTTCCGTGTGTGACAAGAAGTACGTCACAGAGTACATGCTTCAGAAACACGTCCAGCTCA  2659

Query 2555  CACACGACAAGGTGGAGGCGCAGAGCTGCCAGCTGTGCGGGACCAAGGTGTCCACCAGGGCCTCCATGAGCCGA  2628
            |.||.|||||||||||.||.|||||.|||||.||.||.||.|||||.|||||.|||.||||||||||||||.||
Sbjct 2660  CTCATGACAAGGTGGAAGCACAGAGTTGCCAACTATGTGGCACCAAAGTGTCAACCCGGGCCTCCATGAGCAGA  2733

Query 2629  CACATGCGGCGCAAGCACCCCGAGGTGCTCGCGGTGAGGATCGATGACCTGGACCACCTCCCGGAGACCACCAC  2702
            ||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||..||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 2734  CATATGCGACGCAAGCACCCCGAGGTCCTCGCTGTTCGGATTGACGATCTGGACCACCTCCCCGAGACCACCAC  2807

Query 2703  CATCGACGCCTCCTCCATTGGCATCGTCCAGCCTGAGCTGACTCTGGAGCAGGAGGATTTGGCCGAAGGGAAGC  2776
            ||||||.||.||.|||||.|||||.||||||||||.||||...|||||||||||.||..||||.|||||.||||
Sbjct 2808  CATCGATGCATCTTCCATCGGCATTGTCCAGCCTGCGCTGGGCCTGGAGCAGGAAGAACTGGCAGAAGGTAAGC  2881

Query 2777  ACGGGAAAGCTGCCAAGCGAAGTCACAAGAGAAAGCAGAAGCCAGAAGAGGAGGCGGGTGCTCCGGTGCCCGAG  2850
            |.||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||.|||
Sbjct 2882  ATGGAAAGGCTGCCAAGCGCAGCCACAAGAGAAAGCAGAAGCCAGAGGAAGAGGCAGGGGCTCCAGTGCCTGAG  2955

Query 2851  GACGCCACCTTCAGCGAATACTCAGAGAAAGAGACGGAGTTCACAGGCAGTGTAGGCGACGAGACCAATTCCGC  2924
            ||..||||||||||.||||||.|.||.||.|||.|.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||
Sbjct 2956  GATACCACCTTCAGTGAATACCCCGAAAAGGAGCCAGAGTTCACAGGCAGTGTGGGTGACGAGACAAATTCTGC  3029

Query 2925  AGTACAGAGCATTCAGCAGGTAGTGGTGACCCTGGGTGACCCAAATGTGACCACACCATCGAGCTCAGTCGGCT  2998
            .||||||||.||.||.|||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||..|.|||||.||||||||.||..
Sbjct 3030  TGTACAGAGTATCCAACAGGTGGTGGTGACCCTAGGGGACCCCAATGTGACTGCTCCATCAAGCTCAGTTGGTC  3103

Query 2999  TGACCAACATCACCGTGACCCCCATCACCACTGCGGCCGCGACTCAGTTTACCAATCTCCAGCCGGTGGCCGTG  3072
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|..|||||||||||||||.|.|||||.|||||.||.
Sbjct 3104  TAACCAACATCACCGTGACCCCCATCACCACTGCAGCTGGAACTCAGTTTACCAATTTACAGCCAGTGGCTGTT  3177

Query 3073  GGGCACCTTACCACCCCTGAACGCCAGTTACAGCTGGACAACTCAATCCTGACCGTGACCTTTGATACCGTCAG  3146
            ||.||.|||||||.||||||.||||||.|||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 3178  GGACATCTTACCAACCCTGATCGCCAGCTACAGCTAGATAACTCCATCCTGACTGTGACCTTTGATACTGTCAG  3251

Query 3147  CGGCTCTGCCATGTTGCACAACCGCCAAAATGACGTCCAGATCCACCCCCAGCCGGAAGCCTCGAACCCACAGT  3220
            .|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||.|.|||||.||||
Sbjct 3252  TGGCTCCGCCATGTTGCACAACCGGCAAAATGATGTCCAGATCCACCCACAGCCAGAAGCCACAAACCCTCAGT  3325

Query 3221  CTGTGGCCCATTTCATCAACCTGACGACCCTGGTCAACTCCATCACGCCCCTGGGGAGCCAGCTTAGTGACCAG  3294
            |.||||||||.||.||||||||.||.||.|||||.|||||||||||.|||.||||||.|||.||.|||||.|||
Sbjct 3326  CAGTGGCCCACTTTATCAACCTTACCACACTGGTAAACTCCATCACACCCTTGGGGAACCAACTCAGTGAGCAG  3399

Query 3295  CACCCGCTCACGTGGCGGGCAGTGCCCCAGACTGACGTCTTGCCACCCCCGCAGCCGCAGGCACCCCCACAGCA  3368
            |||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||.||..|||..||.||.|||.|.|..|||.||||.|||||
Sbjct 3400  CACCCACTCACCTGGCGAGCAGTGCCCCAGACAGATGTGCTGCAGCCGCCACAGGCCCCTGCAGCCCCGCAGCA  3473

Query 3369  GGCGGCCCAGCCCCAGGTGCAGGCGGAGCAGCAGCAGCAGCAGATGTACAGCTAC  3423
            |||||..||.||||||||.|      ||.|..|||||||||||||||||||||||
Sbjct 3474  GGCGGTGCAACCCCAGGTAC------AGAATGAGCAGCAGCAGATGTACAGCTAC  3522