Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_12439
- Subject:
- XM_006522863.3
- Aligned Length:
- 3563
- Identities:
- 2922
- Gaps:
- 151
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGCCGCGCCACCGCCCCCCCGGCTTCCGGTGCTGCGCAGTTTCCGGAGCGGATCGCAACCCGGAGTCCGGATC 74
Query 1 ----------------------------------ATGGCTGAAGATGGGAGCGAAGAGATCATGTTCATCTGGT 40
||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 75 CGACCCCGCTCTGCACATTCCACAGGTATCAGCAATGGCTGAAGATGGTAGTGAGGAGATCATGTTTATCTGGT 148
Query 41 GTGAAGACTGCAGCCAGTACCACGACTCCGAATGTCCCGAGCTGGGCCCAGTGGTCATGGTCAAAGACTCCTTT 114
||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||.||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 149 GTGAAGACTGCAGCCAGTACCATGACTCGGAGTGTCCTGAACTGGGACCTGTGGTCATGGTCAAGGACTCCTTT 222
Query 115 GTGTTAAGCAGGGCAAGGTCATCCCTTCCTCCCAACTTGGAGATCAGACGACTGGAAGATGGAGCCGAGGGGGT 188
|||.|.||||||||||||||.|||||.||..|.|||.||||||||||.||.|||||.||.||.||.||.||.||
Sbjct 223 GTGCTGAGCAGGGCAAGGTCCTCCCTCCCCTCTAACCTGGAGATCAGGCGCCTGGATGACGGGGCTGAAGGCGT 296
Query 189 GTTCGCCATCACTCAGCTCGTCAAGCGGACACAGTTCGGTCCCTTTGAGTCCAGGAGGGTCGCCAAATGGGAAA 262
|||.||..|.||.|||||.||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|
Sbjct 297 GTTTGCAGTGACCCAGCTAGTCAAGCGCACACAATTTGGTCCGTTTGAGTCCAGGAGAGTCGCCAAGTGGGAGA 370
Query 263 AGGAGTCTGCATTTCCCCTGAAGGTGTTCCAGAAGGACGGGCACCCCGTGTGCTTCGACACCTCCAACGAGGAT 336
|.|||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 371 AAGAGTCGGCATTTCCTCTGAAGGTATTTCAGAAGGACGGGCATCCTGTGTGCTTCGACACTTCCAATGAGGAT 444
Query 337 GACTGCAACTGGATGATGCTGGTGCGGCCAGCGGCGGAGGCCGAGCACCAGAACCTGACGGCCTACCAGCACGG 410
||||||||||||||||||||.|||||.|||||...||||.|.|.|||||||||||||||.||||||||.||.||
Sbjct 445 GACTGCAACTGGATGATGCTAGTGCGACCAGCACTGGAGCCTGGGCACCAGAACCTGACAGCCTACCAACATGG 518
Query 411 CAGCGACGTGTACTTCACCACCTCCAGAGACATCCCCCCGGGTACCGAGCTGCGCGTGTGGTATGCGGCCTTCT 484
|||.||||||||.|||||||||||.|..|||||.||..|.||.||.||.|||||.|||||||||||.|||||.|
Sbjct 519 CAGTGACGTGTATTTCACCACCTCAAAGGACATTCCTGCAGGCACTGAACTGCGTGTGTGGTATGCTGCCTTTT 592
Query 485 ATGCCAAGAAGATGGACAAGCCCATGCTGAAGCAGGCCGGCTCTGGCGTCCACGCTGCAGGCACCCCAGAAAAC 558
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||..|.||.||.||||||||||||||.||...|
Sbjct 593 ATGCCAAGAAGATGGACAAGCCCATGCTAAAGCAGGCCTGCTCCAGTGTTCAGGCTGCAGGCACCCCTGAGCCC 666
Query 559 AGCGCCCCCGTGGAGTCGGAACCCAGCCAGTGGGCGTGTAAAGTGTGTTCTGCCACCTTCCTGGAGCTGCAGCT 632
||.|.|.|.|||||..|.||.|...||||.||||.||||||.|||||.||...|||||||||||||||.|||||
Sbjct 667 AGTGTCTCTGTGGAACCTGAGCGTGGCCAATGGGTGTGTAAGGTGTGCTCCAACACCTTCCTGGAGCTTCAGCT 740
Query 633 CCTCAATGAACATCTGTTGGGCCACTTAGAACAAGCCAAAAGCCTTCCTCCAGGCAGCCA-AAGC--GAGGCAG 703
|||.||.||.|||||.||||||||..|.||.||||||||||||||.|||.||||..|||| .||| ||| |
Sbjct 741 CCTGAACGAGCATCTCTTGGGCCATCTGGAGCAAGCCAAAAGCCTCCCTGCAGGTGGCCAGCAGCATGAG---G 811
Query 704 CAGCTCCCGAGAAGGAGCAGGACACACCCCGGGGGGAACCCCCTGCAGTGCCCGAGAGCGAGA----------- 766
|||||.|.||||||||||..||..|||||.||..|||.||.||..|||...||||||||.|||
Sbjct 812 CAGCTTCTGAGAAGGAGCCTGATGCACCCAGGATGGAGCCTCCCACAGCAGCCGAGAGCAAGAGCATCCAGAGT 885
Query 767 ---ATGTTGCCACCAAAGAACAGAAGAAAAAGCCTCGAAGGGGGAGAAAACCCAAAGTGTCCAAAGCTGAGCAG 837
||| |.|||||||||.|..|||||||||||||||||.|||||.||||||||||..|||||.|.|||||||
Sbjct 886 GTCATG--GTCACCAAAGAGCCAAAGAAAAAGCCTCGAAGAGGGAGGAAACCCAAAGCATCCAAGGTTGAGCAG 957
Query 838 CCTCTAGTCATCGTGGAAGACAAGGAACCCACAGAGCAAGTGGCAGAGATCATTACCGAGGTCCCTCCGGATGA 911
|||||.|||||..|..||||||||||.||..|||||||.||||||||||||||.||.|||.||||.||.|||||
Sbjct 958 CCTCTGGTCATTATCAAAGACAAGGAGCCTTCAGAGCATGTGGCAGAGATCATAACTGAGATCCCCCCAGATGA 1031
Query 912 GCCTGTGAGTGCAACGCCAGATGAGCGGATCATGGAGCTGGTTCTGGGGAAGCTGGCCACCACCACCACTGACA 985
|||||||||||||||.||||||||.||||||||||||.|.||..||||||||||||||.||.||||.|.|||..
Sbjct 1032 GCCTGTGAGTGCAACACCAGATGAACGGATCATGGAGTTAGTCTTGGGGAAGCTGGCCGCCCCCACAAATGAAG 1105
Query 986 CCAGCTCGGTTCCAAAGTTCACCCATCATCAGAATAACACCATCACGCTCAAGAGGAGCTTAATTCTCTCAAGC 1059
|||||||.||.|||||||||.|.|||||||..|..|.||||||..|.|||||||||.||||..||||.||.|||
Sbjct 1106 CCAGCTCAGTGCCAAAGTTCCCACATCATCCAAGCAGCACCATTGCCCTCAAGAGGGGCTTGGTTCTGTCCAGC 1179
Query 1060 AGACACGGCATCCGGCGCAAGGTCATCAAACAGCTCGGGGAGCACAAGCGGGTTTACCAGTGCAATATCTGCAG 1133
|||||.|||.|||||||.|||.||.||...|||||.||.|||||.||.||..|..|.|||||....|.||||||
Sbjct 1180 AGACATGGCGTCCGGCGGAAGCTCGTCCGTCAGCTGGGTGAGCATAAACGCATCCATCAGTGTGGCACCTGCAG 1253
Query 1134 CAAGATCTTCCAGAACAGCAGCAACCTGAGCAGGCACGTGCGCTCGCATGGT---------------GACAAGC 1192
||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||| |||||||
Sbjct 1254 CAAGGTCTTCCAGAACAGCAGCAACCTGAGCCGGCACGTGCGCTCGCACGGTGAGTGCGCGCACGGGGACAAGC 1327
Query 1193 TGTTTAAGTGCGAAGAGTGTGCAAAATTGTTCAGCCGCAAAGAGAGCCTAAAGCAGCACGTTTCCTACAAGCAC 1266
|||||||.||.||.||.|||.|.|||.||||||||||.||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1328 TGTTTAAATGTGAGGAATGTTCGAAACTGTTCAGCCGTAAGGAAAGTCTAAAGCAGCATGTTTCCTACAAGCAC 1401
Query 1267 AGCAGGAACGAGGTGGACGGCGAGTACAGGTACCGCTGCGGCACTTGTGAGAAGACCTTCCGCATCGAGAGCGC 1340
|||.||||.|||||||||||.||||||.|.||||||||.||||..||||.||||||.|||||.||.|||||.||
Sbjct 1402 AGCCGGAATGAGGTGGACGGTGAGTACCGCTACCGCTGTGGCAGCTGTGGGAAGACATTCCGAATGGAGAGTGC 1475
Query 1341 GCTGGAGTTCCACAACTGCAGGACAGATGACAAGACGTTCCAATGTGAGATGTGTTTCAGATTCTTCTCCACCA 1414
.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1476 ACTGGAGTTCCACAACTGTAGGACAGATGACAAGACGTTCCAATGTGAGATGTGTTTCAGATTCTTCTCCACCA 1549
Query 1415 ACAGCAACCTCTCCAAGCACAAGAAGAAGCACGGCGACAAGAAGTTTGCCTGTGAGGTCTGCAGCAAGATGTTC 1488
|||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1550 ACAGCAACCTCTCTAAGCACAAGAAGAAACATGGGGACAAGAAGTTTGCCTGTGAGGTCTGCAGTAAGATGTTC 1623
Query 1489 TACCGCAAGGACGTCATGCTGGACCACCAGCGCCGGCACCTGGAAGGAGTGCGGCGAGTGAAGCGAGAGGACCT 1562
|||||||||||.||.|||||||||||||||.|.||.|||.||||.||.||||||||.||||||.||||.|||.|
Sbjct 1624 TACCGCAAGGATGTTATGCTGGACCACCAGAGGCGACACTTGGATGGTGTGCGGCGGGTGAAGAGAGAAGACTT 1697
Query 1563 GGAGGCCGGTGGGGAGAACCTGGTCCGTTACAAGAAGGAGCCTTCCGGGTGCCCGGTGTGTGGCAAGGTGTTCT 1636
|||||||.|.|||||.|.||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1698 GGAGGCCAGCGGGGAAAGCCTGGTTCGTTACAAGAAGGAACCTTCTGGATGCCCAGTGTGTGGCAAGGTGTTCT 1771
Query 1637 CCTGCCGGAGCAATATGAACAAGCACCTGCTCACCCACGGCGACAAGAAGTACACCTGCGAGATCTGCGGGCGC 1710
||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1772 CCTGTCGGAGCAACATGAACAAGCACCTGCTGACCCACGGTGACAAGAAGTACACCTGCGAGATCTGTGGGCGC 1845
Query 1711 AAGTTCTTCCGCGTGGATGTGCTCAGGGACCACATCCATGTCCACTTCAAGGACATCGCGTTGATGGATGACCA 1784
|||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||
Sbjct 1846 AAGTTCTTCCGAGTGGACGTACTCAGGGACCACATCCATGTCCACTTCAAGGACATCGCGCTAATGGATGACCA 1919
Query 1785 CCAGAGGGAAGAGTTTATCGGCAAGATCGGGATCTCCTCGGAAGAAAACGATGACAATTCTGACGAGAGCGCAG 1858
||||.||||.|||||.||.|||||.||.|||||||||||.||.||.||.||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 1920 CCAGCGGGAGGAGTTCATTGGCAAAATTGGGATCTCCTCAGAGGAGAATGATGACAACTCTGATGAGAGCGCAG 1993
Query 1859 ACTCGGAGCCTCACAAGTACAGCTGCAAGCGGTGCCAGCTCACCTTCGGCCGGGGGAAGGAGTACCTGAAGCAC 1932
||||.|||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 1994 ACTCTGAGCCACACAAGTACAGCTGCAAGAGGTGCCAGCTCACTTTCGGCCGTGGGAAGGAATACCTGAAGCAC 2067
Query 1933 ATCATGGAGGTGCACAAGGAGAAGGGCTATGGCTGCAGCATCTGCAACCGGCGCTTTGCACTGAAGGCCACCTA 2006
|||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||.||||.|||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 2068 ATCATGGAGGTGCACAAGGAGAAGGGCCACGGCTGCAGCATCTGCCACCGACGCTTCGCACTCAAGGCCACCTA 2141
Query 2007 CCACGCCCACATGGTCATCCACCGTGAAAACCTGCCGGACCCCAACGTGCAGAAGTACATCCACCCCTGCGAGA 2080
|||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 2142 CCATGCCCACATGGTCATCCACCGGGAGAACCTGCCTGACCCCAACGTGCAGAAGTACATTCACCCCTGTGAGA 2215
Query 2081 TCTGCGGGCGGATCTTCAACAGCATCGGGAACCTGGAGCGCCACAAGCTCATCCACACAGGTGTGAAGAGCCAC 2154
||||.|||.||||.|||||||||||.||||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 2216 TCTGTGGGAGGATATTCAACAGCATTGGGAACTTGGAGCGCCACAAACTCATCCACACAGGTGTGAAAAGCCAC 2289
Query 2155 GCCTGCGAGCAGTGTGGGAAGTCCTTTGCCAGGAAGGACATGCTGAAGGAGCACATGCGTGTGCACGACAACGT 2228
|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.|
Sbjct 2290 GCCTGTGAGCAGTGTGGGAAGTCCTTTGCCAGGAAGGACATGCTGAAAGAGCACATGCGTGTGCATGACAACAT 2363
Query 2229 CCGCGAGTACCTGTGTGCCGAGTGTGGGAAAGGCATGAAGACCAAGCACGCGCTGCGCCACCACATGAAGCTGC 2302
|||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct 2364 CCGGGAGTACCTGTGCGCCGAGTGTGGGAAAGGTATGAAGACCAAGCATGCACTGCGCCACCATATGAAGCTGC 2437
Query 2303 ACAAGGGCATCAAGGAGTACGAGTGCAAGGAGTGCCACCGCAGGTTCGCGCAGAAGGTCAACATGCTCAAGCAC 2376
||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||.|||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2438 ACAAAGGCATCAAGGAGTATGAGTGCAAGGAATGTCACCGCAAGTTTGCACAGAAGGTCAACATGCTCAAGCAC 2511
Query 2377 TGCAAGCGGCACACGGGGATTAAAGATTTCATGTGTGAATTGTGTGGGAAGACATTCAGCGAGAGGAACACCAT 2450
|.|||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 2512 TACAAACGGCACACAGGAATTAAAGACTTCATGTGTGAATTGTGTGGGAAGACATTCAGTGAGAGGAACACAAT 2585
Query 2451 GGAGACCCACAAGCTCATCCACACAGTGGGCAAGCAGTGGACGTGCTCCGTGTGCGACAAGAAGTACGTGACCG 2524
||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||.|
Sbjct 2586 GGAGACACACAAGCTCATCCACACAGTAGGCAAGCAGTGGACTTGTTCCGTGTGTGACAAGAAGTACGTCACAG 2659
Query 2525 AGTACATGCTGCAGAAGCACGTTCAGCTCACACACGACAAGGTGGAGGCGCAGAGCTGCCAGCTGTGCGGGACC 2598
||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.||.|||||.|||||.||.||.||.|||
Sbjct 2660 AGTACATGCTTCAGAAACACGTCCAGCTCACTCATGACAAGGTGGAAGCACAGAGTTGCCAACTATGTGGCACC 2733
Query 2599 AAGGTGTCCACCAGGGCCTCCATGAGCCGACACATGCGGCGCAAGCACCCCGAGGTGCTCGCGGTGAGGATCGA 2672
||.|||||.|||.||||||||||||||.||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||..||||.||
Sbjct 2734 AAAGTGTCAACCCGGGCCTCCATGAGCAGACATATGCGACGCAAGCACCCCGAGGTCCTCGCTGTTCGGATTGA 2807
Query 2673 TGACCTGGACCACCTCCCGGAGACCACCACCATCGACGCCTCCTCCATTGGCATCGTCCAGCCTGAGCTGACTC 2746
.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.||||||||||.||||...|
Sbjct 2808 CGATCTGGACCACCTCCCCGAGACCACCACCATCGATGCATCTTCCATCGGCATTGTCCAGCCTGCGCTGGGCC 2881
Query 2747 TGGAGCAGGAGGATTTGGCCGAAGGGAAGCACGGGAAAGCTGCCAAGCGAAGTCACAAGAGAAAGCAGAAGCCA 2820
||||||||||.||..||||.|||||.|||||.||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 2882 TGGAGCAGGAAGAACTGGCAGAAGGTAAGCATGGAAAGGCTGCCAAGCGCAGCCACAAGAGAAAGCAGAAGCCA 2955
Query 2821 GAAGAGGAGGCGGGTGCTCCGGTGCCCGAGGACGCCACCTTCAGCGAATACTCAGAGAAAGAGACGGAGTTCAC 2894
||.||.|||||.||.|||||.|||||.|||||..||||||||||.||||||.|.||.||.|||.|.||||||||
Sbjct 2956 GAGGAAGAGGCAGGGGCTCCAGTGCCTGAGGATACCACCTTCAGTGAATACCCCGAAAAGGAGCCAGAGTTCAC 3029
Query 2895 AGGCAGTGTAGGCGACGAGACCAATTCCGCAGTACAGAGCATTCAGCAGGTAGTGGTGACCCTGGGTGACCCAA 2968
|||||||||.||.||||||||.|||||.||.||||||||.||.||.|||||.|||||||||||.||.|||||.|
Sbjct 3030 AGGCAGTGTGGGTGACGAGACAAATTCTGCTGTACAGAGTATCCAACAGGTGGTGGTGACCCTAGGGGACCCCA 3103
Query 2969 ATGTGACCACACCATCGAGCTCAGTCGGCTTGACCAACATCACCGTGACCCCCATCACCACTGCGGCCGCGACT 3042
|||||||..|.|||||.||||||||.||..|.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|..|||
Sbjct 3104 ATGTGACTGCTCCATCAAGCTCAGTTGGTCTAACCAACATCACCGTGACCCCCATCACCACTGCAGCTGGAACT 3177
Query 3043 CAGTTTACCAATCTCCAGCCGGTGGCCGTGGGGCACCTTACCACCCCTGAACGCCAGTTACAGCTGGACAACTC 3116
||||||||||||.|.|||||.|||||.||.||.||.|||||||.||||||.||||||.|||||||.||.|||||
Sbjct 3178 CAGTTTACCAATTTACAGCCAGTGGCTGTTGGACATCTTACCAACCCTGATCGCCAGCTACAGCTAGATAACTC 3251
Query 3117 AATCCTGACCGTGACCTTTGATACCGTCAGCGGCTCTGCCATGTTGCACAACCGCCAAAATGACGTCCAGATCC 3190
.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 3252 CATCCTGACTGTGACCTTTGATACTGTCAGTGGCTCCGCCATGTTGCACAACCGGCAAAATGATGTCCAGATCC 3325
Query 3191 ACCCCCAGCCGGAAGCCTCGAACCCACAGTCTGTGGCCCATTTCATCAACCTGACGACCCTGGTCAACTCCATC 3264
||||.|||||.||||||.|.|||||.|||||.||||||||.||.||||||||.||.||.|||||.|||||||||
Sbjct 3326 ACCCACAGCCAGAAGCCACAAACCCTCAGTCAGTGGCCCACTTTATCAACCTTACCACACTGGTAAACTCCATC 3399
Query 3265 ACGCCCCTGGGGAGCCAGCTTAGTGACCAGCACCCGCTCACGTGGCGGGCAGTGCCCCAGACTGACGTCTTGCC 3338
||.|||.||||||.|||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||.||..|||.
Sbjct 3400 ACACCCTTGGGGAACCAACTCAGTGAGCAGCACCCACTCACCTGGCGAGCAGTGCCCCAGACAGATGTGCTGCA 3473
Query 3339 ACCCCCGCAGCCGCAGGCACCCCCACAGCAGGCGGCCCAGCCCCAGGTGCAGGCGGAGCAGCAGCAGCAGCAGA 3412
.||.||.|||.|.|..|||.||||.||||||||||..||.||||||||.| ||.|..||||||||||||
Sbjct 3474 GCCGCCACAGGCCCCTGCAGCCCCGCAGCAGGCGGTGCAACCCCAGGTAC------AGAATGAGCAGCAGCAGA 3541
Query 3413 TGTACAGCTAC 3423
|||||||||||
Sbjct 3542 TGTACAGCTAC 3552