Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_12439
Subject:
XM_006522863.3
Aligned Length:
3563
Identities:
2922
Gaps:
151

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCCGCGCCACCGCCCCCCCGGCTTCCGGTGCTGCGCAGTTTCCGGAGCGGATCGCAACCCGGAGTCCGGATC  74

Query    1  ----------------------------------ATGGCTGAAGATGGGAGCGAAGAGATCATGTTCATCTGGT  40
                                              ||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||
Sbjct   75  CGACCCCGCTCTGCACATTCCACAGGTATCAGCAATGGCTGAAGATGGTAGTGAGGAGATCATGTTTATCTGGT  148

Query   41  GTGAAGACTGCAGCCAGTACCACGACTCCGAATGTCCCGAGCTGGGCCCAGTGGTCATGGTCAAAGACTCCTTT  114
            ||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||.||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  149  GTGAAGACTGCAGCCAGTACCATGACTCGGAGTGTCCTGAACTGGGACCTGTGGTCATGGTCAAGGACTCCTTT  222

Query  115  GTGTTAAGCAGGGCAAGGTCATCCCTTCCTCCCAACTTGGAGATCAGACGACTGGAAGATGGAGCCGAGGGGGT  188
            |||.|.||||||||||||||.|||||.||..|.|||.||||||||||.||.|||||.||.||.||.||.||.||
Sbjct  223  GTGCTGAGCAGGGCAAGGTCCTCCCTCCCCTCTAACCTGGAGATCAGGCGCCTGGATGACGGGGCTGAAGGCGT  296

Query  189  GTTCGCCATCACTCAGCTCGTCAAGCGGACACAGTTCGGTCCCTTTGAGTCCAGGAGGGTCGCCAAATGGGAAA  262
            |||.||..|.||.|||||.||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|
Sbjct  297  GTTTGCAGTGACCCAGCTAGTCAAGCGCACACAATTTGGTCCGTTTGAGTCCAGGAGAGTCGCCAAGTGGGAGA  370

Query  263  AGGAGTCTGCATTTCCCCTGAAGGTGTTCCAGAAGGACGGGCACCCCGTGTGCTTCGACACCTCCAACGAGGAT  336
            |.|||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct  371  AAGAGTCGGCATTTCCTCTGAAGGTATTTCAGAAGGACGGGCATCCTGTGTGCTTCGACACTTCCAATGAGGAT  444

Query  337  GACTGCAACTGGATGATGCTGGTGCGGCCAGCGGCGGAGGCCGAGCACCAGAACCTGACGGCCTACCAGCACGG  410
            ||||||||||||||||||||.|||||.|||||...||||.|.|.|||||||||||||||.||||||||.||.||
Sbjct  445  GACTGCAACTGGATGATGCTAGTGCGACCAGCACTGGAGCCTGGGCACCAGAACCTGACAGCCTACCAACATGG  518

Query  411  CAGCGACGTGTACTTCACCACCTCCAGAGACATCCCCCCGGGTACCGAGCTGCGCGTGTGGTATGCGGCCTTCT  484
            |||.||||||||.|||||||||||.|..|||||.||..|.||.||.||.|||||.|||||||||||.|||||.|
Sbjct  519  CAGTGACGTGTATTTCACCACCTCAAAGGACATTCCTGCAGGCACTGAACTGCGTGTGTGGTATGCTGCCTTTT  592

Query  485  ATGCCAAGAAGATGGACAAGCCCATGCTGAAGCAGGCCGGCTCTGGCGTCCACGCTGCAGGCACCCCAGAAAAC  558
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||..|.||.||.||||||||||||||.||...|
Sbjct  593  ATGCCAAGAAGATGGACAAGCCCATGCTAAAGCAGGCCTGCTCCAGTGTTCAGGCTGCAGGCACCCCTGAGCCC  666

Query  559  AGCGCCCCCGTGGAGTCGGAACCCAGCCAGTGGGCGTGTAAAGTGTGTTCTGCCACCTTCCTGGAGCTGCAGCT  632
            ||.|.|.|.|||||..|.||.|...||||.||||.||||||.|||||.||...|||||||||||||||.|||||
Sbjct  667  AGTGTCTCTGTGGAACCTGAGCGTGGCCAATGGGTGTGTAAGGTGTGCTCCAACACCTTCCTGGAGCTTCAGCT  740

Query  633  CCTCAATGAACATCTGTTGGGCCACTTAGAACAAGCCAAAAGCCTTCCTCCAGGCAGCCA-AAGC--GAGGCAG  703
            |||.||.||.|||||.||||||||..|.||.||||||||||||||.|||.||||..|||| .|||  |||   |
Sbjct  741  CCTGAACGAGCATCTCTTGGGCCATCTGGAGCAAGCCAAAAGCCTCCCTGCAGGTGGCCAGCAGCATGAG---G  811

Query  704  CAGCTCCCGAGAAGGAGCAGGACACACCCCGGGGGGAACCCCCTGCAGTGCCCGAGAGCGAGA-----------  766
            |||||.|.||||||||||..||..|||||.||..|||.||.||..|||...||||||||.|||           
Sbjct  812  CAGCTTCTGAGAAGGAGCCTGATGCACCCAGGATGGAGCCTCCCACAGCAGCCGAGAGCAAGAGCATCCAGAGT  885

Query  767  ---ATGTTGCCACCAAAGAACAGAAGAAAAAGCCTCGAAGGGGGAGAAAACCCAAAGTGTCCAAAGCTGAGCAG  837
               |||  |.|||||||||.|..|||||||||||||||||.|||||.||||||||||..|||||.|.|||||||
Sbjct  886  GTCATG--GTCACCAAAGAGCCAAAGAAAAAGCCTCGAAGAGGGAGGAAACCCAAAGCATCCAAGGTTGAGCAG  957

Query  838  CCTCTAGTCATCGTGGAAGACAAGGAACCCACAGAGCAAGTGGCAGAGATCATTACCGAGGTCCCTCCGGATGA  911
            |||||.|||||..|..||||||||||.||..|||||||.||||||||||||||.||.|||.||||.||.|||||
Sbjct  958  CCTCTGGTCATTATCAAAGACAAGGAGCCTTCAGAGCATGTGGCAGAGATCATAACTGAGATCCCCCCAGATGA  1031

Query  912  GCCTGTGAGTGCAACGCCAGATGAGCGGATCATGGAGCTGGTTCTGGGGAAGCTGGCCACCACCACCACTGACA  985
            |||||||||||||||.||||||||.||||||||||||.|.||..||||||||||||||.||.||||.|.|||..
Sbjct 1032  GCCTGTGAGTGCAACACCAGATGAACGGATCATGGAGTTAGTCTTGGGGAAGCTGGCCGCCCCCACAAATGAAG  1105

Query  986  CCAGCTCGGTTCCAAAGTTCACCCATCATCAGAATAACACCATCACGCTCAAGAGGAGCTTAATTCTCTCAAGC  1059
            |||||||.||.|||||||||.|.|||||||..|..|.||||||..|.|||||||||.||||..||||.||.|||
Sbjct 1106  CCAGCTCAGTGCCAAAGTTCCCACATCATCCAAGCAGCACCATTGCCCTCAAGAGGGGCTTGGTTCTGTCCAGC  1179

Query 1060  AGACACGGCATCCGGCGCAAGGTCATCAAACAGCTCGGGGAGCACAAGCGGGTTTACCAGTGCAATATCTGCAG  1133
            |||||.|||.|||||||.|||.||.||...|||||.||.|||||.||.||..|..|.|||||....|.||||||
Sbjct 1180  AGACATGGCGTCCGGCGGAAGCTCGTCCGTCAGCTGGGTGAGCATAAACGCATCCATCAGTGTGGCACCTGCAG  1253

Query 1134  CAAGATCTTCCAGAACAGCAGCAACCTGAGCAGGCACGTGCGCTCGCATGGT---------------GACAAGC  1192
            ||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||               |||||||
Sbjct 1254  CAAGGTCTTCCAGAACAGCAGCAACCTGAGCCGGCACGTGCGCTCGCACGGTGAGTGCGCGCACGGGGACAAGC  1327

Query 1193  TGTTTAAGTGCGAAGAGTGTGCAAAATTGTTCAGCCGCAAAGAGAGCCTAAAGCAGCACGTTTCCTACAAGCAC  1266
            |||||||.||.||.||.|||.|.|||.||||||||||.||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1328  TGTTTAAATGTGAGGAATGTTCGAAACTGTTCAGCCGTAAGGAAAGTCTAAAGCAGCATGTTTCCTACAAGCAC  1401

Query 1267  AGCAGGAACGAGGTGGACGGCGAGTACAGGTACCGCTGCGGCACTTGTGAGAAGACCTTCCGCATCGAGAGCGC  1340
            |||.||||.|||||||||||.||||||.|.||||||||.||||..||||.||||||.|||||.||.|||||.||
Sbjct 1402  AGCCGGAATGAGGTGGACGGTGAGTACCGCTACCGCTGTGGCAGCTGTGGGAAGACATTCCGAATGGAGAGTGC  1475

Query 1341  GCTGGAGTTCCACAACTGCAGGACAGATGACAAGACGTTCCAATGTGAGATGTGTTTCAGATTCTTCTCCACCA  1414
            .|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1476  ACTGGAGTTCCACAACTGTAGGACAGATGACAAGACGTTCCAATGTGAGATGTGTTTCAGATTCTTCTCCACCA  1549

Query 1415  ACAGCAACCTCTCCAAGCACAAGAAGAAGCACGGCGACAAGAAGTTTGCCTGTGAGGTCTGCAGCAAGATGTTC  1488
            |||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1550  ACAGCAACCTCTCTAAGCACAAGAAGAAACATGGGGACAAGAAGTTTGCCTGTGAGGTCTGCAGTAAGATGTTC  1623

Query 1489  TACCGCAAGGACGTCATGCTGGACCACCAGCGCCGGCACCTGGAAGGAGTGCGGCGAGTGAAGCGAGAGGACCT  1562
            |||||||||||.||.|||||||||||||||.|.||.|||.||||.||.||||||||.||||||.||||.|||.|
Sbjct 1624  TACCGCAAGGATGTTATGCTGGACCACCAGAGGCGACACTTGGATGGTGTGCGGCGGGTGAAGAGAGAAGACTT  1697

Query 1563  GGAGGCCGGTGGGGAGAACCTGGTCCGTTACAAGAAGGAGCCTTCCGGGTGCCCGGTGTGTGGCAAGGTGTTCT  1636
            |||||||.|.|||||.|.||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1698  GGAGGCCAGCGGGGAAAGCCTGGTTCGTTACAAGAAGGAACCTTCTGGATGCCCAGTGTGTGGCAAGGTGTTCT  1771

Query 1637  CCTGCCGGAGCAATATGAACAAGCACCTGCTCACCCACGGCGACAAGAAGTACACCTGCGAGATCTGCGGGCGC  1710
            ||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1772  CCTGTCGGAGCAACATGAACAAGCACCTGCTGACCCACGGTGACAAGAAGTACACCTGCGAGATCTGTGGGCGC  1845

Query 1711  AAGTTCTTCCGCGTGGATGTGCTCAGGGACCACATCCATGTCCACTTCAAGGACATCGCGTTGATGGATGACCA  1784
            |||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||
Sbjct 1846  AAGTTCTTCCGAGTGGACGTACTCAGGGACCACATCCATGTCCACTTCAAGGACATCGCGCTAATGGATGACCA  1919

Query 1785  CCAGAGGGAAGAGTTTATCGGCAAGATCGGGATCTCCTCGGAAGAAAACGATGACAATTCTGACGAGAGCGCAG  1858
            ||||.||||.|||||.||.|||||.||.|||||||||||.||.||.||.||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 1920  CCAGCGGGAGGAGTTCATTGGCAAAATTGGGATCTCCTCAGAGGAGAATGATGACAACTCTGATGAGAGCGCAG  1993

Query 1859  ACTCGGAGCCTCACAAGTACAGCTGCAAGCGGTGCCAGCTCACCTTCGGCCGGGGGAAGGAGTACCTGAAGCAC  1932
            ||||.|||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 1994  ACTCTGAGCCACACAAGTACAGCTGCAAGAGGTGCCAGCTCACTTTCGGCCGTGGGAAGGAATACCTGAAGCAC  2067

Query 1933  ATCATGGAGGTGCACAAGGAGAAGGGCTATGGCTGCAGCATCTGCAACCGGCGCTTTGCACTGAAGGCCACCTA  2006
            |||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||.||||.|||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 2068  ATCATGGAGGTGCACAAGGAGAAGGGCCACGGCTGCAGCATCTGCCACCGACGCTTCGCACTCAAGGCCACCTA  2141

Query 2007  CCACGCCCACATGGTCATCCACCGTGAAAACCTGCCGGACCCCAACGTGCAGAAGTACATCCACCCCTGCGAGA  2080
            |||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 2142  CCATGCCCACATGGTCATCCACCGGGAGAACCTGCCTGACCCCAACGTGCAGAAGTACATTCACCCCTGTGAGA  2215

Query 2081  TCTGCGGGCGGATCTTCAACAGCATCGGGAACCTGGAGCGCCACAAGCTCATCCACACAGGTGTGAAGAGCCAC  2154
            ||||.|||.||||.|||||||||||.||||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 2216  TCTGTGGGAGGATATTCAACAGCATTGGGAACTTGGAGCGCCACAAACTCATCCACACAGGTGTGAAAAGCCAC  2289

Query 2155  GCCTGCGAGCAGTGTGGGAAGTCCTTTGCCAGGAAGGACATGCTGAAGGAGCACATGCGTGTGCACGACAACGT  2228
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.|
Sbjct 2290  GCCTGTGAGCAGTGTGGGAAGTCCTTTGCCAGGAAGGACATGCTGAAAGAGCACATGCGTGTGCATGACAACAT  2363

Query 2229  CCGCGAGTACCTGTGTGCCGAGTGTGGGAAAGGCATGAAGACCAAGCACGCGCTGCGCCACCACATGAAGCTGC  2302
            |||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct 2364  CCGGGAGTACCTGTGCGCCGAGTGTGGGAAAGGTATGAAGACCAAGCATGCACTGCGCCACCATATGAAGCTGC  2437

Query 2303  ACAAGGGCATCAAGGAGTACGAGTGCAAGGAGTGCCACCGCAGGTTCGCGCAGAAGGTCAACATGCTCAAGCAC  2376
            ||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||.|||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2438  ACAAAGGCATCAAGGAGTATGAGTGCAAGGAATGTCACCGCAAGTTTGCACAGAAGGTCAACATGCTCAAGCAC  2511

Query 2377  TGCAAGCGGCACACGGGGATTAAAGATTTCATGTGTGAATTGTGTGGGAAGACATTCAGCGAGAGGAACACCAT  2450
            |.|||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 2512  TACAAACGGCACACAGGAATTAAAGACTTCATGTGTGAATTGTGTGGGAAGACATTCAGTGAGAGGAACACAAT  2585

Query 2451  GGAGACCCACAAGCTCATCCACACAGTGGGCAAGCAGTGGACGTGCTCCGTGTGCGACAAGAAGTACGTGACCG  2524
            ||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||.|
Sbjct 2586  GGAGACACACAAGCTCATCCACACAGTAGGCAAGCAGTGGACTTGTTCCGTGTGTGACAAGAAGTACGTCACAG  2659

Query 2525  AGTACATGCTGCAGAAGCACGTTCAGCTCACACACGACAAGGTGGAGGCGCAGAGCTGCCAGCTGTGCGGGACC  2598
            ||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.||.|||||.|||||.||.||.||.|||
Sbjct 2660  AGTACATGCTTCAGAAACACGTCCAGCTCACTCATGACAAGGTGGAAGCACAGAGTTGCCAACTATGTGGCACC  2733

Query 2599  AAGGTGTCCACCAGGGCCTCCATGAGCCGACACATGCGGCGCAAGCACCCCGAGGTGCTCGCGGTGAGGATCGA  2672
            ||.|||||.|||.||||||||||||||.||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||..||||.||
Sbjct 2734  AAAGTGTCAACCCGGGCCTCCATGAGCAGACATATGCGACGCAAGCACCCCGAGGTCCTCGCTGTTCGGATTGA  2807

Query 2673  TGACCTGGACCACCTCCCGGAGACCACCACCATCGACGCCTCCTCCATTGGCATCGTCCAGCCTGAGCTGACTC  2746
            .||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.||||||||||.||||...|
Sbjct 2808  CGATCTGGACCACCTCCCCGAGACCACCACCATCGATGCATCTTCCATCGGCATTGTCCAGCCTGCGCTGGGCC  2881

Query 2747  TGGAGCAGGAGGATTTGGCCGAAGGGAAGCACGGGAAAGCTGCCAAGCGAAGTCACAAGAGAAAGCAGAAGCCA  2820
            ||||||||||.||..||||.|||||.|||||.||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 2882  TGGAGCAGGAAGAACTGGCAGAAGGTAAGCATGGAAAGGCTGCCAAGCGCAGCCACAAGAGAAAGCAGAAGCCA  2955

Query 2821  GAAGAGGAGGCGGGTGCTCCGGTGCCCGAGGACGCCACCTTCAGCGAATACTCAGAGAAAGAGACGGAGTTCAC  2894
            ||.||.|||||.||.|||||.|||||.|||||..||||||||||.||||||.|.||.||.|||.|.||||||||
Sbjct 2956  GAGGAAGAGGCAGGGGCTCCAGTGCCTGAGGATACCACCTTCAGTGAATACCCCGAAAAGGAGCCAGAGTTCAC  3029

Query 2895  AGGCAGTGTAGGCGACGAGACCAATTCCGCAGTACAGAGCATTCAGCAGGTAGTGGTGACCCTGGGTGACCCAA  2968
            |||||||||.||.||||||||.|||||.||.||||||||.||.||.|||||.|||||||||||.||.|||||.|
Sbjct 3030  AGGCAGTGTGGGTGACGAGACAAATTCTGCTGTACAGAGTATCCAACAGGTGGTGGTGACCCTAGGGGACCCCA  3103

Query 2969  ATGTGACCACACCATCGAGCTCAGTCGGCTTGACCAACATCACCGTGACCCCCATCACCACTGCGGCCGCGACT  3042
            |||||||..|.|||||.||||||||.||..|.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|..|||
Sbjct 3104  ATGTGACTGCTCCATCAAGCTCAGTTGGTCTAACCAACATCACCGTGACCCCCATCACCACTGCAGCTGGAACT  3177

Query 3043  CAGTTTACCAATCTCCAGCCGGTGGCCGTGGGGCACCTTACCACCCCTGAACGCCAGTTACAGCTGGACAACTC  3116
            ||||||||||||.|.|||||.|||||.||.||.||.|||||||.||||||.||||||.|||||||.||.|||||
Sbjct 3178  CAGTTTACCAATTTACAGCCAGTGGCTGTTGGACATCTTACCAACCCTGATCGCCAGCTACAGCTAGATAACTC  3251

Query 3117  AATCCTGACCGTGACCTTTGATACCGTCAGCGGCTCTGCCATGTTGCACAACCGCCAAAATGACGTCCAGATCC  3190
            .||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 3252  CATCCTGACTGTGACCTTTGATACTGTCAGTGGCTCCGCCATGTTGCACAACCGGCAAAATGATGTCCAGATCC  3325

Query 3191  ACCCCCAGCCGGAAGCCTCGAACCCACAGTCTGTGGCCCATTTCATCAACCTGACGACCCTGGTCAACTCCATC  3264
            ||||.|||||.||||||.|.|||||.|||||.||||||||.||.||||||||.||.||.|||||.|||||||||
Sbjct 3326  ACCCACAGCCAGAAGCCACAAACCCTCAGTCAGTGGCCCACTTTATCAACCTTACCACACTGGTAAACTCCATC  3399

Query 3265  ACGCCCCTGGGGAGCCAGCTTAGTGACCAGCACCCGCTCACGTGGCGGGCAGTGCCCCAGACTGACGTCTTGCC  3338
            ||.|||.||||||.|||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||.||..|||.
Sbjct 3400  ACACCCTTGGGGAACCAACTCAGTGAGCAGCACCCACTCACCTGGCGAGCAGTGCCCCAGACAGATGTGCTGCA  3473

Query 3339  ACCCCCGCAGCCGCAGGCACCCCCACAGCAGGCGGCCCAGCCCCAGGTGCAGGCGGAGCAGCAGCAGCAGCAGA  3412
            .||.||.|||.|.|..|||.||||.||||||||||..||.||||||||.|      ||.|..||||||||||||
Sbjct 3474  GCCGCCACAGGCCCCTGCAGCCCCGCAGCAGGCGGTGCAACCCCAGGTAC------AGAATGAGCAGCAGCAGA  3541

Query 3413  TGTACAGCTAC  3423
            |||||||||||
Sbjct 3542  TGTACAGCTAC  3552