Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_12439
Subject:
XM_006522865.3
Aligned Length:
3548
Identities:
2851
Gaps:
223

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCCGCGCCACCGCCCCCCCGGCTTCCGGTGCTGCGCAGTTTCCGGAGCGGATCGCAACCCGGAGTCCGGATC  74

Query    1  ----------------------------------ATGGCTGAAGATGGGAGCGAAGAGATCATGTTCATCTGGT  40
                                              ||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||
Sbjct   75  CGACCCCGCTCTGCACATTCCACAGGTATCAGCAATGGCTGAAGATGGTAGTGAGGAGATCATGTTTATCTGGT  148

Query   41  GTGAAGACTGCAGCCAGTACCACGACTCCGAATGTCCCGAGCTGGGCCCAGTGGTCATGGTCAAAGACTCCTTT  114
            ||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||.||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  149  GTGAAGACTGCAGCCAGTACCATGACTCGGAGTGTCCTGAACTGGGACCTGTGGTCATGGTCAAGGACTCCTTT  222

Query  115  GTGTTAAGCAGGGCAAGGTCATCCCTTCCTCCCAACTTGGAGATCAGACGACTGGAAGATGGAGCCGAGGGGGT  188
            |||.|.||||||||||||||.|||||.||..|.|||.||||||||||.||.|||||.||.||.||.||.||.||
Sbjct  223  GTGCTGAGCAGGGCAAGGTCCTCCCTCCCCTCTAACCTGGAGATCAGGCGCCTGGATGACGGGGCTGAAGGCGT  296

Query  189  GTTCGCCATCACTCAGCTCGTCAAGCGGACACAGTTCGGTCCCTTTGAGTCCAGGAGGGTCGCCAAATGGGAAA  262
            |||.||..|.||.|||||.||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|
Sbjct  297  GTTTGCAGTGACCCAGCTAGTCAAGCGCACACAATTTGGTCCGTTTGAGTCCAGGAGAGTCGCCAAGTGGGAGA  370

Query  263  AGGAGTCTGCATTTCCCCTGAAGGTGTTCCAGAAGGACGGGCACCCCGTGTGCTTCGACACCTCCAACGAGGAT  336
            |.|||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct  371  AAGAGTCGGCATTTCCTCTGAAGGTATTTCAGAAGGACGGGCATCCTGTGTGCTTCGACACTTCCAATGAGGAT  444

Query  337  GACTGCAACTGGATGATGCTGGTGCGGCCAGCGGCGGAGGCCGAGCACCAGAACCTGACGGCCTACCAGCACGG  410
            ||||||||||||||||||||.|||||.|||||...||||.|.|.|||||||||||||||.||||||||.||.||
Sbjct  445  GACTGCAACTGGATGATGCTAGTGCGACCAGCACTGGAGCCTGGGCACCAGAACCTGACAGCCTACCAACATGG  518

Query  411  CAGCGACGTGTACTTCACCACCTCCAGAGACATCCCCCCGGGTACCGAGCTGCGCGTGTGGTATGCGGCCTTCT  484
            |||.||||||||.|||||||||||.|..|||||.||..|.||.||.||.|||||.|||||||||||.|||||.|
Sbjct  519  CAGTGACGTGTATTTCACCACCTCAAAGGACATTCCTGCAGGCACTGAACTGCGTGTGTGGTATGCTGCCTTTT  592

Query  485  ATGCCAAGAAGATGGACAAGCCCATGCTGAAGCAGGCCGGCTCTGGCGTCCACGCTGCAGGCACCCCAGAAAAC  558
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||..|.||.||.||||||||||||||.||...|
Sbjct  593  ATGCCAAGAAGATGGACAAGCCCATGCTAAAGCAGGCCTGCTCCAGTGTTCAGGCTGCAGGCACCCCTGAGCCC  666

Query  559  AGCGCCCCCGTGGAGTCGGAACCCAGCCAGTGGGCGTGTAAAGTGTGTTCTGCCACCTTCCTGGAGCTGCAGCT  632
            ||.|.|.|.|||||..|.||.|...||||.||||.||||||.|||||.||...|||||||||||||||.|||||
Sbjct  667  AGTGTCTCTGTGGAACCTGAGCGTGGCCAATGGGTGTGTAAGGTGTGCTCCAACACCTTCCTGGAGCTTCAGCT  740

Query  633  CCTCAATGAACATCTGTTGGGCCACTTAGAACAAGCCAAAAGCCTTCCTCCAGGCAGCCA-AAGC--GAGGCAG  703
            |||.||.||.|||||.||||||||..|.||.||||||||||||||.|||.||||..|||| .|||  |||   |
Sbjct  741  CCTGAACGAGCATCTCTTGGGCCATCTGGAGCAAGCCAAAAGCCTCCCTGCAGGTGGCCAGCAGCATGAG---G  811

Query  704  CAGCTCCCGAGAAGGAGCAGGACACACCCCGGGGGGAACCCCCTGCAGTGCCCGAGAGCGAGA-----------  766
            |||||.|.||||||||||..||..|||||.||..|||.||.||..|||...||||||||.|||           
Sbjct  812  CAGCTTCTGAGAAGGAGCCTGATGCACCCAGGATGGAGCCTCCCACAGCAGCCGAGAGCAAGAGCATCCAGAGT  885

Query  767  ---ATGTTGCCACCAAAGAACAGAAGAAAAAGCCTCGAAGGGGGAGAAAACCCAAAGTGTCCAAAGCTGAGCAG  837
               |||  |.|||||||||.|..|||||||||||||||||.|||||.||||||||||..|||||.|.|||||||
Sbjct  886  GTCATG--GTCACCAAAGAGCCAAAGAAAAAGCCTCGAAGAGGGAGGAAACCCAAAGCATCCAAGGTTGAGCAG  957

Query  838  CCTCTAGTCATCGTGGAAGACAAGGAACCCACAGAGCAAGTGGCAGAGATCATTACCGAGGTCCCTCCGGATGA  911
            |||||.|||||..|..||||||||||.||..|||||||.||||||||||||||.||.|||.||||.||.|||||
Sbjct  958  CCTCTGGTCATTATCAAAGACAAGGAGCCTTCAGAGCATGTGGCAGAGATCATAACTGAGATCCCCCCAGATGA  1031

Query  912  GCCTGTGAGTGCAACGCCAGATGAGCGGATCATGGAGCTGGTTCTGGGGAAGCTGGCCACCACCACCACTGACA  985
            |||||||||||||||.||||||||.||||||||||||.|.||..||||||||||||||.||.||||.|.|||..
Sbjct 1032  GCCTGTGAGTGCAACACCAGATGAACGGATCATGGAGTTAGTCTTGGGGAAGCTGGCCGCCCCCACAAATGAAG  1105

Query  986  CCAGCTCGGTTCCAAAGTTCACCCATCATCAGAATAACACCATCACGCTCAAGAGGAGCTTAATTCTCTCAAGC  1059
            |||||||.||.|||||||||.|.|||||||..|..|.||||||..|.|||||||||.||||..||||.||.|||
Sbjct 1106  CCAGCTCAGTGCCAAAGTTCCCACATCATCCAAGCAGCACCATTGCCCTCAAGAGGGGCTTGGTTCTGTCCAGC  1179

Query 1060  AGACACGGCATCCGGCGCAAGGTCATCAAACAGCTCGGGGAGCACAAGCGGGTTTACCAGTGCAATATCTGCAG  1133
            |||||.|||.|||||||.|||.||.||...|||||.|||                                   
Sbjct 1180  AGACATGGCGTCCGGCGGAAGCTCGTCCGTCAGCTGGGG-----------------------------------  1218

Query 1134  CAAGATCTTCCAGAACAGCAGCAACCTGAGCAGGCACGTGCGCTCGCATGGTGACAAGCTGTTTAAGTGCGAAG  1207
                                                                ||||||||||||||.||.||.|
Sbjct 1219  ----------------------------------------------------GACAAGCTGTTTAAATGTGAGG  1240

Query 1208  AGTGTGCAAAATTGTTCAGCCGCAAAGAGAGCCTAAAGCAGCACGTTTCCTACAAGCACAGCAGGAACGAGGTG  1281
            |.|||.|.|||.||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||.||||.||||||
Sbjct 1241  AATGTTCGAAACTGTTCAGCCGTAAGGAAAGTCTAAAGCAGCATGTTTCCTACAAGCACAGCCGGAATGAGGTG  1314

Query 1282  GACGGCGAGTACAGGTACCGCTGCGGCACTTGTGAGAAGACCTTCCGCATCGAGAGCGCGCTGGAGTTCCACAA  1355
            |||||.||||||.|.||||||||.||||..||||.||||||.|||||.||.|||||.||.||||||||||||||
Sbjct 1315  GACGGTGAGTACCGCTACCGCTGTGGCAGCTGTGGGAAGACATTCCGAATGGAGAGTGCACTGGAGTTCCACAA  1388

Query 1356  CTGCAGGACAGATGACAAGACGTTCCAATGTGAGATGTGTTTCAGATTCTTCTCCACCAACAGCAACCTCTCCA  1429
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1389  CTGTAGGACAGATGACAAGACGTTCCAATGTGAGATGTGTTTCAGATTCTTCTCCACCAACAGCAACCTCTCTA  1462

Query 1430  AGCACAAGAAGAAGCACGGCGACAAGAAGTTTGCCTGTGAGGTCTGCAGCAAGATGTTCTACCGCAAGGACGTC  1503
            |||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 1463  AGCACAAGAAGAAACATGGGGACAAGAAGTTTGCCTGTGAGGTCTGCAGTAAGATGTTCTACCGCAAGGATGTT  1536

Query 1504  ATGCTGGACCACCAGCGCCGGCACCTGGAAGGAGTGCGGCGAGTGAAGCGAGAGGACCTGGAGGCCGGTGGGGA  1577
            |||||||||||||||.|.||.|||.||||.||.||||||||.||||||.||||.|||.||||||||.|.|||||
Sbjct 1537  ATGCTGGACCACCAGAGGCGACACTTGGATGGTGTGCGGCGGGTGAAGAGAGAAGACTTGGAGGCCAGCGGGGA  1610

Query 1578  GAACCTGGTCCGTTACAAGAAGGAGCCTTCCGGGTGCCCGGTGTGTGGCAAGGTGTTCTCCTGCCGGAGCAATA  1651
            .|.||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 1611  AAGCCTGGTTCGTTACAAGAAGGAACCTTCTGGATGCCCAGTGTGTGGCAAGGTGTTCTCCTGTCGGAGCAACA  1684

Query 1652  TGAACAAGCACCTGCTCACCCACGGCGACAAGAAGTACACCTGCGAGATCTGCGGGCGCAAGTTCTTCCGCGTG  1725
            ||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 1685  TGAACAAGCACCTGCTGACCCACGGTGACAAGAAGTACACCTGCGAGATCTGTGGGCGCAAGTTCTTCCGAGTG  1758

Query 1726  GATGTGCTCAGGGACCACATCCATGTCCACTTCAAGGACATCGCGTTGATGGATGACCACCAGAGGGAAGAGTT  1799
            ||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||.||||.|||||
Sbjct 1759  GACGTACTCAGGGACCACATCCATGTCCACTTCAAGGACATCGCGCTAATGGATGACCACCAGCGGGAGGAGTT  1832

Query 1800  TATCGGCAAGATCGGGATCTCCTCGGAAGAAAACGATGACAATTCTGACGAGAGCGCAGACTCGGAGCCTCACA  1873
            .||.|||||.||.|||||||||||.||.||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 1833  CATTGGCAAAATTGGGATCTCCTCAGAGGAGAATGATGACAACTCTGATGAGAGCGCAGACTCTGAGCCACACA  1906

Query 1874  AGTACAGCTGCAAGCGGTGCCAGCTCACCTTCGGCCGGGGGAAGGAGTACCTGAAGCACATCATGGAGGTGCAC  1947
            ||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1907  AGTACAGCTGCAAGAGGTGCCAGCTCACTTTCGGCCGTGGGAAGGAATACCTGAAGCACATCATGGAGGTGCAC  1980

Query 1948  AAGGAGAAGGGCTATGGCTGCAGCATCTGCAACCGGCGCTTTGCACTGAAGGCCACCTACCACGCCCACATGGT  2021
            ||||||||||||.|.|||||||||||||||.||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1981  AAGGAGAAGGGCCACGGCTGCAGCATCTGCCACCGACGCTTCGCACTCAAGGCCACCTACCATGCCCACATGGT  2054

Query 2022  CATCCACCGTGAAAACCTGCCGGACCCCAACGTGCAGAAGTACATCCACCCCTGCGAGATCTGCGGGCGGATCT  2095
            |||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||.||||.|
Sbjct 2055  CATCCACCGGGAGAACCTGCCTGACCCCAACGTGCAGAAGTACATTCACCCCTGTGAGATCTGTGGGAGGATAT  2128

Query 2096  TCAACAGCATCGGGAACCTGGAGCGCCACAAGCTCATCCACACAGGTGTGAAGAGCCACGCCTGCGAGCAGTGT  2169
            ||||||||||.||||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct 2129  TCAACAGCATTGGGAACTTGGAGCGCCACAAACTCATCCACACAGGTGTGAAAAGCCACGCCTGTGAGCAGTGT  2202

Query 2170  GGGAAGTCCTTTGCCAGGAAGGACATGCTGAAGGAGCACATGCGTGTGCACGACAACGTCCGCGAGTACCTGTG  2243
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.||||.|||||||||||
Sbjct 2203  GGGAAGTCCTTTGCCAGGAAGGACATGCTGAAAGAGCACATGCGTGTGCATGACAACATCCGGGAGTACCTGTG  2276

Query 2244  TGCCGAGTGTGGGAAAGGCATGAAGACCAAGCACGCGCTGCGCCACCACATGAAGCTGCACAAGGGCATCAAGG  2317
            .|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 2277  CGCCGAGTGTGGGAAAGGTATGAAGACCAAGCATGCACTGCGCCACCATATGAAGCTGCACAAAGGCATCAAGG  2350

Query 2318  AGTACGAGTGCAAGGAGTGCCACCGCAGGTTCGCGCAGAAGGTCAACATGCTCAAGCACTGCAAGCGGCACACG  2391
            ||||.|||||||||||.||.|||||||.|||.||.|||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||.
Sbjct 2351  AGTATGAGTGCAAGGAATGTCACCGCAAGTTTGCACAGAAGGTCAACATGCTCAAGCACTACAAACGGCACACA  2424

Query 2392  GGGATTAAAGATTTCATGTGTGAATTGTGTGGGAAGACATTCAGCGAGAGGAACACCATGGAGACCCACAAGCT  2465
            ||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct 2425  GGAATTAAAGACTTCATGTGTGAATTGTGTGGGAAGACATTCAGTGAGAGGAACACAATGGAGACACACAAGCT  2498

Query 2466  CATCCACACAGTGGGCAAGCAGTGGACGTGCTCCGTGTGCGACAAGAAGTACGTGACCGAGTACATGCTGCAGA  2539
            ||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||||
Sbjct 2499  CATCCACACAGTAGGCAAGCAGTGGACTTGTTCCGTGTGTGACAAGAAGTACGTCACAGAGTACATGCTTCAGA  2572

Query 2540  AGCACGTTCAGCTCACACACGACAAGGTGGAGGCGCAGAGCTGCCAGCTGTGCGGGACCAAGGTGTCCACCAGG  2613
            |.|||||.||||||||.||.|||||||||||.||.|||||.|||||.||.||.||.|||||.|||||.|||.||
Sbjct 2573  AACACGTCCAGCTCACTCATGACAAGGTGGAAGCACAGAGTTGCCAACTATGTGGCACCAAAGTGTCAACCCGG  2646

Query 2614  GCCTCCATGAGCCGACACATGCGGCGCAAGCACCCCGAGGTGCTCGCGGTGAGGATCGATGACCTGGACCACCT  2687
            ||||||||||||.||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||..||||.||.||.|||||||||||
Sbjct 2647  GCCTCCATGAGCAGACATATGCGACGCAAGCACCCCGAGGTCCTCGCTGTTCGGATTGACGATCTGGACCACCT  2720

Query 2688  CCCGGAGACCACCACCATCGACGCCTCCTCCATTGGCATCGTCCAGCCTGAGCTGACTCTGGAGCAGGAGGATT  2761
            |||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.||||||||||.||||...|||||||||||.||..
Sbjct 2721  CCCCGAGACCACCACCATCGATGCATCTTCCATCGGCATTGTCCAGCCTGCGCTGGGCCTGGAGCAGGAAGAAC  2794

Query 2762  TGGCCGAAGGGAAGCACGGGAAAGCTGCCAAGCGAAGTCACAAGAGAAAGCAGAAGCCAGAAGAGGAGGCGGGT  2835
            ||||.|||||.|||||.||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.
Sbjct 2795  TGGCAGAAGGTAAGCATGGAAAGGCTGCCAAGCGCAGCCACAAGAGAAAGCAGAAGCCAGAGGAAGAGGCAGGG  2868

Query 2836  GCTCCGGTGCCCGAGGACGCCACCTTCAGCGAATACTCAGAGAAAGAGACGGAGTTCACAGGCAGTGTAGGCGA  2909
            |||||.|||||.|||||..||||||||||.||||||.|.||.||.|||.|.|||||||||||||||||.||.||
Sbjct 2869  GCTCCAGTGCCTGAGGATACCACCTTCAGTGAATACCCCGAAAAGGAGCCAGAGTTCACAGGCAGTGTGGGTGA  2942

Query 2910  CGAGACCAATTCCGCAGTACAGAGCATTCAGCAGGTAGTGGTGACCCTGGGTGACCCAAATGTGACCACACCAT  2983
            ||||||.|||||.||.||||||||.||.||.|||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||..|.||||
Sbjct 2943  CGAGACAAATTCTGCTGTACAGAGTATCCAACAGGTGGTGGTGACCCTAGGGGACCCCAATGTGACTGCTCCAT  3016

Query 2984  CGAGCTCAGTCGGCTTGACCAACATCACCGTGACCCCCATCACCACTGCGGCCGCGACTCAGTTTACCAATCTC  3057
            |.||||||||.||..|.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|..|||||||||||||||.|.
Sbjct 3017  CAAGCTCAGTTGGTCTAACCAACATCACCGTGACCCCCATCACCACTGCAGCTGGAACTCAGTTTACCAATTTA  3090

Query 3058  CAGCCGGTGGCCGTGGGGCACCTTACCACCCCTGAACGCCAGTTACAGCTGGACAACTCAATCCTGACCGTGAC  3131
            |||||.|||||.||.||.||.|||||||.||||||.||||||.|||||||.||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct 3091  CAGCCAGTGGCTGTTGGACATCTTACCAACCCTGATCGCCAGCTACAGCTAGATAACTCCATCCTGACTGTGAC  3164

Query 3132  CTTTGATACCGTCAGCGGCTCTGCCATGTTGCACAACCGCCAAAATGACGTCCAGATCCACCCCCAGCCGGAAG  3205
            |||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 3165  CTTTGATACTGTCAGTGGCTCCGCCATGTTGCACAACCGGCAAAATGATGTCCAGATCCACCCACAGCCAGAAG  3238

Query 3206  CCTCGAACCCACAGTCTGTGGCCCATTTCATCAACCTGACGACCCTGGTCAACTCCATCACGCCCCTGGGGAGC  3279
            ||.|.|||||.|||||.||||||||.||.||||||||.||.||.|||||.|||||||||||.|||.||||||.|
Sbjct 3239  CCACAAACCCTCAGTCAGTGGCCCACTTTATCAACCTTACCACACTGGTAAACTCCATCACACCCTTGGGGAAC  3312

Query 3280  CAGCTTAGTGACCAGCACCCGCTCACGTGGCGGGCAGTGCCCCAGACTGACGTCTTGCCACCCCCGCAGCCGCA  3353
            ||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||.||..|||..||.||.|||.|.|.
Sbjct 3313  CAACTCAGTGAGCAGCACCCACTCACCTGGCGAGCAGTGCCCCAGACAGATGTGCTGCAGCCGCCACAGGCCCC  3386

Query 3354  GGCACCCCCACAGCAGGCGGCCCAGCCCCAGGTGCAGGCGGAGCAGCAGCAGCAGCAGATGTACAGCTAC  3423
            .|||.||||.||||||||||..||.||||||||.|      ||.|..|||||||||||||||||||||||
Sbjct 3387  TGCAGCCCCGCAGCAGGCGGTGCAACCCCAGGTAC------AGAATGAGCAGCAGCAGATGTACAGCTAC  3450