Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_12439
- Subject:
- XM_006522865.3
- Aligned Length:
- 3548
- Identities:
- 2851
- Gaps:
- 223
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGCCGCGCCACCGCCCCCCCGGCTTCCGGTGCTGCGCAGTTTCCGGAGCGGATCGCAACCCGGAGTCCGGATC 74
Query 1 ----------------------------------ATGGCTGAAGATGGGAGCGAAGAGATCATGTTCATCTGGT 40
||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 75 CGACCCCGCTCTGCACATTCCACAGGTATCAGCAATGGCTGAAGATGGTAGTGAGGAGATCATGTTTATCTGGT 148
Query 41 GTGAAGACTGCAGCCAGTACCACGACTCCGAATGTCCCGAGCTGGGCCCAGTGGTCATGGTCAAAGACTCCTTT 114
||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||.||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 149 GTGAAGACTGCAGCCAGTACCATGACTCGGAGTGTCCTGAACTGGGACCTGTGGTCATGGTCAAGGACTCCTTT 222
Query 115 GTGTTAAGCAGGGCAAGGTCATCCCTTCCTCCCAACTTGGAGATCAGACGACTGGAAGATGGAGCCGAGGGGGT 188
|||.|.||||||||||||||.|||||.||..|.|||.||||||||||.||.|||||.||.||.||.||.||.||
Sbjct 223 GTGCTGAGCAGGGCAAGGTCCTCCCTCCCCTCTAACCTGGAGATCAGGCGCCTGGATGACGGGGCTGAAGGCGT 296
Query 189 GTTCGCCATCACTCAGCTCGTCAAGCGGACACAGTTCGGTCCCTTTGAGTCCAGGAGGGTCGCCAAATGGGAAA 262
|||.||..|.||.|||||.||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|
Sbjct 297 GTTTGCAGTGACCCAGCTAGTCAAGCGCACACAATTTGGTCCGTTTGAGTCCAGGAGAGTCGCCAAGTGGGAGA 370
Query 263 AGGAGTCTGCATTTCCCCTGAAGGTGTTCCAGAAGGACGGGCACCCCGTGTGCTTCGACACCTCCAACGAGGAT 336
|.|||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 371 AAGAGTCGGCATTTCCTCTGAAGGTATTTCAGAAGGACGGGCATCCTGTGTGCTTCGACACTTCCAATGAGGAT 444
Query 337 GACTGCAACTGGATGATGCTGGTGCGGCCAGCGGCGGAGGCCGAGCACCAGAACCTGACGGCCTACCAGCACGG 410
||||||||||||||||||||.|||||.|||||...||||.|.|.|||||||||||||||.||||||||.||.||
Sbjct 445 GACTGCAACTGGATGATGCTAGTGCGACCAGCACTGGAGCCTGGGCACCAGAACCTGACAGCCTACCAACATGG 518
Query 411 CAGCGACGTGTACTTCACCACCTCCAGAGACATCCCCCCGGGTACCGAGCTGCGCGTGTGGTATGCGGCCTTCT 484
|||.||||||||.|||||||||||.|..|||||.||..|.||.||.||.|||||.|||||||||||.|||||.|
Sbjct 519 CAGTGACGTGTATTTCACCACCTCAAAGGACATTCCTGCAGGCACTGAACTGCGTGTGTGGTATGCTGCCTTTT 592
Query 485 ATGCCAAGAAGATGGACAAGCCCATGCTGAAGCAGGCCGGCTCTGGCGTCCACGCTGCAGGCACCCCAGAAAAC 558
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||..|.||.||.||||||||||||||.||...|
Sbjct 593 ATGCCAAGAAGATGGACAAGCCCATGCTAAAGCAGGCCTGCTCCAGTGTTCAGGCTGCAGGCACCCCTGAGCCC 666
Query 559 AGCGCCCCCGTGGAGTCGGAACCCAGCCAGTGGGCGTGTAAAGTGTGTTCTGCCACCTTCCTGGAGCTGCAGCT 632
||.|.|.|.|||||..|.||.|...||||.||||.||||||.|||||.||...|||||||||||||||.|||||
Sbjct 667 AGTGTCTCTGTGGAACCTGAGCGTGGCCAATGGGTGTGTAAGGTGTGCTCCAACACCTTCCTGGAGCTTCAGCT 740
Query 633 CCTCAATGAACATCTGTTGGGCCACTTAGAACAAGCCAAAAGCCTTCCTCCAGGCAGCCA-AAGC--GAGGCAG 703
|||.||.||.|||||.||||||||..|.||.||||||||||||||.|||.||||..|||| .||| ||| |
Sbjct 741 CCTGAACGAGCATCTCTTGGGCCATCTGGAGCAAGCCAAAAGCCTCCCTGCAGGTGGCCAGCAGCATGAG---G 811
Query 704 CAGCTCCCGAGAAGGAGCAGGACACACCCCGGGGGGAACCCCCTGCAGTGCCCGAGAGCGAGA----------- 766
|||||.|.||||||||||..||..|||||.||..|||.||.||..|||...||||||||.|||
Sbjct 812 CAGCTTCTGAGAAGGAGCCTGATGCACCCAGGATGGAGCCTCCCACAGCAGCCGAGAGCAAGAGCATCCAGAGT 885
Query 767 ---ATGTTGCCACCAAAGAACAGAAGAAAAAGCCTCGAAGGGGGAGAAAACCCAAAGTGTCCAAAGCTGAGCAG 837
||| |.|||||||||.|..|||||||||||||||||.|||||.||||||||||..|||||.|.|||||||
Sbjct 886 GTCATG--GTCACCAAAGAGCCAAAGAAAAAGCCTCGAAGAGGGAGGAAACCCAAAGCATCCAAGGTTGAGCAG 957
Query 838 CCTCTAGTCATCGTGGAAGACAAGGAACCCACAGAGCAAGTGGCAGAGATCATTACCGAGGTCCCTCCGGATGA 911
|||||.|||||..|..||||||||||.||..|||||||.||||||||||||||.||.|||.||||.||.|||||
Sbjct 958 CCTCTGGTCATTATCAAAGACAAGGAGCCTTCAGAGCATGTGGCAGAGATCATAACTGAGATCCCCCCAGATGA 1031
Query 912 GCCTGTGAGTGCAACGCCAGATGAGCGGATCATGGAGCTGGTTCTGGGGAAGCTGGCCACCACCACCACTGACA 985
|||||||||||||||.||||||||.||||||||||||.|.||..||||||||||||||.||.||||.|.|||..
Sbjct 1032 GCCTGTGAGTGCAACACCAGATGAACGGATCATGGAGTTAGTCTTGGGGAAGCTGGCCGCCCCCACAAATGAAG 1105
Query 986 CCAGCTCGGTTCCAAAGTTCACCCATCATCAGAATAACACCATCACGCTCAAGAGGAGCTTAATTCTCTCAAGC 1059
|||||||.||.|||||||||.|.|||||||..|..|.||||||..|.|||||||||.||||..||||.||.|||
Sbjct 1106 CCAGCTCAGTGCCAAAGTTCCCACATCATCCAAGCAGCACCATTGCCCTCAAGAGGGGCTTGGTTCTGTCCAGC 1179
Query 1060 AGACACGGCATCCGGCGCAAGGTCATCAAACAGCTCGGGGAGCACAAGCGGGTTTACCAGTGCAATATCTGCAG 1133
|||||.|||.|||||||.|||.||.||...|||||.|||
Sbjct 1180 AGACATGGCGTCCGGCGGAAGCTCGTCCGTCAGCTGGGG----------------------------------- 1218
Query 1134 CAAGATCTTCCAGAACAGCAGCAACCTGAGCAGGCACGTGCGCTCGCATGGTGACAAGCTGTTTAAGTGCGAAG 1207
||||||||||||||.||.||.|
Sbjct 1219 ----------------------------------------------------GACAAGCTGTTTAAATGTGAGG 1240
Query 1208 AGTGTGCAAAATTGTTCAGCCGCAAAGAGAGCCTAAAGCAGCACGTTTCCTACAAGCACAGCAGGAACGAGGTG 1281
|.|||.|.|||.||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||.||||.||||||
Sbjct 1241 AATGTTCGAAACTGTTCAGCCGTAAGGAAAGTCTAAAGCAGCATGTTTCCTACAAGCACAGCCGGAATGAGGTG 1314
Query 1282 GACGGCGAGTACAGGTACCGCTGCGGCACTTGTGAGAAGACCTTCCGCATCGAGAGCGCGCTGGAGTTCCACAA 1355
|||||.||||||.|.||||||||.||||..||||.||||||.|||||.||.|||||.||.||||||||||||||
Sbjct 1315 GACGGTGAGTACCGCTACCGCTGTGGCAGCTGTGGGAAGACATTCCGAATGGAGAGTGCACTGGAGTTCCACAA 1388
Query 1356 CTGCAGGACAGATGACAAGACGTTCCAATGTGAGATGTGTTTCAGATTCTTCTCCACCAACAGCAACCTCTCCA 1429
|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1389 CTGTAGGACAGATGACAAGACGTTCCAATGTGAGATGTGTTTCAGATTCTTCTCCACCAACAGCAACCTCTCTA 1462
Query 1430 AGCACAAGAAGAAGCACGGCGACAAGAAGTTTGCCTGTGAGGTCTGCAGCAAGATGTTCTACCGCAAGGACGTC 1503
|||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 1463 AGCACAAGAAGAAACATGGGGACAAGAAGTTTGCCTGTGAGGTCTGCAGTAAGATGTTCTACCGCAAGGATGTT 1536
Query 1504 ATGCTGGACCACCAGCGCCGGCACCTGGAAGGAGTGCGGCGAGTGAAGCGAGAGGACCTGGAGGCCGGTGGGGA 1577
|||||||||||||||.|.||.|||.||||.||.||||||||.||||||.||||.|||.||||||||.|.|||||
Sbjct 1537 ATGCTGGACCACCAGAGGCGACACTTGGATGGTGTGCGGCGGGTGAAGAGAGAAGACTTGGAGGCCAGCGGGGA 1610
Query 1578 GAACCTGGTCCGTTACAAGAAGGAGCCTTCCGGGTGCCCGGTGTGTGGCAAGGTGTTCTCCTGCCGGAGCAATA 1651
.|.||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 1611 AAGCCTGGTTCGTTACAAGAAGGAACCTTCTGGATGCCCAGTGTGTGGCAAGGTGTTCTCCTGTCGGAGCAACA 1684
Query 1652 TGAACAAGCACCTGCTCACCCACGGCGACAAGAAGTACACCTGCGAGATCTGCGGGCGCAAGTTCTTCCGCGTG 1725
||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 1685 TGAACAAGCACCTGCTGACCCACGGTGACAAGAAGTACACCTGCGAGATCTGTGGGCGCAAGTTCTTCCGAGTG 1758
Query 1726 GATGTGCTCAGGGACCACATCCATGTCCACTTCAAGGACATCGCGTTGATGGATGACCACCAGAGGGAAGAGTT 1799
||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||.||||.|||||
Sbjct 1759 GACGTACTCAGGGACCACATCCATGTCCACTTCAAGGACATCGCGCTAATGGATGACCACCAGCGGGAGGAGTT 1832
Query 1800 TATCGGCAAGATCGGGATCTCCTCGGAAGAAAACGATGACAATTCTGACGAGAGCGCAGACTCGGAGCCTCACA 1873
.||.|||||.||.|||||||||||.||.||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 1833 CATTGGCAAAATTGGGATCTCCTCAGAGGAGAATGATGACAACTCTGATGAGAGCGCAGACTCTGAGCCACACA 1906
Query 1874 AGTACAGCTGCAAGCGGTGCCAGCTCACCTTCGGCCGGGGGAAGGAGTACCTGAAGCACATCATGGAGGTGCAC 1947
||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1907 AGTACAGCTGCAAGAGGTGCCAGCTCACTTTCGGCCGTGGGAAGGAATACCTGAAGCACATCATGGAGGTGCAC 1980
Query 1948 AAGGAGAAGGGCTATGGCTGCAGCATCTGCAACCGGCGCTTTGCACTGAAGGCCACCTACCACGCCCACATGGT 2021
||||||||||||.|.|||||||||||||||.||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1981 AAGGAGAAGGGCCACGGCTGCAGCATCTGCCACCGACGCTTCGCACTCAAGGCCACCTACCATGCCCACATGGT 2054
Query 2022 CATCCACCGTGAAAACCTGCCGGACCCCAACGTGCAGAAGTACATCCACCCCTGCGAGATCTGCGGGCGGATCT 2095
|||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||.||||.|
Sbjct 2055 CATCCACCGGGAGAACCTGCCTGACCCCAACGTGCAGAAGTACATTCACCCCTGTGAGATCTGTGGGAGGATAT 2128
Query 2096 TCAACAGCATCGGGAACCTGGAGCGCCACAAGCTCATCCACACAGGTGTGAAGAGCCACGCCTGCGAGCAGTGT 2169
||||||||||.||||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct 2129 TCAACAGCATTGGGAACTTGGAGCGCCACAAACTCATCCACACAGGTGTGAAAAGCCACGCCTGTGAGCAGTGT 2202
Query 2170 GGGAAGTCCTTTGCCAGGAAGGACATGCTGAAGGAGCACATGCGTGTGCACGACAACGTCCGCGAGTACCTGTG 2243
||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.||||.|||||||||||
Sbjct 2203 GGGAAGTCCTTTGCCAGGAAGGACATGCTGAAAGAGCACATGCGTGTGCATGACAACATCCGGGAGTACCTGTG 2276
Query 2244 TGCCGAGTGTGGGAAAGGCATGAAGACCAAGCACGCGCTGCGCCACCACATGAAGCTGCACAAGGGCATCAAGG 2317
.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 2277 CGCCGAGTGTGGGAAAGGTATGAAGACCAAGCATGCACTGCGCCACCATATGAAGCTGCACAAAGGCATCAAGG 2350
Query 2318 AGTACGAGTGCAAGGAGTGCCACCGCAGGTTCGCGCAGAAGGTCAACATGCTCAAGCACTGCAAGCGGCACACG 2391
||||.|||||||||||.||.|||||||.|||.||.|||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||.
Sbjct 2351 AGTATGAGTGCAAGGAATGTCACCGCAAGTTTGCACAGAAGGTCAACATGCTCAAGCACTACAAACGGCACACA 2424
Query 2392 GGGATTAAAGATTTCATGTGTGAATTGTGTGGGAAGACATTCAGCGAGAGGAACACCATGGAGACCCACAAGCT 2465
||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct 2425 GGAATTAAAGACTTCATGTGTGAATTGTGTGGGAAGACATTCAGTGAGAGGAACACAATGGAGACACACAAGCT 2498
Query 2466 CATCCACACAGTGGGCAAGCAGTGGACGTGCTCCGTGTGCGACAAGAAGTACGTGACCGAGTACATGCTGCAGA 2539
||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||||
Sbjct 2499 CATCCACACAGTAGGCAAGCAGTGGACTTGTTCCGTGTGTGACAAGAAGTACGTCACAGAGTACATGCTTCAGA 2572
Query 2540 AGCACGTTCAGCTCACACACGACAAGGTGGAGGCGCAGAGCTGCCAGCTGTGCGGGACCAAGGTGTCCACCAGG 2613
|.|||||.||||||||.||.|||||||||||.||.|||||.|||||.||.||.||.|||||.|||||.|||.||
Sbjct 2573 AACACGTCCAGCTCACTCATGACAAGGTGGAAGCACAGAGTTGCCAACTATGTGGCACCAAAGTGTCAACCCGG 2646
Query 2614 GCCTCCATGAGCCGACACATGCGGCGCAAGCACCCCGAGGTGCTCGCGGTGAGGATCGATGACCTGGACCACCT 2687
||||||||||||.||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||..||||.||.||.|||||||||||
Sbjct 2647 GCCTCCATGAGCAGACATATGCGACGCAAGCACCCCGAGGTCCTCGCTGTTCGGATTGACGATCTGGACCACCT 2720
Query 2688 CCCGGAGACCACCACCATCGACGCCTCCTCCATTGGCATCGTCCAGCCTGAGCTGACTCTGGAGCAGGAGGATT 2761
|||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.||||||||||.||||...|||||||||||.||..
Sbjct 2721 CCCCGAGACCACCACCATCGATGCATCTTCCATCGGCATTGTCCAGCCTGCGCTGGGCCTGGAGCAGGAAGAAC 2794
Query 2762 TGGCCGAAGGGAAGCACGGGAAAGCTGCCAAGCGAAGTCACAAGAGAAAGCAGAAGCCAGAAGAGGAGGCGGGT 2835
||||.|||||.|||||.||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.
Sbjct 2795 TGGCAGAAGGTAAGCATGGAAAGGCTGCCAAGCGCAGCCACAAGAGAAAGCAGAAGCCAGAGGAAGAGGCAGGG 2868
Query 2836 GCTCCGGTGCCCGAGGACGCCACCTTCAGCGAATACTCAGAGAAAGAGACGGAGTTCACAGGCAGTGTAGGCGA 2909
|||||.|||||.|||||..||||||||||.||||||.|.||.||.|||.|.|||||||||||||||||.||.||
Sbjct 2869 GCTCCAGTGCCTGAGGATACCACCTTCAGTGAATACCCCGAAAAGGAGCCAGAGTTCACAGGCAGTGTGGGTGA 2942
Query 2910 CGAGACCAATTCCGCAGTACAGAGCATTCAGCAGGTAGTGGTGACCCTGGGTGACCCAAATGTGACCACACCAT 2983
||||||.|||||.||.||||||||.||.||.|||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||..|.||||
Sbjct 2943 CGAGACAAATTCTGCTGTACAGAGTATCCAACAGGTGGTGGTGACCCTAGGGGACCCCAATGTGACTGCTCCAT 3016
Query 2984 CGAGCTCAGTCGGCTTGACCAACATCACCGTGACCCCCATCACCACTGCGGCCGCGACTCAGTTTACCAATCTC 3057
|.||||||||.||..|.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|..|||||||||||||||.|.
Sbjct 3017 CAAGCTCAGTTGGTCTAACCAACATCACCGTGACCCCCATCACCACTGCAGCTGGAACTCAGTTTACCAATTTA 3090
Query 3058 CAGCCGGTGGCCGTGGGGCACCTTACCACCCCTGAACGCCAGTTACAGCTGGACAACTCAATCCTGACCGTGAC 3131
|||||.|||||.||.||.||.|||||||.||||||.||||||.|||||||.||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct 3091 CAGCCAGTGGCTGTTGGACATCTTACCAACCCTGATCGCCAGCTACAGCTAGATAACTCCATCCTGACTGTGAC 3164
Query 3132 CTTTGATACCGTCAGCGGCTCTGCCATGTTGCACAACCGCCAAAATGACGTCCAGATCCACCCCCAGCCGGAAG 3205
|||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 3165 CTTTGATACTGTCAGTGGCTCCGCCATGTTGCACAACCGGCAAAATGATGTCCAGATCCACCCACAGCCAGAAG 3238
Query 3206 CCTCGAACCCACAGTCTGTGGCCCATTTCATCAACCTGACGACCCTGGTCAACTCCATCACGCCCCTGGGGAGC 3279
||.|.|||||.|||||.||||||||.||.||||||||.||.||.|||||.|||||||||||.|||.||||||.|
Sbjct 3239 CCACAAACCCTCAGTCAGTGGCCCACTTTATCAACCTTACCACACTGGTAAACTCCATCACACCCTTGGGGAAC 3312
Query 3280 CAGCTTAGTGACCAGCACCCGCTCACGTGGCGGGCAGTGCCCCAGACTGACGTCTTGCCACCCCCGCAGCCGCA 3353
||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||.||..|||..||.||.|||.|.|.
Sbjct 3313 CAACTCAGTGAGCAGCACCCACTCACCTGGCGAGCAGTGCCCCAGACAGATGTGCTGCAGCCGCCACAGGCCCC 3386
Query 3354 GGCACCCCCACAGCAGGCGGCCCAGCCCCAGGTGCAGGCGGAGCAGCAGCAGCAGCAGATGTACAGCTAC 3423
.|||.||||.||||||||||..||.||||||||.| ||.|..|||||||||||||||||||||||
Sbjct 3387 TGCAGCCCCGCAGCAGGCGGTGCAACCCCAGGTAC------AGAATGAGCAGCAGCAGATGTACAGCTAC 3450