Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_12439
Subject:
XM_006522866.3
Aligned Length:
3563
Identities:
2849
Gaps:
253

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCCGCGCCACCGCCCCCCCGGCTTCCGGTGCTGCGCAGTTTCCGGAGCGGATCGCAACCCGGAGTCCGGATC  74

Query    1  ----------------------------------ATGGCTGAAGATGGGAGCGAAGAGATCATGTTCATCTGGT  40
                                              ||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||
Sbjct   75  CGACCCCGCTCTGCACATTCCACAGGTATCAGCAATGGCTGAAGATGGTAGTGAGGAGATCATGTTTATCTGGT  148

Query   41  GTGAAGACTGCAGCCAGTACCACGACTCCGAATGTCCCGAGCTGGGCCCAGTGGTCATGGTCAAAGACTCCTTT  114
            ||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||.||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  149  GTGAAGACTGCAGCCAGTACCATGACTCGGAGTGTCCTGAACTGGGACCTGTGGTCATGGTCAAGGACTCCTTT  222

Query  115  GTGTTAAGCAGGGCAAGGTCATCCCTTCCTCCCAACTTGGAGATCAGACGACTGGAAGATGGAGCCGAGGGGGT  188
            |||.|.||||||||||||||.|||||.||..|.|||.||||||||||.||.|||||.||.||.||.||.||.||
Sbjct  223  GTGCTGAGCAGGGCAAGGTCCTCCCTCCCCTCTAACCTGGAGATCAGGCGCCTGGATGACGGGGCTGAAGGCGT  296

Query  189  GTTCGCCATCACTCAGCTCGTCAAGCGGACACAGTTCGGTCCCTTTGAGTCCAGGAGGGTCGCCAAATGGGAAA  262
            |||.||..|.||.|||||.||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|
Sbjct  297  GTTTGCAGTGACCCAGCTAGTCAAGCGCACACAATTTGGTCCGTTTGAGTCCAGGAGAGTCGCCAAGTGGGAGA  370

Query  263  AGGAGTCTGCATTTCCCCTGAAGGTGTTCCAGAAGGACGGGCACCCCGTGTGCTTCGACACCTCCAACGAGGAT  336
            |.|||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct  371  AAGAGTCGGCATTTCCTCTGAAGGTATTTCAGAAGGACGGGCATCCTGTGTGCTTCGACACTTCCAATGAGGAT  444

Query  337  GACTGCAACTGGATGATGCTGGTGCGGCCAGCGGCGGAGGCCGAGCACCAGAACCTGACGGCCTACCAGCACGG  410
            ||||||||||||||||||||.|||||.|||||...||||.|.|.|||||||||||||||.||||||||.||.||
Sbjct  445  GACTGCAACTGGATGATGCTAGTGCGACCAGCACTGGAGCCTGGGCACCAGAACCTGACAGCCTACCAACATGG  518

Query  411  CAGCGACGTGTACTTCACCACCTCCAGAGACATCCCCCCGGGTACCGAGCTGCGCGTGTGGTATGCGGCCTTCT  484
            |||.||||||||.|||||||||||.|..|||||.||..|.||.||.||.|||||.|||||||||||.|||||.|
Sbjct  519  CAGTGACGTGTATTTCACCACCTCAAAGGACATTCCTGCAGGCACTGAACTGCGTGTGTGGTATGCTGCCTTTT  592

Query  485  ATGCCAAGAAGATGGACAAGCCCATGCTGAAGCAGGCCGGCTCTGGCGTCCACGCTGCAGGCACCCCAGAAAAC  558
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||       ||||                      
Sbjct  593  ATGCCAAGAAGATGGACAAGCCCATGCTAAAGCAGGCCTGC-------TCCA----------------------  637

Query  559  AGCGCCCCCGTGGAGTCGGAACCCAGCCAGTGGGCGTGTAAAGTGTGTTCTGCCACCTTCCTGGAGCTGCAGCT  632
                                                        ||||||                        
Sbjct  638  --------------------------------------------GTGTTC------------------------  643

Query  633  CCTCAATGAACATCTGTTGGGCCACTTAGAACAAGCCAAAAGCCTTCCTCCAGGCAGCCA-AAGC--GAGGCAG  703
                 |.||.|||||.||||||||..|.||.||||||||||||||.|||.||||..|||| .|||  |||   |
Sbjct  644  -----AGGAGCATCTCTTGGGCCATCTGGAGCAAGCCAAAAGCCTCCCTGCAGGTGGCCAGCAGCATGAG---G  709

Query  704  CAGCTCCCGAGAAGGAGCAGGACACACCCCGGGGGGAACCCCCTGCAGTGCCCGAGAGCGAGA-----------  766
            |||||.|.||||||||||..||..|||||.||..|||.||.||..|||...||||||||.|||           
Sbjct  710  CAGCTTCTGAGAAGGAGCCTGATGCACCCAGGATGGAGCCTCCCACAGCAGCCGAGAGCAAGAGCATCCAGAGT  783

Query  767  ---ATGTTGCCACCAAAGAACAGAAGAAAAAGCCTCGAAGGGGGAGAAAACCCAAAGTGTCCAAAGCTGAGCAG  837
               |||  |.|||||||||.|..|||||||||||||||||.|||||.||||||||||..|||||.|.|||||||
Sbjct  784  GTCATG--GTCACCAAAGAGCCAAAGAAAAAGCCTCGAAGAGGGAGGAAACCCAAAGCATCCAAGGTTGAGCAG  855

Query  838  CCTCTAGTCATCGTGGAAGACAAGGAACCCACAGAGCAAGTGGCAGAGATCATTACCGAGGTCCCTCCGGATGA  911
            |||||.|||||..|..||||||||||.||..|||||||.||||||||||||||.||.|||.||||.||.|||||
Sbjct  856  CCTCTGGTCATTATCAAAGACAAGGAGCCTTCAGAGCATGTGGCAGAGATCATAACTGAGATCCCCCCAGATGA  929

Query  912  GCCTGTGAGTGCAACGCCAGATGAGCGGATCATGGAGCTGGTTCTGGGGAAGCTGGCCACCACCACCACTGACA  985
            |||||||||||||||.||||||||.||||||||||||.|.||..||||||||||||||.||.||||.|.|||..
Sbjct  930  GCCTGTGAGTGCAACACCAGATGAACGGATCATGGAGTTAGTCTTGGGGAAGCTGGCCGCCCCCACAAATGAAG  1003

Query  986  CCAGCTCGGTTCCAAAGTTCACCCATCATCAGAATAACACCATCACGCTCAAGAGGAGCTTAATTCTCTCAAGC  1059
            |||||||.||.|||||||||.|.|||||||..|..|.||||||..|.|||||||||.||||..||||.||.|||
Sbjct 1004  CCAGCTCAGTGCCAAAGTTCCCACATCATCCAAGCAGCACCATTGCCCTCAAGAGGGGCTTGGTTCTGTCCAGC  1077

Query 1060  AGACACGGCATCCGGCGCAAGGTCATCAAACAGCTCGGGGAGCACAAGCGGGTTTACCAGTGCAATATCTGCAG  1133
            |||||.|||.|||||||.|||.||.||...|||||.||.|||||.||.||..|..|.|||||....|.||||||
Sbjct 1078  AGACATGGCGTCCGGCGGAAGCTCGTCCGTCAGCTGGGTGAGCATAAACGCATCCATCAGTGTGGCACCTGCAG  1151

Query 1134  CAAGATCTTCCAGAACAGCAGCAACCTGAGCAGGCACGTGCGCTCGCATGGT---------------GACAAGC  1192
            ||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||               |||||||
Sbjct 1152  CAAGGTCTTCCAGAACAGCAGCAACCTGAGCCGGCACGTGCGCTCGCACGGTGAGTGCGCGCACGGGGACAAGC  1225

Query 1193  TGTTTAAGTGCGAAGAGTGTGCAAAATTGTTCAGCCGCAAAGAGAGCCTAAAGCAGCACGTTTCCTACAAGCAC  1266
            |||||||.||.||.||.|||.|.|||.||||||||||.||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1226  TGTTTAAATGTGAGGAATGTTCGAAACTGTTCAGCCGTAAGGAAAGTCTAAAGCAGCATGTTTCCTACAAGCAC  1299

Query 1267  AGCAGGAACGAGGTGGACGGCGAGTACAGGTACCGCTGCGGCACTTGTGAGAAGACCTTCCGCATCGAGAGCGC  1340
            |||.||||.|||||||||||.||||||.|.||||||||.||||..||||.||||||.|||||.||.|||||.||
Sbjct 1300  AGCCGGAATGAGGTGGACGGTGAGTACCGCTACCGCTGTGGCAGCTGTGGGAAGACATTCCGAATGGAGAGTGC  1373

Query 1341  GCTGGAGTTCCACAACTGCAGGACAGATGACAAGACGTTCCAATGTGAGATGTGTTTCAGATTCTTCTCCACCA  1414
            .|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1374  ACTGGAGTTCCACAACTGTAGGACAGATGACAAGACGTTCCAATGTGAGATGTGTTTCAGATTCTTCTCCACCA  1447

Query 1415  ACAGCAACCTCTCCAAGCACAAGAAGAAGCACGGCGACAAGAAGTTTGCCTGTGAGGTCTGCAGCAAGATGTTC  1488
            |||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1448  ACAGCAACCTCTCTAAGCACAAGAAGAAACATGGGGACAAGAAGTTTGCCTGTGAGGTCTGCAGTAAGATGTTC  1521

Query 1489  TACCGCAAGGACGTCATGCTGGACCACCAGCGCCGGCACCTGGAAGGAGTGCGGCGAGTGAAGCGAGAGGACCT  1562
            |||||||||||.||.|||||||||||||||.|.||.|||.||||.||.||||||||.||||||.||||.|||.|
Sbjct 1522  TACCGCAAGGATGTTATGCTGGACCACCAGAGGCGACACTTGGATGGTGTGCGGCGGGTGAAGAGAGAAGACTT  1595

Query 1563  GGAGGCCGGTGGGGAGAACCTGGTCCGTTACAAGAAGGAGCCTTCCGGGTGCCCGGTGTGTGGCAAGGTGTTCT  1636
            |||||||.|.|||||.|.||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1596  GGAGGCCAGCGGGGAAAGCCTGGTTCGTTACAAGAAGGAACCTTCTGGATGCCCAGTGTGTGGCAAGGTGTTCT  1669

Query 1637  CCTGCCGGAGCAATATGAACAAGCACCTGCTCACCCACGGCGACAAGAAGTACACCTGCGAGATCTGCGGGCGC  1710
            ||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1670  CCTGTCGGAGCAACATGAACAAGCACCTGCTGACCCACGGTGACAAGAAGTACACCTGCGAGATCTGTGGGCGC  1743

Query 1711  AAGTTCTTCCGCGTGGATGTGCTCAGGGACCACATCCATGTCCACTTCAAGGACATCGCGTTGATGGATGACCA  1784
            |||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||
Sbjct 1744  AAGTTCTTCCGAGTGGACGTACTCAGGGACCACATCCATGTCCACTTCAAGGACATCGCGCTAATGGATGACCA  1817

Query 1785  CCAGAGGGAAGAGTTTATCGGCAAGATCGGGATCTCCTCGGAAGAAAACGATGACAATTCTGACGAGAGCGCAG  1858
            ||||.||||.|||||.||.|||||.||.|||||||||||.||.||.||.||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 1818  CCAGCGGGAGGAGTTCATTGGCAAAATTGGGATCTCCTCAGAGGAGAATGATGACAACTCTGATGAGAGCGCAG  1891

Query 1859  ACTCGGAGCCTCACAAGTACAGCTGCAAGCGGTGCCAGCTCACCTTCGGCCGGGGGAAGGAGTACCTGAAGCAC  1932
            ||||.|||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 1892  ACTCTGAGCCACACAAGTACAGCTGCAAGAGGTGCCAGCTCACTTTCGGCCGTGGGAAGGAATACCTGAAGCAC  1965

Query 1933  ATCATGGAGGTGCACAAGGAGAAGGGCTATGGCTGCAGCATCTGCAACCGGCGCTTTGCACTGAAGGCCACCTA  2006
            |||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||.||||.|||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 1966  ATCATGGAGGTGCACAAGGAGAAGGGCCACGGCTGCAGCATCTGCCACCGACGCTTCGCACTCAAGGCCACCTA  2039

Query 2007  CCACGCCCACATGGTCATCCACCGTGAAAACCTGCCGGACCCCAACGTGCAGAAGTACATCCACCCCTGCGAGA  2080
            |||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 2040  CCATGCCCACATGGTCATCCACCGGGAGAACCTGCCTGACCCCAACGTGCAGAAGTACATTCACCCCTGTGAGA  2113

Query 2081  TCTGCGGGCGGATCTTCAACAGCATCGGGAACCTGGAGCGCCACAAGCTCATCCACACAGGTGTGAAGAGCCAC  2154
            ||||.|||.||||.|||||||||||.||||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 2114  TCTGTGGGAGGATATTCAACAGCATTGGGAACTTGGAGCGCCACAAACTCATCCACACAGGTGTGAAAAGCCAC  2187

Query 2155  GCCTGCGAGCAGTGTGGGAAGTCCTTTGCCAGGAAGGACATGCTGAAGGAGCACATGCGTGTGCACGACAACGT  2228
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.|
Sbjct 2188  GCCTGTGAGCAGTGTGGGAAGTCCTTTGCCAGGAAGGACATGCTGAAAGAGCACATGCGTGTGCATGACAACAT  2261

Query 2229  CCGCGAGTACCTGTGTGCCGAGTGTGGGAAAGGCATGAAGACCAAGCACGCGCTGCGCCACCACATGAAGCTGC  2302
            |||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct 2262  CCGGGAGTACCTGTGCGCCGAGTGTGGGAAAGGTATGAAGACCAAGCATGCACTGCGCCACCATATGAAGCTGC  2335

Query 2303  ACAAGGGCATCAAGGAGTACGAGTGCAAGGAGTGCCACCGCAGGTTCGCGCAGAAGGTCAACATGCTCAAGCAC  2376
            ||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||.|||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2336  ACAAAGGCATCAAGGAGTATGAGTGCAAGGAATGTCACCGCAAGTTTGCACAGAAGGTCAACATGCTCAAGCAC  2409

Query 2377  TGCAAGCGGCACACGGGGATTAAAGATTTCATGTGTGAATTGTGTGGGAAGACATTCAGCGAGAGGAACACCAT  2450
            |.|||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 2410  TACAAACGGCACACAGGAATTAAAGACTTCATGTGTGAATTGTGTGGGAAGACATTCAGTGAGAGGAACACAAT  2483

Query 2451  GGAGACCCACAAGCTCATCCACACAGTGGGCAAGCAGTGGACGTGCTCCGTGTGCGACAAGAAGTACGTGACCG  2524
            ||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||.|
Sbjct 2484  GGAGACACACAAGCTCATCCACACAGTAGGCAAGCAGTGGACTTGTTCCGTGTGTGACAAGAAGTACGTCACAG  2557

Query 2525  AGTACATGCTGCAGAAGCACGTTCAGCTCACACACGACAAGGTGGAGGCGCAGAGCTGCCAGCTGTGCGGGACC  2598
            ||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.||.|||||.|||||.||.||.||.|||
Sbjct 2558  AGTACATGCTTCAGAAACACGTCCAGCTCACTCATGACAAGGTGGAAGCACAGAGTTGCCAACTATGTGGCACC  2631

Query 2599  AAGGTGTCCACCAGGGCCTCCATGAGCCGACACATGCGGCGCAAGCACCCCGAGGTGCTCGCGGTGAGGATCGA  2672
            ||.|||||.|||.||||||||||||||.||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||..||||.||
Sbjct 2632  AAAGTGTCAACCCGGGCCTCCATGAGCAGACATATGCGACGCAAGCACCCCGAGGTCCTCGCTGTTCGGATTGA  2705

Query 2673  TGACCTGGACCACCTCCCGGAGACCACCACCATCGACGCCTCCTCCATTGGCATCGTCCAGCCTGAGCTGACTC  2746
            .||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.||||||||||.||||...|
Sbjct 2706  CGATCTGGACCACCTCCCCGAGACCACCACCATCGATGCATCTTCCATCGGCATTGTCCAGCCTGCGCTGGGCC  2779

Query 2747  TGGAGCAGGAGGATTTGGCCGAAGGGAAGCACGGGAAAGCTGCCAAGCGAAGTCACAAGAGAAAGCAGAAGCCA  2820
            ||||||||||.||..||||.|||||.|||||.||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 2780  TGGAGCAGGAAGAACTGGCAGAAGGTAAGCATGGAAAGGCTGCCAAGCGCAGCCACAAGAGAAAGCAGAAGCCA  2853

Query 2821  GAAGAGGAGGCGGGTGCTCCGGTGCCCGAGGACGCCACCTTCAGCGAATACTCAGAGAAAGAGACGGAGTTCAC  2894
            ||.||.|||||.||.|||||.|||||.|||||..||||||||||.||||||.|.||.||.|||.|.||||||||
Sbjct 2854  GAGGAAGAGGCAGGGGCTCCAGTGCCTGAGGATACCACCTTCAGTGAATACCCCGAAAAGGAGCCAGAGTTCAC  2927

Query 2895  AGGCAGTGTAGGCGACGAGACCAATTCCGCAGTACAGAGCATTCAGCAGGTAGTGGTGACCCTGGGTGACCCAA  2968
            |||||||||.||.||||||||.|||||.||.||||||||.||.||.|||||.|||||||||||.||.|||||.|
Sbjct 2928  AGGCAGTGTGGGTGACGAGACAAATTCTGCTGTACAGAGTATCCAACAGGTGGTGGTGACCCTAGGGGACCCCA  3001

Query 2969  ATGTGACCACACCATCGAGCTCAGTCGGCTTGACCAACATCACCGTGACCCCCATCACCACTGCGGCCGCGACT  3042
            |||||||..|.|||||.||||||||.||..|.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|..|||
Sbjct 3002  ATGTGACTGCTCCATCAAGCTCAGTTGGTCTAACCAACATCACCGTGACCCCCATCACCACTGCAGCTGGAACT  3075

Query 3043  CAGTTTACCAATCTCCAGCCGGTGGCCGTGGGGCACCTTACCACCCCTGAACGCCAGTTACAGCTGGACAACTC  3116
            ||||||||||||.|.|||||.|||||.||.||.||.|||||||.||||||.||||||.|||||||.||.|||||
Sbjct 3076  CAGTTTACCAATTTACAGCCAGTGGCTGTTGGACATCTTACCAACCCTGATCGCCAGCTACAGCTAGATAACTC  3149

Query 3117  AATCCTGACCGTGACCTTTGATACCGTCAGCGGCTCTGCCATGTTGCACAACCGCCAAAATGACGTCCAGATCC  3190
            .||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 3150  CATCCTGACTGTGACCTTTGATACTGTCAGTGGCTCCGCCATGTTGCACAACCGGCAAAATGATGTCCAGATCC  3223

Query 3191  ACCCCCAGCCGGAAGCCTCGAACCCACAGTCTGTGGCCCATTTCATCAACCTGACGACCCTGGTCAACTCCATC  3264
            ||||.|||||.||||||.|.|||||.|||||.||||||||.||.||||||||.||.||.|||||.|||||||||
Sbjct 3224  ACCCACAGCCAGAAGCCACAAACCCTCAGTCAGTGGCCCACTTTATCAACCTTACCACACTGGTAAACTCCATC  3297

Query 3265  ACGCCCCTGGGGAGCCAGCTTAGTGACCAGCACCCGCTCACGTGGCGGGCAGTGCCCCAGACTGACGTCTTGCC  3338
            ||.|||.||||||.|||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||.||..|||.
Sbjct 3298  ACACCCTTGGGGAACCAACTCAGTGAGCAGCACCCACTCACCTGGCGAGCAGTGCCCCAGACAGATGTGCTGCA  3371

Query 3339  ACCCCCGCAGCCGCAGGCACCCCCACAGCAGGCGGCCCAGCCCCAGGTGCAGGCGGAGCAGCAGCAGCAGCAGA  3412
            .||.||.|||.|.|..|||.||||.||||||||||..||.||||||||.|      ||.|..||||||||||||
Sbjct 3372  GCCGCCACAGGCCCCTGCAGCCCCGCAGCAGGCGGTGCAACCCCAGGTAC------AGAATGAGCAGCAGCAGA  3439

Query 3413  TGTACAGCTAC  3423
            |||||||||||
Sbjct 3440  TGTACAGCTAC  3450