Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_12439
- Subject:
- XM_006522866.3
- Aligned Length:
- 3563
- Identities:
- 2849
- Gaps:
- 253
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGCCGCGCCACCGCCCCCCCGGCTTCCGGTGCTGCGCAGTTTCCGGAGCGGATCGCAACCCGGAGTCCGGATC 74
Query 1 ----------------------------------ATGGCTGAAGATGGGAGCGAAGAGATCATGTTCATCTGGT 40
||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 75 CGACCCCGCTCTGCACATTCCACAGGTATCAGCAATGGCTGAAGATGGTAGTGAGGAGATCATGTTTATCTGGT 148
Query 41 GTGAAGACTGCAGCCAGTACCACGACTCCGAATGTCCCGAGCTGGGCCCAGTGGTCATGGTCAAAGACTCCTTT 114
||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||.||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 149 GTGAAGACTGCAGCCAGTACCATGACTCGGAGTGTCCTGAACTGGGACCTGTGGTCATGGTCAAGGACTCCTTT 222
Query 115 GTGTTAAGCAGGGCAAGGTCATCCCTTCCTCCCAACTTGGAGATCAGACGACTGGAAGATGGAGCCGAGGGGGT 188
|||.|.||||||||||||||.|||||.||..|.|||.||||||||||.||.|||||.||.||.||.||.||.||
Sbjct 223 GTGCTGAGCAGGGCAAGGTCCTCCCTCCCCTCTAACCTGGAGATCAGGCGCCTGGATGACGGGGCTGAAGGCGT 296
Query 189 GTTCGCCATCACTCAGCTCGTCAAGCGGACACAGTTCGGTCCCTTTGAGTCCAGGAGGGTCGCCAAATGGGAAA 262
|||.||..|.||.|||||.||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|
Sbjct 297 GTTTGCAGTGACCCAGCTAGTCAAGCGCACACAATTTGGTCCGTTTGAGTCCAGGAGAGTCGCCAAGTGGGAGA 370
Query 263 AGGAGTCTGCATTTCCCCTGAAGGTGTTCCAGAAGGACGGGCACCCCGTGTGCTTCGACACCTCCAACGAGGAT 336
|.|||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 371 AAGAGTCGGCATTTCCTCTGAAGGTATTTCAGAAGGACGGGCATCCTGTGTGCTTCGACACTTCCAATGAGGAT 444
Query 337 GACTGCAACTGGATGATGCTGGTGCGGCCAGCGGCGGAGGCCGAGCACCAGAACCTGACGGCCTACCAGCACGG 410
||||||||||||||||||||.|||||.|||||...||||.|.|.|||||||||||||||.||||||||.||.||
Sbjct 445 GACTGCAACTGGATGATGCTAGTGCGACCAGCACTGGAGCCTGGGCACCAGAACCTGACAGCCTACCAACATGG 518
Query 411 CAGCGACGTGTACTTCACCACCTCCAGAGACATCCCCCCGGGTACCGAGCTGCGCGTGTGGTATGCGGCCTTCT 484
|||.||||||||.|||||||||||.|..|||||.||..|.||.||.||.|||||.|||||||||||.|||||.|
Sbjct 519 CAGTGACGTGTATTTCACCACCTCAAAGGACATTCCTGCAGGCACTGAACTGCGTGTGTGGTATGCTGCCTTTT 592
Query 485 ATGCCAAGAAGATGGACAAGCCCATGCTGAAGCAGGCCGGCTCTGGCGTCCACGCTGCAGGCACCCCAGAAAAC 558
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|| ||||
Sbjct 593 ATGCCAAGAAGATGGACAAGCCCATGCTAAAGCAGGCCTGC-------TCCA---------------------- 637
Query 559 AGCGCCCCCGTGGAGTCGGAACCCAGCCAGTGGGCGTGTAAAGTGTGTTCTGCCACCTTCCTGGAGCTGCAGCT 632
||||||
Sbjct 638 --------------------------------------------GTGTTC------------------------ 643
Query 633 CCTCAATGAACATCTGTTGGGCCACTTAGAACAAGCCAAAAGCCTTCCTCCAGGCAGCCA-AAGC--GAGGCAG 703
|.||.|||||.||||||||..|.||.||||||||||||||.|||.||||..|||| .||| ||| |
Sbjct 644 -----AGGAGCATCTCTTGGGCCATCTGGAGCAAGCCAAAAGCCTCCCTGCAGGTGGCCAGCAGCATGAG---G 709
Query 704 CAGCTCCCGAGAAGGAGCAGGACACACCCCGGGGGGAACCCCCTGCAGTGCCCGAGAGCGAGA----------- 766
|||||.|.||||||||||..||..|||||.||..|||.||.||..|||...||||||||.|||
Sbjct 710 CAGCTTCTGAGAAGGAGCCTGATGCACCCAGGATGGAGCCTCCCACAGCAGCCGAGAGCAAGAGCATCCAGAGT 783
Query 767 ---ATGTTGCCACCAAAGAACAGAAGAAAAAGCCTCGAAGGGGGAGAAAACCCAAAGTGTCCAAAGCTGAGCAG 837
||| |.|||||||||.|..|||||||||||||||||.|||||.||||||||||..|||||.|.|||||||
Sbjct 784 GTCATG--GTCACCAAAGAGCCAAAGAAAAAGCCTCGAAGAGGGAGGAAACCCAAAGCATCCAAGGTTGAGCAG 855
Query 838 CCTCTAGTCATCGTGGAAGACAAGGAACCCACAGAGCAAGTGGCAGAGATCATTACCGAGGTCCCTCCGGATGA 911
|||||.|||||..|..||||||||||.||..|||||||.||||||||||||||.||.|||.||||.||.|||||
Sbjct 856 CCTCTGGTCATTATCAAAGACAAGGAGCCTTCAGAGCATGTGGCAGAGATCATAACTGAGATCCCCCCAGATGA 929
Query 912 GCCTGTGAGTGCAACGCCAGATGAGCGGATCATGGAGCTGGTTCTGGGGAAGCTGGCCACCACCACCACTGACA 985
|||||||||||||||.||||||||.||||||||||||.|.||..||||||||||||||.||.||||.|.|||..
Sbjct 930 GCCTGTGAGTGCAACACCAGATGAACGGATCATGGAGTTAGTCTTGGGGAAGCTGGCCGCCCCCACAAATGAAG 1003
Query 986 CCAGCTCGGTTCCAAAGTTCACCCATCATCAGAATAACACCATCACGCTCAAGAGGAGCTTAATTCTCTCAAGC 1059
|||||||.||.|||||||||.|.|||||||..|..|.||||||..|.|||||||||.||||..||||.||.|||
Sbjct 1004 CCAGCTCAGTGCCAAAGTTCCCACATCATCCAAGCAGCACCATTGCCCTCAAGAGGGGCTTGGTTCTGTCCAGC 1077
Query 1060 AGACACGGCATCCGGCGCAAGGTCATCAAACAGCTCGGGGAGCACAAGCGGGTTTACCAGTGCAATATCTGCAG 1133
|||||.|||.|||||||.|||.||.||...|||||.||.|||||.||.||..|..|.|||||....|.||||||
Sbjct 1078 AGACATGGCGTCCGGCGGAAGCTCGTCCGTCAGCTGGGTGAGCATAAACGCATCCATCAGTGTGGCACCTGCAG 1151
Query 1134 CAAGATCTTCCAGAACAGCAGCAACCTGAGCAGGCACGTGCGCTCGCATGGT---------------GACAAGC 1192
||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||| |||||||
Sbjct 1152 CAAGGTCTTCCAGAACAGCAGCAACCTGAGCCGGCACGTGCGCTCGCACGGTGAGTGCGCGCACGGGGACAAGC 1225
Query 1193 TGTTTAAGTGCGAAGAGTGTGCAAAATTGTTCAGCCGCAAAGAGAGCCTAAAGCAGCACGTTTCCTACAAGCAC 1266
|||||||.||.||.||.|||.|.|||.||||||||||.||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1226 TGTTTAAATGTGAGGAATGTTCGAAACTGTTCAGCCGTAAGGAAAGTCTAAAGCAGCATGTTTCCTACAAGCAC 1299
Query 1267 AGCAGGAACGAGGTGGACGGCGAGTACAGGTACCGCTGCGGCACTTGTGAGAAGACCTTCCGCATCGAGAGCGC 1340
|||.||||.|||||||||||.||||||.|.||||||||.||||..||||.||||||.|||||.||.|||||.||
Sbjct 1300 AGCCGGAATGAGGTGGACGGTGAGTACCGCTACCGCTGTGGCAGCTGTGGGAAGACATTCCGAATGGAGAGTGC 1373
Query 1341 GCTGGAGTTCCACAACTGCAGGACAGATGACAAGACGTTCCAATGTGAGATGTGTTTCAGATTCTTCTCCACCA 1414
.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1374 ACTGGAGTTCCACAACTGTAGGACAGATGACAAGACGTTCCAATGTGAGATGTGTTTCAGATTCTTCTCCACCA 1447
Query 1415 ACAGCAACCTCTCCAAGCACAAGAAGAAGCACGGCGACAAGAAGTTTGCCTGTGAGGTCTGCAGCAAGATGTTC 1488
|||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1448 ACAGCAACCTCTCTAAGCACAAGAAGAAACATGGGGACAAGAAGTTTGCCTGTGAGGTCTGCAGTAAGATGTTC 1521
Query 1489 TACCGCAAGGACGTCATGCTGGACCACCAGCGCCGGCACCTGGAAGGAGTGCGGCGAGTGAAGCGAGAGGACCT 1562
|||||||||||.||.|||||||||||||||.|.||.|||.||||.||.||||||||.||||||.||||.|||.|
Sbjct 1522 TACCGCAAGGATGTTATGCTGGACCACCAGAGGCGACACTTGGATGGTGTGCGGCGGGTGAAGAGAGAAGACTT 1595
Query 1563 GGAGGCCGGTGGGGAGAACCTGGTCCGTTACAAGAAGGAGCCTTCCGGGTGCCCGGTGTGTGGCAAGGTGTTCT 1636
|||||||.|.|||||.|.||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1596 GGAGGCCAGCGGGGAAAGCCTGGTTCGTTACAAGAAGGAACCTTCTGGATGCCCAGTGTGTGGCAAGGTGTTCT 1669
Query 1637 CCTGCCGGAGCAATATGAACAAGCACCTGCTCACCCACGGCGACAAGAAGTACACCTGCGAGATCTGCGGGCGC 1710
||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1670 CCTGTCGGAGCAACATGAACAAGCACCTGCTGACCCACGGTGACAAGAAGTACACCTGCGAGATCTGTGGGCGC 1743
Query 1711 AAGTTCTTCCGCGTGGATGTGCTCAGGGACCACATCCATGTCCACTTCAAGGACATCGCGTTGATGGATGACCA 1784
|||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||
Sbjct 1744 AAGTTCTTCCGAGTGGACGTACTCAGGGACCACATCCATGTCCACTTCAAGGACATCGCGCTAATGGATGACCA 1817
Query 1785 CCAGAGGGAAGAGTTTATCGGCAAGATCGGGATCTCCTCGGAAGAAAACGATGACAATTCTGACGAGAGCGCAG 1858
||||.||||.|||||.||.|||||.||.|||||||||||.||.||.||.||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 1818 CCAGCGGGAGGAGTTCATTGGCAAAATTGGGATCTCCTCAGAGGAGAATGATGACAACTCTGATGAGAGCGCAG 1891
Query 1859 ACTCGGAGCCTCACAAGTACAGCTGCAAGCGGTGCCAGCTCACCTTCGGCCGGGGGAAGGAGTACCTGAAGCAC 1932
||||.|||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 1892 ACTCTGAGCCACACAAGTACAGCTGCAAGAGGTGCCAGCTCACTTTCGGCCGTGGGAAGGAATACCTGAAGCAC 1965
Query 1933 ATCATGGAGGTGCACAAGGAGAAGGGCTATGGCTGCAGCATCTGCAACCGGCGCTTTGCACTGAAGGCCACCTA 2006
|||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||.||||.|||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 1966 ATCATGGAGGTGCACAAGGAGAAGGGCCACGGCTGCAGCATCTGCCACCGACGCTTCGCACTCAAGGCCACCTA 2039
Query 2007 CCACGCCCACATGGTCATCCACCGTGAAAACCTGCCGGACCCCAACGTGCAGAAGTACATCCACCCCTGCGAGA 2080
|||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 2040 CCATGCCCACATGGTCATCCACCGGGAGAACCTGCCTGACCCCAACGTGCAGAAGTACATTCACCCCTGTGAGA 2113
Query 2081 TCTGCGGGCGGATCTTCAACAGCATCGGGAACCTGGAGCGCCACAAGCTCATCCACACAGGTGTGAAGAGCCAC 2154
||||.|||.||||.|||||||||||.||||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 2114 TCTGTGGGAGGATATTCAACAGCATTGGGAACTTGGAGCGCCACAAACTCATCCACACAGGTGTGAAAAGCCAC 2187
Query 2155 GCCTGCGAGCAGTGTGGGAAGTCCTTTGCCAGGAAGGACATGCTGAAGGAGCACATGCGTGTGCACGACAACGT 2228
|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.|
Sbjct 2188 GCCTGTGAGCAGTGTGGGAAGTCCTTTGCCAGGAAGGACATGCTGAAAGAGCACATGCGTGTGCATGACAACAT 2261
Query 2229 CCGCGAGTACCTGTGTGCCGAGTGTGGGAAAGGCATGAAGACCAAGCACGCGCTGCGCCACCACATGAAGCTGC 2302
|||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct 2262 CCGGGAGTACCTGTGCGCCGAGTGTGGGAAAGGTATGAAGACCAAGCATGCACTGCGCCACCATATGAAGCTGC 2335
Query 2303 ACAAGGGCATCAAGGAGTACGAGTGCAAGGAGTGCCACCGCAGGTTCGCGCAGAAGGTCAACATGCTCAAGCAC 2376
||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||.|||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2336 ACAAAGGCATCAAGGAGTATGAGTGCAAGGAATGTCACCGCAAGTTTGCACAGAAGGTCAACATGCTCAAGCAC 2409
Query 2377 TGCAAGCGGCACACGGGGATTAAAGATTTCATGTGTGAATTGTGTGGGAAGACATTCAGCGAGAGGAACACCAT 2450
|.|||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 2410 TACAAACGGCACACAGGAATTAAAGACTTCATGTGTGAATTGTGTGGGAAGACATTCAGTGAGAGGAACACAAT 2483
Query 2451 GGAGACCCACAAGCTCATCCACACAGTGGGCAAGCAGTGGACGTGCTCCGTGTGCGACAAGAAGTACGTGACCG 2524
||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||.|
Sbjct 2484 GGAGACACACAAGCTCATCCACACAGTAGGCAAGCAGTGGACTTGTTCCGTGTGTGACAAGAAGTACGTCACAG 2557
Query 2525 AGTACATGCTGCAGAAGCACGTTCAGCTCACACACGACAAGGTGGAGGCGCAGAGCTGCCAGCTGTGCGGGACC 2598
||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.||.|||||.|||||.||.||.||.|||
Sbjct 2558 AGTACATGCTTCAGAAACACGTCCAGCTCACTCATGACAAGGTGGAAGCACAGAGTTGCCAACTATGTGGCACC 2631
Query 2599 AAGGTGTCCACCAGGGCCTCCATGAGCCGACACATGCGGCGCAAGCACCCCGAGGTGCTCGCGGTGAGGATCGA 2672
||.|||||.|||.||||||||||||||.||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||..||||.||
Sbjct 2632 AAAGTGTCAACCCGGGCCTCCATGAGCAGACATATGCGACGCAAGCACCCCGAGGTCCTCGCTGTTCGGATTGA 2705
Query 2673 TGACCTGGACCACCTCCCGGAGACCACCACCATCGACGCCTCCTCCATTGGCATCGTCCAGCCTGAGCTGACTC 2746
.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.||||||||||.||||...|
Sbjct 2706 CGATCTGGACCACCTCCCCGAGACCACCACCATCGATGCATCTTCCATCGGCATTGTCCAGCCTGCGCTGGGCC 2779
Query 2747 TGGAGCAGGAGGATTTGGCCGAAGGGAAGCACGGGAAAGCTGCCAAGCGAAGTCACAAGAGAAAGCAGAAGCCA 2820
||||||||||.||..||||.|||||.|||||.||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 2780 TGGAGCAGGAAGAACTGGCAGAAGGTAAGCATGGAAAGGCTGCCAAGCGCAGCCACAAGAGAAAGCAGAAGCCA 2853
Query 2821 GAAGAGGAGGCGGGTGCTCCGGTGCCCGAGGACGCCACCTTCAGCGAATACTCAGAGAAAGAGACGGAGTTCAC 2894
||.||.|||||.||.|||||.|||||.|||||..||||||||||.||||||.|.||.||.|||.|.||||||||
Sbjct 2854 GAGGAAGAGGCAGGGGCTCCAGTGCCTGAGGATACCACCTTCAGTGAATACCCCGAAAAGGAGCCAGAGTTCAC 2927
Query 2895 AGGCAGTGTAGGCGACGAGACCAATTCCGCAGTACAGAGCATTCAGCAGGTAGTGGTGACCCTGGGTGACCCAA 2968
|||||||||.||.||||||||.|||||.||.||||||||.||.||.|||||.|||||||||||.||.|||||.|
Sbjct 2928 AGGCAGTGTGGGTGACGAGACAAATTCTGCTGTACAGAGTATCCAACAGGTGGTGGTGACCCTAGGGGACCCCA 3001
Query 2969 ATGTGACCACACCATCGAGCTCAGTCGGCTTGACCAACATCACCGTGACCCCCATCACCACTGCGGCCGCGACT 3042
|||||||..|.|||||.||||||||.||..|.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|..|||
Sbjct 3002 ATGTGACTGCTCCATCAAGCTCAGTTGGTCTAACCAACATCACCGTGACCCCCATCACCACTGCAGCTGGAACT 3075
Query 3043 CAGTTTACCAATCTCCAGCCGGTGGCCGTGGGGCACCTTACCACCCCTGAACGCCAGTTACAGCTGGACAACTC 3116
||||||||||||.|.|||||.|||||.||.||.||.|||||||.||||||.||||||.|||||||.||.|||||
Sbjct 3076 CAGTTTACCAATTTACAGCCAGTGGCTGTTGGACATCTTACCAACCCTGATCGCCAGCTACAGCTAGATAACTC 3149
Query 3117 AATCCTGACCGTGACCTTTGATACCGTCAGCGGCTCTGCCATGTTGCACAACCGCCAAAATGACGTCCAGATCC 3190
.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 3150 CATCCTGACTGTGACCTTTGATACTGTCAGTGGCTCCGCCATGTTGCACAACCGGCAAAATGATGTCCAGATCC 3223
Query 3191 ACCCCCAGCCGGAAGCCTCGAACCCACAGTCTGTGGCCCATTTCATCAACCTGACGACCCTGGTCAACTCCATC 3264
||||.|||||.||||||.|.|||||.|||||.||||||||.||.||||||||.||.||.|||||.|||||||||
Sbjct 3224 ACCCACAGCCAGAAGCCACAAACCCTCAGTCAGTGGCCCACTTTATCAACCTTACCACACTGGTAAACTCCATC 3297
Query 3265 ACGCCCCTGGGGAGCCAGCTTAGTGACCAGCACCCGCTCACGTGGCGGGCAGTGCCCCAGACTGACGTCTTGCC 3338
||.|||.||||||.|||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||.||..|||.
Sbjct 3298 ACACCCTTGGGGAACCAACTCAGTGAGCAGCACCCACTCACCTGGCGAGCAGTGCCCCAGACAGATGTGCTGCA 3371
Query 3339 ACCCCCGCAGCCGCAGGCACCCCCACAGCAGGCGGCCCAGCCCCAGGTGCAGGCGGAGCAGCAGCAGCAGCAGA 3412
.||.||.|||.|.|..|||.||||.||||||||||..||.||||||||.| ||.|..||||||||||||
Sbjct 3372 GCCGCCACAGGCCCCTGCAGCCCCGCAGCAGGCGGTGCAACCCCAGGTAC------AGAATGAGCAGCAGCAGA 3439
Query 3413 TGTACAGCTAC 3423
|||||||||||
Sbjct 3440 TGTACAGCTAC 3450