Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_12439
Subject:
XM_006522868.3
Aligned Length:
3455
Identities:
2624
Gaps:
391

Alignment

Query    1  ATGGCTGAAGATGGGAGCGAAGAGATCATGTTCATCTGGTGTGAAGACTGCAGCCAGTACCACGACTCCGAATG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TCCCGAGCTGGGCCCAGTGGTCATGGTCAAAGACTCCTTTGTGTTAAGCAGGGCAAGGTCATCCCTTCCTCCCA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ACTTGGAGATCAGACGACTGGAAGATGGAGCCGAGGGGGTGTTCGCCATCACTCAGCTCGTCAAGCGGACACAG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  TTCGGTCCCTTTGAGTCCAGGAGGGTCGCCAAATGGGAAAAGGAGTCTGCATTTCCCCTGAAGGTGTTCCAGAA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  GGACGGGCACCCCGTGTGCTTCGACACCTCCAACGAGGATGACTGCAACTGGATGATGCTGGTGCGGCCAGCGG  370
                                                                ||||||||.|||||.|||||..
Sbjct    1  ----------------------------------------------------ATGATGCTAGTGCGACCAGCAC  22

Query  371  CGGAGGCCGAGCACCAGAACCTGACGGCCTACCAGCACGGCAGCGACGTGTACTTCACCACCTCCAGAGACATC  444
            .||||.|.|.|||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.|..|||||.
Sbjct   23  TGGAGCCTGGGCACCAGAACCTGACAGCCTACCAACATGGCAGTGACGTGTATTTCACCACCTCAAAGGACATT  96

Query  445  CCCCCGGGTACCGAGCTGCGCGTGTGGTATGCGGCCTTCTATGCCAAGAAGATGGACAAGCCCATGCTGAAGCA  518
            ||..|.||.||.||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct   97  CCTGCAGGCACTGAACTGCGTGTGTGGTATGCTGCCTTTTATGCCAAGAAGATGGACAAGCCCATGCTAAAGCA  170

Query  519  GGCCGGCTCTGGCGTCCACGCTGCAGGCACCCCAGAAAACAGCGCCCCCGTGGAGTCGGAACCCAGCCAGTGGG  592
            ||||.||||..|.||.||.||||||||||||||.||...|||.|.|.|.|||||..|.||.|...||||.||||
Sbjct  171  GGCCTGCTCCAGTGTTCAGGCTGCAGGCACCCCTGAGCCCAGTGTCTCTGTGGAACCTGAGCGTGGCCAATGGG  244

Query  593  CGTGTAAAGTGTGTTCTGCCACCTTCCTGGAGCTGCAGCTCCTCAATGAACATCTGTTGGGCCACTTAGAACAA  666
            .||||||.|||||.||...|||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.||||||||..|.||.|||
Sbjct  245  TGTGTAAGGTGTGCTCCAACACCTTCCTGGAGCTTCAGCTCCTGAACGAGCATCTCTTGGGCCATCTGGAGCAA  318

Query  667  GCCAAAAGCCTTCCTCCAGGCAGCCA-AAGC--GAGGCAGCAGCTCCCGAGAAGGAGCAGGACACACCCCGGGG  737
            |||||||||||.|||.||||..|||| .|||  |||   ||||||.|.||||||||||..||..|||||.||..
Sbjct  319  GCCAAAAGCCTCCCTGCAGGTGGCCAGCAGCATGAG---GCAGCTTCTGAGAAGGAGCCTGATGCACCCAGGAT  389

Query  738  GGAACCCCCTGCAGTGCCCGAGAGCGAGA--------------ATGTTGCCACCAAAGAACAGAAGAAAAAGCC  797
            |||.||.||..|||...||||||||.|||              |||  |.|||||||||.|..|||||||||||
Sbjct  390  GGAGCCTCCCACAGCAGCCGAGAGCAAGAGCATCCAGAGTGTCATG--GTCACCAAAGAGCCAAAGAAAAAGCC  461

Query  798  TCGAAGGGGGAGAAAACCCAAAGTGTCCAAAGCTGAGCAGCCTCTAGTCATCGTGGAAGACAAGGAACCCACAG  871
            ||||||.|||||.||||||||||..|||||.|.||||||||||||.|||||..|..||||||||||.||..|||
Sbjct  462  TCGAAGAGGGAGGAAACCCAAAGCATCCAAGGTTGAGCAGCCTCTGGTCATTATCAAAGACAAGGAGCCTTCAG  535

Query  872  AGCAAGTGGCAGAGATCATTACCGAGGTCCCTCCGGATGAGCCTGTGAGTGCAACGCCAGATGAGCGGATCATG  945
            ||||.||||||||||||||.||.|||.||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct  536  AGCATGTGGCAGAGATCATAACTGAGATCCCCCCAGATGAGCCTGTGAGTGCAACACCAGATGAACGGATCATG  609

Query  946  GAGCTGGTTCTGGGGAAGCTGGCCACCACCACCACTGACACCAGCTCGGTTCCAAAGTTCACCCATCATCAGAA  1019
            |||.|.||..||||||||||||||.||.||||.|.|||..|||||||.||.|||||||||.|.|||||||..|.
Sbjct  610  GAGTTAGTCTTGGGGAAGCTGGCCGCCCCCACAAATGAAGCCAGCTCAGTGCCAAAGTTCCCACATCATCCAAG  683

Query 1020  TAACACCATCACGCTCAAGAGGAGCTTAATTCTCTCAAGCAGACACGGCATCCGGCGCAAGGTCATCAAACAGC  1093
            .|.||||||..|.|||||||||.||||..||||.||.||||||||.|||.|||||||.|||.||.||...||||
Sbjct  684  CAGCACCATTGCCCTCAAGAGGGGCTTGGTTCTGTCCAGCAGACATGGCGTCCGGCGGAAGCTCGTCCGTCAGC  757

Query 1094  TCGGGGAGCACAAGCGGGTTTACCAGTGCAATATCTGCAGCAAGATCTTCCAGAACAGCAGCAACCTGAGCAGG  1167
            |.||.|||||.||.||..|..|.|||||....|.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  758  TGGGTGAGCATAAACGCATCCATCAGTGTGGCACCTGCAGCAAGGTCTTCCAGAACAGCAGCAACCTGAGCCGG  831

Query 1168  CACGTGCGCTCGCATGGT---------------GACAAGCTGTTTAAGTGCGAAGAGTGTGCAAAATTGTTCAG  1226
            ||||||||||||||.|||               ||||||||||||||.||.||.||.|||.|.|||.|||||||
Sbjct  832  CACGTGCGCTCGCACGGTGAGTGCGCGCACGGGGACAAGCTGTTTAAATGTGAGGAATGTTCGAAACTGTTCAG  905

Query 1227  CCGCAAAGAGAGCCTAAAGCAGCACGTTTCCTACAAGCACAGCAGGAACGAGGTGGACGGCGAGTACAGGTACC  1300
            |||.||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||.||||.|||||||||||.||||||.|.||||
Sbjct  906  CCGTAAGGAAAGTCTAAAGCAGCATGTTTCCTACAAGCACAGCCGGAATGAGGTGGACGGTGAGTACCGCTACC  979

Query 1301  GCTGCGGCACTTGTGAGAAGACCTTCCGCATCGAGAGCGCGCTGGAGTTCCACAACTGCAGGACAGATGACAAG  1374
            ||||.||||..||||.||||||.|||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  980  GCTGTGGCAGCTGTGGGAAGACATTCCGAATGGAGAGTGCACTGGAGTTCCACAACTGTAGGACAGATGACAAG  1053

Query 1375  ACGTTCCAATGTGAGATGTGTTTCAGATTCTTCTCCACCAACAGCAACCTCTCCAAGCACAAGAAGAAGCACGG  1448
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||
Sbjct 1054  ACGTTCCAATGTGAGATGTGTTTCAGATTCTTCTCCACCAACAGCAACCTCTCTAAGCACAAGAAGAAACATGG  1127

Query 1449  CGACAAGAAGTTTGCCTGTGAGGTCTGCAGCAAGATGTTCTACCGCAAGGACGTCATGCTGGACCACCAGCGCC  1522
            .|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||.|.|
Sbjct 1128  GGACAAGAAGTTTGCCTGTGAGGTCTGCAGTAAGATGTTCTACCGCAAGGATGTTATGCTGGACCACCAGAGGC  1201

Query 1523  GGCACCTGGAAGGAGTGCGGCGAGTGAAGCGAGAGGACCTGGAGGCCGGTGGGGAGAACCTGGTCCGTTACAAG  1596
            |.|||.||||.||.||||||||.||||||.||||.|||.||||||||.|.|||||.|.||||||.|||||||||
Sbjct 1202  GACACTTGGATGGTGTGCGGCGGGTGAAGAGAGAAGACTTGGAGGCCAGCGGGGAAAGCCTGGTTCGTTACAAG  1275

Query 1597  AAGGAGCCTTCCGGGTGCCCGGTGTGTGGCAAGGTGTTCTCCTGCCGGAGCAATATGAACAAGCACCTGCTCAC  1670
            |||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 1276  AAGGAACCTTCTGGATGCCCAGTGTGTGGCAAGGTGTTCTCCTGTCGGAGCAACATGAACAAGCACCTGCTGAC  1349

Query 1671  CCACGGCGACAAGAAGTACACCTGCGAGATCTGCGGGCGCAAGTTCTTCCGCGTGGATGTGCTCAGGGACCACA  1744
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||
Sbjct 1350  CCACGGTGACAAGAAGTACACCTGCGAGATCTGTGGGCGCAAGTTCTTCCGAGTGGACGTACTCAGGGACCACA  1423

Query 1745  TCCATGTCCACTTCAAGGACATCGCGTTGATGGATGACCACCAGAGGGAAGAGTTTATCGGCAAGATCGGGATC  1818
            ||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||.||||.|||||.||.|||||.||.||||||
Sbjct 1424  TCCATGTCCACTTCAAGGACATCGCGCTAATGGATGACCACCAGCGGGAGGAGTTCATTGGCAAAATTGGGATC  1497

Query 1819  TCCTCGGAAGAAAACGATGACAATTCTGACGAGAGCGCAGACTCGGAGCCTCACAAGTACAGCTGCAAGCGGTG  1892
            |||||.||.||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1498  TCCTCAGAGGAGAATGATGACAACTCTGATGAGAGCGCAGACTCTGAGCCACACAAGTACAGCTGCAAGAGGTG  1571

Query 1893  CCAGCTCACCTTCGGCCGGGGGAAGGAGTACCTGAAGCACATCATGGAGGTGCACAAGGAGAAGGGCTATGGCT  1966
            |||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||
Sbjct 1572  CCAGCTCACTTTCGGCCGTGGGAAGGAATACCTGAAGCACATCATGGAGGTGCACAAGGAGAAGGGCCACGGCT  1645

Query 1967  GCAGCATCTGCAACCGGCGCTTTGCACTGAAGGCCACCTACCACGCCCACATGGTCATCCACCGTGAAAACCTG  2040
            |||||||||||.||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 1646  GCAGCATCTGCCACCGACGCTTCGCACTCAAGGCCACCTACCATGCCCACATGGTCATCCACCGGGAGAACCTG  1719

Query 2041  CCGGACCCCAACGTGCAGAAGTACATCCACCCCTGCGAGATCTGCGGGCGGATCTTCAACAGCATCGGGAACCT  2114
            ||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||.||||.|||||||||||.||||||.|
Sbjct 1720  CCTGACCCCAACGTGCAGAAGTACATTCACCCCTGTGAGATCTGTGGGAGGATATTCAACAGCATTGGGAACTT  1793

Query 2115  GGAGCGCCACAAGCTCATCCACACAGGTGTGAAGAGCCACGCCTGCGAGCAGTGTGGGAAGTCCTTTGCCAGGA  2188
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1794  GGAGCGCCACAAACTCATCCACACAGGTGTGAAAAGCCACGCCTGTGAGCAGTGTGGGAAGTCCTTTGCCAGGA  1867

Query 2189  AGGACATGCTGAAGGAGCACATGCGTGTGCACGACAACGTCCGCGAGTACCTGTGTGCCGAGTGTGGGAAAGGC  2262
            |||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1868  AGGACATGCTGAAAGAGCACATGCGTGTGCATGACAACATCCGGGAGTACCTGTGCGCCGAGTGTGGGAAAGGT  1941

Query 2263  ATGAAGACCAAGCACGCGCTGCGCCACCACATGAAGCTGCACAAGGGCATCAAGGAGTACGAGTGCAAGGAGTG  2336
            ||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1942  ATGAAGACCAAGCATGCACTGCGCCACCATATGAAGCTGCACAAAGGCATCAAGGAGTATGAGTGCAAGGAATG  2015

Query 2337  CCACCGCAGGTTCGCGCAGAAGGTCAACATGCTCAAGCACTGCAAGCGGCACACGGGGATTAAAGATTTCATGT  2410
            .|||||||.|||.||.|||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||.||.||||||||.|||||||
Sbjct 2016  TCACCGCAAGTTTGCACAGAAGGTCAACATGCTCAAGCACTACAAACGGCACACAGGAATTAAAGACTTCATGT  2089

Query 2411  GTGAATTGTGTGGGAAGACATTCAGCGAGAGGAACACCATGGAGACCCACAAGCTCATCCACACAGTGGGCAAG  2484
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 2090  GTGAATTGTGTGGGAAGACATTCAGTGAGAGGAACACAATGGAGACACACAAGCTCATCCACACAGTAGGCAAG  2163

Query 2485  CAGTGGACGTGCTCCGTGTGCGACAAGAAGTACGTGACCGAGTACATGCTGCAGAAGCACGTTCAGCTCACACA  2558
            ||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||
Sbjct 2164  CAGTGGACTTGTTCCGTGTGTGACAAGAAGTACGTCACAGAGTACATGCTTCAGAAACACGTCCAGCTCACTCA  2237

Query 2559  CGACAAGGTGGAGGCGCAGAGCTGCCAGCTGTGCGGGACCAAGGTGTCCACCAGGGCCTCCATGAGCCGACACA  2632
            .|||||||||||.||.|||||.|||||.||.||.||.|||||.|||||.|||.||||||||||||||.||||.|
Sbjct 2238  TGACAAGGTGGAAGCACAGAGTTGCCAACTATGTGGCACCAAAGTGTCAACCCGGGCCTCCATGAGCAGACATA  2311

Query 2633  TGCGGCGCAAGCACCCCGAGGTGCTCGCGGTGAGGATCGATGACCTGGACCACCTCCCGGAGACCACCACCATC  2706
            ||||.|||||||||||||||||.|||||.||..||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 2312  TGCGACGCAAGCACCCCGAGGTCCTCGCTGTTCGGATTGACGATCTGGACCACCTCCCCGAGACCACCACCATC  2385

Query 2707  GACGCCTCCTCCATTGGCATCGTCCAGCCTGAGCTGACTCTGGAGCAGGAGGATTTGGCCGAAGGGAAGCACGG  2780
            ||.||.||.|||||.|||||.||||||||||.||||...|||||||||||.||..||||.|||||.|||||.||
Sbjct 2386  GATGCATCTTCCATCGGCATTGTCCAGCCTGCGCTGGGCCTGGAGCAGGAAGAACTGGCAGAAGGTAAGCATGG  2459

Query 2781  GAAAGCTGCCAAGCGAAGTCACAAGAGAAAGCAGAAGCCAGAAGAGGAGGCGGGTGCTCCGGTGCCCGAGGACG  2854
            .||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||.|||||..
Sbjct 2460  AAAGGCTGCCAAGCGCAGCCACAAGAGAAAGCAGAAGCCAGAGGAAGAGGCAGGGGCTCCAGTGCCTGAGGATA  2533

Query 2855  CCACCTTCAGCGAATACTCAGAGAAAGAGACGGAGTTCACAGGCAGTGTAGGCGACGAGACCAATTCCGCAGTA  2928
            ||||||||||.||||||.|.||.||.|||.|.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||.|||
Sbjct 2534  CCACCTTCAGTGAATACCCCGAAAAGGAGCCAGAGTTCACAGGCAGTGTGGGTGACGAGACAAATTCTGCTGTA  2607

Query 2929  CAGAGCATTCAGCAGGTAGTGGTGACCCTGGGTGACCCAAATGTGACCACACCATCGAGCTCAGTCGGCTTGAC  3002
            |||||.||.||.|||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||..|.|||||.||||||||.||..|.||
Sbjct 2608  CAGAGTATCCAACAGGTGGTGGTGACCCTAGGGGACCCCAATGTGACTGCTCCATCAAGCTCAGTTGGTCTAAC  2681

Query 3003  CAACATCACCGTGACCCCCATCACCACTGCGGCCGCGACTCAGTTTACCAATCTCCAGCCGGTGGCCGTGGGGC  3076
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||.|..|||||||||||||||.|.|||||.|||||.||.||.|
Sbjct 2682  CAACATCACCGTGACCCCCATCACCACTGCAGCTGGAACTCAGTTTACCAATTTACAGCCAGTGGCTGTTGGAC  2755

Query 3077  ACCTTACCACCCCTGAACGCCAGTTACAGCTGGACAACTCAATCCTGACCGTGACCTTTGATACCGTCAGCGGC  3150
            |.|||||||.||||||.||||||.|||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 2756  ATCTTACCAACCCTGATCGCCAGCTACAGCTAGATAACTCCATCCTGACTGTGACCTTTGATACTGTCAGTGGC  2829

Query 3151  TCTGCCATGTTGCACAACCGCCAAAATGACGTCCAGATCCACCCCCAGCCGGAAGCCTCGAACCCACAGTCTGT  3224
            ||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||.|.|||||.|||||.||
Sbjct 2830  TCCGCCATGTTGCACAACCGGCAAAATGATGTCCAGATCCACCCACAGCCAGAAGCCACAAACCCTCAGTCAGT  2903

Query 3225  GGCCCATTTCATCAACCTGACGACCCTGGTCAACTCCATCACGCCCCTGGGGAGCCAGCTTAGTGACCAGCACC  3298
            ||||||.||.||||||||.||.||.|||||.|||||||||||.|||.||||||.|||.||.|||||.|||||||
Sbjct 2904  GGCCCACTTTATCAACCTTACCACACTGGTAAACTCCATCACACCCTTGGGGAACCAACTCAGTGAGCAGCACC  2977

Query 3299  CGCTCACGTGGCGGGCAGTGCCCCAGACTGACGTCTTGCCACCCCCGCAGCCGCAGGCACCCCCACAGCAGGCG  3372
            |.|||||.|||||.||||||||||||||.||.||..|||..||.||.|||.|.|..|||.||||.|||||||||
Sbjct 2978  CACTCACCTGGCGAGCAGTGCCCCAGACAGATGTGCTGCAGCCGCCACAGGCCCCTGCAGCCCCGCAGCAGGCG  3051

Query 3373  GCCCAGCCCCAGGTGCAGGCGGAGCAGCAGCAGCAGCAGATGTACAGCTAC  3423
            |..||.||||||||.|      ||.|..|||||||||||||||||||||||
Sbjct 3052  GTGCAACCCCAGGTAC------AGAATGAGCAGCAGCAGATGTACAGCTAC  3096