Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12439
• Subject: XM_006522869.3
• Aligned Length: 3455
• Identities: 2922
• Gaps: 43

Alignment

Query    1  ATGGCTGAAGATGGGAGCGAAGAGATCATGTTCATCTGGTGTGAAGACTGCAGCCAGTACCACGACTCCGAATG  74
            ||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||
Sbjct    1  ATGGCTGAAGATGGTAGTGAGGAGATCATGTTTATCTGGTGTGAAGACTGCAGCCAGTACCATGACTCGGAGTG  74

Query   75  TCCCGAGCTGGGCCCAGTGGTCATGGTCAAAGACTCCTTTGTGTTAAGCAGGGCAAGGTCATCCCTTCCTCCCA  148
            |||.||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||.|.||||||||||||||.|||||.||..|.|
Sbjct   75  TCCTGAACTGGGACCTGTGGTCATGGTCAAGGACTCCTTTGTGCTGAGCAGGGCAAGGTCCTCCCTCCCCTCTA  148

Query  149  ACTTGGAGATCAGACGACTGGAAGATGGAGCCGAGGGGGTGTTCGCCATCACTCAGCTCGTCAAGCGGACACAG  222
            ||.||||||||||.||.|||||.||.||.||.||.||.|||||.||..|.||.|||||.||||||||.|||||.
Sbjct  149  ACCTGGAGATCAGGCGCCTGGATGACGGGGCTGAAGGCGTGTTTGCAGTGACCCAGCTAGTCAAGCGCACACAA  222

Query  223  TTCGGTCCCTTTGAGTCCAGGAGGGTCGCCAAATGGGAAAAGGAGTCTGCATTTCCCCTGAAGGTGTTCCAGAA  296
            ||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.||||||||.||.|||||
Sbjct  223  TTTGGTCCGTTTGAGTCCAGGAGAGTCGCCAAGTGGGAGAAAGAGTCGGCATTTCCTCTGAAGGTATTTCAGAA  296

Query  297  GGACGGGCACCCCGTGTGCTTCGACACCTCCAACGAGGATGACTGCAACTGGATGATGCTGGTGCGGCCAGCGG  370
            |||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||..
Sbjct  297  GGACGGGCATCCTGTGTGCTTCGACACTTCCAATGAGGATGACTGCAACTGGATGATGCTAGTGCGACCAGCAC  370

Query  371  CGGAGGCCGAGCACCAGAACCTGACGGCCTACCAGCACGGCAGCGACGTGTACTTCACCACCTCCAGAGACATC  444
            .||||.|.|.|||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.|..|||||.
Sbjct  371  TGGAGCCTGGGCACCAGAACCTGACAGCCTACCAACATGGCAGTGACGTGTATTTCACCACCTCAAAGGACATT  444

Query  445  CCCCCGGGTACCGAGCTGCGCGTGTGGTATGCGGCCTTCTATGCCAAGAAGATGGACAAGCCCATGCTGAAGCA  518
            ||..|.||.||.||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  445  CCTGCAGGCACTGAACTGCGTGTGTGGTATGCTGCCTTTTATGCCAAGAAGATGGACAAGCCCATGCTAAAGCA  518

Query  519  GGCCGGCTCTGGCGTCCACGCTGCAGGCACCCCAGAAAACAGCGCCCCCGTGGAGTCGGAACCCAGCCAGTGGG  592
            ||||.||||..|.||.||.||||||||||||||.||...|||.|.|.|.|||||..|.||.|...||||.||||
Sbjct  519  GGCCTGCTCCAGTGTTCAGGCTGCAGGCACCCCTGAGCCCAGTGTCTCTGTGGAACCTGAGCGTGGCCAATGGG  592

Query  593  CGTGTAAAGTGTGTTCTGCCACCTTCCTGGAGCTGCAGCTCCTCAATGAACATCTGTTGGGCCACTTAGAACAA  666
            .||||||.|||||.||...|||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.||||||||..|.||.|||
Sbjct  593  TGTGTAAGGTGTGCTCCAACACCTTCCTGGAGCTTCAGCTCCTGAACGAGCATCTCTTGGGCCATCTGGAGCAA  666

Query  667  GCCAAAAGCCTTCCTCCAGGCAGCCA-AAGC--GAGGCAGCAGCTCCCGAGAAGGAGCAGGACACACCCCGGGG  737
            |||||||||||.|||.||||..|||| .|||  |||   ||||||.|.||||||||||..||..|||||.||..
Sbjct  667  GCCAAAAGCCTCCCTGCAGGTGGCCAGCAGCATGAG---GCAGCTTCTGAGAAGGAGCCTGATGCACCCAGGAT  737

Query  738  GGAACCCCCTGCAGTGCCCGAGAGCGAGA--------------ATGTTGCCACCAAAGAACAGAAGAAAAAGCC  797
            |||.||.||..|||...||||||||.|||              |||  |.|||||||||.|..|||||||||||
Sbjct  738  GGAGCCTCCCACAGCAGCCGAGAGCAAGAGCATCCAGAGTGTCATG--GTCACCAAAGAGCCAAAGAAAAAGCC  809

Query  798  TCGAAGGGGGAGAAAACCCAAAGTGTCCAAAGCTGAGCAGCCTCTAGTCATCGTGGAAGACAAGGAACCCACAG  871
            ||||||.|||||.||||||||||..|||||.|.||||||||||||.|||||..|..||||||||||.||..|||
Sbjct  810  TCGAAGAGGGAGGAAACCCAAAGCATCCAAGGTTGAGCAGCCTCTGGTCATTATCAAAGACAAGGAGCCTTCAG  883

Query  872  AGCAAGTGGCAGAGATCATTACCGAGGTCCCTCCGGATGAGCCTGTGAGTGCAACGCCAGATGAGCGGATCATG  945
            ||||.||||||||||||||.||.|||.||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct  884  AGCATGTGGCAGAGATCATAACTGAGATCCCCCCAGATGAGCCTGTGAGTGCAACACCAGATGAACGGATCATG  957

Query  946  GAGCTGGTTCTGGGGAAGCTGGCCACCACCACCACTGACACCAGCTCGGTTCCAAAGTTCACCCATCATCAGAA  1019
            |||.|.||..||||||||||||||.||.||||.|.|||..|||||||.||.|||||||||.|.|||||||..|.
Sbjct  958  GAGTTAGTCTTGGGGAAGCTGGCCGCCCCCACAAATGAAGCCAGCTCAGTGCCAAAGTTCCCACATCATCCAAG  1031

Query 1020  TAACACCATCACGCTCAAGAGGAGCTTAATTCTCTCAAGCAGACACGGCATCCGGCGCAAGGTCATCAAACAGC  1093
            .|.||||||..|.|||||||||.||||..||||.||.||||||||.|||.|||||||.|||.||.||...||||
Sbjct 1032  CAGCACCATTGCCCTCAAGAGGGGCTTGGTTCTGTCCAGCAGACATGGCGTCCGGCGGAAGCTCGTCCGTCAGC  1105

Query 1094  TCGGGGAGCACAAGCGGGTTTACCAGTGCAATATCTGCAGCAAGATCTTCCAGAACAGCAGCAACCTGAGCAGG  1167
            |.||.|||||.||.||..|..|.|||||....|.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1106  TGGGTGAGCATAAACGCATCCATCAGTGTGGCACCTGCAGCAAGGTCTTCCAGAACAGCAGCAACCTGAGCCGG  1179

Query 1168  CACGTGCGCTCGCATGGT---------------GACAAGCTGTTTAAGTGCGAAGAGTGTGCAAAATTGTTCAG  1226
            ||||||||||||||.|||               ||||||||||||||.||.||.||.|||.|.|||.|||||||
Sbjct 1180  CACGTGCGCTCGCACGGTGAGTGCGCGCACGGGGACAAGCTGTTTAAATGTGAGGAATGTTCGAAACTGTTCAG  1253

Query 1227  CCGCAAAGAGAGCCTAAAGCAGCACGTTTCCTACAAGCACAGCAGGAACGAGGTGGACGGCGAGTACAGGTACC  1300
            |||.||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||.||||.|||||||||||.||||||.|.||||
Sbjct 1254  CCGTAAGGAAAGTCTAAAGCAGCATGTTTCCTACAAGCACAGCCGGAATGAGGTGGACGGTGAGTACCGCTACC  1327

Query 1301  GCTGCGGCACTTGTGAGAAGACCTTCCGCATCGAGAGCGCGCTGGAGTTCCACAACTGCAGGACAGATGACAAG  1374
            ||||.||||..||||.||||||.|||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1328  GCTGTGGCAGCTGTGGGAAGACATTCCGAATGGAGAGTGCACTGGAGTTCCACAACTGTAGGACAGATGACAAG  1401

Query 1375  ACGTTCCAATGTGAGATGTGTTTCAGATTCTTCTCCACCAACAGCAACCTCTCCAAGCACAAGAAGAAGCACGG  1448
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||
Sbjct 1402  ACGTTCCAATGTGAGATGTGTTTCAGATTCTTCTCCACCAACAGCAACCTCTCTAAGCACAAGAAGAAACATGG  1475

Query 1449  CGACAAGAAGTTTGCCTGTGAGGTCTGCAGCAAGATGTTCTACCGCAAGGACGTCATGCTGGACCACCAGCGCC  1522
            .|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||.|.|
Sbjct 1476  GGACAAGAAGTTTGCCTGTGAGGTCTGCAGTAAGATGTTCTACCGCAAGGATGTTATGCTGGACCACCAGAGGC  1549

Query 1523  GGCACCTGGAAGGAGTGCGGCGAGTGAAGCGAGAGGACCTGGAGGCCGGTGGGGAGAACCTGGTCCGTTACAAG  1596
            |.|||.||||.||.||||||||.||||||.||||.|||.||||||||.|.|||||.|.||||||.|||||||||
Sbjct 1550  GACACTTGGATGGTGTGCGGCGGGTGAAGAGAGAAGACTTGGAGGCCAGCGGGGAAAGCCTGGTTCGTTACAAG  1623

Query 1597  AAGGAGCCTTCCGGGTGCCCGGTGTGTGGCAAGGTGTTCTCCTGCCGGAGCAATATGAACAAGCACCTGCTCAC  1670
            |||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 1624  AAGGAACCTTCTGGATGCCCAGTGTGTGGCAAGGTGTTCTCCTGTCGGAGCAACATGAACAAGCACCTGCTGAC  1697

Query 1671  CCACGGCGACAAGAAGTACACCTGCGAGATCTGCGGGCGCAAGTTCTTCCGCGTGGATGTGCTCAGGGACCACA  1744
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||
Sbjct 1698  CCACGGTGACAAGAAGTACACCTGCGAGATCTGTGGGCGCAAGTTCTTCCGAGTGGACGTACTCAGGGACCACA  1771

Query 1745  TCCATGTCCACTTCAAGGACATCGCGTTGATGGATGACCACCAGAGGGAAGAGTTTATCGGCAAGATCGGGATC  1818
            ||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||.||||.|||||.||.|||||.||.||||||
Sbjct 1772  TCCATGTCCACTTCAAGGACATCGCGCTAATGGATGACCACCAGCGGGAGGAGTTCATTGGCAAAATTGGGATC  1845

Query 1819  TCCTCGGAAGAAAACGATGACAATTCTGACGAGAGCGCAGACTCGGAGCCTCACAAGTACAGCTGCAAGCGGTG  1892
            |||||.||.||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1846  TCCTCAGAGGAGAATGATGACAACTCTGATGAGAGCGCAGACTCTGAGCCACACAAGTACAGCTGCAAGAGGTG  1919

Query 1893  CCAGCTCACCTTCGGCCGGGGGAAGGAGTACCTGAAGCACATCATGGAGGTGCACAAGGAGAAGGGCTATGGCT  1966
            |||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||
Sbjct 1920  CCAGCTCACTTTCGGCCGTGGGAAGGAATACCTGAAGCACATCATGGAGGTGCACAAGGAGAAGGGCCACGGCT  1993

Query 1967  GCAGCATCTGCAACCGGCGCTTTGCACTGAAGGCCACCTACCACGCCCACATGGTCATCCACCGTGAAAACCTG  2040
            |||||||||||.||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 1994  GCAGCATCTGCCACCGACGCTTCGCACTCAAGGCCACCTACCATGCCCACATGGTCATCCACCGGGAGAACCTG  2067

Query 2041  CCGGACCCCAACGTGCAGAAGTACATCCACCCCTGCGAGATCTGCGGGCGGATCTTCAACAGCATCGGGAACCT  2114
            ||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||.||||.|||||||||||.||||||.|
Sbjct 2068  CCTGACCCCAACGTGCAGAAGTACATTCACCCCTGTGAGATCTGTGGGAGGATATTCAACAGCATTGGGAACTT  2141

Query 2115  GGAGCGCCACAAGCTCATCCACACAGGTGTGAAGAGCCACGCCTGCGAGCAGTGTGGGAAGTCCTTTGCCAGGA  2188
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2142  GGAGCGCCACAAACTCATCCACACAGGTGTGAAAAGCCACGCCTGTGAGCAGTGTGGGAAGTCCTTTGCCAGGA  2215

Query 2189  AGGACATGCTGAAGGAGCACATGCGTGTGCACGACAACGTCCGCGAGTACCTGTGTGCCGAGTGTGGGAAAGGC  2262
            |||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 2216  AGGACATGCTGAAAGAGCACATGCGTGTGCATGACAACATCCGGGAGTACCTGTGCGCCGAGTGTGGGAAAGGT  2289

Query 2263  ATGAAGACCAAGCACGCGCTGCGCCACCACATGAAGCTGCACAAGGGCATCAAGGAGTACGAGTGCAAGGAGTG  2336
            ||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 2290  ATGAAGACCAAGCATGCACTGCGCCACCATATGAAGCTGCACAAAGGCATCAAGGAGTATGAGTGCAAGGAATG  2363

Query 2337  CCACCGCAGGTTCGCGCAGAAGGTCAACATGCTCAAGCACTGCAAGCGGCACACGGGGATTAAAGATTTCATGT  2410
            .|||||||.|||.||.|||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||.||.||||||||.|||||||
Sbjct 2364  TCACCGCAAGTTTGCACAGAAGGTCAACATGCTCAAGCACTACAAACGGCACACAGGAATTAAAGACTTCATGT  2437

Query 2411  GTGAATTGTGTGGGAAGACATTCAGCGAGAGGAACACCATGGAGACCCACAAGCTCATCCACACAGTGGGCAAG  2484
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 2438  GTGAATTGTGTGGGAAGACATTCAGTGAGAGGAACACAATGGAGACACACAAGCTCATCCACACAGTAGGCAAG  2511

Query 2485  CAGTGGACGTGCTCCGTGTGCGACAAGAAGTACGTGACCGAGTACATGCTGCAGAAGCACGTTCAGCTCACACA  2558
            ||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||
Sbjct 2512  CAGTGGACTTGTTCCGTGTGTGACAAGAAGTACGTCACAGAGTACATGCTTCAGAAACACGTCCAGCTCACTCA  2585

Query 2559  CGACAAGGTGGAGGCGCAGAGCTGCCAGCTGTGCGGGACCAAGGTGTCCACCAGGGCCTCCATGAGCCGACACA  2632
            .|||||||||||.||.|||||.|||||.||.||.||.|||||.|||||.|||.||||||||||||||.||||.|
Sbjct 2586  TGACAAGGTGGAAGCACAGAGTTGCCAACTATGTGGCACCAAAGTGTCAACCCGGGCCTCCATGAGCAGACATA  2659

Query 2633  TGCGGCGCAAGCACCCCGAGGTGCTCGCGGTGAGGATCGATGACCTGGACCACCTCCCGGAGACCACCACCATC  2706
            ||||.|||||||||||||||||.|||||.||..||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 2660  TGCGACGCAAGCACCCCGAGGTCCTCGCTGTTCGGATTGACGATCTGGACCACCTCCCCGAGACCACCACCATC  2733

Query 2707  GACGCCTCCTCCATTGGCATCGTCCAGCCTGAGCTGACTCTGGAGCAGGAGGATTTGGCCGAAGGGAAGCACGG  2780
            ||.||.||.|||||.|||||.||||||||||.||||...|||||||||||.||..||||.|||||.|||||.||
Sbjct 2734  GATGCATCTTCCATCGGCATTGTCCAGCCTGCGCTGGGCCTGGAGCAGGAAGAACTGGCAGAAGGTAAGCATGG  2807

Query 2781  GAAAGCTGCCAAGCGAAGTCACAAGAGAAAGCAGAAGCCAGAAGAGGAGGCGGGTGCTCCGGTGCCCGAGGACG  2854
            .||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||.|||||..
Sbjct 2808  AAAGGCTGCCAAGCGCAGCCACAAGAGAAAGCAGAAGCCAGAGGAAGAGGCAGGGGCTCCAGTGCCTGAGGATA  2881

Query 2855  CCACCTTCAGCGAATACTCAGAGAAAGAGACGGAGTTCACAGGCAGTGTAGGCGACGAGACCAATTCCGCAGTA  2928
            ||||||||||.||||||.|.||.||.|||.|.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||.|||
Sbjct 2882  CCACCTTCAGTGAATACCCCGAAAAGGAGCCAGAGTTCACAGGCAGTGTGGGTGACGAGACAAATTCTGCTGTA  2955

Query 2929  CAGAGCATTCAGCAGGTAGTGGTGACCCTGGGTGACCCAAATGTGACCACACCATCGAGCTCAGTCGGCTTGAC  3002
            |||||.||.||.|||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||..|.|||||.||||||||.||..|.||
Sbjct 2956  CAGAGTATCCAACAGGTGGTGGTGACCCTAGGGGACCCCAATGTGACTGCTCCATCAAGCTCAGTTGGTCTAAC  3029

Query 3003  CAACATCACCGTGACCCCCATCACCACTGCGGCCGCGACTCAGTTTACCAATCTCCAGCCGGTGGCCGTGGGGC  3076
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||.|..|||||||||||||||.|.|||||.|||||.||.||.|
Sbjct 3030  CAACATCACCGTGACCCCCATCACCACTGCAGCTGGAACTCAGTTTACCAATTTACAGCCAGTGGCTGTTGGAC  3103

Query 3077  ACCTTACCACCCCTGAACGCCAGTTACAGCTGGACAACTCAATCCTGACCGTGACCTTTGATACCGTCAGCGGC  3150
            |.|||||||.||||||.||||||.|||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 3104  ATCTTACCAACCCTGATCGCCAGCTACAGCTAGATAACTCCATCCTGACTGTGACCTTTGATACTGTCAGTGGC  3177

Query 3151  TCTGCCATGTTGCACAACCGCCAAAATGACGTCCAGATCCACCCCCAGCCGGAAGCCTCGAACCCACAGTCTGT  3224
            ||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||.|.|||||.|||||.||
Sbjct 3178  TCCGCCATGTTGCACAACCGGCAAAATGATGTCCAGATCCACCCACAGCCAGAAGCCACAAACCCTCAGTCAGT  3251

Query 3225  GGCCCATTTCATCAACCTGACGACCCTGGTCAACTCCATCACGCCCCTGGGGAGCCAGCTTAGTGACCAGCACC  3298
            ||||||.||.||||||||.||.||.|||||.|||||||||||.|||.||||||.|||.||.|||||.|||||||
Sbjct 3252  GGCCCACTTTATCAACCTTACCACACTGGTAAACTCCATCACACCCTTGGGGAACCAACTCAGTGAGCAGCACC  3325

Query 3299  CGCTCACGTGGCGGGCAGTGCCCCAGACTGACGTCTTGCCACCCCCGCAGCCGCAGGCACCCCCACAGCAGGCG  3372
            |.|||||.|||||.||||||||||||||.||.||..|||..||.||.|||.|.|..|||.||||.|||||||||
Sbjct 3326  CACTCACCTGGCGAGCAGTGCCCCAGACAGATGTGCTGCAGCCGCCACAGGCCCCTGCAGCCCCGCAGCAGGCG  3399

Query 3373  GCCCAGCCCCAGGTGCAGGCGGAGCAGCAGCAGCAGCAGATGTACAGCTAC  3423
            |..||.||||||||.|      ||.|..|||||||||||||||||||||||
Sbjct 3400  GTGCAACCCCAGGTAC------AGAATGAGCAGCAGCAGATGTACAGCTAC  3444