Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_12439
- Subject:
- XM_011246090.2
- Aligned Length:
- 3455
- Identities:
- 2624
- Gaps:
- 391
Alignment
Query 1 ATGGCTGAAGATGGGAGCGAAGAGATCATGTTCATCTGGTGTGAAGACTGCAGCCAGTACCACGACTCCGAATG 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 TCCCGAGCTGGGCCCAGTGGTCATGGTCAAAGACTCCTTTGTGTTAAGCAGGGCAAGGTCATCCCTTCCTCCCA 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 ACTTGGAGATCAGACGACTGGAAGATGGAGCCGAGGGGGTGTTCGCCATCACTCAGCTCGTCAAGCGGACACAG 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 TTCGGTCCCTTTGAGTCCAGGAGGGTCGCCAAATGGGAAAAGGAGTCTGCATTTCCCCTGAAGGTGTTCCAGAA 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 GGACGGGCACCCCGTGTGCTTCGACACCTCCAACGAGGATGACTGCAACTGGATGATGCTGGTGCGGCCAGCGG 370
||||||||.|||||.|||||..
Sbjct 1 ----------------------------------------------------ATGATGCTAGTGCGACCAGCAC 22
Query 371 CGGAGGCCGAGCACCAGAACCTGACGGCCTACCAGCACGGCAGCGACGTGTACTTCACCACCTCCAGAGACATC 444
.||||.|.|.|||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.|..|||||.
Sbjct 23 TGGAGCCTGGGCACCAGAACCTGACAGCCTACCAACATGGCAGTGACGTGTATTTCACCACCTCAAAGGACATT 96
Query 445 CCCCCGGGTACCGAGCTGCGCGTGTGGTATGCGGCCTTCTATGCCAAGAAGATGGACAAGCCCATGCTGAAGCA 518
||..|.||.||.||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 97 CCTGCAGGCACTGAACTGCGTGTGTGGTATGCTGCCTTTTATGCCAAGAAGATGGACAAGCCCATGCTAAAGCA 170
Query 519 GGCCGGCTCTGGCGTCCACGCTGCAGGCACCCCAGAAAACAGCGCCCCCGTGGAGTCGGAACCCAGCCAGTGGG 592
||||.||||..|.||.||.||||||||||||||.||...|||.|.|.|.|||||..|.||.|...||||.||||
Sbjct 171 GGCCTGCTCCAGTGTTCAGGCTGCAGGCACCCCTGAGCCCAGTGTCTCTGTGGAACCTGAGCGTGGCCAATGGG 244
Query 593 CGTGTAAAGTGTGTTCTGCCACCTTCCTGGAGCTGCAGCTCCTCAATGAACATCTGTTGGGCCACTTAGAACAA 666
.||||||.|||||.||...|||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.||||||||..|.||.|||
Sbjct 245 TGTGTAAGGTGTGCTCCAACACCTTCCTGGAGCTTCAGCTCCTGAACGAGCATCTCTTGGGCCATCTGGAGCAA 318
Query 667 GCCAAAAGCCTTCCTCCAGGCAGCCA-AAGC--GAGGCAGCAGCTCCCGAGAAGGAGCAGGACACACCCCGGGG 737
|||||||||||.|||.||||..|||| .||| ||| ||||||.|.||||||||||..||..|||||.||..
Sbjct 319 GCCAAAAGCCTCCCTGCAGGTGGCCAGCAGCATGAG---GCAGCTTCTGAGAAGGAGCCTGATGCACCCAGGAT 389
Query 738 GGAACCCCCTGCAGTGCCCGAGAGCGAGA--------------ATGTTGCCACCAAAGAACAGAAGAAAAAGCC 797
|||.||.||..|||...||||||||.||| ||| |.|||||||||.|..|||||||||||
Sbjct 390 GGAGCCTCCCACAGCAGCCGAGAGCAAGAGCATCCAGAGTGTCATG--GTCACCAAAGAGCCAAAGAAAAAGCC 461
Query 798 TCGAAGGGGGAGAAAACCCAAAGTGTCCAAAGCTGAGCAGCCTCTAGTCATCGTGGAAGACAAGGAACCCACAG 871
||||||.|||||.||||||||||..|||||.|.||||||||||||.|||||..|..||||||||||.||..|||
Sbjct 462 TCGAAGAGGGAGGAAACCCAAAGCATCCAAGGTTGAGCAGCCTCTGGTCATTATCAAAGACAAGGAGCCTTCAG 535
Query 872 AGCAAGTGGCAGAGATCATTACCGAGGTCCCTCCGGATGAGCCTGTGAGTGCAACGCCAGATGAGCGGATCATG 945
||||.||||||||||||||.||.|||.||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 536 AGCATGTGGCAGAGATCATAACTGAGATCCCCCCAGATGAGCCTGTGAGTGCAACACCAGATGAACGGATCATG 609
Query 946 GAGCTGGTTCTGGGGAAGCTGGCCACCACCACCACTGACACCAGCTCGGTTCCAAAGTTCACCCATCATCAGAA 1019
|||.|.||..||||||||||||||.||.||||.|.|||..|||||||.||.|||||||||.|.|||||||..|.
Sbjct 610 GAGTTAGTCTTGGGGAAGCTGGCCGCCCCCACAAATGAAGCCAGCTCAGTGCCAAAGTTCCCACATCATCCAAG 683
Query 1020 TAACACCATCACGCTCAAGAGGAGCTTAATTCTCTCAAGCAGACACGGCATCCGGCGCAAGGTCATCAAACAGC 1093
.|.||||||..|.|||||||||.||||..||||.||.||||||||.|||.|||||||.|||.||.||...||||
Sbjct 684 CAGCACCATTGCCCTCAAGAGGGGCTTGGTTCTGTCCAGCAGACATGGCGTCCGGCGGAAGCTCGTCCGTCAGC 757
Query 1094 TCGGGGAGCACAAGCGGGTTTACCAGTGCAATATCTGCAGCAAGATCTTCCAGAACAGCAGCAACCTGAGCAGG 1167
|.||.|||||.||.||..|..|.|||||....|.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 758 TGGGTGAGCATAAACGCATCCATCAGTGTGGCACCTGCAGCAAGGTCTTCCAGAACAGCAGCAACCTGAGCCGG 831
Query 1168 CACGTGCGCTCGCATGGT---------------GACAAGCTGTTTAAGTGCGAAGAGTGTGCAAAATTGTTCAG 1226
||||||||||||||.||| ||||||||||||||.||.||.||.|||.|.|||.|||||||
Sbjct 832 CACGTGCGCTCGCACGGTGAGTGCGCGCACGGGGACAAGCTGTTTAAATGTGAGGAATGTTCGAAACTGTTCAG 905
Query 1227 CCGCAAAGAGAGCCTAAAGCAGCACGTTTCCTACAAGCACAGCAGGAACGAGGTGGACGGCGAGTACAGGTACC 1300
|||.||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||.||||.|||||||||||.||||||.|.||||
Sbjct 906 CCGTAAGGAAAGTCTAAAGCAGCATGTTTCCTACAAGCACAGCCGGAATGAGGTGGACGGTGAGTACCGCTACC 979
Query 1301 GCTGCGGCACTTGTGAGAAGACCTTCCGCATCGAGAGCGCGCTGGAGTTCCACAACTGCAGGACAGATGACAAG 1374
||||.||||..||||.||||||.|||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 980 GCTGTGGCAGCTGTGGGAAGACATTCCGAATGGAGAGTGCACTGGAGTTCCACAACTGTAGGACAGATGACAAG 1053
Query 1375 ACGTTCCAATGTGAGATGTGTTTCAGATTCTTCTCCACCAACAGCAACCTCTCCAAGCACAAGAAGAAGCACGG 1448
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||
Sbjct 1054 ACGTTCCAATGTGAGATGTGTTTCAGATTCTTCTCCACCAACAGCAACCTCTCTAAGCACAAGAAGAAACATGG 1127
Query 1449 CGACAAGAAGTTTGCCTGTGAGGTCTGCAGCAAGATGTTCTACCGCAAGGACGTCATGCTGGACCACCAGCGCC 1522
.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||.|.|
Sbjct 1128 GGACAAGAAGTTTGCCTGTGAGGTCTGCAGTAAGATGTTCTACCGCAAGGATGTTATGCTGGACCACCAGAGGC 1201
Query 1523 GGCACCTGGAAGGAGTGCGGCGAGTGAAGCGAGAGGACCTGGAGGCCGGTGGGGAGAACCTGGTCCGTTACAAG 1596
|.|||.||||.||.||||||||.||||||.||||.|||.||||||||.|.|||||.|.||||||.|||||||||
Sbjct 1202 GACACTTGGATGGTGTGCGGCGGGTGAAGAGAGAAGACTTGGAGGCCAGCGGGGAAAGCCTGGTTCGTTACAAG 1275
Query 1597 AAGGAGCCTTCCGGGTGCCCGGTGTGTGGCAAGGTGTTCTCCTGCCGGAGCAATATGAACAAGCACCTGCTCAC 1670
|||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 1276 AAGGAACCTTCTGGATGCCCAGTGTGTGGCAAGGTGTTCTCCTGTCGGAGCAACATGAACAAGCACCTGCTGAC 1349
Query 1671 CCACGGCGACAAGAAGTACACCTGCGAGATCTGCGGGCGCAAGTTCTTCCGCGTGGATGTGCTCAGGGACCACA 1744
||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||
Sbjct 1350 CCACGGTGACAAGAAGTACACCTGCGAGATCTGTGGGCGCAAGTTCTTCCGAGTGGACGTACTCAGGGACCACA 1423
Query 1745 TCCATGTCCACTTCAAGGACATCGCGTTGATGGATGACCACCAGAGGGAAGAGTTTATCGGCAAGATCGGGATC 1818
||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||.||||.|||||.||.|||||.||.||||||
Sbjct 1424 TCCATGTCCACTTCAAGGACATCGCGCTAATGGATGACCACCAGCGGGAGGAGTTCATTGGCAAAATTGGGATC 1497
Query 1819 TCCTCGGAAGAAAACGATGACAATTCTGACGAGAGCGCAGACTCGGAGCCTCACAAGTACAGCTGCAAGCGGTG 1892
|||||.||.||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1498 TCCTCAGAGGAGAATGATGACAACTCTGATGAGAGCGCAGACTCTGAGCCACACAAGTACAGCTGCAAGAGGTG 1571
Query 1893 CCAGCTCACCTTCGGCCGGGGGAAGGAGTACCTGAAGCACATCATGGAGGTGCACAAGGAGAAGGGCTATGGCT 1966
|||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||
Sbjct 1572 CCAGCTCACTTTCGGCCGTGGGAAGGAATACCTGAAGCACATCATGGAGGTGCACAAGGAGAAGGGCCACGGCT 1645
Query 1967 GCAGCATCTGCAACCGGCGCTTTGCACTGAAGGCCACCTACCACGCCCACATGGTCATCCACCGTGAAAACCTG 2040
|||||||||||.||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 1646 GCAGCATCTGCCACCGACGCTTCGCACTCAAGGCCACCTACCATGCCCACATGGTCATCCACCGGGAGAACCTG 1719
Query 2041 CCGGACCCCAACGTGCAGAAGTACATCCACCCCTGCGAGATCTGCGGGCGGATCTTCAACAGCATCGGGAACCT 2114
||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||.||||.|||||||||||.||||||.|
Sbjct 1720 CCTGACCCCAACGTGCAGAAGTACATTCACCCCTGTGAGATCTGTGGGAGGATATTCAACAGCATTGGGAACTT 1793
Query 2115 GGAGCGCCACAAGCTCATCCACACAGGTGTGAAGAGCCACGCCTGCGAGCAGTGTGGGAAGTCCTTTGCCAGGA 2188
||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1794 GGAGCGCCACAAACTCATCCACACAGGTGTGAAAAGCCACGCCTGTGAGCAGTGTGGGAAGTCCTTTGCCAGGA 1867
Query 2189 AGGACATGCTGAAGGAGCACATGCGTGTGCACGACAACGTCCGCGAGTACCTGTGTGCCGAGTGTGGGAAAGGC 2262
|||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1868 AGGACATGCTGAAAGAGCACATGCGTGTGCATGACAACATCCGGGAGTACCTGTGCGCCGAGTGTGGGAAAGGT 1941
Query 2263 ATGAAGACCAAGCACGCGCTGCGCCACCACATGAAGCTGCACAAGGGCATCAAGGAGTACGAGTGCAAGGAGTG 2336
||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1942 ATGAAGACCAAGCATGCACTGCGCCACCATATGAAGCTGCACAAAGGCATCAAGGAGTATGAGTGCAAGGAATG 2015
Query 2337 CCACCGCAGGTTCGCGCAGAAGGTCAACATGCTCAAGCACTGCAAGCGGCACACGGGGATTAAAGATTTCATGT 2410
.|||||||.|||.||.|||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||.||.||||||||.|||||||
Sbjct 2016 TCACCGCAAGTTTGCACAGAAGGTCAACATGCTCAAGCACTACAAACGGCACACAGGAATTAAAGACTTCATGT 2089
Query 2411 GTGAATTGTGTGGGAAGACATTCAGCGAGAGGAACACCATGGAGACCCACAAGCTCATCCACACAGTGGGCAAG 2484
|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 2090 GTGAATTGTGTGGGAAGACATTCAGTGAGAGGAACACAATGGAGACACACAAGCTCATCCACACAGTAGGCAAG 2163
Query 2485 CAGTGGACGTGCTCCGTGTGCGACAAGAAGTACGTGACCGAGTACATGCTGCAGAAGCACGTTCAGCTCACACA 2558
||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||
Sbjct 2164 CAGTGGACTTGTTCCGTGTGTGACAAGAAGTACGTCACAGAGTACATGCTTCAGAAACACGTCCAGCTCACTCA 2237
Query 2559 CGACAAGGTGGAGGCGCAGAGCTGCCAGCTGTGCGGGACCAAGGTGTCCACCAGGGCCTCCATGAGCCGACACA 2632
.|||||||||||.||.|||||.|||||.||.||.||.|||||.|||||.|||.||||||||||||||.||||.|
Sbjct 2238 TGACAAGGTGGAAGCACAGAGTTGCCAACTATGTGGCACCAAAGTGTCAACCCGGGCCTCCATGAGCAGACATA 2311
Query 2633 TGCGGCGCAAGCACCCCGAGGTGCTCGCGGTGAGGATCGATGACCTGGACCACCTCCCGGAGACCACCACCATC 2706
||||.|||||||||||||||||.|||||.||..||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 2312 TGCGACGCAAGCACCCCGAGGTCCTCGCTGTTCGGATTGACGATCTGGACCACCTCCCCGAGACCACCACCATC 2385
Query 2707 GACGCCTCCTCCATTGGCATCGTCCAGCCTGAGCTGACTCTGGAGCAGGAGGATTTGGCCGAAGGGAAGCACGG 2780
||.||.||.|||||.|||||.||||||||||.||||...|||||||||||.||..||||.|||||.|||||.||
Sbjct 2386 GATGCATCTTCCATCGGCATTGTCCAGCCTGCGCTGGGCCTGGAGCAGGAAGAACTGGCAGAAGGTAAGCATGG 2459
Query 2781 GAAAGCTGCCAAGCGAAGTCACAAGAGAAAGCAGAAGCCAGAAGAGGAGGCGGGTGCTCCGGTGCCCGAGGACG 2854
.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||.|||||..
Sbjct 2460 AAAGGCTGCCAAGCGCAGCCACAAGAGAAAGCAGAAGCCAGAGGAAGAGGCAGGGGCTCCAGTGCCTGAGGATA 2533
Query 2855 CCACCTTCAGCGAATACTCAGAGAAAGAGACGGAGTTCACAGGCAGTGTAGGCGACGAGACCAATTCCGCAGTA 2928
||||||||||.||||||.|.||.||.|||.|.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||.|||
Sbjct 2534 CCACCTTCAGTGAATACCCCGAAAAGGAGCCAGAGTTCACAGGCAGTGTGGGTGACGAGACAAATTCTGCTGTA 2607
Query 2929 CAGAGCATTCAGCAGGTAGTGGTGACCCTGGGTGACCCAAATGTGACCACACCATCGAGCTCAGTCGGCTTGAC 3002
|||||.||.||.|||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||..|.|||||.||||||||.||..|.||
Sbjct 2608 CAGAGTATCCAACAGGTGGTGGTGACCCTAGGGGACCCCAATGTGACTGCTCCATCAAGCTCAGTTGGTCTAAC 2681
Query 3003 CAACATCACCGTGACCCCCATCACCACTGCGGCCGCGACTCAGTTTACCAATCTCCAGCCGGTGGCCGTGGGGC 3076
||||||||||||||||||||||||||||||.||.|..|||||||||||||||.|.|||||.|||||.||.||.|
Sbjct 2682 CAACATCACCGTGACCCCCATCACCACTGCAGCTGGAACTCAGTTTACCAATTTACAGCCAGTGGCTGTTGGAC 2755
Query 3077 ACCTTACCACCCCTGAACGCCAGTTACAGCTGGACAACTCAATCCTGACCGTGACCTTTGATACCGTCAGCGGC 3150
|.|||||||.||||||.||||||.|||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 2756 ATCTTACCAACCCTGATCGCCAGCTACAGCTAGATAACTCCATCCTGACTGTGACCTTTGATACTGTCAGTGGC 2829
Query 3151 TCTGCCATGTTGCACAACCGCCAAAATGACGTCCAGATCCACCCCCAGCCGGAAGCCTCGAACCCACAGTCTGT 3224
||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||.|.|||||.|||||.||
Sbjct 2830 TCCGCCATGTTGCACAACCGGCAAAATGATGTCCAGATCCACCCACAGCCAGAAGCCACAAACCCTCAGTCAGT 2903
Query 3225 GGCCCATTTCATCAACCTGACGACCCTGGTCAACTCCATCACGCCCCTGGGGAGCCAGCTTAGTGACCAGCACC 3298
||||||.||.||||||||.||.||.|||||.|||||||||||.|||.||||||.|||.||.|||||.|||||||
Sbjct 2904 GGCCCACTTTATCAACCTTACCACACTGGTAAACTCCATCACACCCTTGGGGAACCAACTCAGTGAGCAGCACC 2977
Query 3299 CGCTCACGTGGCGGGCAGTGCCCCAGACTGACGTCTTGCCACCCCCGCAGCCGCAGGCACCCCCACAGCAGGCG 3372
|.|||||.|||||.||||||||||||||.||.||..|||..||.||.|||.|.|..|||.||||.|||||||||
Sbjct 2978 CACTCACCTGGCGAGCAGTGCCCCAGACAGATGTGCTGCAGCCGCCACAGGCCCCTGCAGCCCCGCAGCAGGCG 3051
Query 3373 GCCCAGCCCCAGGTGCAGGCGGAGCAGCAGCAGCAGCAGATGTACAGCTAC 3423
|..||.||||||||.| ||.|..|||||||||||||||||||||||
Sbjct 3052 GTGCAACCCCAGGTAC------AGAATGAGCAGCAGCAGATGTACAGCTAC 3096