Nucleotide Global Alignment
Description
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- ccsbBroadEn_12439
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- XM_011529683.1
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- 4323
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Alignment
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Sbjct 1 ATGCCCCGCCGCCGCCCCCCGGCTTCCGGTGCTGCGCAGTTTCCGGAGCGGATCGCAACCCGGAGTCCGGATCC 74
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Sbjct 149 CATTCGCCGGCTGCGGGCACCGTTGGCGATCGGAGTCAAAACCCGGCTGGATTTCCCGGAGCCGCTCCGGGATC 222
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Sbjct 223 GCCCTGCGCGCCGCCCGCCCGCCGGGGTCTTCGCCGCCCCGGCCCGCGGCCCCGCGGCCCCCGCCGCCGGGCGG 296
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Sbjct 297 CGTCGTCGCCGAGGCCCCAGGGGATGTCGTTATCCCCCGCCCTCGGGTACAGCCCATGCGGGTCGCACGGGGGG 370
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Sbjct 371 GTCCCTGGACCCCCAACCCCGCGTTTAGAGAAGCTGAGTCCTGGTCCCAGATTGGGAACCAGAGGGTCAGTGAG 444
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Sbjct 519 ACGCAATCCTGCCCTACCTCCTGGACCCTTTGCACAAAACTTTTCCTGGGGGAACCAGGAAAATCTGCCCCCAG 592
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Query 137 CCCTTCCTCCCAACTTGGAGATCAGACGACTGGAAGATGGAGCCGAGGGGGTGTTCGCCATCACTCAGCTCGTC 210
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Sbjct 1037 CCCTTCCTCCCAACTTGGAGATCAGACGACTGGAAGATGGAGCCGAGGGGGTGTTCGCCATCACTCAGCTCGTC 1110
Query 211 AAGCGGACACAGTTCGGTCCCTTTGAGTCCAGGAGGGTCGCCAAATGGGAAAAGGAGTCTGCATTTCCCCTGAA 284
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Query 285 GGTGTTCCAGAAGGACGGGCACCCCGTGTGCTTCGACACCTCCAACGAGGATGACTGCAACTGGATGATGCTGG 358
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Query 359 TGCGGCCAGCGGCGGAGGCCGAGCACCAGAACCTGACGGCCTACCAGCACGGCAGCGACGTGTACTTCACCACC 432
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Sbjct 1259 TGCGGCCAGCGGCGGAGGCCGAGCACCAGAACCTGACGGCCTACCAGCACGGCAGCGACGTGTACTTCACCACC 1332
Query 433 TCCAGAGACATCCCCCCGGGTACCGAGCTGCGCGTGTGGTATGCGGCCTTCTATGCCAAGAAGATGGACAAGCC 506
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Sbjct 1333 TCCAGAGACATCCCCCCGGGTACCGAGCTGCGCGTGTGGTATGCGGCCTTCTATGCCAAGAAGATGGACAAGCC 1406
Query 507 CATGCTGAAGCAGGCCGGCTCTGGCGTCCACGCTGCAGGCACCCCAGAAAACAGCGCCCCCGTGGAGTCGGAAC 580
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Sbjct 1407 CATGCTGAAGCAGGCCGGCTCTGGCGTCCACGCTGCAGGCACCCCAGAAAACAGCGCCCCCGTGGAGTCGGAGC 1480
Query 581 CCAGCCAGTGGGCGTGTAAAGTGTGTTCTGCCACCTTCCTGGAGCTGCAGCTCCTCAATGAACATCTGTTGGGC 654
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Sbjct 1481 CCAGCCAGTGGGCGTGTAAAGTGTGTTCTGCCACCTTCCTGGAGCTGCAGCTCCTCAATGAACATCTGTTGGGC 1554
Query 655 CACTTAGAACAAGCCAAAAGCCTTCCTCCAGGCAGCCAAAGCGAGGCAGCAGCTCCCGAGAAGGAGCAGGACAC 728
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Sbjct 1555 CACTTAGAACAAGCCAAAAGCCTTCCTCCAGGCAGCCAAAGCGAGGCAGCAGCTCCCGAGAAGGAGCAGGACAC 1628
Query 729 ACCCCGGGGGGAACCCCCTGCAGTGCCCGAGAGCGAGAATGTTGCCACCAAAGAACAGAAGAAAAAGCCTCGAA 802
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Sbjct 1629 ACCCCGGGGGGAACCCCCTGCAGTGCCCGAGAGCGAGAATGTTGCCACCAAAGAACAGAAGAAAAAGCCTCGAA 1702
Query 803 GGGGGAGAAAACCCAAAGTGTCCAAAGCTGAGCAGCCTCTAGTCATCGTGGAAGACAAGGAACCCACAGAGCAA 876
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Sbjct 1703 GGGGGAGAAAACCCAAAGTGTCCAAAGCTGAGCAGCCTCTAGTCATCGTGGAAGACAAGGAACCCACAGAGCAA 1776
Query 877 GTGGCAGAGATCATTACCGAGGTCCCTCCGGATGAGCCTGTGAGTGCAACGCCAGATGAGCGGATCATGGAGCT 950
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Sbjct 1777 GTGGCAGAGATCATTACCGAGGTCCCTCCGGATGAGCCTGTGAGTGCAACGCCAGATGAGCGGATCATGGAGCT 1850
Query 951 GGTTCTGGGGAAGCTGGCCACCACCACCACTGACACCAGCTCGGTTCCAAAGTTCACCCATCATCAGAATAACA 1024
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Sbjct 1851 GGTTCTGGGGAAGCTGGCCACCACCACCACTGACACCAGCTCGGTTCCAAAGTTCACCCATCATCAGAATAACA 1924
Query 1025 CCATCACGCTCAAGAGGAGCTTAATTCTCTCAAGCAGACACGGCATCCGGCGCAAGGTCATCAAACAGCTCGGG 1098
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Sbjct 1925 CCATCACGCTCAAGAGGAGCTTAATTCTCTCAAGCAGACACGGCATCCGGCGCAAGCTCATCAAACAGCTCGGG 1998
Query 1099 GAGCACAAGCGGGTTTACCAGTGCAATATCTGCAGCAAGATCTTCCAGAACAGCAGCAACCTGAGCAGGCACGT 1172
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Sbjct 1999 GAGCACAAGCGGGTTTACCAGTGCAATATCTGCAGCAAGATCTTCCAGAACAGCAGCAACCTGAGCAGGCACGT 2072
Query 1173 GCGCTCGCATGGTGACAAGCTGTTTAAGTGCGAAGAGTGTGCAAAATTGTTCAGCCGCAAAGAGAGCCTAAAGC 1246
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Sbjct 2073 GCGCTCGCATGGTGACAAGCTGTTTAAGTGCGAAGAGTGTGCAAAATTGTTCAGCCGCAAAGAGAGCCTAAAGC 2146
Query 1247 AGCACGTTTCCTACAAGCACAGCAGGAACGAGGTGGACGGCGAGTACAGGTACCGCTGCGGCACTTGTGAGAAG 1320
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Sbjct 2147 AGCACGTTTCCTACAAGCACAGCAGGAACGAGGTGGACGGCGAGTACAGGTACCGCTGCGGCACTTGTGAGAAG 2220
Query 1321 ACCTTCCGCATCGAGAGCGCGCTGGAGTTCCACAACTGCAGGACAGATGACAAGACGTTCCAATGTGAGATGTG 1394
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Sbjct 2221 ACCTTCCGCATCGAGAGCGCGCTGGAGTTCCACAACTGCAGGACAGATGACAAGACGTTCCAATGTGAGATGTG 2294
Query 1395 TTTCAGATTCTTCTCCACCAACAGCAACCTCTCCAAGCACAAGAAGAAGCACGGCGACAAGAAGTTTGCCTGTG 1468
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Sbjct 2295 TTTCAGATTCTTCTCCACCAACAGCAACCTCTCCAAGCACAAGAAGAAGCACGGCGACAAGAAGTTTGCCTGTG 2368
Query 1469 AGGTCTGCAGCAAGATGTTCTACCGCAAGGACGTCATGCTGGACCACCAGCGCCGGCACCTGGAAGGAGTGCGG 1542
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Sbjct 2369 AGGTCTGCAGCAAGATGTTCTACCGCAAGGACGTCATGCTGGACCACCAGCGCCGGCACCTGGAAGGAGTGCGG 2442
Query 1543 CGAGTGAAGCGAGAGGACCTGGAGGCCGGTGGGGAGAACCTGGTCCGTTACAAGAAGGAGCCTTCCGGGTGCCC 1616
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Sbjct 2443 CGAGTGAAGCGAGAGGACCTGGAGGCCGGTGGGGAGAACCTGGTCCGTTACAAGAAGGAGCCTTCCGGGTGCCC 2516
Query 1617 GGTGTGTGGCAAGGTGTTCTCCTGCCGGAGCAATATGAACAAGCACCTGCTCACCCACGGCGACAAGAAGTACA 1690
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Sbjct 2517 GGTGTGTGGCAAGGTGTTCTCCTGCCGGAGCAATATGAACAAGCACCTGCTCACCCACGGCGACAAGAAGTACA 2590
Query 1691 CCTGCGAGATCTGCGGGCGCAAGTTCTTCCGCGTGGATGTGCTCAGGGACCACATCCATGTCCACTTCAAGGAC 1764
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Sbjct 2591 CCTGCGAGATCTGCGGGCGCAAGTTCTTCCGCGTGGATGTGCTCAGGGACCACATCCATGTCCACTTCAAGGAC 2664
Query 1765 ATCGCGTTGATGGATGACCACCAGAGGGAAGAGTTTATCGGCAAGATCGGGATCTCCTCGGAAGAAAACGATGA 1838
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Sbjct 2665 ATCGCGTTGATGGATGACCACCAGAGGGAAGAGTTTATCGGCAAGATCGGGATCTCCTCGGAAGAAAACGATGA 2738
Query 1839 CAATTCTGACGAGAGCGCAGACTCGGAGCCTCACAAGTACAGCTGCAAGCGGTGCCAGCTCACCTTCGGCCGGG 1912
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Query 1913 GGAAGGAGTACCTGAAGCACATCATGGAGGTGCACAAGGAGAAGGGCTATGGCTGCAGCATCTGCAACCGGCGC 1986
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Sbjct 2813 GGAAGGAGTACCTGAAGCACATCATGGAGGTGCACAAGGAGAAGGGCTATGGCTGCAGCATCTGCAACCGGCGC 2886
Query 1987 TTTGCACTGAAGGCCACCTACCACGCCCACATGGTCATCCACCGTGAAAACCTGCCGGACCCCAACGTGCAGAA 2060
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Sbjct 2887 TTTGCACTGAAGGCCACCTACCACGCCCACATGGTCATCCACCGTGAAAACCTGCCGGACCCCAACGTGCAGAA 2960
Query 2061 GTACATCCACCCCTGCGAGATCTGCGGGCGGATCTTCAACAGCATCGGGAACCTGGAGCGCCACAAGCTCATCC 2134
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Sbjct 2961 GTACATCCACCCCTGCGAGATCTGCGGGCGGATCTTCAACAGCATCGGGAACCTGGAGCGCCACAAGCTCATCC 3034
Query 2135 ACACAGGTGTGAAGAGCCACGCCTGCGAGCAGTGTGGGAAGTCCTTTGCCAGGAAGGACATGCTGAAGGAGCAC 2208
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Sbjct 3035 ACACAGGTGTGAAGAGCCACGCCTGCGAGCAGTGTGGGAAGTCCTTTGCCAGGAAGGACATGCTGAAGGAGCAC 3108
Query 2209 ATGCGTGTGCACGACAACGTCCGCGAGTACCTGTGTGCCGAGTGTGGGAAAGGCATGAAGACCAAGCACGCGCT 2282
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Sbjct 3109 ATGCGTGTGCACGACAATGTCCGCGAGTACCTGTGTGCCGAGTGTGGGAAAGGCATGAAGACCAAGCACGCGCT 3182
Query 2283 GCGCCACCACATGAAGCTGCACAAGGGCATCAAGGAGTACGAGTGCAAGGAGTGCCACCGCAGGTTCGCGCAGA 2356
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Sbjct 3183 GCGCCACCACATGAAGCTGCACAAGGGCATCAAGGAGTACGAGTGCAAGGAGTGCCACCGCAGGTTCGCGCAGA 3256
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Sbjct 3331 TTCAGCGAGAGGAACACCATGGAGACCCACAAGCTCATCCACACAGTGGGCAAGCAGTGGACGTGCTCCGTGTG 3404
Query 2505 CGACAAGAAGTACGTGACCGAGTACATGCTGCAGAAGCACGTTCAGCTCACACACGACAAGGTGGAGGCGCAGA 2578
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Sbjct 3405 CGACAAGAAGTACGTGACCGAGTACATGCTGCAGAAGCACGTTCAGCTCACACACGACAAGGTGGAGGCGCAGA 3478
Query 2579 GCTGCCAGCTGTGCGGGACCAAGGTGTCCACCAGGGCCTCCATGAGCCGACACATGCGGCGCAAGCACCCCGAG 2652
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Sbjct 3479 GCTGCCAGCTGTGCGGGACCAAGGTGTCCACCAGGGCCTCCATGAGCCGACACATGCGGCGCAAGCACCCCGAG 3552
Query 2653 GTGCTCGCGGTGAGGATCGATGACCTGGACCACCTCCCGGAGACCACCACCATCGACGCCTCCTCCATTGGCAT 2726
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Sbjct 3553 GTGCTCGCGGTGAGGATCGATGACCTGGACCACCTCCCGGAGACCACCACCATCGACGCCTCCTCCATTGGCAT 3626
Query 2727 CGTCCAGCCTGAGCTGACTCTGGAGCAGGAGGATTTGGCCGAAGGGAAGCACGGGAAAGCTGCCAAGCGAAGTC 2800
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Sbjct 3627 CGTCCAGCCTGAGCTGACTCTGGAGCAGGAGGATTTGGCCGAAGGGAAGCACGGGAAAGCTGCCAAGCGAAGTC 3700
Query 2801 ACAAGAGAAAGCAGAAGCCAGAAGAGGAGGCGGGTGCTCCGGTGCCCGAGGACGCCACCTTCAGCGAATACTCA 2874
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Sbjct 3701 ACAAGAGAAAGCAGAAGCCAGAAGAGGAGGCGGGTGCTCCGGTGCCCGAGGACGCCACCTTCAGCGAATACTCA 3774
Query 2875 GAGAAAGAGACGGAGTTCACAGGCAGTGTAGGCGACGAGACCAATTCCGCAGTACAGAGCATTCAGCAGGTAGT 2948
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Sbjct 3775 GAGAAAGAGACGGAGTTCACAGGCAGTGTAGGCGACGAGACCAATTCCGCAGTACAGAGCATTCAGCAGGTAGT 3848
Query 2949 GGTGACCCTGGGTGACCCAAATGTGACCACACCATCGAGCTCAGTCGGCTTGACCAACATCACCGTGACCCCCA 3022
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Sbjct 3849 GGTGACCCTGGGTGACCCAAATGTGACCACACCATCGAGCTCAGTCGGCTTAACCAACATCACCGTGACCCCCA 3922
Query 3023 TCACCACTGCGGCCGCGACTCAGTTTACCAATCTCCAGCCGGTGGCCGTGGGGCACCTTACCACCCCTGAACGC 3096
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Sbjct 3923 TCACCACTGCGGCCGCGACTCAGTTTACCAATCTCCAGCCGGTGGCCGTGGGGCACCTTACCACCCCTGAACGC 3996
Query 3097 CAGTTACAGCTGGACAACTCAATCCTGACCGTGACCTTTGATACCGTCAGCGGCTCTGCCATGTTGCACAACCG 3170
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Sbjct 3997 CAGTTACAGCTGGACAACTCAATCCTGACCGTGACCTTTGATACCGTCAGCGGCTCTGCCATGTTGCACAACCG 4070
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Sbjct 4071 CCAAAATGACGTCCAGATCCACCCCCAGCCGGAAGCCTCGAACCCACAGTCTGTGGCCCATTTCATCAACCTGA 4144
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Sbjct 4145 CGACCCTGGTCAACTCCATCACGCCCCTGGGGAGCCAGCTTAGTGACCAGCACCCGCTCACGTGGCGGGCAGTG 4218
Query 3319 CCCCAGACTGACGTCTTGCCACCCCCGCAGCCGCAGGCACCCCCACAGCAGGCGGCCCAGCCCCAGGTGCAGGC 3392
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Sbjct 4219 CCCCAGACTGACGTCTTGCCACCCTCGCAGCCGCAGGCACCCCCACAGCAGGCGGCCCAGCCCCAGGTGCAGGC 4292
Query 3393 GGAGCAGCAGCAGCAGCAGATGTACAGCTAC 3423
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Sbjct 4293 GGAGCAGCAGCAGCAGCAGATGTACAGCTAC 4323
