Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12439
• Subject: XM_017028426.1
• Aligned Length: 3423
• Identities: 3418
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGCTGAAGATGGGAGCGAAGAGATCATGTTCATCTGGTGTGAAGACTGCAGCCAGTACCACGACTCCGAATG  74
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Sbjct    1  ATGGCTGAAGATGGGAGCGAAGAGATCATGTTCATCTGGTGTGAAGACTGCAGCCAGTACCACGACTCCGAATG  74

Query   75  TCCCGAGCTGGGCCCAGTGGTCATGGTCAAAGACTCCTTTGTGTTAAGCAGGGCAAGGTCATCCCTTCCTCCCA  148
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Sbjct   75  TCCCGAGCTGGGCCCAGTGGTCATGGTCAAAGACTCCTTTGTGTTAAGCAGGGCAAGGTCATCCCTTCCTCCCA  148

Query  149  ACTTGGAGATCAGACGACTGGAAGATGGAGCCGAGGGGGTGTTCGCCATCACTCAGCTCGTCAAGCGGACACAG  222
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Sbjct  149  ACTTGGAGATCAGACGACTGGAAGATGGAGCCGAGGGGGTGTTCGCCATCACTCAGCTCGTCAAGCGGACACAG  222

Query  223  TTCGGTCCCTTTGAGTCCAGGAGGGTCGCCAAATGGGAAAAGGAGTCTGCATTTCCCCTGAAGGTGTTCCAGAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTCGGTCCCTTTGAGTCCAGGAGGGTCGCCAAATGGGAAAAGGAGTCTGCATTTCCCCTGAAGGTGTTCCAGAA  296

Query  297  GGACGGGCACCCCGTGTGCTTCGACACCTCCAACGAGGATGACTGCAACTGGATGATGCTGGTGCGGCCAGCGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGACGGGCACCCCGTGTGCTTCGACACCTCCAACGAGGATGACTGCAACTGGATGATGCTGGTGCGGCCAGCGG  370

Query  371  CGGAGGCCGAGCACCAGAACCTGACGGCCTACCAGCACGGCAGCGACGTGTACTTCACCACCTCCAGAGACATC  444
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Sbjct  371  CGGAGGCCGAGCACCAGAACCTGACGGCCTACCAGCACGGCAGCGACGTGTACTTCACCACCTCCAGAGACATC  444

Query  445  CCCCCGGGTACCGAGCTGCGCGTGTGGTATGCGGCCTTCTATGCCAAGAAGATGGACAAGCCCATGCTGAAGCA  518
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Sbjct  445  CCCCCGGGTACCGAGCTGCGCGTGTGGTATGCGGCCTTCTATGCCAAGAAGATGGACAAGCCCATGCTGAAGCA  518

Query  519  GGCCGGCTCTGGCGTCCACGCTGCAGGCACCCCAGAAAACAGCGCCCCCGTGGAGTCGGAACCCAGCCAGTGGG  592
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Sbjct  519  GGCCGGCTCTGGCGTCCACGCTGCAGGCACCCCAGAAAACAGCGCCCCCGTGGAGTCGGAGCCCAGCCAGTGGG  592

Query  593  CGTGTAAAGTGTGTTCTGCCACCTTCCTGGAGCTGCAGCTCCTCAATGAACATCTGTTGGGCCACTTAGAACAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CGTGTAAAGTGTGTTCTGCCACCTTCCTGGAGCTGCAGCTCCTCAATGAACATCTGTTGGGCCACTTAGAACAA  666

Query  667  GCCAAAAGCCTTCCTCCAGGCAGCCAAAGCGAGGCAGCAGCTCCCGAGAAGGAGCAGGACACACCCCGGGGGGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GCCAAAAGCCTTCCTCCAGGCAGCCAAAGCGAGGCAGCAGCTCCCGAGAAGGAGCAGGACACACCCCGGGGGGA  740

Query  741  ACCCCCTGCAGTGCCCGAGAGCGAGAATGTTGCCACCAAAGAACAGAAGAAAAAGCCTCGAAGGGGGAGAAAAC  814
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Sbjct  741  ACCCCCTGCAGTGCCCGAGAGCGAGAATGTTGCCACCAAAGAACAGAAGAAAAAGCCTCGAAGGGGGAGAAAAC  814

Query  815  CCAAAGTGTCCAAAGCTGAGCAGCCTCTAGTCATCGTGGAAGACAAGGAACCCACAGAGCAAGTGGCAGAGATC  888
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Sbjct  815  CCAAAGTGTCCAAAGCTGAGCAGCCTCTAGTCATCGTGGAAGACAAGGAACCCACAGAGCAAGTGGCAGAGATC  888

Query  889  ATTACCGAGGTCCCTCCGGATGAGCCTGTGAGTGCAACGCCAGATGAGCGGATCATGGAGCTGGTTCTGGGGAA  962
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Sbjct  889  ATTACCGAGGTCCCTCCGGATGAGCCTGTGAGTGCAACGCCAGATGAGCGGATCATGGAGCTGGTTCTGGGGAA  962

Query  963  GCTGGCCACCACCACCACTGACACCAGCTCGGTTCCAAAGTTCACCCATCATCAGAATAACACCATCACGCTCA  1036
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Sbjct  963  GCTGGCCACCACCACCACTGACACCAGCTCGGTTCCAAAGTTCACCCATCATCAGAATAACACCATCACGCTCA  1036

Query 1037  AGAGGAGCTTAATTCTCTCAAGCAGACACGGCATCCGGCGCAAGGTCATCAAACAGCTCGGGGAGCACAAGCGG  1110
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Sbjct 1037  AGAGGAGCTTAATTCTCTCAAGCAGACACGGCATCCGGCGCAAGCTCATCAAACAGCTCGGGGAGCACAAGCGG  1110

Query 1111  GTTTACCAGTGCAATATCTGCAGCAAGATCTTCCAGAACAGCAGCAACCTGAGCAGGCACGTGCGCTCGCATGG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GTTTACCAGTGCAATATCTGCAGCAAGATCTTCCAGAACAGCAGCAACCTGAGCAGGCACGTGCGCTCGCATGG  1184

Query 1185  TGACAAGCTGTTTAAGTGCGAAGAGTGTGCAAAATTGTTCAGCCGCAAAGAGAGCCTAAAGCAGCACGTTTCCT  1258
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Sbjct 1185  TGACAAGCTGTTTAAGTGCGAAGAGTGTGCAAAATTGTTCAGCCGCAAAGAGAGCCTAAAGCAGCACGTTTCCT  1258

Query 1259  ACAAGCACAGCAGGAACGAGGTGGACGGCGAGTACAGGTACCGCTGCGGCACTTGTGAGAAGACCTTCCGCATC  1332
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Sbjct 1259  ACAAGCACAGCAGGAACGAGGTGGACGGCGAGTACAGGTACCGCTGCGGCACTTGTGAGAAGACCTTCCGCATC  1332

Query 1333  GAGAGCGCGCTGGAGTTCCACAACTGCAGGACAGATGACAAGACGTTCCAATGTGAGATGTGTTTCAGATTCTT  1406
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Sbjct 1333  GAGAGCGCGCTGGAGTTCCACAACTGCAGGACAGATGACAAGACGTTCCAATGTGAGATGTGTTTCAGATTCTT  1406

Query 1407  CTCCACCAACAGCAACCTCTCCAAGCACAAGAAGAAGCACGGCGACAAGAAGTTTGCCTGTGAGGTCTGCAGCA  1480
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Sbjct 1407  CTCCACCAACAGCAACCTCTCCAAGCACAAGAAGAAGCACGGCGACAAGAAGTTTGCCTGTGAGGTCTGCAGCA  1480

Query 1481  AGATGTTCTACCGCAAGGACGTCATGCTGGACCACCAGCGCCGGCACCTGGAAGGAGTGCGGCGAGTGAAGCGA  1554
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Sbjct 1481  AGATGTTCTACCGCAAGGACGTCATGCTGGACCACCAGCGCCGGCACCTGGAAGGAGTGCGGCGAGTGAAGCGA  1554

Query 1555  GAGGACCTGGAGGCCGGTGGGGAGAACCTGGTCCGTTACAAGAAGGAGCCTTCCGGGTGCCCGGTGTGTGGCAA  1628
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Sbjct 1555  GAGGACCTGGAGGCCGGTGGGGAGAACCTGGTCCGTTACAAGAAGGAGCCTTCCGGGTGCCCGGTGTGTGGCAA  1628

Query 1629  GGTGTTCTCCTGCCGGAGCAATATGAACAAGCACCTGCTCACCCACGGCGACAAGAAGTACACCTGCGAGATCT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GGTGTTCTCCTGCCGGAGCAATATGAACAAGCACCTGCTCACCCACGGCGACAAGAAGTACACCTGCGAGATCT  1702

Query 1703  GCGGGCGCAAGTTCTTCCGCGTGGATGTGCTCAGGGACCACATCCATGTCCACTTCAAGGACATCGCGTTGATG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GCGGGCGCAAGTTCTTCCGCGTGGATGTGCTCAGGGACCACATCCATGTCCACTTCAAGGACATCGCGTTGATG  1776

Query 1777  GATGACCACCAGAGGGAAGAGTTTATCGGCAAGATCGGGATCTCCTCGGAAGAAAACGATGACAATTCTGACGA  1850
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Sbjct 1777  GATGACCACCAGAGGGAAGAGTTTATCGGCAAGATCGGGATCTCCTCGGAAGAAAACGATGACAATTCTGACGA  1850

Query 1851  GAGCGCAGACTCGGAGCCTCACAAGTACAGCTGCAAGCGGTGCCAGCTCACCTTCGGCCGGGGGAAGGAGTACC  1924
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Sbjct 1851  GAGCGCAGACTCGGAGCCTCACAAGTACAGCTGCAAGCGGTGCCAGCTCACCTTCGGCCGGGGGAAGGAGTACC  1924

Query 1925  TGAAGCACATCATGGAGGTGCACAAGGAGAAGGGCTATGGCTGCAGCATCTGCAACCGGCGCTTTGCACTGAAG  1998
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Sbjct 1925  TGAAGCACATCATGGAGGTGCACAAGGAGAAGGGCTATGGCTGCAGCATCTGCAACCGGCGCTTTGCACTGAAG  1998

Query 1999  GCCACCTACCACGCCCACATGGTCATCCACCGTGAAAACCTGCCGGACCCCAACGTGCAGAAGTACATCCACCC  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GCCACCTACCACGCCCACATGGTCATCCACCGTGAAAACCTGCCGGACCCCAACGTGCAGAAGTACATCCACCC  2072

Query 2073  CTGCGAGATCTGCGGGCGGATCTTCAACAGCATCGGGAACCTGGAGCGCCACAAGCTCATCCACACAGGTGTGA  2146
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Sbjct 2073  CTGCGAGATCTGCGGGCGGATCTTCAACAGCATCGGGAACCTGGAGCGCCACAAGCTCATCCACACAGGTGTGA  2146

Query 2147  AGAGCCACGCCTGCGAGCAGTGTGGGAAGTCCTTTGCCAGGAAGGACATGCTGAAGGAGCACATGCGTGTGCAC  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  AGAGCCACGCCTGCGAGCAGTGTGGGAAGTCCTTTGCCAGGAAGGACATGCTGAAGGAGCACATGCGTGTGCAC  2220

Query 2221  GACAACGTCCGCGAGTACCTGTGTGCCGAGTGTGGGAAAGGCATGAAGACCAAGCACGCGCTGCGCCACCACAT  2294
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  GACAATGTCCGCGAGTACCTGTGTGCCGAGTGTGGGAAAGGCATGAAGACCAAGCACGCGCTGCGCCACCACAT  2294

Query 2295  GAAGCTGCACAAGGGCATCAAGGAGTACGAGTGCAAGGAGTGCCACCGCAGGTTCGCGCAGAAGGTCAACATGC  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  GAAGCTGCACAAGGGCATCAAGGAGTACGAGTGCAAGGAGTGCCACCGCAGGTTCGCGCAGAAGGTCAACATGC  2368

Query 2369  TCAAGCACTGCAAGCGGCACACGGGGATTAAAGATTTCATGTGTGAATTGTGTGGGAAGACATTCAGCGAGAGG  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  TCAAGCACTGCAAGCGGCACACGGGGATTAAAGATTTCATGTGTGAATTGTGTGGGAAGACATTCAGCGAGAGG  2442

Query 2443  AACACCATGGAGACCCACAAGCTCATCCACACAGTGGGCAAGCAGTGGACGTGCTCCGTGTGCGACAAGAAGTA  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  AACACCATGGAGACCCACAAGCTCATCCACACAGTGGGCAAGCAGTGGACGTGCTCCGTGTGCGACAAGAAGTA  2516

Query 2517  CGTGACCGAGTACATGCTGCAGAAGCACGTTCAGCTCACACACGACAAGGTGGAGGCGCAGAGCTGCCAGCTGT  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  CGTGACCGAGTACATGCTGCAGAAGCACGTTCAGCTCACACACGACAAGGTGGAGGCGCAGAGCTGCCAGCTGT  2590

Query 2591  GCGGGACCAAGGTGTCCACCAGGGCCTCCATGAGCCGACACATGCGGCGCAAGCACCCCGAGGTGCTCGCGGTG  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  GCGGGACCAAGGTGTCCACCAGGGCCTCCATGAGCCGACACATGCGGCGCAAGCACCCCGAGGTGCTCGCGGTG  2664

Query 2665  AGGATCGATGACCTGGACCACCTCCCGGAGACCACCACCATCGACGCCTCCTCCATTGGCATCGTCCAGCCTGA  2738
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Sbjct 2665  AGGATCGATGACCTGGACCACCTCCCGGAGACCACCACCATCGACGCCTCCTCCATTGGCATCGTCCAGCCTGA  2738

Query 2739  GCTGACTCTGGAGCAGGAGGATTTGGCCGAAGGGAAGCACGGGAAAGCTGCCAAGCGAAGTCACAAGAGAAAGC  2812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  GCTGACTCTGGAGCAGGAGGATTTGGCCGAAGGGAAGCACGGGAAAGCTGCCAAGCGAAGTCACAAGAGAAAGC  2812

Query 2813  AGAAGCCAGAAGAGGAGGCGGGTGCTCCGGTGCCCGAGGACGCCACCTTCAGCGAATACTCAGAGAAAGAGACG  2886
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Sbjct 2813  AGAAGCCAGAAGAGGAGGCGGGTGCTCCGGTGCCCGAGGACGCCACCTTCAGCGAATACTCAGAGAAAGAGACG  2886

Query 2887  GAGTTCACAGGCAGTGTAGGCGACGAGACCAATTCCGCAGTACAGAGCATTCAGCAGGTAGTGGTGACCCTGGG  2960
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Sbjct 2887  GAGTTCACAGGCAGTGTAGGCGACGAGACCAATTCCGCAGTACAGAGCATTCAGCAGGTAGTGGTGACCCTGGG  2960

Query 2961  TGACCCAAATGTGACCACACCATCGAGCTCAGTCGGCTTGACCAACATCACCGTGACCCCCATCACCACTGCGG  3034
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961  TGACCCAAATGTGACCACACCATCGAGCTCAGTCGGCTTAACCAACATCACCGTGACCCCCATCACCACTGCGG  3034

Query 3035  CCGCGACTCAGTTTACCAATCTCCAGCCGGTGGCCGTGGGGCACCTTACCACCCCTGAACGCCAGTTACAGCTG  3108
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Sbjct 3035  CCGCGACTCAGTTTACCAATCTCCAGCCGGTGGCCGTGGGGCACCTTACCACCCCTGAACGCCAGTTACAGCTG  3108

Query 3109  GACAACTCAATCCTGACCGTGACCTTTGATACCGTCAGCGGCTCTGCCATGTTGCACAACCGCCAAAATGACGT  3182
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109  GACAACTCAATCCTGACCGTGACCTTTGATACCGTCAGCGGCTCTGCCATGTTGCACAACCGCCAAAATGACGT  3182

Query 3183  CCAGATCCACCCCCAGCCGGAAGCCTCGAACCCACAGTCTGTGGCCCATTTCATCAACCTGACGACCCTGGTCA  3256
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183  CCAGATCCACCCCCAGCCGGAAGCCTCGAACCCACAGTCTGTGGCCCATTTCATCAACCTGACGACCCTGGTCA  3256

Query 3257  ACTCCATCACGCCCCTGGGGAGCCAGCTTAGTGACCAGCACCCGCTCACGTGGCGGGCAGTGCCCCAGACTGAC  3330
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257  ACTCCATCACGCCCCTGGGGAGCCAGCTTAGTGACCAGCACCCGCTCACGTGGCGGGCAGTGCCCCAGACTGAC  3330

Query 3331  GTCTTGCCACCCCCGCAGCCGCAGGCACCCCCACAGCAGGCGGCCCAGCCCCAGGTGCAGGCGGAGCAGCAGCA  3404
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3331  GTCTTGCCACCCTCGCAGCCGCAGGCACCCCCACAGCAGGCGGCCCAGCCCCAGGTGCAGGCGGAGCAGCAGCA  3404

Query 3405  GCAGCAGATGTACAGCTAC  3423
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Sbjct 3405  GCAGCAGATGTACAGCTAC  3423