Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12559
• Subject: NM_001286810.1
• Aligned Length: 1158
• Identities: 662
• Gaps: 495

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCTCAGTCGCTCACACAGGTCAGTGCTGACAGTTGCTTGTGAACAAACTGAAGTTCTGCTTTTTGACCCTAT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  ATCTTCAAAGCACATAAAAACACTTTCTGAAGCTCATGAAGACTGTGTAAATAATATCAGATTTCTTGATAACC  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  GGCTGTTTGCTACCTGCTCTGATGACACTACAATAGCACTATGGGATCTGAGAAAATTGAACACCAAAGTATGC  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  ACTTTACATGGTCACACTAGCTGGGTGAAGAACATCGAATATGATACTAATACAAGACTCTTAGTAACATCAGG  296

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  297  ATTTGATGGAAATGTCATTATTTGGGACACTAACAGGTATACAGAAGATGGGTGTCCACATAAGAAATTCTTTC  370

Query    1  --------------ATGCGAATGAGGTTAACACCAGATTGTTCCAAAATGTTGATTTCAACGTCCTCTGGATAT  60
                          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACACACGTTTTCTCATGCGAATGAGGTTAACACCAGATTGTTCCAAAATGTTGATTTCAACGTCCTCTGGATAT  444

Query   61  CTCTTAATTTTGCATGACCTTGACTTAACTAACTCTTTAGAAGTAGGCAGCTATCCCATTTTAAGAGCAAGAAG  134
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTCTTAATTTTGCATGACCTTGACTTAACTAAGTCTTTAGAAGTAGGCAGCTATCCCATTTTAAGAGCAAGAAG  518

Query  135  AACTACTTCAAGTTC-----------------------------------------------------------  149
            |||||||||||||||                                                           
Sbjct  519  AACTACTTCAAGTTCAGATTTGACCACTTCATCAAGTTCATCTGGTCCTAGAGTTTCTGGCTCACCTTGTCATC  592

Query  150  ----------------------------------------------------AGGAGTTTCACCACGAAATAGT  171
                                                                ||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATAGTGATTCTAATTCTTCTGAGAAACACATGTCACGAGCCTCTCAAAGAGAAGGAGTTTCACCACGAAATAGT  666

Query  172  CTTGAAGTCGTAACCCCTGAAGTTCTTGGTGAGAGTGACCACGGAAACTGCATCACGTCCTTACAGCTGCACCC  245
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTTGAAGTCGTAACCCCTGAAGTTCTTGGTGAGAGTGACCACGGAAACTGCATCACGTCCTTACAGCTGCACCC  740

Query  246  AAAAGGCTGGGCCACTCTTCTTCGGTGCTCAAGCAACAGTGATGATGAGGAGTGTACTTGTGTCTATGAATTCC  319
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AAAAGGCTGGGCCACTCTTCTTCGGTGCTCAAGCAACAGTGATGATGAGGAGTGTACTTGTGTCTATGAATTCC  814

Query  320  AAGAAGGAGCTCCAGTGCGACCTGTCTCACCTCGCTGTTCTCTACGACTGACTCATTACATTGAAGAAGCCAAT  393
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAGAAGGAGCTCCAGTGCGACCTGTCTCACCTCGCTGTTCTCTACGACTGACTCATTACATTGAAGAAGCCAAT  888

Query  394  GTAGGCAGGGGTTACATCAAAGAACTTTGCTTCAGCCCCGATGGACGAATGATTTCTTCCCCACATGGCTATGG  467
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GTAGGCAGGGGTTACATCAAAGAACTTTGCTTCAGCCCCGATGGACGAATGATTTCTTCCCCACATGGCTATGG  962

Query  468  GATTCGCTTGTTGGGATTTGACAAACAGTGCAGTGAACTTGTTGACTGCTTGCCCAAAGAAGCCAGTCCCCTGC  541
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GATTCGCTTGTTGGGATTTGACAAACAGTGCAGTGAACTTGTTGACTGCTTGCCCAAAGAAGCCAGTCCCCTGC  1036

Query  542  GGGTGATCCGTTCTCTGTACTCTCATAATGATGTGGTACTGACAACAAAGTTCTCTCCAACACATTGTCAGATT  615
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GGGTGATCCGTTCTCTGTACTCTCATAATGATGTGGTACTGACAACAAAGTTCTCTCCAACACATTGTCAGATT  1110

Query  616  GCCTCAGGGTGCCTTAGTGGACGGGTTTCTTTGTATCAGCCAAAGTTT  663
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCCTCAGGGTGCCTTAGTGGACGGGTTTCTTTGTATCAGCCAAAGTTT  1158