Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12574
• Subject: NM_001045530.2
• Aligned Length: 1206
• Identities: 905
• Gaps: 156

Alignment

Query    1  ATGGAT----CG--------------------CTACAACGT-CAC--CAC-CTCC--------------AAGCA  32
            ||||||    ||                    ||...|||| |||  ||| ||.|              ||||.
Sbjct    1  ATGGATGAGCCGTGGTGGGAAGGGCGCGTCGCCTCGGACGTACACTGCACTCTGCGCGAGAAGGAACTGAAGCT  74

Query   33  GCTCTAC--ACCGTGGCCGTCTCCTGCCTCCTGCTTGCAAACGGAG----------TTT-----CGCTCTTATC  89
            || |.||  .|||| |||..||||...||||||     ||   |||          |||     |..|||    
Sbjct   75  GC-CCACCTTCCGT-GCCCACTCCCCGCTCCTG-----AA---GAGCCGTCGATTCTTTGTAGACATTCT----  134

Query   90  GCCCAGGCTGAAGTGCAG----TGGCATGATCTCAGCTCAT------TGCAACCT--CCACCTCCCAGGTTCAA  151
            |.||..|||||   ||||    ||.|   |||||.||.|.|      .|| ||||  |||.||.||        
Sbjct  135  GACCCTGCTGA---GCAGACACTGCC---ATCTCTGCCCCTCGGCCCGGC-ACCTGGCCATCTACC--------  193

Query  152  GCAATTCT---CCTGCTTCAGCGCCC----CACC--CCCCACCCACACCGCCCCAAGTAGCTG-AGACT-----  210
                ||||   || .|||||..|.||    ||.|  |.||||        |.|||||.||||| |.|||     
Sbjct  194  ----TTCTGGACC-ACTTCATGGACCAGTACAACATCACCAC--------CTCCAAGCAGCTGTATACTGTGGC  254

Query  211  -------------------ACAGGTAAGTTCGAGGATCGGGAAGACCACGTCCCCAAGTTGGAGCAAATAAACA  265
                               .||.|||||||.||.||..|||||||||.|||.||.||.||||||||.|||||||
Sbjct  255  TGTCTCCTGCCTCCTGCTGGCAAGTAAGTTTGAAGACAGGGAAGACCGCGTGCCTAAATTGGAGCAGATAAACA  328

Query  266  GCACGAGGATCCTGAGCAGCCAGAACTTCACCCTCACCAAGAAGGAGCTGCTGAGCACAGAGCTGCTGCTCCTG  339
            ..||.|||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||.||.|||||||||
Sbjct  329  ATACAAGGATCCTGAGCAGCCAAAACTTCTCCCTCACCAAGAAGGAGCTGCTGACCACAGAACTTCTGCTCCTG  402

Query  340  GAGGCCTTCAGCTGGAACCTCTGCCTGCCCACGCCTGCCCACTTCCTGGACTACTACCTCTTGGCCTCCGTCAG  413
            |||||.|||||||||.||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  403  GAGGCTTTCAGCTGGGACCTTTGCCTGCCCACGCCCGCCCACTTTCTGGACTACTACCTCTTGGCCTCCATCAG  476

Query  414  CCAGAAGGACCACCACTGCCACACCTGGCCCACCACCTGCCCCCGCAAGACCAAAGAGTGCCTCAAGGAGTATG  487
            ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  477  CCAGAAGGACCACCACTGCCACGCCTGGCCCACCACCTGCCTCCGAAAGACCAAAGAGTGCCTCAAGGAGTATG  550

Query  488  CCCATTACTTCCTAGAGGTCACCCTGCAAGATCACATATTCTACAAATTCCAGCCTTCTGTGGTCGCTGCGGCC  561
            |.||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||
Sbjct  551  CTCACTACTTCCTAGAAGTTACCCTGCAAGATCATATATTTTACAAATTCCAGCCTTCCGTGGTTGCTGCAGCC  624

Query  562  TGTGTTGGGGCCTCCAGGATTTGCCTGCAGCTTTCTCCCTACTGGACCAGAGACCTGCAGAGGATCTCAAGCTA  635
            ||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||.||||||||.||||.|||||
Sbjct  625  TGTGTTGGGGCCTCCAGGATCTGCCTTCAGCTGTCTCCCTACTGGACCAGAGACTTGCAGAGGGTCTCGAGCTA  698

Query  636  TTCCCTGGAGCACCTCAGCACGTGTATTGAAATCCTGCTGGTAGTGTATGACAACGTCCTCAAGGATGCCGTAG  709
            .|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||..||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct  699  CTCCCTAGAGCATCTCAGCACGTGTATCGAAATCCTGCTGGTAGCCTATGACAATGTCCTCAAGGATGCCGTTG  772

Query  710  CCGTCAAGAGCCAGGCCTTGGCAATGGTGCCCGGCACACCCCCCACCCCCACTCAAGTGCTGTTCCAGCCACCA  783
            |.||||||||||||.|..||||.||||||||.|||.||.|..|..|.|||.|.||||||||||||||.||.||.
Sbjct  773  CAGTCAAGAGCCAGACGCTGGCCATGGTGCCGGGCTCATCATCAGCTCCCGCCCAAGTGCTGTTCCAACCGCCC  846

Query  784  GCCTACCCGGCCCTCGGCCAGCCAGCG---ACCACCCTGGCACAGTTCCAGACCCCCGTGCAGGACCTATGCTT  854
            .||||||||.|.|||.||||||||.||   ||.||.||.||.||||||||||..||.|.|||||||.|.|||||
Sbjct  847  ACCTACCCGACTCTCAGCCAGCCACCGCCAACAACTCTAGCCCAGTTCCAGAGTCCAGCGCAGGACTTGTGCTT  920

Query  855  GGCCTATCGGGACTCCTTGCAGGCCCACCGTTCAGGGAGCCTGCTCTCGGGGAGTACA--GGCTCATCCCTCCA  926
            |||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||| .|||| |||  ||..||||||||||
Sbjct  921  GGCATATCGGGACTCGTTGCAGGCCCACCGTTCAGGGGGCCTGCTCTC-AGGAG-ACACTGGTCCATCCCTCCA  992

Query  927  CACCCCGTA-CCAACCGCTGCAGCCCTTGGATATGTGTCCCGTGCCCGTCCCTGCATCCCTTAGCATGCATATG  999
            |||.||.|| |||||| ||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  993  CACGCCATACCCAACC-CTCCAGCCCTTGGATATGTGTCCTGTGCCCGTCCCTGCATCCCTTAGCATGCAGATG  1065

Query 1000  GCCATTGCAGCTGAGCCCAGGCACTGCCTCGCCACCACCTATGGAAGCAGCTACTTCAGTGGGAGCCACATGTT  1073
            |||||.||||||||.||||||||||||||..|..||.||||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||
Sbjct 1066  GCCATAGCAGCTGAACCCAGGCACTGCCTTACGGCCTCCTACGGAAGCAGCTACTTCAGCGGCAGCCATATGTT  1139

Query 1074  CCCCACCGGCTGCTTTGACAGA  1095
            |||..|.|||||.||.|||||.
Sbjct 1140  CCCTGCAGGCTGTTTCGACAGC  1161