Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_12574
- Subject:
- NM_024565.7
- Aligned Length:
- 1305
- Identities:
- 1095
- Gaps:
- 210
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGATGGATGAGCCGTGGTGGGAAGGGCGCGTCGCCTCGGACGTCCACTGCACCCTGCGCGAGAAGGAACTGAA 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GCTGCCCACCTTCCGAGCCCACTCCCCACTCCTGAAGAGCCGCCGGTTCTTCGTGGACATCCTGACCCTGCTGA 148
Query 1 --------------------------------------------------------------ATGGATCGCTAC 12
||||||||||||
Sbjct 149 GCAGCCACTGCCAGCTCTGCCCTGCAGCCCGGCACCTGGCCGTCTACCTGCTGGACCACTTCATGGATCGCTAC 222
Query 13 AACGTCACCACCTCCAAGCAGCTCTACACCGTGGCCGTCTCCTGCCTCCTGCTTGCAAACGGAGTTTCGCTCTT 86
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AACGTCACCACCTCCAAGCAGCTCTACACCGTGGCCGTCTCCTGCCTCCTGCTTGCAAACGGAGTTTCGCTCTT 296
Query 87 ATCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGCATGATCTCAGCTCATTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTC 160
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 ATCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGCATGATCTCAGCTCATTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTC 370
Query 161 CTGCTTCAGCGCCCCACCCCCCACCCACACCGCCCCAAGTAGCTGAGACTACAGGTAAGTTCGAGGATCGGGAA 234
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CTGCTTCAGCGCCCCACCCCCCACCCACACCGCCCCAAGTAGCTGAGACTACAGGTAAGTTCGAGGATCGGGAA 444
Query 235 GACCACGTCCCCAAGTTGGAGCAAATAAACAGCACGAGGATCCTGAGCAGCCAGAACTTCACCCTCACCAAGAA 308
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GACCACGTCCCCAAGTTGGAGCAAATAAACAGCACGAGGATCCTGAGCAGCCAGAACTTCACCCTCACCAAGAA 518
Query 309 GGAGCTGCTGAGCACAGAGCTGCTGCTCCTGGAGGCCTTCAGCTGGAACCTCTGCCTGCCCACGCCTGCCCACT 382
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GGAGCTGCTGAGCACAGAGCTGCTGCTCCTGGAGGCCTTCAGCTGGAACCTCTGCCTGCCCACGCCTGCCCACT 592
Query 383 TCCTGGACTACTACCTCTTGGCCTCCGTCAGCCAGAAGGACCACCACTGCCACACCTGGCCCACCACCTGCCCC 456
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TCCTGGACTACTACCTCTTGGCCTCCGTCAGCCAGAAGGACCACCACTGCCACACCTGGCCCACCACCTGCCCC 666
Query 457 CGCAAGACCAAAGAGTGCCTCAAGGAGTATGCCCATTACTTCCTAGAGGTCACCCTGCAAGATCACATATTCTA 530
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CGCAAGACCAAAGAGTGCCTCAAGGAGTATGCCCATTACTTCCTAGAGGTCACCCTGCAAGATCACATATTCTA 740
Query 531 CAAATTCCAGCCTTCTGTGGTCGCTGCGGCCTGTGTTGGGGCCTCCAGGATTTGCCTGCAGCTTTCTCCCTACT 604
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CAAATTCCAGCCTTCTGTGGTCGCTGCGGCCTGTGTTGGGGCCTCCAGGATTTGCCTGCAGCTTTCTCCCTACT 814
Query 605 GGACCAGAGACCTGCAGAGGATCTCAAGCTATTCCCTGGAGCACCTCAGCACGTGTATTGAAATCCTGCTGGTA 678
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GGACCAGAGACCTGCAGAGGATCTCAAGCTATTCCCTGGAGCACCTCAGCACGTGTATTGAAATCCTGCTGGTA 888
Query 679 GTGTATGACAACGTCCTCAAGGATGCCGTAGCCGTCAAGAGCCAGGCCTTGGCAATGGTGCCCGGCACACCCCC 752
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GTGTATGACAACGTCCTCAAGGATGCCGTAGCCGTCAAGAGCCAGGCCTTGGCAATGGTGCCCGGCACACCCCC 962
Query 753 CACCCCCACTCAAGTGCTGTTCCAGCCACCAGCCTACCCGGCCCTCGGCCAGCCAGCGACCACCCTGGCACAGT 826
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CACCCCCACTCAAGTGCTGTTCCAGCCACCAGCCTACCCGGCCCTCGGCCAGCCAGCGACCACCCTGGCACAGT 1036
Query 827 TCCAGACCCCCGTGCAGGACCTATGCTTGGCCTATCGGGACTCCTTGCAGGCCCACCGTTCAGGGAGCCTGCTC 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TCCAGACCCCCGTGCAGGACCTATGCTTGGCCTATCGGGACTCCTTGCAGGCCCACCGTTCAGGGAGCCTGCTC 1110
Query 901 TCGGGGAGTACAGGCTCATCCCTCCACACCCCGTACCAACCGCTGCAGCCCTTGGATATGTGTCCCGTGCCCGT 974
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TCGGGGAGTACAGGCTCATCCCTCCACACCCCGTACCAACCGCTGCAGCCCTTGGATATGTGTCCCGTGCCCGT 1184
Query 975 CCCTGCATCCCTTAGCATGCATATGGCCATTGCAGCTGAGCCCAGGCACTGCCTCGCCACCACCTATGGAAGCA 1048
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CCCTGCATCCCTTAGCATGCATATGGCCATTGCAGCTGAGCCCAGGCACTGCCTCGCCACCACCTATGGAAGCA 1258
Query 1049 GCTACTTCAGTGGGAGCCACATGTTCCCCACCGGCTGCTTTGACAGA 1095
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GCTACTTCAGTGGGAGCCACATGTTCCCCACCGGCTGCTTTGACAGA 1305