Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12574
• Subject: XM_017009848.1
• Aligned Length: 1095
• Identities: 951
• Gaps: 144

Alignment

Query    1  ATGGATCGCTACAACGTCACCACCTCCAAGCAGCTCTACACCGTGGCCGTCTCCTGCCTCCTGCTTGCAAACGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
Sbjct    1  ATGGATCGCTACAACGTCACCACCTCCAAGCAGCTCTACACCGTGGCCGTCTCCTGCCTCCTGCTTGCAA----  70

Query   75  AGTTTCGCTCTTATCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGCATGATCTCAGCTCATTGCAACCTCCACCTCCCAGGTT  148
                                                                                      
Sbjct   71  --------------------------------------------------------------------------  70

Query  149  CAAGCAATTCTCCTGCTTCAGCGCCCCACCCCCCACCCACACCGCCCCAAGTAGCTGAGACTACAGGTAAGTTC  222
                                                                              ||||||||
Sbjct   71  ------------------------------------------------------------------GTAAGTTC  78

Query  223  GAGGATCGGGAAGACCACGTCCCCAAGTTGGAGCAAATAAACAGCACGAGGATCCTGAGCAGCCAGAACTTCAC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   79  GAGGATCGGGAAGACCACGTCCCCAAGTTGGAGCAAATAAACAGCACGAGGATCCTGAGCAGCCAGAACTTCAC  152

Query  297  CCTCACCAAGAAGGAGCTGCTGAGCACAGAGCTGCTGCTCCTGGAGGCCTTCAGCTGGAACCTCTGCCTGCCCA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  153  CCTCACCAAGAAGGAGCTGCTGAGCACAGAGCTGCTGCTCCTGGAGGCCTTCAGCTGGAACCTCTGCCTGCCCA  226

Query  371  CGCCTGCCCACTTCCTGGACTACTACCTCTTGGCCTCCGTCAGCCAGAAGGACCACCACTGCCACACCTGGCCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  227  CGCCTGCCCACTTCCTGGACTACTACCTCTTGGCCTCCGTCAGCCAGAAGGACCACCACTGCCACACCTGGCCC  300

Query  445  ACCACCTGCCCCCGCAAGACCAAAGAGTGCCTCAAGGAGTATGCCCATTACTTCCTAGAGGTCACCCTGCAAGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  ACCACCTGCCCCCGCAAGACCAAAGAGTGCCTCAAGGAGTATGCCCATTACTTCCTAGAGGTCACCCTGCAAGA  374

Query  519  TCACATATTCTACAAATTCCAGCCTTCTGTGGTCGCTGCGGCCTGTGTTGGGGCCTCCAGGATTTGCCTGCAGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  375  TCACATATTCTACAAATTCCAGCCTTCTGTGGTCGCTGCGGCCTGTGTTGGGGCCTCCAGGATTTGCCTGCAGC  448

Query  593  TTTCTCCCTACTGGACCAGAGACCTGCAGAGGATCTCAAGCTATTCCCTGGAGCACCTCAGCACGTGTATTGAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  449  TTTCTCCCTACTGGACCAGAGACCTGCAGAGGATCTCAAGCTATTCCCTGGAGCACCTCAGCACGTGTATTGAA  522

Query  667  ATCCTGCTGGTAGTGTATGACAACGTCCTCAAGGATGCCGTAGCCGTCAAGAGCCAGGCCTTGGCAATGGTGCC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  523  ATCCTGCTGGTAGTGTATGACAACGTCCTCAAGGATGCCGTAGCCGTCAAGAGCCAGGCCTTGGCAATGGTGCC  596

Query  741  CGGCACACCCCCCACCCCCACTCAAGTGCTGTTCCAGCCACCAGCCTACCCGGCCCTCGGCCAGCCAGCGACCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  597  CGGCACACCCCCCACCCCCACTCAAGTGCTGTTCCAGCCACCAGCCTACCCGGCCCTCGGCCAGCCAGCGACCA  670

Query  815  CCCTGGCACAGTTCCAGACCCCCGTGCAGGACCTATGCTTGGCCTATCGGGACTCCTTGCAGGCCCACCGTTCA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  671  CCCTGGCACAGTTCCAGACCCCCGTGCAGGACCTATGCTTGGCCTATCGGGACTCCTTGCAGGCCCACCGTTCA  744

Query  889  GGGAGCCTGCTCTCGGGGAGTACAGGCTCATCCCTCCACACCCCGTACCAACCGCTGCAGCCCTTGGATATGTG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  745  GGGAGCCTGCTCTCGGGGAGTACAGGCTCATCCCTCCACACCCCGTACCAACCGCTGCAGCCCTTGGATATGTG  818

Query  963  TCCCGTGCCCGTCCCTGCATCCCTTAGCATGCATATGGCCATTGCAGCTGAGCCCAGGCACTGCCTCGCCACCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  819  TCCCGTGCCCGTCCCTGCATCCCTTAGCATGCATATGGCCATTGCAGCTGAGCCCAGGCACTGCCTCGCCACCA  892

Query 1037  CCTATGGAAGCAGCTACTTCAGTGGGAGCCACATGTTCCCCACCGGCTGCTTTGACAGA  1095
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  893  CCTATGGAAGCAGCTACTTCAGTGGGAGCCACATGTTCCCCACCGGCTGCTTTGACAGA  951