Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_12614
- Subject:
- XM_006517470.3
- Aligned Length:
- 2382
- Identities:
- 1450
- Gaps:
- 774
Alignment
Query 1 ATGCTAGACAGCTGCAAGCTGAAAAGTGCCTGCAATTTGCCATTTATTTGTAATAAGAAAATAATAAACACTGC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 TGGAACCAGTAATGCAGAAGTCCCCTTGGCTGATCCCGGAATGTACCAGCTGGACATTACATTAAGAAGGGGTC 148
|||||||||.||||.||.|||.||||||||||||
Sbjct 1 ----------------------------------------ATGTACCAGTTGGATATCACACTAAGAAGGGGTC 34
Query 149 AAAGTTTAGCTGCTCGAGATCGAGGAGGGACGAGTGATCCATATGTGAAGTTTAAAATCGGAGGAAAAGAAGTT 222
|||||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||.|||||||||||
Sbjct 35 AAAGTTTAGCTGCCCGTGATCGAGGAGGGACAAGCGATCCGTATGTGAAGTTTAAAATTGGAAGAAAAGAAGTT 108
Query 223 TTTAGAAGTAAGATAATACACAAGAACCTCAACCCTGTGTGGGAAGAAAAAGCTTGTATTCTGGTTGATCATCT 296
||||||||.||.||.||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||..|.||..||||.|||||
Sbjct 109 TTTAGAAGCAAAATTATCCACAAGAACCTAAATCCTGTGTGGGAGGAAAAGGCTTGCGTGCTCATTGACCATCT 182
Query 297 TAGGGAGCCATTGTATATAAAGGTATTTGACTATGATTTTGGACTACAGGATGACTTTATGGGCTCAGCCTTTC 370
|||.||||||.|.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 183 TAGAGAGCCACTATATATCAAGGTATTTGACTATGATTTTGGACTGCAAGATGACTTTATGGGCTCAGCCTTTC 256
Query 371 TGGATCTGACACAATTGGAGTTAAACAGGCCCACAGATGTGACCCTTACTCTGAAAGATCCTCATTATCCTGAC 444
|.|||||.||.||.|||||||||||||||.||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 257 TTGATCTCACTCAGTTGGAGTTAAACAGGTCCACAGATGTTACCCTAACTCTGAAAGACCCCCATTATCCTGAC 330
Query 445 CATGATCTTGGAATCATTTTGCTCTCAGTCATCCTTACCCCTAAAGAAGGAGAGTCCAGGGATGTG-------- 510
|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||...||||||||||
Sbjct 331 CATGACCTTGGAATCATTTTGCTGTCAGTCATCCTTACGCCTAAGGAAGGTGAACACAGGGATGTGCAGAGTTC 404
Query 511 ----------------------------------------ACAATGCTAATGAGGAAGAGTTGGAAAAGATCAA 544
||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 405 AATACACAGCTTTCTTCCTTGGAGAATTTGTGACATAAAAACAATGCTAATGAGGAAGAGTTGGAAAAGATCCA 478
Query 545 GTAAGGAACTTTCAGAAAATGAAGTGGTTGGATCTTATTTCTCTGTGAAGTCTCTCTTTTGGAGGACGTGCGGC 618
||||||||||.|||||||||||||||.||||||.|.|.|||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 479 GTAAGGAACTCTCAGAAAATGAAGTGTTTGGATTTCACTTCTCTGTGCAGTCTTTCTTTTGGAGG--------- 543
Query 619 AGGCCAGCTCTTCCTGTCCTGGGCTTCTGCAGAGCAGAGCTTCAGAATCCTTATTGCAAAAATGTACAATTTCA 692
|||||
Sbjct 544 ---------------------------------------------------------------------TTTCA 548
Query 693 GACCCAAAGTTTACGCCTATCAGACCTACACAGAAAATCGCATCTTTGGAGAGGAATAGTCAGCATCACCTTGA 766
||||||||||||||||||.||.||||..|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 549 GACCCAAAGTTTACGCCTGTCCGACCAGCACAGGAAATCACACCTTTGGAGAGGAATAGTCAGCATCACCTTGA 622
Query 767 TTGAAGGGAGAGACCTCAAGGCCATGGATTCCAACGGGTTGAGCGATCCCTACGTGAAGTTCCGGCTTGGGCAT 840
||||.||..||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 623 TTGAGGGTCGAGATCTCAAAGCAATGGATTCCAATGGGTTGAGTGATCCATATGTGAAGTTCCGGCTTGGCCAT 696
Query 841 CAGAAGTACAAGAGCAAGATTATGCCAAAAACGTTGAATCCTCAGTGGAGGGAACAATTTGATTTTCACCTTTA 914
||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||
Sbjct 697 CAGAAGTACAAGAGCAAGATTATGCCCAAAACTTTGAACCCTCAGTGGAGGGAGCAATTTGATTTCCATCTCTA 770
Query 915 TGAAGAAAGAGGAGGAGTCATTGATATCACTGCATGGGACAAAGATGCTGGGAAAAGGGATGATTTCATTGGCA 988
||||||||||||.||..||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|
Sbjct 771 TGAAGAAAGAGGTGGGATCATGGACATCACTGCCTGGGACAAAGATGCTGGGAAAAGAGATGACTTTATTGGAA 844
Query 989 GGTGCCAGGTCGACCTGTCAGCCCTCAGTAGGGAACAGACGCACAAGCTGGAGTTGCAGCTGGAAGAGGGTGAG 1062
||||||||||.||||||||..|||||||||||||.||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 845 GGTGCCAGGTTGACCTGTCTTCCCTCAGTAGGGAGCAAACTCACAAGCTGGAGTTACATCTGGAAGAGGGTGAG 918
Query 1063 GGACACCTGGTGCTGCTGGTCACTCTGACAGCATCAGCCACAGTCAGCATCTCTGACCTGTCTGTCAACTCCCT 1136
||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||.|.|||||||||||.||||||||.|||.|
Sbjct 919 GGCCACCTGGTTCTGCTTGTCACTCTGACAGCCTCGGCCACAGTCTGTATCTCTGACCTCTCTGTCAATTCCAT 992
Query 1137 GGAGGACCAGAAGGAACGAGAGGAGATATTAAAGAAATATAGCCCATTGAGGATATTTCACAACCTGAAAGATG 1210
|||||||||||||||.||.||.|||||||||||||.||||||||||.|||||||||||.|||||||.|||||.|
Sbjct 993 GGAGGACCAGAAGGAGCGGGAAGAGATATTAAAGAGATATAGCCCACTGAGGATATTTAACAACCTAAAAGACG 1066
Query 1211 TGGGATTTCTCCAGGTGAAAGTCATCAGAGCGGAAGGGTTAATGGCTGCCGACGTCACTGGAAAAAGTGACCCA 1284
|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||.|||||.||.||||||||.|||
Sbjct 1067 TGGGATTTCTCCAGGTGAAAGTCATCAGAGCAGAAGGTTTGATGGCTGCAGATGTCACAGGTAAAAGTGATCCA 1140
Query 1285 TTTTGTGTGGTAGAACTGAACAACGATAGACTGCTAACACATACTGTCTACAAAAATCTCAATCCTGAGTGGAA 1358
||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1141 TTTTGTGTAGTAGAACTGAACAATGATAGGCTGCTAACACACACTGTGTACAAAAACCTCAATCCTGAGTGGAA 1214
Query 1359 TAAAGTCTTCACGTTCAACATTAAAGATATCCATTCAGTTCTTGAAGTGACAGTTTATGATGAAGATCGGGATC 1432
.|||||.|||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 1215 CAAAGTGTTCACATTTAACATTAAAGACATTCATTCAGTTCTTGAAGTGACAGTTTATGATGAAGATCGTGACC 1288
Query 1433 GAAGTGCTGACTTTCTGGGCAAAGTTGCTATACCATTGCTGTCTATTCAAAATGGTGAACAGAAAGCCTACGTC 1506
|.|||||.|||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1289 GGAGTGCCGACTTTCTGGGCAGAGTCGCTATACCATTGCTGTCTATTCAAAATGGTGAACAGAAAGCCTACGTC 1362
Query 1507 TTGAAAAACAAGCAGCTGACAGGGCCAACAAAGGGGGTCATCTATCTTGAAATAGATGTGATTTTTAATGCTGT 1580
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1363 TTGAAAAACAAGCAGCTGACAGGGCCAACAAAGGGGGTCATCTATCTTGAAATAGATGTGATTTTTAATGCTGT 1436
Query 1581 GAAAGCCAGCTTACGAACATTAATACCCAAAGAACAGAAGTACATTGAAGAGGAAAACAGACTCTCTAAACAGC 1654
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1437 GAAAGCCAGCTTACGAACATTAATACCCAAAGAACGGAAGTACATTGAAGAGGAAAACAGACTCTCTAAACAGC 1510
Query 1655 TGCTACTAAGAAACTTTATCAGAATGAAACGTTGTGTCATGGTGCTGGTAAATGCTGCATACTACGTTAATAGT 1728
||||.|||||||||||||||||||..||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1511 TGCTTCTAAGAAACTTTATCAGAACAAAACGTTGTGTCATAGTGCTTGTAAACGCTGCATACTACGTTAATAGT 1584
Query 1729 TGCTTTGATTGGGATTCACCCCCAAGGAGTCTCGCTGCTTTTGTG----------GCCTTGTATGGGACTTT-- 1790
|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||| .|.||||.|||.|||||
Sbjct 1585 TGCTTTGATTGGGATTCGCCCCCAAGGAGTCTTGCTGCTTTTGTGCTCTTTCTCCTCATTGTCTGGAACTTTGA 1658
Query 1791 ------CAT-----------------------TAATGTC----------------------------------- 1800
||| ||.||.|
Sbjct 1659 GCTCTACATGATACCACTGCTGCTGTTGTTACTATTGACATGGAACTACTTCCTGATAATATCCGGGAAAGACA 1732
Query 1801 -------------------------------------------------------------------------- 1800
Sbjct 1733 ACAGGCAACGGGACACAGTAGTGGAGGACATGCTGGAGGACGAAGAGGAAGAAGATGACAGAGATGACAAGGAT 1806
Query 1801 -------------------------------------------------------------------------- 1800
Sbjct 1807 GGTGAAAAGAAAGGATTTATAAATAAAATCTATGCGATCCAGGAAGTCTGTGTCAGTGTGCAGAACATCCTAGA 1880
Query 1801 -------------------------------------------------------------------------- 1800
Sbjct 1881 TGAAGTGGCTTCCCTTGGTGAAAGGATAAAGAATACTTTCAACTGGACTGTCCCCTTCTTAAGCTGGCTGGCCA 1954
Query 1801 -------------------------------------------------------------------------- 1800
Sbjct 1955 TTGTAGCCCTGTGTGTGTTCACCGCCATTCTGTACTTCATCCCACTGAGATACATTGTTCTTGTTTGGGGAATT 2028
Query 1801 -------------------------------------------------------------------------- 1800
Sbjct 2029 AATAAATTTACAAAAAAGCTTCGGAGTCCATATGCAATTGATAACAATGAACTACTTGACTTCCTTTCCAGAGT 2102
Query 1801 -------------------------------------------------------------------------- 1800
Sbjct 2103 TCCTTCAGATGTACAAGTGGTGCAGTACCAAGAACTGAAACCAGATCATTCTCATAGCCCATACAAAAGGAAGA 2176
Query 1801 -------------- 1800
Sbjct 2177 AAAACAACCTTGGC 2190
