Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12616
• Subject: XM_005274292.3
• Aligned Length: 1632
• Identities: 1020
• Gaps: 600

Alignment

Query    1  ATGATACATGTTAGAAGACATGAAACAAGGAGAAATTCTAAGAGTCACGTGCCTGAGCAGAAATCTCGAGTTGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGATACATGTTAGAAGACATGAAACAAGGAGAAATTCTAAGAGTCACGTGCCTGAGCAGAAATCTCGAGTTGA  74

Query   75  TTGGAGGCGAACTAAAAGAAGTAGTATCTCACAATTACTTGATAGTGATGAAGAGCTTGATAGTGAAGAATTTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TTGGAGGCGAACTAAAAGAAGTAGTATCTCACAATTACTTGATAGTGATGAAGAGCTTGATAGTGAAGAATTTG  148

Query  149  ATAGTGATGAAGAGCTTGATAGTGATGAAAGTTTTGAAAATGATGAAGAGCTTGATAGTAACAAGGGACCTGAT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATAGTGATGAAGAGCTTGATAGTGATGAAAGTTTTGAAAATGATGAAGAGCTTGATAGTAACAAGGGACCTGAT  222

Query  223  TGTAATAAAACACCAGGAAGTGAAAGAGAGCTCAACTTAAGTAAAATTCAAAGTGAAGGAAATGACAGTAAGTG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TGTAATAAAACACCAGGAAGTGAAAGAGAGCTCAACTTAAGTAAAATTCAAAGTGAAGGAAATGACAGTAAGTG  296

Query  297  TCTCATTAACTCTGGCAACGGTTCAACATATGAAGAAGAAACGAACAAAATCAAACATAGGAATATTGACTTAC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCTCATTAACTCTGGCAACGGTTCAACATATGAAGAAGAAACGAACAAAATCAAACATAGGAATATTGACTTAC  370

Query  371  AAGATCAGGAAAAACATTTAAGTCAAGAGGATAATGATCTCAACAAACAAACTGGACAAATAATAGAGGATGAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAGATCAGGAAAAACATTTAAGTCAAGAGGATAATGATCTCAACAAACAAACTGGACAAATAATAGAGGATGAT  444

Query  445  GAGGAAAAACATTTAAGTCAAGAGGATAATGATCTCAACAAACAAACTGGACAAATAATAGAGGATGATTTAGA  518
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CAGGAAAAACATTTAAGTCAAGAGGATAATGATCTCAACAAACAAACTGGACAAATAATAGAGGATGATTTAGA  518

Query  519  AGAAGAAGACATCAAGCGAGGAAAAAGAAAAAGGCTATCCTCTGTGATGTGTGACAGTGATGAGAGTGATGACA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGAAGAAGACATCAAGCGAGGAAAAAGAAAAAGGCTATCCTCTGTGATGTGTGACAGTGATGAGAGTGATGACA  592

Query  593  GCGATATCCTAGTTAGAAAAGTAGGTGTTAAACGTCCCCGTAGAGTGGTTGAAGATGAAGGTTCTTCAGTGGAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCGATATCCTAGTTAGAAAAGTAGGTGTTAAACGTCCCCGTAGAGTGGTTGAAGATGAAGGTTCTTCAGTGGAA  666

Query  667  ATGGAGCAAAAGACTCCTGAAAAAACATTAGCTGCACAAAAGCGAGAAAAACTTCAGAAGCTCAAAGAACTCTC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATGGAGCAAAAGACTCCTGAAAAAACATTAGCTGCACAAAAGCGAGAAAAACTTCAGAAGCTCAAAGAACTCTC  740

Query  741  AAAACAAAGATCTCGTCAGAGACGCAGTAGTGGTAGAGATTTTGAGGACTCTGAAAAGGAATCTTGCCCAAGCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AAAACAAAGATCTCGTCAGAGACGCAGTAGTGGTAGAGATTTTGAGGACTCTGAAAAGGAATCTTGCCCAAGCA  814

Query  815  GTGATGAAGTTGATGAGGAGGAAGAAGAGGATAATTATGAATCTGATGAAGATGGAGATGATTATATTATCGAT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GTGATGAAGTTGATGAGGAGGAAGAAGAGGATAATTATGAATCTGATGAAGATGGAGATGATTATATTATCGAT  888

Query  889  GACTTTGTAGTGCAAGATGAGGAGGGTGATGAAGAGAATAAAAACCAACAAGGAGAAAAATTGACTACATCACA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GACTTTGTAGTGCAAGATGAGGAGGGTGATGAAGAGAATAAAAACCAACAAGGAGAAAAATTGACTACATCACA  962

Query  963  ACTGAAATTAGTAAAACAGAATTCTCTTTGTAAGTTCAAT-------------ATTAAGAAAATGTT-------  1016
            |||||||||||||||||||||||||||||.|...||.|.|             |||..||||..|||       
Sbjct  963  ACTGAAATTAGTAAAACAGAATTCTCTTTATTCTTTTAGTGACCACTATACTCATTTTGAAAGAGTTGTGAAGG  1036

Query 1017  -TC------------------ATGAAT-TGTTCT-----CA---------------------------------  1032
             ||                  |||||| |.||||     ||                                 
Sbjct 1037  CTCTTCTGATCAACGCTTTAGATGAATCTTTTCTGGGAACATTATATGATGGCACAAGGCAAAAATCATATGCA  1110

Query 1033  --------------------------------------------------------------------------  1032
                                                                                      
Sbjct 1111  AAAGATATGCTAACATCTCTTCATTATTTGGATAACCGCTTTGTTCAGCCTCGTCTAGAGAGCTTGGTATCTAG  1184

Query 1033  --------------------------------------------------------------------------  1032
                                                                                      
Sbjct 1185  AAGTCGTTGGAAAGAGCAATATAAGGAGCGAGTAGAAAATTATTCTAATGTAAGTATTCATTTGAAGAATCCTG  1258

Query 1033  --------------------------------------------------------------------------  1032
                                                                                      
Sbjct 1259  AAAACTGTTCCTGCCAGGCTTGTGGACTGCATCGCTACTGTAAATATTCAGTGCATTTATCAGGAGAGTTGTAT  1332

Query 1033  --------------------------------------------------------------------------  1032
                                                                                      
Sbjct 1333  AACACCAGGACCATGCAAATAGATAATTTCATGTCACATGATAAACAGGTGTTCACTGTTGGCAGAATTTGTGC  1406

Query 1033  --------------------------------------------------------------------------  1032
                                                                                      
Sbjct 1407  CAGCCGTACCAGAATTTATCATAAACTGAAACATTTTAAATTCAAACTATACCAGGAATGTTGCACCATTGCAA  1480

Query 1033  --------------------------------------------------------------------------  1032
                                                                                      
Sbjct 1481  TGACAGAAGAAGTTGAAGATGAACAAGTTAAAGAAACAGTGGAAAGAATTTTCAGGCGGTCAAAAGAAAATGGC  1554

Query 1033  --------------------------------------------------------------------------  1032
                                                                                      
Sbjct 1555  TGGATTAAGGAGAAATATGGTCAACTTGAAGAATATCTCAATTTTGCGGATTACTTTCAAGAAGAGAAGTTTGA  1628

Query 1033  ----  1032
                
Sbjct 1629  GTTG  1632