Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12622
• Subject: XM_011532252.3
• Aligned Length: 1899
• Identities: 1896
• Gaps: 3

Alignment

Query    1  ATGAAAGCCATAAAGAAAAGTCTTACAGAAGAAGAATACCTGTACCTGGACTTTTCTCACCAAACAGAAGGATG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAAAGCCATAAAGAAAAGTCTTACAGAAGAAGAATACCTGTACCTGGACTTTTCTCACCAAACAGAAGGATG  74

Query   75  CATCTTTCCTCTTCATACATCTGTAACTTTATTTCTGTTATCTTACTGTGACTGTAAAATCTTTAAAATTTGCT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CATCTTTCCTCTTCATACATCTGTAACTTTATTTCTGTTATCTTACTGTGACTGTAAAATCTTTAAAATTTGCT  148

Query  149  TAGTTGTCACCAAAGAGGTGAGTAGAGATAGTTCACTACTAAGAGATGACCTGATCCAGGATGTTGAAATACAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TAGTTGTCACCAAAGAGGTGAGTAGAGATAGTTCACTACTAAGAGATGACCTGATCCAGGATGTTGAAATACAG  222

Query  223  ATTATTTCAAGGCAGGAGCTCCCACCAATAGTCCAAAATTGCTGTTTGCCTGCAGTAGTAGAACGATCAGACAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATTATTTCAAGGCAGGAGCTCCCACCAATAGTCCAAAATTGCTGTTTGCCTGCAGTAGTAGAACGATCAGACAA  296

Query  297  TTTTTGTAGAGCAGGACTTGCTGTTGTATTGAGACACATAATCCAGAAATCCTATGAAGCAGACCCCTTAAAGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TTTTTGTAGAGCAGGACTTGCTGTTGTATTGAGACACATAATCCAGAAATCCTATGAAGCAGACCCCTTAAAGA  370

Query  371  AGGAACTTTTGGAACTTCTGGGCTTTAAAAAGACTTGCTTGAAAGCCTGTGCTGAAGTTAGTCAGTGGACCAGG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGGAACTTTTGGAACTTCTGGGCTTTAAAAAGACTTGCTTGAAAGCCTGTGCTGAAGTTAGTCAGTGGACCAGG  444

Query  445  CTATGTGAACTCACCATCCCTTTGGCTATTGAGAATTTTCTCAGAGAATCTTCTGACCAGCCCCCAACTATACC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTATGTGAACTCACCATCCCTTTGGCTATTGAGAATTTTCTCAGAGAATCTTCTGACCAGCCCCCAACTATACC  518

Query  519  TGTAGAAATACTACAGCTAGAGAAAAAGCTTAGTGAGCCTGTTAGAGTGCATAATGATGATAAACTCCGCAGGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGTAGAAATACTACAGCTAGAGAAAAAGCTTAGTGAGCCTGTTAGAGTGCATAATGATGATAAACTCCGCAGGC  592

Query  593  AGAAGCTCAAGCAACAGAAGGCTGATGGAGTTGGGCCTCCCCTTACTAAGGGAAAGGCAAAGAGCAAGGTCCAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGAAGCTCAAGCAACAGAAGGCTGATGGAGTTGGGCCTCCCCTTACTAAGGGAAAGGCAAAGAGCAAGGTCCAC  666

Query  667  ACACAGGAAACATCTGAAGGGTTGGATTCTTCATCCAAGAGTCTGGAACTGAAAGTGGCATTCTCAAAGCTCAC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACACAGGAAACATCTGAAGGGTTGGATTCTTCATCCAAGAGTCTGGAACTGAAAGTGGCATTCTCAAAGCTCAC  740

Query  741  AGTACAGGAAGAACCAGCTACTACCAACAGAGAGCCTTCTCACATCAGAAAAGCAAAAGCCTCCGACCTTCCAC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGTACAGGAAGAACCAGCTACTACCAACAGAGAGCCTTCTCACATCAGAAAAGCAAAAGCCTCCGACCTTCCAC  814

Query  815  CTCTGGAGCATGTGTTTGCAGAAGGGCTTTACTTCACTCTGGCAGATATTGTGCTCTTGCCCTGTATCCATCAT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTCTGGAGCATGTGTTTGCAGAAGGGCTTTACTTCACTCTGGCAGATATTGTGCTCTTGCCCTGTATCCATCAT  888

Query  889  TTCTTGGTAATTATCAGCAGGAAATTTTCTGAGAAGCTGGTAGAATTTCCATTGCTAGCCTCTTGGTACCAGAG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTCTTGGTAATTATCAGCAGGAAATTTTCTGAGAAGCTGGTAGAATTTCCATTGCTAGCCTCTTGGTACCAGAG  962

Query  963  GATTCAGGAAGTGCCAGGAGTAAAAA---CAGCTTCTAAGTGTGGGATCCAATTTCTCCATTTACCAAAGTTGT  1033
            ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GATTCAGGAAGTGCCAGGAGTAAAAACAGCAGCTTCTAAGTGTGGGATCCAATTTCTCCATTTACCAAAGTTGT  1036

Query 1034  TGACAACCTCAACTGAACAGCATCCAAACTTATGTGAAGTCCCAGGTGTAGAAGAGCAAAGCGATCCTTTATTT  1107
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGACAACCTCAACTGAACAGCATCCAAACTTATGTGAAGTCCCAGGTGTAGAAGAGCAAAGCGATCCTTTATTT  1110

Query 1108  ATAGGAGGACCAAGACCAACCATGGCCAAGTTAATGGAAAAGGGCATTGAAGTGATGTTTTCTCCCCACCCTTG  1181
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ATAGGAGGACCAAGACCAACCATGGCCAAGTTAATGGAAAAGGGCATTGAAGTGATGTTTTCTCCCCACCCTTG  1184

Query 1182  CCCTACTTGGACTCTTGATTGGAATGTTCTCCCTGCAGCAGTCAGCCCAAAGGAAGGTAAAATGTCCAGTGATC  1255
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCCTACTTGGACTCTTGATTGGAATGTTCTCCCTGCAGCAGTCAGCCCAAAGGAAGGTAAAATGTCCAGTGATC  1258

Query 1256  GAGCTTTGAGGAAGCAGCAACAGTTGAACAACCTTGTCTATGTGGTAACAAATCAGGCCAAACCTGGTGACAGA  1329
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GAGCTTTGAGGAAGCAGCAACAGTTGAACAACCTTGTCTATGTGGTAACAAATCAGGCCAAACCTGGTGACAGA  1332

Query 1330  ATTGTGGATTTCTGCAGCGGTGGGGGCCATGTTGGAATTGTCCTTGCTCACATGCTGCCATCATGTCAGGTTAC  1403
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ATTGTGGATTTCTGCAGCGGTGGGGGCCATGTTGGAATTGTCCTTGCTCACATGCTGCCATCATGTCAGGTTAC  1406

Query 1404  ATTAATAGAAAACAAGGAATTATCATTAATTCGTGCTAAGAAGAGAAGTGATGAACTGGGTTTAAGCAACATTT  1477
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  ATTAATAGAAAACAAGGAATTATCATTAATTCGTGCTAAGAAGAGAAGTGATGAACTGGGTTTAAGCAACATTT  1480

Query 1478  GGTTCATTCAAGCAAATATGGAATATTTTACTGGGATGTTTAATATTGGAGTAGCATTGCATGCTTGTGGAGTG  1551
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GGTTCATTCAAGCAAATATGGAATATTTTACTGGGATGTTTAATATTGGAGTAGCATTGCATGCTTGTGGAGTG  1554

Query 1552  GCAACAGACATGGTGATTGAGCACTGTATCAAAACACGGGCTTCCTTCGTCACATGCCCTTGCTGTTATGGTTT  1625
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GCAACAGACATGGTGATTGAGCACTGTATCAAAACACGGGCTTCCTTCGTCACATGCCCTTGCTGTTATGGTTT  1628

Query 1626  CATTCAGAACACCTCAAAGTTCAATTTTCCAAAAAGTGAACAATTCAAGAAAACTTTATCATACAAGGAACACA  1699
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CATTCAGAACACCTCAAAGTTCAATTTTCCAAAAAGTGAACAATTCAAGAAAACTTTATCATACAAGGAACACA  1702

Query 1700  TGATTCTGTGCAGATTTGCAGACCAGACAGCTGTCCAGCTCCCACCCCAACGAAGGCTCATAGGAAAACAGTGC  1773
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TGATTCTGTGCAGATTTGCAGACCAGACAGCTGTCCAGCTCCCACCCCAACGAAGGCTCATAGGAAAACAGTGC  1776

Query 1774  ATGTGCTTGGTGGATCTGGATCGAGCAAGAGCTGCAGAAGAATGTGGATACTCCGTTCAAGTGATATCCATGGA  1847
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  ATGTGCTTGGTGGATCTGGATCGAGCAAGAGCTGCAGAAGAATGTGGATACTCCGTTCAAGTGATATCCATGGA  1850

Query 1848  GCCAGAGAGCTGCTCTCCCAAAAATAACATGATTGTGGGAGTCCCCATT  1896
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GCCAGAGAGCTGCTCTCCCAAAAATAACATGATTGTGGGAGTCCCCATT  1899