Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_12623
Subject:
NM_001284404.1
Aligned Length:
714
Identities:
636
Gaps:
72

Alignment

Query   1  ATGAAAGACCAGCATTTACGAGGTTTCTTCTCAGACTCCACATCATTCAATATTTTGA--TGG----ATATGTT  68
                                                              ||.|.||  |||    |.||||.
Sbjct   1  ---------------------------------------------------ATGTGGAACTGGCTAAAAATGTC  23

Query  69  ATTTATCAAAGGCAAATATAAAAGTGCTTTGCAAGTATTGATAGAGATGAAAAACCAAGATGTGAAGTTCACCA  142
           |||               ||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  24  ATT---------------TACAGGTGCTTTGCAAGTATTGATAGAGATGAAAAACCAAGATGTGAAGTTCACCA  82

Query 143  AAGATACCTATGTTCTTGCTTTTGCAATTTGCTACAAACTGAATAGCCCTGAGTCTTTCAAAATCTGTACTACA  216
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  83  AAGATACCTATGTTCTTGCTTTTGCAATTTGCTACAAACTGAATAGCCCTGAGTCTTTCAAAATCTGTACTACA  156

Query 217  TTAAGAGAAGAAGCTCTACTCAAAGGAGAAATTCTCTCCAGGAGAGCATCCTGTTTCGCTGTGGCATTAGCTCT  290
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 157  TTAAGAGAAGAAGCTCTACTCAAAGGAGAAATTCTCTCCAGGAGAGCATCCTGTTTCGCTGTGGCATTAGCTCT  230

Query 291  GAATCAGAATGAGATGGCAAAAGCTGTGTCCATTTTTTCTCAAATCATGAATCCAGAAAGCATAGCCTGCATTA  364
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 231  GAATCAGAATGAGATGGCAAAAGCTGTGTCCATTTTTTCTCAAATCATGAATCCAGAAAGCATAGCCTGCATTA  304

Query 365  ATTTAAATATTATAATCCATATCCAGTCAAATATGTTGGAAAACCTGATAAAGACTCTAAAAAATGCTGCAGAA  438
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 305  ATTTAAATATTATAATCCATATCCAGTCAAATATGTTGGAAAACCTGATAAAGACTCTAAAAAATGCTGCAGAA  378

Query 439  GGAAATTTATCAAAATTTGTGAAAAGACATGTGTTCTCGGAGGAAGTGCTGGCCAAAGTGAGGGAAAAAGTGAA  512
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 379  GGAAATTTATCAAAATTTGTGAAAAGACATGTGTTCTCGGAGGAAGTGCTGGCCAAAGTGAGGGAAAAAGTGAA  452

Query 513  GGATGTGCCTGCCCTTGTGGCCAAATTTGATGAGATCTATGGGACACTGCACATCACTGGCCAGGTCACCACTG  586
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 453  GGATGTGCCTGCCCTTGTGGCCAAATTTGATGAGATCTATGGGACACTGCACATCACTGGCCAGGTCACCACTG  526

Query 587  ATTCTTTGGATGCTGTGCTCTGCCACACCCCCAGGGACAGGAAATCTCACACGTTGCTATTAAACAAGAGGATG  660
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 527  ATTCTTTGGATGCTGTGCTCTGCCACACCCCCAGGGACAGGAAATCTCACACGTTGCTATTAAACAAGAGGATG  600

Query 661  GTCAGCCGTCGCACCTTCCAGCCACTCAGCCAGTCCCTGTTGGCTGAG  708
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601  GTCAGCCGTCGCACCTTCCAGCCACTCAGCCAGTCCCTGTTGGCTGAG  648