Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12695
• Subject: NM_001282447.2
• Aligned Length: 2436
• Identities: 2076
• Gaps: 360

Alignment

Query    1  ATGGGCTGGAGGCCCCGGAGAGCTCGGGGGACCCCGTTGCTGCTGCTGCTACTACTGCTGCTGCTCTGGCCAGT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGCTGGAGGCCCCGGAGAGCTCGGGGGACCCCGTTGCTGCTGCTGCTACTACTGCTGCTGCTCTGGCCAGT  74

Query   75  GCCAGGCGCCGGGGTGCTTCAAGGACATATCCCTGGGCAGCCAGTCACCCCGCACTGGGTCCTGGATGGACAAC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCCAGGCGCCGGGGTGCTTCAAGGACATATCCCTGGGCAGCCAGTCACCCCGCACTGGGTCCTGGATGGACAAC  148

Query  149  CCTGGCGCACCGTCAGCCTGGAGGAGCCGGTCTCGAAGCCAGACATGGGGCTGGTGGCCCTGGAGGCTGAAGGC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCTGGCGCACCGTCAGCCTGGAGGAGCCGGTCTCGAAGCCAGACATGGGGCTGGTGGCCCTGGAGGCTGAAGGC  222

Query  223  CAGGAGCTCCTGCTTGAGCTGGAGAAGAACCACAGGCTGCTGGCCCCAGGATACATAGAAACCCACTACGGCCC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAGGAGCTCCTGCTTGAGCTGGAGAAGAACCACAGGCTGCTGGCCCCAGGATACATAGAAACCCACTACGGCCC  296

Query  297  AGATGGGCAGCCAGTGGTGCTGGCCCCCAACCACACGGATCATTGCCACTACCAAGGGCGAGTAAGGGGCTTCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGATGGGCAGCCAGTGGTGCTGGCCCCCAACCACACGGATCATTGCCACTACCAAGGGCGAGTAAGGGGCTTCC  370

Query  371  CCGACTCCTGGGTAGTCCTCTGCACCTGCTCTGGGATGAGTGGCCTGATCACCCTCAGCAGGAATGCCAGCTAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCGACTCCTGGGTAGTCCTCTGCACCTGCTCTGGGATGAGTGGCCTGATCACCCTCAGCAGGAATGCCAGCTAT  444

Query  445  TATCTGCGTCCCTGGCCACCCCGGGGCTCCAAGGACTTCTCAACCCACGAGATCTTTCGGATGGAGCAGCTGCT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TATCTGCGTCCCTGGCCACCCCGGGGCTCCAAGGACTTCTCAACCCACGAGATCTTTCGGATGGAGCAGCTGCT  518

Query  519  CACCTGGAAAGGAACCTGTGGCCACAGGGATCCTGGGAACAAAGCGGGCATGACCAGCCTTCCTGGTGGTCCCC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CACCTGGAAAGGAACCTGTGGCCACAGGGATCCTGGGAACAAAGCGGGCATGACCAGCCTTCCTGGTGGTCCCC  592

Query  593  AGAGCAGGGGCAGGCGAGAAGCGCGCAGGACCCGGAAGTACCTGGAACTGTACATTGTGGCAGACCACACCCTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGAGCAGGGGCAGGCGAGAAGCGCGCAGGACCCGGAAGTACCTGGAACTGTACATTGTGGCAGACCACACCCTG  666

Query  667  TTCTTGACTCGGCACCGAAACTTGAACCACACCAAACAGCGTCTCCTGGAAGTCGCCAACTACGTGGACCAGCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TTCTTGACTCGGCACCGAAACTTGAACCACACCAAACAGCGTCTCCTGGAAGTCGCCAACTACGTGGACCAGCT  740

Query  741  TCTCAGGACTCTGGACATTCAGGTGGCGCTGACCGGCCTGGAGGTGTGGACCGAGCGGGACC------------  802
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
Sbjct  741  TCTCAGGACTCTGGACATTCAGGTGGCGCTGACCGGCCTGGAGGTGTGGACCGAGCGGGACCGCAGCCGCGTCA  814

Query  803  --------------------------------------------------------------------------  802
                                                                                      
Sbjct  815  CGCAGGACGCCAACGCCACGCTCTGGGCCTTCCTGCAGTGGCGCCGGGGGCTGTGGGCGCAGCGGCCCCACGAC  888

Query  803  --------------------------------------------------------------------------  802
                                                                                      
Sbjct  889  TCCGCGCAGCTGCTCACGGGCCGCGCCTTCCAGGGCGCCACAGTGGGCCTGGCGCCCGTCGAGGGCATGTGCCG  962

Query  803  --------------------------------------------------------------------------  802
                                                                                      
Sbjct  963  CGCCGAGAGCTCGGGAGGCGTGAGCACGGACCACTCGGAGCTCCCCATCGGCGCCGCAGCCACCATGGCCCATG  1036

Query  803  --------------------------------------------------------------------------  802
                                                                                      
Sbjct 1037  AGATCGGCCACAGCCTCGGCCTCAGCCACGACCCCGACGGCTGCTGCGTGGAGGCTGCGGCCGAGTCCGGAGGC  1110

Query  803  ----------------------------------------------------GCAGCCGCCGCCAGCTGCGCGC  824
                                                                ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TGCGTCATGGCTGCGGCCACCGGGCACCCGTTTCCGCGCGTGTTCAGCGCCTGCAGCCGCCGCCAGCTGCGCGC  1184

Query  825  CTTCTTCCGCAAGGGGGGCGGCGCTTGCCTCTCCAATGCCCCGGACCCCGGACTCCCGGTGCCGCCGGCGCTCT  898
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CTTCTTCCGCAAGGGGGGCGGCGCTTGCCTCTCCAATGCCCCGGACCCCGGACTCCCGGTGCCGCCGGCGCTCT  1258

Query  899  GCGGGAACGGCTTCGTGGAAGCGGGCGAGGAGTGTGACTGCGGCCCTGGCCAGGAGTGCCGCGACCTCTGCTGC  972
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GCGGGAACGGCTTCGTGGAAGCGGGCGAGGAGTGTGACTGCGGCCCTGGCCAGGAGTGCCGCGACCTCTGCTGC  1332

Query  973  TTTGCTCACAACTGCTCGCTGCGCCCGGGGGCCCAGTGCGCCCACGGGGACTGCTGCGTGCGCTGCCTGCTGAA  1046
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TTTGCTCACAACTGCTCGCTGCGCCCGGGGGCCCAGTGCGCCCACGGGGACTGCTGCGTGCGCTGCCTGCTGAA  1406

Query 1047  GCCGGCTGGAGCGCTGTGCCGCCAGGCCATGGGTGACTGTGACCTCCCTGAGTTTTGCACGGGCACCTCCTCCC  1120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GCCGGCTGGAGCGCTGTGCCGCCAGGCCATGGGTGACTGTGACCTCCCTGAGTTTTGCACGGGCACCTCCTCCC  1480

Query 1121  ACTGTCCCCCAGACGTTTACCTACTGGACGGCTCACCCTGTGCCAGGGGCAGTGGCTACTGCTGGGATGGCGCA  1194
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ACTGTCCCCCAGACGTTTACCTACTGGACGGCTCACCCTGTGCCAGGGGCAGTGGCTACTGCTGGGATGGCGCA  1554

Query 1195  TGTCCCACGCTGGAGCAGCAGTGCCAGCAGCTCTGGGGGCCTGGCTCCCACCCAGCTCCCGAGGCCTGTTTCCA  1268
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TGTCCCACGCTGGAGCAGCAGTGCCAGCAGCTCTGGGGGCCTGGCTCCCACCCAGCTCCCGAGGCCTGTTTCCA  1628

Query 1269  GGTGGTGAACTCTGCGGGAGATGCTCATGGAAACTGCGGCCAGGACAGCGAGGGCCACTTCCTGCCCTGTGCAG  1342
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GGTGGTGAACTCTGCGGGAGATGCTCATGGAAACTGCGGCCAGGACAGCGAGGGCCACTTCCTGCCCTGTGCAG  1702

Query 1343  GGAGGGATGCCCTGTGTGGGAAGCTGCAGTGCCAGGGTGGAAAGCCCAGCCTGCTCGCACCGCACATGGTGCCA  1416
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GGAGGGATGCCCTGTGTGGGAAGCTGCAGTGCCAGGGTGGAAAGCCCAGCCTGCTCGCACCGCACATGGTGCCA  1776

Query 1417  GTGGACTCTACCGTTCACCTAGATGGCCAGGAAGTGACTTGTCGGGGAGCCTTGGCACTCCCCAGTGCCCAGCT  1490
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GTGGACTCTACCGTTCACCTAGATGGCCAGGAAGTGACTTGTCGGGGAGCCTTGGCACTCCCCAGTGCCCAGCT  1850

Query 1491  GGACCTGCTTGGCCTGGGCCTGGTAGAGCCAGGCACCCAGTGTGGACCTAGAATGGTGTGCCAGAGCAGGCGCT  1564
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GGACCTGCTTGGCCTGGGCCTGGTAGAGCCAGGCACCCAGTGTGGACCTAGAATGGTGTGCCAGAGCAGGCGCT  1924

Query 1565  GCAGGAAGAATGCCTTCCAGGAGCTTCAGCGCTGCCTGACTGCCTGCCACAGCCACGGGGTTTGCAATAGCAAC  1638
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  GCAGGAAGAATGCCTTCCAGGAGCTTCAGCGCTGCCTGACTGCCTGCCACAGCCACGGGGTTTGCAATAGCAAC  1998

Query 1639  CATAACTGCCACTGTGCTCCAGGCTGGGCTCCACCCTTCTGTGACAAGCCAGGCTTTGGTGGCAGCATGGACAG  1712
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CATAACTGCCACTGTGCTCCAGGCTGGGCTCCACCCTTCTGTGACAAGCCAGGCTTTGGTGGCAGCATGGACAG  2072

Query 1713  TGGCCCTGTGCAGGCTGAAAACCATGACACCTTCCTGCTGGCCATGCTCCTCAGCGTCCTGCTGCCTCTGCTCC  1786
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  TGGCCCTGTGCAGGCTGAAAACCATGACACCTTCCTGCTGGCCATGCTCCTCAGCGTCCTGCTGCCTCTGCTCC  2146

Query 1787  CAGGGGCCGGCCTGGCCTGGTGTTGCTACCGACTCCCAGGAGCCCATCTGCAGCGATGCAGCTGGGGCTGCAGA  1860
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  CAGGGGCCGGCCTGGCCTGGTGTTGCTACCGACTCCCAGGAGCCCATCTGCAGCGATGCAGCTGGGGCTGCAGA  2220

Query 1861  AGGGACCCTGCGTGCAGTGGCCCCAAAGATGGCCCACACAGGGACCACCCCCTGGGCGGCGTTCACCCCATGGA  1934
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  AGGGACCCTGCGTGCAGTGGCCCCAAAGATGGCCCACACAGGGACCACCCCCTGGGCGGCGTTCACCCCATGGA  2294

Query 1935  GTTGGGCCCCACAGCCACTGGACAGCCCTGGCCCCTGGACCCTGAGAACTCTCATGAGCCCAGCAGCCACCCTG  2008
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  GTTGGGCCCCACAGCCACTGGACAGCCCTGGCCCCTGGACCCTGAGAACTCTCATGAGCCCAGCAGCCACCCTG  2368

Query 2009  AGAAGCCTCTGCCAGCAGTCTCGCCTGACCCCCAAGATCAAGTCCAGATGCCAAGATCCTGCCTCTGG  2076
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  AGAAGCCTCTGCCAGCAGTCTCGCCTGACCCCCAAGATCAAGTCCAGATGCCAAGATCCTGCCTCTGG  2436