Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_12695
- Subject:
- XM_006723640.1
- Aligned Length:
- 2469
- Identities:
- 2076
- Gaps:
- 393
Alignment
Query 1 ATGGGCTGGAGGCCCCGGAGAGCTCGGGGGACCCCGTTGCTGCTGCTGCTACTACTGCTGCTGCTCTGGCCAGT 74
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Sbjct 1 ATGGGCTGGAGGCCCCGGAGAGCTCGGGGGACCCCGTTGCTGCTGCTGCTACTACTGCTGCTGCTCTGGCCAGT 74
Query 75 GCCAGGCGCCGGGGTGCTTCAAGGACATATCCCTGGGCAGCCAGTCACCCCGCACTGGGTCCTGGATGGACAAC 148
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Sbjct 75 GCCAGGCGCCGGGGTGCTTCAAGGACATATCCCTGGGCAGCCAGTCACCCCGCACTGGGTCCTGGATGGACAAC 148
Query 149 CCTGGCGCACCGTCAGCCTGGAGGAGCCGGTCTCGAAGCCAGACATGGGGCTGGTGGCCCTGGAGGCTGAAGGC 222
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Sbjct 149 CCTGGCGCACCGTCAGCCTGGAGGAGCCGGTCTCGAAGCCAGACATGGGGCTGGTGGCCCTGGAGGCTGAAGGC 222
Query 223 CAGGAGCTCCTGCTTGAGCTGGAGAAGAACCACAGGCTGCTGGCCCCAGGATACATAGAAACCCACTACGGCCC 296
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Sbjct 223 CAGGAGCTCCTGCTTGAGCTGGAGAAGAACCACAGGCTGCTGGCCCCAGGATACATAGAAACCCACTACGGCCC 296
Query 297 AGATGGGCAGCCAGTGGTGCTGGCCCCCAACCACAC-------------------------------------- 332
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Sbjct 297 AGATGGGCAGCCAGTGGTGCTGGCCCCCAACCACACGGTGAGATGCTTCCATGGGCTCTGGGATGCACCGCCAG 370
Query 333 -GGATCATTGCCACTACCAAGGGCGAGTAAGGGGCTTCCCCGACTCCTGGGTAGTCCTCTGCACCTGCTCTGGG 405
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Sbjct 371 AGGATCATTGCCACTACCAAGGGCGAGTAAGGGGCTTCCCCGACTCCTGGGTAGTCCTCTGCACCTGCTCTGGG 444
Query 406 ATGAGTGGCCTGATCACCCTCAGCAGGAATGCCAGCTATTATCTGCGTCCCTGGCCACCCCGGGGCTCCAAGGA 479
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Sbjct 445 ATGAGTGGCCTGATCACCCTCAGCAGGAATGCCAGCTATTATCTGCGTCCCTGGCCACCCCGGGGCTCCAAGGA 518
Query 480 CTTCTCAACCCACGAGATCTTTCGGATGGAGCAGCTGCTCACCTGGAAAGGAACCTGTGGCCACAGGGATCCTG 553
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Sbjct 519 CTTCTCAACCCACGAGATCTTTCGGATGGAGCAGCTGCTCACCTGGAAAGGAACCTGTGGCCACAGGGATCCTG 592
Query 554 GGAACAAAGCGGGCATGACCAGCCTTCCTGGTGGTCCCCAGAGCAGGGGCAGGCGAGAAGCGCGCAGGACCCGG 627
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Sbjct 593 GGAACAAAGCGGGCATGACCAGCCTTCCTGGTGGTCCCCAGAGCAGGGGCAGGCGAGAAGCGCGCAGGACCCGG 666
Query 628 AAGTACCTGGAACTGTACATTGTGGCAGACCACACCCTGTTCTTGACTCGGCACCGAAACTTGAACCACACCAA 701
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Sbjct 667 AAGTACCTGGAACTGTACATTGTGGCAGACCACACCCTGTTCTTGACTCGGCACCGAAACTTGAACCACACCAA 740
Query 702 ACAGCGTCTCCTGGAAGTCGCCAACTACGTGGACCAGCTTCTCAGGACTCTGGACATTCAGGTGGCGCTGACCG 775
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Sbjct 741 ACAGCGTCTCCTGGAAGTCGCCAACTACGTGGACCAGCTTCTCAGGACTCTGGACATTCAGGTGGCGCTGACCG 814
Query 776 GCCTGGAGGTGTGGACCGAGCGGGACC----------------------------------------------- 802
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Sbjct 815 GCCTGGAGGTGTGGACCGAGCGGGACCGCAGCCGCGTCACGCAGGACGCCAACGCCACGCTCTGGGCCTTCCTG 888
Query 803 -------------------------------------------------------------------------- 802
Sbjct 889 CAGTGGCGCCGGGGGCTGTGGGCGCAGCGGCCCCACGACTCCGCGCAGCTGCTCACGGGCCGCGCCTTCCAGGG 962
Query 803 -------------------------------------------------------------------------- 802
Sbjct 963 CGCCACAGTGGGCCTGGCGCCCGTCGAGGGCATGTGCCGCGCCGAGAGCTCGGGAGGCGACCACTCGGAGCTCC 1036
Query 803 -------------------------------------------------------------------------- 802
Sbjct 1037 CCATCGGCGCCGCAGCCACCATGGCCCATGAGATCGGCCACAGCCTCGGCCTCAGCCACGACCCCGACGGCTGC 1110
Query 803 -------------------------------------------------------------------------- 802
Sbjct 1111 TGCGTGGAGGCTGCGGCCGAGTCCGGAGGCTGCGTCATGGCTGCGGCCACCGGGCACCCGTTTCCGCGCGTGTT 1184
Query 803 --------GCAGCCGCCGCCAGCTGCGCGCCTTCTTCCGCAAGGGGGGCGGCGCTTGCCTCTCCAATGCCCCGG 868
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Sbjct 1185 CAGCGCCTGCAGCCGCCGCCAGCTGCGCGCCTTCTTCCGCAAGGGGGGCGGCGCTTGCCTCTCCAATGCCCCGG 1258
Query 869 ACCCCGGACTCCCGGTGCCGCCGGCGCTCTGCGGGAACGGCTTCGTGGAAGCGGGCGAGGAGTGTGACTGCGGC 942
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Sbjct 1259 ACCCCGGACTCCCGGTGCCGCCGGCGCTCTGCGGGAACGGCTTCGTGGAAGCGGGCGAGGAGTGTGACTGCGGC 1332
Query 943 CCTGGCCAGGAGTGCCGCGACCTCTGCTGCTTTGCTCACAACTGCTCGCTGCGCCCGGGGGCCCAGTGCGCCCA 1016
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Sbjct 1333 CCTGGCCAGGAGTGCCGCGACCTCTGCTGCTTTGCTCACAACTGCTCGCTGCGCCCGGGGGCCCAGTGCGCCCA 1406
Query 1017 CGGGGACTGCTGCGTGCGCTGCCTGCTGAAGCCGGCTGGAGCGCTGTGCCGCCAGGCCATGGGTGACTGTGACC 1090
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Sbjct 1407 CGGGGACTGCTGCGTGCGCTGCCTGCTGAAGCCGGCTGGAGCGCTGTGCCGCCAGGCCATGGGTGACTGTGACC 1480
Query 1091 TCCCTGAGTTTTGCACGGGCACCTCCTCCCACTGTCCCCCAGACGTTTACCTACTGGACGGCTCACCCTGTGCC 1164
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Sbjct 1481 TCCCTGAGTTTTGCACGGGCACCTCCTCCCACTGTCCCCCAGACGTTTACCTACTGGACGGCTCACCCTGTGCC 1554
Query 1165 AGGGGCAGTGGCTACTGCTGGGATGGCGCATGTCCCACGCTGGAGCAGCAGTGCCAGCAGCTCTGGGGGCCTGG 1238
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Sbjct 1555 AGGGGCAGTGGCTACTGCTGGGATGGCGCATGTCCCACGCTGGAGCAGCAGTGCCAGCAGCTCTGGGGGCCTGG 1628
Query 1239 CTCCCACCCAGCTCCCGAGGCCTGTTTCCAGGTGGTGAACTCTGCGGGAGATGCTCATGGAAACTGCGGCCAGG 1312
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Sbjct 1629 CTCCCACCCAGCTCCCGAGGCCTGTTTCCAGGTGGTGAACTCTGCGGGAGATGCTCATGGAAACTGCGGCCAGG 1702
Query 1313 ACAGCGAGGGCCACTTCCTGCCCTGTGCAGGGAGGGATGCCCTGTGTGGGAAGCTGCAGTGCCAGGGTGGAAAG 1386
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Sbjct 1703 ACAGCGAGGGCCACTTCCTGCCCTGTGCAGGGAGGGATGCCCTGTGTGGGAAGCTGCAGTGCCAGGGTGGAAAG 1776
Query 1387 CCCAGCCTGCTCGCACCGCACATGGTGCCAGTGGACTCTACCGTTCACCTAGATGGCCAGGAAGTGACTTGTCG 1460
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Sbjct 1777 CCCAGCCTGCTCGCACCGCACATGGTGCCAGTGGACTCTACCGTTCACCTAGATGGCCAGGAAGTGACTTGTCG 1850
Query 1461 GGGAGCCTTGGCACTCCCCAGTGCCCAGCTGGACCTGCTTGGCCTGGGCCTGGTAGAGCCAGGCACCCAGTGTG 1534
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Sbjct 1851 GGGAGCCTTGGCACTCCCCAGTGCCCAGCTGGACCTGCTTGGCCTGGGCCTGGTAGAGCCAGGCACCCAGTGTG 1924
Query 1535 GACCTAGAATGGTGTGCCAGAGCAGGCGCTGCAGGAAGAATGCCTTCCAGGAGCTTCAGCGCTGCCTGACTGCC 1608
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Sbjct 1925 GACCTAGAATGGTGTGCCAGAGCAGGCGCTGCAGGAAGAATGCCTTCCAGGAGCTTCAGCGCTGCCTGACTGCC 1998
Query 1609 TGCCACAGCCACGGGGTTTGCAATAGCAACCATAACTGCCACTGTGCTCCAGGCTGGGCTCCACCCTTCTGTGA 1682
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Sbjct 1999 TGCCACAGCCACGGGGTTTGCAATAGCAACCATAACTGCCACTGTGCTCCAGGCTGGGCTCCACCCTTCTGTGA 2072
Query 1683 CAAGCCAGGCTTTGGTGGCAGCATGGACAGTGGCCCTGTGCAGGCTGAAAACCATGACACCTTCCTGCTGGCCA 1756
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Sbjct 2073 CAAGCCAGGCTTTGGTGGCAGCATGGACAGTGGCCCTGTGCAGGCTGAAAACCATGACACCTTCCTGCTGGCCA 2146
Query 1757 TGCTCCTCAGCGTCCTGCTGCCTCTGCTCCCAGGGGCCGGCCTGGCCTGGTGTTGCTACCGACTCCCAGGAGCC 1830
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Sbjct 2147 TGCTCCTCAGCGTCCTGCTGCCTCTGCTCCCAGGGGCCGGCCTGGCCTGGTGTTGCTACCGACTCCCAGGAGCC 2220
Query 1831 CATCTGCAGCGATGCAGCTGGGGCTGCAGAAGGGACCCTGCGTGCAGTGGCCCCAAAGATGGCCCACACAGGGA 1904
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Sbjct 2221 CATCTGCAGCGATGCAGCTGGGGCTGCAGAAGGGACCCTGCGTGCAGTGGCCCCAAAGATGGCCCACACAGGGA 2294
Query 1905 CCACCCCCTGGGCGGCGTTCACCCCATGGAGTTGGGCCCCACAGCCACTGGACAGCCCTGGCCCCTGGACCCTG 1978
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Sbjct 2295 CCACCCCCTGGGCGGCGTTCACCCCATGGAGTTGGGCCCCACAGCCACTGGACAGCCCTGGCCCCTGGACCCTG 2368
Query 1979 AGAACTCTCATGAGCCCAGCAGCCACCCTGAGAAGCCTCTGCCAGCAGTCTCGCCTGACCCCCA---AGATCAA 2049
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Sbjct 2369 AGAACTCTCATGAGCCCAGCAGCCACCCTGAGAAGCCTCTGCCAGCAGTCTCGCCTGACCCCCAAGCAGATCAA 2442
Query 2050 GTCCAGATGCCAAGATCCTGCCTCTGG 2076
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Sbjct 2443 GTCCAGATGCCAAGATCCTGCCTCTGG 2469